MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 81742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011726	CAAT	2	8	26504	26511	50 %	25 %	0 %	25 %	218244918
502	NC_011726	ATC	2	6	26562	26567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244918
503	NC_011726	GAA	2	6	26616	26621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244918
504	NC_011726	AAG	2	6	26626	26631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244918
505	NC_011726	AACG	2	8	26654	26661	50 %	0 %	25 %	25 %	218244918
506	NC_011726	T	6	6	26750	26755	0 %	100 %	0 %	0 %	218244918
507	NC_011726	CTAT	2	8	26764	26771	25 %	50 %	0 %	25 %	218244918
508	NC_011726	A	6	6	26863	26868	100 %	0 %	0 %	0 %	218244918
509	NC_011726	A	6	6	26888	26893	100 %	0 %	0 %	0 %	218244918
510	NC_011726	TCG	2	6	26909	26914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244918
511	NC_011726	GAT	2	6	26937	26942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244918
512	NC_011726	TGA	2	6	27125	27130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244918
513	NC_011726	ATTTAG	2	12	27233	27244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218244918
514	NC_011726	ATC	2	6	27274	27279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244919
515	NC_011726	TCT	2	6	27280	27285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244919
516	NC_011726	GAC	3	9	27326	27334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244919
517	NC_011726	GTTT	2	8	27397	27404	0 %	75 %	25 %	0 %	218244919
518	NC_011726	GAAA	2	8	27419	27426	75 %	0 %	25 %	0 %	218244919
519	NC_011726	ATT	2	6	27429	27434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244919
520	NC_011726	TAA	2	6	27465	27470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244919
521	NC_011726	GTT	2	6	27472	27477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244919
522	NC_011726	ATA	2	6	27513	27518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244919
523	NC_011726	CAA	2	6	27542	27547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244919
524	NC_011726	CTT	2	6	27575	27580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244919
525	NC_011726	T	6	6	27602	27607	0 %	100 %	0 %	0 %	218244919
526	NC_011726	CTT	2	6	27629	27634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244919
527	NC_011726	TCT	2	6	27640	27645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244919
528	NC_011726	ACG	2	6	27678	27683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244919
529	NC_011726	TAA	2	6	27692	27697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244919
530	NC_011726	CATT	2	8	27749	27756	25 %	50 %	0 %	25 %	218244919
531	NC_011726	ATC	2	6	27792	27797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244919
532	NC_011726	ATT	2	6	27912	27917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244919
533	NC_011726	TGA	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244919
534	NC_011726	TAA	2	6	27960	27965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244919
535	NC_011726	TCT	2	6	28060	28065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244919
536	NC_011726	AC	3	6	28066	28071	50 %	0 %	0 %	50 %	218244919
537	NC_011726	TTG	2	6	28130	28135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244919
538	NC_011726	AGC	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244919
539	NC_011726	TAA	2	6	28176	28181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244919
540	NC_011726	TC	3	6	28183	28188	0 %	50 %	0 %	50 %	218244919
541	NC_011726	TCC	2	6	28236	28241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244919
542	NC_011726	CATA	2	8	28298	28305	50 %	25 %	0 %	25 %	218244919
543	NC_011726	T	7	7	28339	28345	0 %	100 %	0 %	0 %	218244919
544	NC_011726	T	8	8	28440	28447	0 %	100 %	0 %	0 %	218244919
545	NC_011726	TTG	2	6	28455	28460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244919
546	NC_011726	TTG	2	6	28542	28547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244919
547	NC_011726	AGG	2	6	28578	28583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244919
548	NC_011726	TCA	2	6	29082	29087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244920
549	NC_011726	CGG	2	6	29135	29140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218244920
550	NC_011726	GTG	2	6	29144	29149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244920
551	NC_011726	GTC	2	6	29198	29203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244920
552	NC_011726	TTA	2	6	29249	29254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244920
553	NC_011726	CATTA	2	10	29296	29305	40 %	40 %	0 %	20 %	218244920
554	NC_011726	AAAATG	2	12	29306	29317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218244920
555	NC_011726	CAA	2	6	29384	29389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244920
556	NC_011726	TCT	2	6	29406	29411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244920
557	NC_011726	ATT	2	6	29546	29551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244920
558	NC_011726	AGA	2	6	29649	29654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244920
559	NC_011726	CGT	2	6	29711	29716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244920
560	NC_011726	AGC	2	6	29727	29732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244920
561	NC_011726	CTGTGA	2	12	29853	29864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218244920
562	NC_011726	GAA	2	6	30010	30015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244920
563	NC_011726	TAC	2	6	30041	30046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244920
564	NC_011726	ATT	2	6	30058	30063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244920
565	NC_011726	GTT	2	6	30085	30090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244920
566	NC_011726	TCG	2	6	30141	30146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244920
567	NC_011726	A	6	6	30152	30157	100 %	0 %	0 %	0 %	218244920
568	NC_011726	ATT	2	6	30240	30245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244920
569	NC_011726	GAT	2	6	30259	30264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244920
570	NC_011726	TCTTA	2	10	30366	30375	20 %	60 %	0 %	20 %	218244920
571	NC_011726	GTT	2	6	30447	30452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244920
572	NC_011726	GCA	2	6	30484	30489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244920
573	NC_011726	TTG	2	6	30492	30497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244920
574	NC_011726	TATTT	2	10	30607	30616	20 %	80 %	0 %	0 %	218244920
575	NC_011726	AT	3	6	30624	30629	50 %	50 %	0 %	0 %	218244920
576	NC_011726	CTG	2	6	30638	30643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244920
577	NC_011726	AAG	2	6	30665	30670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244920
578	NC_011726	A	7	7	30717	30723	100 %	0 %	0 %	0 %	218244920
579	NC_011726	TGA	2	6	30766	30771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244920
580	NC_011726	CT	3	6	30781	30786	0 %	50 %	0 %	50 %	218244921
581	NC_011726	CTA	2	6	30981	30986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244921
582	NC_011726	TGA	2	6	31054	31059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244921
583	NC_011726	TAA	3	9	31078	31086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244921
584	NC_011726	ATA	2	6	31104	31109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244921
585	NC_011726	A	6	6	31124	31129	100 %	0 %	0 %	0 %	218244921
586	NC_011726	TAAA	2	8	31156	31163	75 %	25 %	0 %	0 %	218244921
587	NC_011726	TGG	2	6	31391	31396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244922
588	NC_011726	T	8	8	31420	31427	0 %	100 %	0 %	0 %	218244922
589	NC_011726	T	7	7	31468	31474	0 %	100 %	0 %	0 %	218244922
590	NC_011726	TAT	2	6	31506	31511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
591	NC_011726	TAT	2	6	31537	31542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
592	NC_011726	AATT	2	8	31554	31561	50 %	50 %	0 %	0 %	218244922
593	NC_011726	ACT	2	6	31566	31571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244922
594	NC_011726	CGT	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244922
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596	NC_011726	AGA	2	6	31687	31692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244922
597	NC_011726	TTG	2	6	31703	31708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244922
598	NC_011726	TCCC	2	8	31716	31723	0 %	25 %	0 %	75 %	218244922
599	NC_011726	TCC	2	6	31765	31770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244922
600	NC_011726	TTTC	2	8	31872	31879	0 %	75 %	0 %	25 %	218244922
601	NC_011726	CGT	2	6	31910	31915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244922
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603	NC_011726	TTTAAG	2	12	31943	31954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218244922
604	NC_011726	T	6	6	32003	32008	0 %	100 %	0 %	0 %	218244922
605	NC_011726	GTTT	2	8	32014	32021	0 %	75 %	25 %	0 %	218244922
606	NC_011726	T	6	6	32084	32089	0 %	100 %	0 %	0 %	218244922
607	NC_011726	TTTA	2	8	32095	32102	25 %	75 %	0 %	0 %	218244922
608	NC_011726	ATTT	2	8	32111	32118	25 %	75 %	0 %	0 %	218244922
609	NC_011726	T	6	6	32161	32166	0 %	100 %	0 %	0 %	218244922
610	NC_011726	T	6	6	32188	32193	0 %	100 %	0 %	0 %	218244922
611	NC_011726	TAA	2	6	32296	32301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244922
612	NC_011726	TAT	2	6	32374	32379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
613	NC_011726	ATT	3	9	32401	32409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
614	NC_011726	TAC	2	6	32412	32417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244922
615	NC_011726	AT	3	6	32455	32460	50 %	50 %	0 %	0 %	218244922
616	NC_011726	ATT	2	6	32474	32479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
617	NC_011726	TCTTT	2	10	32518	32527	0 %	80 %	0 %	20 %	218244922
618	NC_011726	TTA	2	6	32570	32575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
619	NC_011726	CAA	2	6	32629	32634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244922
620	NC_011726	ATT	2	6	32728	32733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
621	NC_011726	ATT	2	6	32774	32779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244922
622	NC_011726	AGC	2	6	32782	32787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244922
623	NC_011726	TGG	3	9	32859	32867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244923
624	NC_011726	TGG	2	6	32871	32876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244923
625	NC_011726	TA	3	6	32879	32884	50 %	50 %	0 %	0 %	218244923
626	NC_011726	GTGG	2	8	32906	32913	0 %	25 %	75 %	0 %	218244923
627	NC_011726	ATT	2	6	33039	33044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244923
628	NC_011726	ATT	2	6	33143	33148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244923
629	NC_011726	CCT	2	6	33261	33266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244923
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