MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 81742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011726	T	8	8	306390	306397	0 %	100 %	0 %	0 %	218245197
5502	NC_011726	GTT	2	6	306398	306403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245197
5503	NC_011726	TTTC	2	8	306424	306431	0 %	75 %	0 %	25 %	218245197
5504	NC_011726	TTC	3	9	306453	306461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245197
5505	NC_011726	GTT	2	6	306467	306472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245197
5506	NC_011726	TCTT	2	8	306495	306502	0 %	75 %	0 %	25 %	218245197
5507	NC_011726	TGA	2	6	306514	306519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245197
5508	NC_011726	T	7	7	306577	306583	0 %	100 %	0 %	0 %	218245197
5509	NC_011726	TTGA	2	8	306585	306592	25 %	50 %	25 %	0 %	218245197
5510	NC_011726	TTC	2	6	306594	306599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245197
5511	NC_011726	ATC	2	6	306651	306656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245197
5512	NC_011726	TTC	2	6	306699	306704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245197
5513	NC_011726	TCT	2	6	306724	306729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245197
5514	NC_011726	AAT	2	6	306813	306818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245197
5515	NC_011726	AAT	2	6	306822	306827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245197
5516	NC_011726	TTA	2	6	306829	306834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245197
5517	NC_011726	GAG	2	6	306899	306904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245197
5518	NC_011726	TTC	2	6	306978	306983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245197
5519	NC_011726	AGTTA	2	10	307068	307077	40 %	40 %	20 %	0 %	218245198
5520	NC_011726	TTA	2	6	307158	307163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245198
5521	NC_011726	ATT	2	6	307180	307185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245198
5522	NC_011726	GCT	2	6	307196	307201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245198
5523	NC_011726	TTAA	2	8	307235	307242	50 %	50 %	0 %	0 %	218245198
5524	NC_011726	TCT	2	6	307362	307367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245198
5525	NC_011726	TTG	2	6	307390	307395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245198
5526	NC_011726	CTTTTT	2	12	307425	307436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218245198
5527	NC_011726	TC	3	6	307455	307460	0 %	50 %	0 %	50 %	218245198
5528	NC_011726	TTG	2	6	307465	307470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245198
5529	NC_011726	TTC	2	6	307480	307485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245198
5530	NC_011726	CTT	2	6	307542	307547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245198
5531	NC_011726	T	7	7	307554	307560	0 %	100 %	0 %	0 %	218245198
5532	NC_011726	TAAT	2	8	307563	307570	50 %	50 %	0 %	0 %	218245198
5533	NC_011726	TCT	2	6	307577	307582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245198
5534	NC_011726	TTC	2	6	307600	307605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245198
5535	NC_011726	T	6	6	307632	307637	0 %	100 %	0 %	0 %	218245198
5536	NC_011726	TGC	2	6	307664	307669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245198
5537	NC_011726	TGT	2	6	307676	307681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245198
5538	NC_011726	CTA	2	6	307737	307742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245198
5539	NC_011726	T	6	6	307774	307779	0 %	100 %	0 %	0 %	218245198
5540	NC_011726	TTC	2	6	307801	307806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245198
5541	NC_011726	TGT	2	6	307822	307827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245198
5542	NC_011726	AAT	2	6	307849	307854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245198
5543	NC_011726	CTT	2	6	307962	307967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245198
5544	NC_011726	TAG	2	6	308578	308583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245199
5545	NC_011726	CAT	2	6	308629	308634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245199
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5547	NC_011726	TATC	2	8	309497	309504	25 %	50 %	0 %	25 %	218245200
5548	NC_011726	TTG	2	6	309509	309514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245200
5549	NC_011726	CTT	2	6	309541	309546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245200
5550	NC_011726	AAG	2	6	309566	309571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245200
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5552	NC_011726	CAATC	2	10	309670	309679	40 %	20 %	0 %	40 %	218245200
5553	NC_011726	TCT	2	6	309747	309752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245200
5554	NC_011726	GTG	2	6	309753	309758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245200
5555	NC_011726	AAT	2	6	309788	309793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245200
5556	NC_011726	CAAA	2	8	309835	309842	75 %	0 %	0 %	25 %	218245200
5557	NC_011726	ATA	2	6	309854	309859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245200
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5576	NC_011726	A	8	8	310582	310589	100 %	0 %	0 %	0 %	218245200
5577	NC_011726	TTGA	2	8	310592	310599	25 %	50 %	25 %	0 %	218245200
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5579	NC_011726	ATTA	2	8	310649	310656	50 %	50 %	0 %	0 %	218245200
5580	NC_011726	CGAGTC	2	12	310677	310688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218245200
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5593	NC_011726	TATG	2	8	311475	311482	25 %	50 %	25 %	0 %	218245201
5594	NC_011726	CAAGGA	2	12	311488	311499	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218245201
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5603	NC_011726	GAA	2	6	312034	312039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245201
5604	NC_011726	A	6	6	312134	312139	100 %	0 %	0 %	0 %	218245201
5605	NC_011726	AAG	2	6	312149	312154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245201
5606	NC_011726	CCT	2	6	312158	312163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245201
5607	NC_011726	CGGA	2	8	312179	312186	25 %	0 %	50 %	25 %	218245201
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5610	NC_011726	AT	3	6	312288	312293	50 %	50 %	0 %	0 %	218245201
5611	NC_011726	GAT	2	6	312325	312330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245201
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5613	NC_011726	ATGG	2	8	312454	312461	25 %	25 %	50 %	0 %	218245201
5614	NC_011726	CTT	2	6	312464	312469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245201
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5620	NC_011726	GGTT	2	8	313054	313061	0 %	50 %	50 %	0 %	218245202
5621	NC_011726	TCC	2	6	313107	313112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245202
5622	NC_011726	TCAAC	2	10	313158	313167	40 %	20 %	0 %	40 %	218245202
5623	NC_011726	C	6	6	313249	313254	0 %	0 %	0 %	100 %	218245202
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5870	NC_011726	CGAT	2	8	330948	330955	25 %	25 %	25 %	25 %	218245215
5871	NC_011726	TGGT	2	8	330961	330968	0 %	50 %	50 %	0 %	218245215
5872	NC_011726	GGTT	2	8	330986	330993	0 %	50 %	50 %	0 %	218245215
5873	NC_011726	ATG	2	6	331118	331123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245215
5874	NC_011726	GTC	2	6	331124	331129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245215
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5884	NC_011726	TGA	2	6	331659	331664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245216
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5888	NC_011726	CAA	2	6	331828	331833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245216
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5891	NC_011726	A	6	6	331927	331932	100 %	0 %	0 %	0 %	218245216
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5988	NC_011726	GT	3	6	339032	339037	0 %	50 %	50 %	0 %	218245228
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5990	NC_011726	TTG	2	6	339115	339120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245228
5991	NC_011726	A	6	6	339145	339150	100 %	0 %	0 %	0 %	218245228
5992	NC_011726	CAA	2	6	339171	339176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245228
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