MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 81742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011726	CCG	2	6	253234	253239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245156
4502	NC_011726	AGCA	2	8	253492	253499	50 %	0 %	25 %	25 %	218245156
4503	NC_011726	AT	3	6	254052	254057	50 %	50 %	0 %	0 %	218245157
4504	NC_011726	AACAA	2	10	254150	254159	80 %	0 %	0 %	20 %	218245157
4505	NC_011726	ACTG	2	8	254285	254292	25 %	25 %	25 %	25 %	218245158
4506	NC_011726	TCC	2	6	254326	254331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245158
4507	NC_011726	GAC	2	6	254393	254398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245158
4508	NC_011726	AGA	2	6	254424	254429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245158
4509	NC_011726	TGA	2	6	254478	254483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245158
4510	NC_011726	TAT	2	6	254492	254497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245158
4511	NC_011726	AAT	2	6	254514	254519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245158
4512	NC_011726	TGAC	2	8	254602	254609	25 %	25 %	25 %	25 %	218245158
4513	NC_011726	A	7	7	254616	254622	100 %	0 %	0 %	0 %	218245158
4514	NC_011726	TTC	2	6	254749	254754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245159
4515	NC_011726	CTT	3	9	254814	254822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245159
4516	NC_011726	TCT	2	6	254825	254830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245159
4517	NC_011726	CAG	2	6	254874	254879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245159
4518	NC_011726	GGA	2	6	254885	254890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245159
4519	NC_011726	TTG	2	6	254893	254898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245159
4520	NC_011726	TTG	2	6	254902	254907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245159
4521	NC_011726	ATC	2	6	254914	254919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245159
4522	NC_011726	CTT	2	6	254934	254939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245159
4523	NC_011726	GAA	2	6	254958	254963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245159
4524	NC_011726	TCA	2	6	254969	254974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245159
4525	NC_011726	ATC	2	6	255317	255322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245160
4526	NC_011726	GCC	2	6	255373	255378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245160
4527	NC_011726	CAG	2	6	255381	255386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245160
4528	NC_011726	CCT	2	6	255477	255482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245160
4529	NC_011726	TGC	2	6	255584	255589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245160
4530	NC_011726	GAG	2	6	255650	255655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245160
4531	NC_011726	AAG	2	6	255671	255676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245160
4532	NC_011726	CTC	2	6	255699	255704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245160
4533	NC_011726	CAA	2	6	255721	255726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245160
4534	NC_011726	TAC	2	6	255727	255732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245160
4535	NC_011726	CCG	2	6	255745	255750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245160
4536	NC_011726	T	6	6	255780	255785	0 %	100 %	0 %	0 %	218245160
4537	NC_011726	CGG	2	6	255817	255822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245160
4538	NC_011726	ACGA	2	8	255854	255861	50 %	0 %	25 %	25 %	218245160
4539	NC_011726	TGG	3	9	255866	255874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245160
4540	NC_011726	CGA	2	6	255885	255890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245160
4541	NC_011726	GAA	2	6	255910	255915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245160
4542	NC_011726	TGG	2	6	255938	255943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245160
4543	NC_011726	CCG	2	6	255947	255952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245160
4544	NC_011726	GAG	2	6	255953	255958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245160
4545	NC_011726	CG	3	6	255985	255990	0 %	0 %	50 %	50 %	218245160
4546	NC_011726	TCCCCA	2	12	255993	256004	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	218245160
4547	NC_011726	TC	3	6	256089	256094	0 %	50 %	0 %	50 %	218245160
4548	NC_011726	AG	3	6	256116	256121	50 %	0 %	50 %	0 %	218245160
4549	NC_011726	ATT	2	6	256156	256161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245160
4550	NC_011726	AT	3	6	256230	256235	50 %	50 %	0 %	0 %	218245160
4551	NC_011726	AGG	2	6	256278	256283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245160
4552	NC_011726	G	6	6	256282	256287	0 %	0 %	100 %	0 %	218245160
4553	NC_011726	AAG	2	6	256367	256372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245160
4554	NC_011726	ACA	3	9	256416	256424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245160
4555	NC_011726	TTG	2	6	256445	256450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245160
4556	NC_011726	TAAT	2	8	256478	256485	50 %	50 %	0 %	0 %	218245160
4557	NC_011726	CCG	2	6	256511	256516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245160
4558	NC_011726	ATT	2	6	256521	256526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245160
4559	NC_011726	CAC	2	6	256542	256547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245160
4560	NC_011726	TCG	2	6	256548	256553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245160
4561	NC_011726	TGG	2	6	256643	256648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245160
4562	NC_011726	GTT	2	6	256702	256707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245160
4563	NC_011726	TCC	2	6	256790	256795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245160
4564	NC_011726	TAA	2	6	256803	256808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245160
4565	NC_011726	TATT	2	8	256868	256875	25 %	75 %	0 %	0 %	218245160
4566	NC_011726	GCA	2	6	256881	256886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245160
4567	NC_011726	ACA	2	6	256911	256916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245160
4568	NC_011726	TAGGG	2	10	256923	256932	20 %	20 %	60 %	0 %	218245160
4569	NC_011726	T	7	7	257371	257377	0 %	100 %	0 %	0 %	218245161
4570	NC_011726	ATT	2	6	257388	257393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245161
4571	NC_011726	TTTC	2	8	257403	257410	0 %	75 %	0 %	25 %	218245161
4572	NC_011726	GTT	2	6	257412	257417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245161
4573	NC_011726	GAAC	2	8	257433	257440	50 %	0 %	25 %	25 %	218245161
4574	NC_011726	GCT	2	6	257523	257528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245161
4575	NC_011726	TCG	2	6	257747	257752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245161
4576	NC_011726	T	6	6	257773	257778	0 %	100 %	0 %	0 %	218245161
4577	NC_011726	A	7	7	257805	257811	100 %	0 %	0 %	0 %	218245161
4578	NC_011726	AGC	2	6	257840	257845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245161
4579	NC_011726	TTGG	2	8	257887	257894	0 %	50 %	50 %	0 %	218245161
4580	NC_011726	TTG	2	6	257908	257913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245161
4581	NC_011726	TTA	2	6	258006	258011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245161
4582	NC_011726	TCT	2	6	258031	258036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245161
4583	NC_011726	AAAC	2	8	258039	258046	75 %	0 %	0 %	25 %	218245161
4584	NC_011726	A	6	6	258085	258090	100 %	0 %	0 %	0 %	218245161
4585	NC_011726	ATG	2	6	258133	258138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245161
4586	NC_011726	CTT	2	6	258157	258162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245161
4587	NC_011726	AGTT	2	8	258176	258183	25 %	50 %	25 %	0 %	218245161
4588	NC_011726	AGG	2	6	258224	258229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245161
4589	NC_011726	T	6	6	258337	258342	0 %	100 %	0 %	0 %	218245162
4590	NC_011726	ATC	2	6	258355	258360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245162
4591	NC_011726	T	6	6	258369	258374	0 %	100 %	0 %	0 %	218245162
4592	NC_011726	TTG	2	6	258442	258447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245162
4593	NC_011726	TAA	2	6	258480	258485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245162
4594	NC_011726	TTG	2	6	258535	258540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245162
4595	NC_011726	CGATCA	2	12	258629	258640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218245162
4596	NC_011726	AC	3	6	258654	258659	50 %	0 %	0 %	50 %	218245162
4597	NC_011726	GGC	2	6	258688	258693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245162
4598	NC_011726	TTG	2	6	258754	258759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245162
4599	NC_011726	CAG	2	6	258864	258869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245162
4600	NC_011726	TAAAT	2	10	258883	258892	60 %	40 %	0 %	0 %	218245162
4601	NC_011726	CCA	2	6	258897	258902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245162
4602	NC_011726	G	6	6	258930	258935	0 %	0 %	100 %	0 %	218245162
4603	NC_011726	CAT	2	6	259068	259073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245162
4604	NC_011726	TAA	2	6	259080	259085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245162
4605	NC_011726	GAT	2	6	259167	259172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245162
4606	NC_011726	GTT	2	6	259296	259301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245162
4607	NC_011726	GTA	2	6	259325	259330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245162
4608	NC_011726	TTG	2	6	259342	259347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245162
4609	NC_011726	GTC	2	6	259433	259438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245162
4610	NC_011726	ATC	2	6	259466	259471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245162
4611	NC_011726	TTG	2	6	259477	259482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245162
4612	NC_011726	AAT	2	6	259543	259548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245162
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4614	NC_011726	TAA	2	6	259596	259601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245162
4615	NC_011726	ATAA	2	8	259676	259683	75 %	25 %	0 %	0 %	218245162
4616	NC_011726	GGAG	2	8	259737	259744	25 %	0 %	75 %	0 %	218245162
4617	NC_011726	TAG	2	6	259767	259772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245162
4618	NC_011726	TAA	2	6	259783	259788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245162
4619	NC_011726	ATA	2	6	260176	260181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245163
4620	NC_011726	A	6	6	260181	260186	100 %	0 %	0 %	0 %	218245163
4621	NC_011726	TTG	2	6	260221	260226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245163
4622	NC_011726	T	6	6	260247	260252	0 %	100 %	0 %	0 %	218245163
4623	NC_011726	TTA	2	6	260296	260301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245163
4624	NC_011726	AATCA	2	10	260316	260325	60 %	20 %	0 %	20 %	218245163
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