MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	TAT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203934
2	NC_011723	AAC	2	6	687	692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203934
3	NC_011723	CAA	2	6	725	730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203934
4	NC_011723	GAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203934
5	NC_011723	CTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
6	NC_011723	TTG	2	6	858	863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203934
7	NC_011723	GAC	2	6	887	892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203934
8	NC_011723	TAC	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203934
9	NC_011723	TGC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203934
10	NC_011723	AAT	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203934
11	NC_011723	TCT	4	12	1108	1119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
12	NC_011723	AGC	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203934
13	NC_011723	TAT	2	6	1250	1255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203934
14	NC_011723	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
15	NC_011723	TTG	2	6	1410	1415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203934
16	NC_011723	TAA	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203934
17	NC_011723	ACA	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203935
18	NC_011723	AAC	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203935
19	NC_011723	CAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203935
20	NC_011723	TGA	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
21	NC_011723	TGT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
22	NC_011723	GTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
23	NC_011723	TCA	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
24	NC_011723	TGC	2	6	3963	3968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203936
25	NC_011723	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
26	NC_011723	ATG	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
27	NC_011723	TAA	2	6	3999	4004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203936
28	NC_011723	CAA	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
29	NC_011723	CTG	3	9	4052	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203936
30	NC_011723	ACA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
31	NC_011723	AAC	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
32	NC_011723	GTT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
33	NC_011723	TGA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
34	NC_011723	TCA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
35	NC_011723	AAC	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
36	NC_011723	CAA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
37	NC_011723	GCA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203936
38	NC_011723	CTT	2	6	4840	4845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203937
39	NC_011723	CTC	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203937
40	NC_011723	TGC	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203937
41	NC_011723	AAC	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203937
42	NC_011723	GAC	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203937
43	NC_011723	AAC	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203937
44	NC_011723	GAC	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203937
45	NC_011723	GAA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203937
46	NC_011723	TTA	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
47	NC_011723	ATT	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
48	NC_011723	AGT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203937
49	NC_011723	GGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203937
50	NC_011723	TAC	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203937
51	NC_011723	CGG	2	6	5532	5537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203937
52	NC_011723	ATC	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203937
53	NC_011723	GAT	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203937
54	NC_011723	TGC	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203937
55	NC_011723	ATT	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
56	NC_011723	AAG	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203937
57	NC_011723	ACA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203938
58	NC_011723	CGA	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203938
59	NC_011723	TCG	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203938
60	NC_011723	AGC	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203938
61	NC_011723	GGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203938
62	NC_011723	TGC	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203938
63	NC_011723	GCC	2	6	6408	6413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203938
64	NC_011723	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203938
65	NC_011723	TTG	2	6	6570	6575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203938
66	NC_011723	ACA	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203938
67	NC_011723	AAT	2	6	6681	6686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203938
68	NC_011723	CAA	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203939
69	NC_011723	TCT	2	6	7480	7485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
70	NC_011723	TAA	2	6	7588	7593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
71	NC_011723	TCC	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203939
72	NC_011723	TAA	2	6	7737	7742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
73	NC_011723	TTC	3	9	7750	7758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
74	NC_011723	TCT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
75	NC_011723	TTC	2	6	7895	7900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
76	NC_011723	CTT	2	6	7904	7909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
77	NC_011723	TAA	2	6	8029	8034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
78	NC_011723	AAT	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
79	NC_011723	TGC	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203939
80	NC_011723	CTA	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203939
81	NC_011723	ATA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
82	NC_011723	TCT	2	6	8313	8318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
83	NC_011723	AAG	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203940
84	NC_011723	GAG	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203940
85	NC_011723	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203940
86	NC_011723	ACC	2	6	8998	9003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203940
87	NC_011723	AAC	2	6	9004	9009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203940
88	NC_011723	CAT	2	6	9129	9134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203940
89	NC_011723	CTT	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203940
90	NC_011723	ATT	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203940
91	NC_011723	AGC	3	9	9193	9201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203940
92	NC_011723	CAG	2	6	9264	9269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203940
93	NC_011723	GGT	2	6	9280	9285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203940
94	NC_011723	AAC	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203940
95	NC_011723	TCT	2	6	9445	9450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203941
96	NC_011723	ATA	2	6	9466	9471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203941
97	NC_011723	AGC	3	9	9519	9527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203941
98	NC_011723	ATC	2	6	9618	9623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203941
99	NC_011723	ACG	2	6	9705	9710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203941
100	NC_011723	CCA	2	6	9727	9732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203941
101	NC_011723	TCC	2	6	10249	10254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203942
102	NC_011723	GTT	2	6	10527	10532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203942
103	NC_011723	ATT	2	6	10564	10569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203942
104	NC_011723	ACG	2	6	10648	10653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203942
105	NC_011723	TTA	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203942
106	NC_011723	AAT	2	6	10972	10977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203942
107	NC_011723	AGA	2	6	11141	11146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203943
108	NC_011723	ACT	2	6	11184	11189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203943
109	NC_011723	GCT	2	6	11229	11234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203943
110	NC_011723	AGG	2	6	11243	11248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203943
111	NC_011723	CAG	2	6	11391	11396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203943
112	NC_011723	AGA	2	6	11468	11473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203943
113	NC_011723	CTT	2	6	11498	11503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203943
114	NC_011723	GTA	2	6	11532	11537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203943
115	NC_011723	TCC	2	6	11635	11640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203943
116	NC_011723	TAC	2	6	11945	11950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203944
117	NC_011723	GAT	2	6	11968	11973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203944
118	NC_011723	CTG	2	6	12038	12043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203944
119	NC_011723	AAC	2	6	12111	12116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203944
120	NC_011723	AGG	2	6	12138	12143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203944
121	NC_011723	AAG	2	6	12251	12256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203944
122	NC_011723	GCA	2	6	12348	12353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203944
123	NC_011723	GAA	2	6	12364	12369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203944
124	NC_011723	CAG	2	6	12370	12375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203944
125	NC_011723	GAC	2	6	12668	12673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203945
126	NC_011723	GGC	2	6	12876	12881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203945
127	NC_011723	GCA	2	6	13102	13107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203945
128	NC_011723	CTT	2	6	13358	13363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203945
129	NC_011723	AGC	2	6	13401	13406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203945
130	NC_011723	ATG	2	6	14042	14047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203946
131	NC_011723	TGC	2	6	14281	14286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203946
132	NC_011723	TGT	2	6	14368	14373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203946
133	NC_011723	TAC	2	6	14485	14490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203946
134	NC_011723	ATG	2	6	14498	14503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203946
135	NC_011723	ACT	2	6	14694	14699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203947
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140	NC_011723	TCT	2	6	15895	15900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203947
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152	NC_011723	AAC	2	6	17187	17192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203950
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161	NC_011723	AAT	2	6	18240	18245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203951
162	NC_011723	CTT	2	6	18263	18268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203951
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378	NC_011723	TGA	2	6	40186	40191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203977
379	NC_011723	GTA	2	6	40209	40214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203977
380	NC_011723	ACG	2	6	40244	40249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203977
381	NC_011723	CAA	2	6	40325	40330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203977
382	NC_011723	ATA	2	6	40373	40378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203977

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.