MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	GT	3	6	610	615	0 %	50 %	50 %	0 %	218203846
2	NC_011721	CA	3	6	623	628	50 %	0 %	0 %	50 %	218203846
3	NC_011721	TC	3	6	1296	1301	0 %	50 %	0 %	50 %	218203847
4	NC_011721	AG	3	6	1351	1356	50 %	0 %	50 %	0 %	218203847
5	NC_011721	AG	3	6	2067	2072	50 %	0 %	50 %	0 %	218203848
6	NC_011721	TC	3	6	2469	2474	0 %	50 %	0 %	50 %	218203848
7	NC_011721	CT	3	6	5503	5508	0 %	50 %	0 %	50 %	218203850
8	NC_011721	TA	3	6	8988	8993	50 %	50 %	0 %	0 %	218203852
9	NC_011721	AT	3	6	10936	10941	50 %	50 %	0 %	0 %	218203855
10	NC_011721	TC	3	6	11473	11478	0 %	50 %	0 %	50 %	218203855
11	NC_011721	CA	3	6	11676	11681	50 %	0 %	0 %	50 %	218203856
12	NC_011721	TG	3	6	11839	11844	0 %	50 %	50 %	0 %	218203856
13	NC_011721	TG	3	6	11989	11994	0 %	50 %	50 %	0 %	218203856
14	NC_011721	AG	3	6	12552	12557	50 %	0 %	50 %	0 %	218203858
15	NC_011721	GT	3	6	12742	12747	0 %	50 %	50 %	0 %	218203858
16	NC_011721	AG	3	6	14246	14251	50 %	0 %	50 %	0 %	218203860
17	NC_011721	TA	3	6	14869	14874	50 %	50 %	0 %	0 %	218203860
18	NC_011721	GA	3	6	15384	15389	50 %	0 %	50 %	0 %	218203861
19	NC_011721	AG	4	8	16926	16933	50 %	0 %	50 %	0 %	218203864
20	NC_011721	TA	3	6	17026	17031	50 %	50 %	0 %	0 %	218203864
21	NC_011721	AT	3	6	17163	17168	50 %	50 %	0 %	0 %	218203864
22	NC_011721	TA	3	6	17795	17800	50 %	50 %	0 %	0 %	218203864
23	NC_011721	TC	3	6	20348	20353	0 %	50 %	0 %	50 %	218203869
24	NC_011721	TA	3	6	20537	20542	50 %	50 %	0 %	0 %	218203870
25	NC_011721	TA	3	6	20826	20831	50 %	50 %	0 %	0 %	218203870
26	NC_011721	CT	3	6	23166	23171	0 %	50 %	0 %	50 %	218203873
27	NC_011721	AT	3	6	23254	23259	50 %	50 %	0 %	0 %	218203873
28	NC_011721	AG	3	6	23362	23367	50 %	0 %	50 %	0 %	218203873
29	NC_011721	TA	3	6	23856	23861	50 %	50 %	0 %	0 %	218203874
30	NC_011721	TC	3	6	25588	25593	0 %	50 %	0 %	50 %	218203875
31	NC_011721	TC	3	6	25807	25812	0 %	50 %	0 %	50 %	218203875
32	NC_011721	AT	3	6	26293	26298	50 %	50 %	0 %	0 %	218203876
33	NC_011721	TC	3	6	27418	27423	0 %	50 %	0 %	50 %	218203878
34	NC_011721	AG	3	6	30742	30747	50 %	0 %	50 %	0 %	218203881
35	NC_011721	TA	3	6	31365	31370	50 %	50 %	0 %	0 %	218203881
36	NC_011721	AG	3	6	40735	40740	50 %	0 %	50 %	0 %	218203885
37	NC_011721	TC	3	6	41279	41284	0 %	50 %	0 %	50 %	218203886
38	NC_011721	CT	3	6	41885	41890	0 %	50 %	0 %	50 %	218203886
39	NC_011721	AG	3	6	41963	41968	50 %	0 %	50 %	0 %	218203886
40	NC_011721	AG	3	6	44490	44495	50 %	0 %	50 %	0 %	218203889
41	NC_011721	TA	3	6	45113	45118	50 %	50 %	0 %	0 %	218203889
42	NC_011721	AT	3	6	46410	46415	50 %	50 %	0 %	0 %	218203890
43	NC_011721	TC	3	6	46961	46966	0 %	50 %	0 %	50 %	218203890
44	NC_011721	GA	3	6	47685	47690	50 %	0 %	50 %	0 %	218203891
45	NC_011721	AC	3	6	49990	49995	50 %	0 %	0 %	50 %	218203894
46	NC_011721	AC	3	6	50359	50364	50 %	0 %	0 %	50 %	218203895
47	NC_011721	AC	3	6	50728	50733	50 %	0 %	0 %	50 %	218203896

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.