MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 11204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	ATA	2	6	40	45	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
2	NC_011565	ATA	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
3	NC_011565	AGA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
4	NC_011565	TTC	2	6	185	190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550358
5	NC_011565	ATT	3	9	238	246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550358
6	NC_011565	AAT	2	6	247	252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
7	NC_011565	AAG	2	6	268	273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
8	NC_011565	ACA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550358
9	NC_011565	ATA	2	6	398	403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
10	NC_011565	GGA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550358
11	NC_011565	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550358
12	NC_011565	CAG	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550358
13	NC_011565	ATA	2	6	787	792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
14	NC_011565	AGA	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
15	NC_011565	AGA	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
16	NC_011565	GAA	2	6	919	924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
17	NC_011565	AAT	2	6	1300	1305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
18	NC_011565	CAA	2	6	1331	1336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550358
19	NC_011565	TCT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550359
20	NC_011565	ATT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
21	NC_011565	TAT	3	9	1914	1922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
22	NC_011565	TCA	2	6	1963	1968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550359
23	NC_011565	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550359
24	NC_011565	TAA	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550359
25	NC_011565	TTA	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
26	NC_011565	TTC	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550359
27	NC_011565	AGA	2	6	2370	2375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
28	NC_011565	TAT	2	6	2530	2535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
29	NC_011565	TGA	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550359
30	NC_011565	GAA	2	6	2929	2934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
31	NC_011565	TAA	2	6	2961	2966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550359
32	NC_011565	TAT	2	6	3240	3245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
33	NC_011565	AAG	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
34	NC_011565	AGA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
35	NC_011565	ATT	2	6	3517	3522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
36	NC_011565	TTC	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
37	NC_011565	ATT	2	6	3548	3553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
38	NC_011565	ATC	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
39	NC_011565	TTC	2	6	3773	3778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
40	NC_011565	CAT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
41	NC_011565	AAT	2	6	3827	3832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
42	NC_011565	ACC	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550360
43	NC_011565	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550360
44	NC_011565	ATA	2	6	3919	3924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
45	NC_011565	CAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
46	NC_011565	CCA	2	6	4012	4017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550360
47	NC_011565	CTG	2	6	4066	4071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550360
48	NC_011565	TCA	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
49	NC_011565	TAC	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
50	NC_011565	TTC	2	6	4352	4357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
51	NC_011565	GAT	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550360
52	NC_011565	GGT	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550360
53	NC_011565	CTA	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
54	NC_011565	AAT	2	6	4515	4520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
55	NC_011565	TGA	2	6	4556	4561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550360
56	NC_011565	AAT	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
57	NC_011565	CCT	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550360
58	NC_011565	ATT	2	6	4712	4717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
59	NC_011565	TAA	2	6	4888	4893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
60	NC_011565	TAT	2	6	5002	5007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
61	NC_011565	TCT	2	6	5078	5083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
62	NC_011565	TAA	2	6	5125	5130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
63	NC_011565	TTG	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550360
64	NC_011565	AAT	2	6	5418	5423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
65	NC_011565	CTT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550361
66	NC_011565	GTT	2	6	5434	5439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550361
67	NC_011565	CAA	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550361
68	NC_011565	ATC	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550361
69	NC_011565	TTA	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550361
70	NC_011565	AAT	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
71	NC_011565	TCC	2	6	5700	5705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550361
72	NC_011565	ATC	2	6	5754	5759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550361
73	NC_011565	ATA	2	6	5942	5947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
74	NC_011565	AAT	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
75	NC_011565	ATC	2	6	5989	5994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550361
76	NC_011565	CTT	2	6	6026	6031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550361
77	NC_011565	TAA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
78	NC_011565	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550361
79	NC_011565	ATG	2	6	6354	6359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550361
80	NC_011565	AGA	2	6	6510	6515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550361
81	NC_011565	TAA	2	6	6519	6524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
82	NC_011565	AGC	2	6	6525	6530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550361
83	NC_011565	GAT	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550361
84	NC_011565	CAA	3	9	6656	6664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550361
85	NC_011565	CAA	2	6	6684	6689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550361
86	NC_011565	CAT	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550361
87	NC_011565	TAG	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550362
88	NC_011565	TTC	2	6	7061	7066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
89	NC_011565	TTA	2	6	7084	7089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550362
90	NC_011565	GAA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550362
91	NC_011565	AAC	2	6	7127	7132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550362
92	NC_011565	CAT	2	6	7241	7246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
93	NC_011565	TCT	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
94	NC_011565	TAA	2	6	7798	7803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
95	NC_011565	TCA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
96	NC_011565	GAC	2	6	8050	8055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550362
97	NC_011565	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550362
98	NC_011565	TCA	2	6	8085	8090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
99	NC_011565	TCA	2	6	8112	8117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
100	NC_011565	CAT	2	6	8131	8136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
101	NC_011565	ACC	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550362
102	NC_011565	AGC	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550362
103	NC_011565	TAC	2	6	8275	8280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
104	NC_011565	TCT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
105	NC_011565	ACT	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
106	NC_011565	TCT	2	6	8559	8564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
107	NC_011565	TAA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
108	NC_011565	ACG	2	6	8600	8605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550362
109	NC_011565	AAT	2	6	8732	8737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
110	NC_011565	TCC	3	9	8741	8749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550362
111	NC_011565	CAT	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
112	NC_011565	ATC	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
113	NC_011565	AAT	2	6	8933	8938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
114	NC_011565	CTT	2	6	9013	9018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
115	NC_011565	CAT	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
116	NC_011565	TCA	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
117	NC_011565	TAA	2	6	9166	9171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
118	NC_011565	TTC	2	6	9197	9202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
119	NC_011565	TCA	2	6	9294	9299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
120	NC_011565	ATC	2	6	9302	9307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
121	NC_011565	CCT	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550362
122	NC_011565	AAT	2	6	9432	9437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
123	NC_011565	TAA	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
124	NC_011565	AAT	2	6	9740	9745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
125	NC_011565	AAC	2	6	9791	9796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550362
126	NC_011565	ATA	2	6	9819	9824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
127	NC_011565	CAG	2	6	9841	9846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550362
128	NC_011565	CAA	3	9	9892	9900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550362
129	NC_011565	AAT	2	6	9916	9921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
130	NC_011565	CTT	2	6	10060	10065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
131	NC_011565	AAT	2	6	10142	10147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
132	NC_011565	AGC	2	6	10178	10183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550362
133	NC_011565	CCA	2	6	10191	10196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550362
134	NC_011565	AGA	2	6	10280	10285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550362
135	NC_011565	TTG	2	6	10334	10339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550362
136	NC_011565	CTC	2	6	10423	10428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550362
137	NC_011565	ATC	2	6	10460	10465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550362
138	NC_011565	TTC	3	9	10511	10519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550362
139	NC_011565	ACA	2	6	10566	10571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550362
140	NC_011565	ATA	2	6	10580	10585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
141	NC_011565	AAT	2	6	10586	10591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
142	NC_011565	CGA	2	6	10607	10612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550362
143	NC_011565	AAC	2	6	10676	10681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550362
144	NC_011565	ACA	2	6	10752	10757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550362
145	NC_011565	AAT	2	6	10833	10838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
146	NC_011565	CAC	2	6	10894	10899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550362
147	NC_011565	AGA	2	6	10922	10927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550362
148	NC_011565	TAA	2	6	10936	10941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550362
149	NC_011565	ATA	2	6	11083	11088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550363
150	NC_011565	ATA	3	9	11114	11122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550363
151	NC_011565	CAT	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
152	NC_011565	AAG	2	6	11243	11248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550363
153	NC_011565	CCA	2	6	11296	11301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550363
154	NC_011565	GCT	2	6	11324	11329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550363
155	NC_011565	ATC	2	6	11373	11378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
156	NC_011565	GAC	2	6	11726	11731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550363
157	NC_011565	CTT	2	6	11763	11768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
158	NC_011565	GAA	2	6	11792	11797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550363
159	NC_011565	TCA	2	6	11812	11817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
160	NC_011565	ACG	2	6	12215	12220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550363
161	NC_011565	GAA	2	6	12278	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550363
162	NC_011565	TTC	2	6	12438	12443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
163	NC_011565	TAC	2	6	12516	12521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
164	NC_011565	ATT	2	6	12532	12537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550363
165	NC_011565	TTC	2	6	12589	12594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
166	NC_011565	CTC	4	12	12765	12776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550363
167	NC_011565	TTG	2	6	12803	12808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550363
168	NC_011565	CAA	2	6	12812	12817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550363
169	NC_011565	ACC	2	6	12820	12825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550363
170	NC_011565	TCA	2	6	12935	12940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
171	NC_011565	CAT	2	6	12968	12973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
172	NC_011565	ATC	2	6	13098	13103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
173	NC_011565	CAT	3	9	13115	13123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
174	NC_011565	CTT	2	6	13163	13168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
175	NC_011565	CTA	2	6	13172	13177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
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239	NC_011565	ACC	2	6	18939	18944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550370
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242	NC_011565	GCA	2	6	19617	19622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550370
243	NC_011565	ACA	2	6	20761	20766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550371
244	NC_011565	TCA	2	6	20789	20794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550371
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248	NC_011565	AGC	2	6	21109	21114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550371
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252	NC_011565	AAT	2	6	21270	21275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550371
253	NC_011565	ATG	2	6	21295	21300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550371
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256	NC_011565	TTC	2	6	21407	21412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550371
257	NC_011565	GAA	2	6	21434	21439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550371
258	NC_011565	CTA	2	6	21612	21617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550371
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261	NC_011565	CTG	2	6	21843	21848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550371
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