MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	GAA	2	6	25	30	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
2	NC_011562	AAC	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550289
3	NC_011562	ATT	2	6	174	179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550289
4	NC_011562	TTC	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550289
5	NC_011562	TAG	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550289
6	NC_011562	AGT	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550289
7	NC_011562	AGA	2	6	654	659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
8	NC_011562	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
9	NC_011562	GTT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550289
10	NC_011562	TTC	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550289
11	NC_011562	AAG	2	6	991	996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
12	NC_011562	AGA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
13	NC_011562	CAG	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550289
14	NC_011562	ATC	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550289
15	NC_011562	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550289
16	NC_011562	GCT	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550289
17	NC_011562	CTA	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550289
18	NC_011562	TAG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550289
19	NC_011562	TAA	2	6	2039	2044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550290
20	NC_011562	TTC	2	6	2050	2055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550290
21	NC_011562	TCT	2	6	2059	2064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550290
22	NC_011562	AGA	2	6	2198	2203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550290
23	NC_011562	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550290
24	NC_011562	AAG	2	6	2472	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550290
25	NC_011562	TTC	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550291
26	NC_011562	GAA	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550291
27	NC_011562	TCA	2	6	2890	2895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550291
28	NC_011562	TTC	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550291
29	NC_011562	TGG	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550291
30	NC_011562	GAA	2	6	3117	3122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550291
31	NC_011562	AGG	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550291
32	NC_011562	TTG	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550292
33	NC_011562	TAT	2	6	3403	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
34	NC_011562	CTT	2	6	3495	3500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
35	NC_011562	GAT	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550292
36	NC_011562	TTA	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
37	NC_011562	TCT	2	6	3827	3832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
38	NC_011562	CAT	2	6	3912	3917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550292
39	NC_011562	TTC	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
40	NC_011562	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550292
41	NC_011562	TGG	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550292
42	NC_011562	TGT	2	6	4100	4105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550292
43	NC_011562	TTG	2	6	4233	4238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550292
44	NC_011562	CAA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550292
45	NC_011562	ATA	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550292
46	NC_011562	CTA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550292
47	NC_011562	AAG	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550292
48	NC_011562	TTC	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
49	NC_011562	ATT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
50	NC_011562	ATT	2	6	4784	4789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
51	NC_011562	GTA	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550292
52	NC_011562	CTC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550292
53	NC_011562	CAT	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550292
54	NC_011562	ATA	2	6	5188	5193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550292
55	NC_011562	ACA	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550292
56	NC_011562	TAT	2	6	5272	5277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
57	NC_011562	TCT	2	6	5364	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550293
58	NC_011562	TCT	3	9	5411	5419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550293
59	NC_011562	TTA	2	6	5451	5456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550293
60	NC_011562	TCT	2	6	5484	5489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550293
61	NC_011562	TCC	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550293
62	NC_011562	TAT	2	6	5707	5712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550293
63	NC_011562	GCA	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550293
64	NC_011562	ATC	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550293
65	NC_011562	ACA	2	6	6229	6234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550293
66	NC_011562	TGA	2	6	6482	6487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550294
67	NC_011562	GTA	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550294
68	NC_011562	CTT	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550294
69	NC_011562	CTT	2	6	6535	6540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550294
70	NC_011562	GTT	2	6	6630	6635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550294
71	NC_011562	GAT	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550294
72	NC_011562	GAA	2	6	6677	6682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550294
73	NC_011562	GTT	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550294
74	NC_011562	TAA	2	6	6731	6736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550295
75	NC_011562	TGC	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550295
76	NC_011562	GTT	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550295
77	NC_011562	ATG	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550295
78	NC_011562	CTA	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550295
79	NC_011562	AAG	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550295
80	NC_011562	GCA	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550295
81	NC_011562	TTC	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550295
82	NC_011562	CTC	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550295
83	NC_011562	TGT	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550295
84	NC_011562	TTC	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550295
85	NC_011562	TGC	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550296
86	NC_011562	TCT	2	6	7875	7880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
87	NC_011562	TAT	2	6	7990	7995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550296
88	NC_011562	CTC	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550296
89	NC_011562	ATC	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
90	NC_011562	ATA	2	6	8360	8365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550296
91	NC_011562	TTG	2	6	8373	8378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550296
92	NC_011562	CTA	2	6	8379	8384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
93	NC_011562	TAT	2	6	8385	8390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550296
94	NC_011562	TTC	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
95	NC_011562	ACT	2	6	8428	8433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
96	NC_011562	TTG	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550296
97	NC_011562	AGC	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550296
98	NC_011562	ATG	2	6	8585	8590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550296
99	NC_011562	CCA	2	6	8612	8617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550296
100	NC_011562	TCT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
101	NC_011562	TCT	2	6	8702	8707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
102	NC_011562	CAC	2	6	8715	8720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550296
103	NC_011562	GAC	2	6	8722	8727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550296
104	NC_011562	TTA	2	6	8828	8833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550296
105	NC_011562	GAA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550296
106	NC_011562	TCT	2	6	8884	8889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
107	NC_011562	TTC	2	6	8899	8904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
108	NC_011562	ATA	2	6	8917	8922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550296
109	NC_011562	CTA	2	6	8961	8966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
110	NC_011562	TCT	2	6	8981	8986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
111	NC_011562	GGC	2	6	9070	9075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212550296
112	NC_011562	TAT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550297
113	NC_011562	TTA	2	6	9259	9264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550297
114	NC_011562	ATT	2	6	9280	9285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550297
115	NC_011562	TGC	2	6	9306	9311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550297
116	NC_011562	TTG	2	6	9401	9406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550297
117	NC_011562	GCT	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550297
118	NC_011562	TCT	2	6	9493	9498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550297
119	NC_011562	TCT	2	6	9512	9517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550297
120	NC_011562	TTC	2	6	9535	9540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550297
121	NC_011562	TAC	2	6	9651	9656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550297
122	NC_011562	CAG	2	6	10116	10121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550297
123	NC_011562	GTT	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550297
124	NC_011562	TGG	2	6	10188	10193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550297
125	NC_011562	CCT	2	6	10208	10213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550297
126	NC_011562	ATC	2	6	10240	10245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550297
127	NC_011562	TCT	2	6	10279	10284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550297
128	NC_011562	GTT	2	6	10468	10473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550297
129	NC_011562	ATG	2	6	10489	10494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550297
130	NC_011562	TTG	2	6	10505	10510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550297
131	NC_011562	ATG	2	6	13033	13038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550298
132	NC_011562	TGA	2	6	13061	13066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550298
133	NC_011562	TCA	3	9	13198	13206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550298
134	NC_011562	ACG	2	6	13234	13239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550298
135	NC_011562	AAT	2	6	13266	13271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550298
136	NC_011562	GCA	2	6	13317	13322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550298
137	NC_011562	GAT	2	6	13326	13331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550298
138	NC_011562	GAA	2	6	13428	13433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550298
139	NC_011562	CAT	2	6	13475	13480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550298
140	NC_011562	AGA	2	6	13481	13486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550298
141	NC_011562	GAT	2	6	13511	13516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550298
142	NC_011562	ACA	2	6	13517	13522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550298
143	NC_011562	ACA	2	6	13573	13578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550298
144	NC_011562	TGT	2	6	13589	13594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550298
145	NC_011562	ATC	2	6	13601	13606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550298
146	NC_011562	AAG	2	6	13644	13649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550298
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149	NC_011562	AGA	2	6	13721	13726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550298
150	NC_011562	TTG	2	6	13749	13754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550298
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152	NC_011562	TAC	2	6	14953	14958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550299
153	NC_011562	AAG	2	6	14998	15003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550299
154	NC_011562	AAG	2	6	15023	15028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550299
155	NC_011562	TGA	2	6	15156	15161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550299
156	NC_011562	TGA	2	6	15244	15249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550299
157	NC_011562	AGC	2	6	16126	16131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550300
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159	NC_011562	GAG	2	6	16292	16297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550300
160	NC_011562	TCT	2	6	16331	16336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550300
161	NC_011562	TGG	2	6	16513	16518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550300
162	NC_011562	ATG	2	6	16646	16651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550300
163	NC_011562	AGC	2	6	16693	16698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550300
164	NC_011562	GGA	2	6	16754	16759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550300
165	NC_011562	TGA	2	6	16825	16830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550300
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167	NC_011562	GAA	2	6	16989	16994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550301
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169	NC_011562	TTA	2	6	17025	17030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550301
170	NC_011562	TTA	2	6	17037	17042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550301
171	NC_011562	AAT	2	6	17045	17050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550301
172	NC_011562	TGG	2	6	17150	17155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550301
173	NC_011562	CAG	2	6	17250	17255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550301
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251	NC_011562	ATG	2	6	26957	26962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550309
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253	NC_011562	AGC	2	6	27088	27093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550309
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255	NC_011562	CTT	2	6	27530	27535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550310
256	NC_011562	GTC	2	6	27551	27556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550310
257	NC_011562	ATG	3	9	27647	27655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550310
258	NC_011562	TGA	3	9	27660	27668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550310
259	NC_011562	CTT	2	6	27682	27687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550310
260	NC_011562	CTT	2	6	27718	27723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550310
261	NC_011562	TCT	2	6	28294	28299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550311
262	NC_011562	TCT	2	6	28303	28308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550311
263	NC_011562	TCC	2	6	28336	28341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550311
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.