MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	AGTA	2	8	904	911	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
2	NC_011561	ATTC	2	8	1246	1253	25 %	50 %	0 %	25 %	212550260
3	NC_011561	GAAA	2	8	1328	1335	75 %	0 %	25 %	0 %	212550260
4	NC_011561	TGAA	2	8	1430	1437	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
5	NC_011561	TGAA	2	8	1445	1452	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
6	NC_011561	GATG	2	8	1859	1866	25 %	25 %	50 %	0 %	212550261
7	NC_011561	AATT	2	8	2055	2062	50 %	50 %	0 %	0 %	212550261
8	NC_011561	TAAG	2	8	2709	2716	50 %	25 %	25 %	0 %	212550262
9	NC_011561	GGAA	2	8	3261	3268	50 %	0 %	50 %	0 %	212550263
10	NC_011561	GACA	2	8	3365	3372	50 %	0 %	25 %	25 %	212550263
11	NC_011561	GATG	2	8	3439	3446	25 %	25 %	50 %	0 %	212550263
12	NC_011561	AGAT	2	8	3816	3823	50 %	25 %	25 %	0 %	212550263
13	NC_011561	GAAT	2	8	3971	3978	50 %	25 %	25 %	0 %	212550263
14	NC_011561	AGGA	2	8	4373	4380	50 %	0 %	50 %	0 %	212550264
15	NC_011561	CTAC	2	8	4683	4690	25 %	25 %	0 %	50 %	212550265
16	NC_011561	GATT	2	8	4729	4736	25 %	50 %	25 %	0 %	212550265
17	NC_011561	ATGG	2	8	4758	4765	25 %	25 %	50 %	0 %	212550265
18	NC_011561	ATCT	2	8	4779	4786	25 %	50 %	0 %	25 %	212550265
19	NC_011561	TTTC	2	8	5027	5034	0 %	75 %	0 %	25 %	212550265
20	NC_011561	ATTA	2	8	5130	5137	50 %	50 %	0 %	0 %	212550265
21	NC_011561	TAGT	2	8	5164	5171	25 %	50 %	25 %	0 %	212550265
22	NC_011561	GATT	2	8	5765	5772	25 %	50 %	25 %	0 %	212550266
23	NC_011561	TCTA	2	8	6282	6289	25 %	50 %	0 %	25 %	212550266
24	NC_011561	TAAA	2	8	6468	6475	75 %	25 %	0 %	0 %	212550266
25	NC_011561	TTTC	2	8	7145	7152	0 %	75 %	0 %	25 %	212550266
26	NC_011561	CTTT	2	8	7157	7164	0 %	75 %	0 %	25 %	212550266
27	NC_011561	TATT	2	8	7193	7200	25 %	75 %	0 %	0 %	212550266
28	NC_011561	ATTT	2	8	8253	8260	25 %	75 %	0 %	0 %	212550268
29	NC_011561	AAGT	2	8	8437	8444	50 %	25 %	25 %	0 %	212550268
30	NC_011561	TCTT	2	8	8750	8757	0 %	75 %	0 %	25 %	212550268
31	NC_011561	TTTC	2	8	8985	8992	0 %	75 %	0 %	25 %	212550268
32	NC_011561	CTTT	2	8	9026	9033	0 %	75 %	0 %	25 %	212550268
33	NC_011561	CTCC	2	8	9253	9260	0 %	25 %	0 %	75 %	212550268
34	NC_011561	TTGC	2	8	9674	9681	0 %	50 %	25 %	25 %	212550268
35	NC_011561	TGTA	2	8	9774	9781	25 %	50 %	25 %	0 %	212550268
36	NC_011561	CAAC	2	8	10119	10126	50 %	0 %	0 %	50 %	212550268
37	NC_011561	ATAA	2	8	13701	13708	75 %	25 %	0 %	0 %	212550270
38	NC_011561	ATCC	2	8	13777	13784	25 %	25 %	0 %	50 %	212550270
39	NC_011561	CAAC	2	8	14466	14473	50 %	0 %	0 %	50 %	212550271
40	NC_011561	AAAG	2	8	14565	14572	75 %	0 %	25 %	0 %	212550271
41	NC_011561	TATC	2	8	15611	15618	25 %	50 %	0 %	25 %	212550272
42	NC_011561	CATC	2	8	16446	16453	25 %	25 %	0 %	50 %	212550273
43	NC_011561	TACT	2	8	16645	16652	25 %	50 %	0 %	25 %	212550273
44	NC_011561	TCCA	2	8	16861	16868	25 %	25 %	0 %	50 %	212550273
45	NC_011561	TATC	2	8	16939	16946	25 %	50 %	0 %	25 %	212550273
46	NC_011561	CAGT	2	8	17277	17284	25 %	25 %	25 %	25 %	212550273
47	NC_011561	TATT	2	8	18082	18089	25 %	75 %	0 %	0 %	212550273
48	NC_011561	ATGG	2	8	18707	18714	25 %	25 %	50 %	0 %	212550274
49	NC_011561	GCAT	2	8	20302	20309	25 %	25 %	25 %	25 %	212550275
50	NC_011561	GGAT	2	8	20492	20499	25 %	25 %	50 %	0 %	212550275
51	NC_011561	ATTG	2	8	21108	21115	25 %	50 %	25 %	0 %	212550276
52	NC_011561	CTTC	2	8	23426	23433	0 %	50 %	0 %	50 %	212550277
53	NC_011561	ATTT	2	8	23569	23576	25 %	75 %	0 %	0 %	212550277
54	NC_011561	AAAG	2	8	24866	24873	75 %	0 %	25 %	0 %	212550278
55	NC_011561	CTAT	2	8	25071	25078	25 %	50 %	0 %	25 %	212550278
56	NC_011561	GGAT	2	8	25104	25111	25 %	25 %	50 %	0 %	212550278
57	NC_011561	GTAT	2	8	27013	27020	25 %	50 %	25 %	0 %	212550280
58	NC_011561	AAAG	2	8	27261	27268	75 %	0 %	25 %	0 %	212550281
59	NC_011561	TCCT	2	8	27411	27418	0 %	50 %	0 %	50 %	212550281
60	NC_011561	AATG	2	8	27425	27432	50 %	25 %	25 %	0 %	212550281
61	NC_011561	AAAG	2	8	27495	27502	75 %	0 %	25 %	0 %	212550281
62	NC_011561	GTCA	2	8	27870	27877	25 %	25 %	25 %	25 %	212550282
63	NC_011561	AGAT	2	8	28369	28376	50 %	25 %	25 %	0 %	212550282
64	NC_011561	TCGT	2	8	28794	28801	0 %	50 %	25 %	25 %	212550282
65	NC_011561	AGTA	2	8	30324	30331	50 %	25 %	25 %	0 %	212550283
66	NC_011561	CAAA	2	8	30597	30604	75 %	0 %	0 %	25 %	212550283
67	NC_011561	TTTG	2	8	30745	30752	0 %	75 %	25 %	0 %	212550283
68	NC_011561	CAGA	2	8	30819	30826	50 %	0 %	25 %	25 %	212550283
69	NC_011561	GTTA	2	8	30923	30930	25 %	50 %	25 %	0 %	212550283
70	NC_011561	CTGT	2	8	31257	31264	0 %	50 %	25 %	25 %	212550284
71	NC_011561	AGGA	2	8	31267	31274	50 %	0 %	50 %	0 %	212550284
72	NC_011561	CTTT	2	8	32294	32301	0 %	75 %	0 %	25 %	212550285
73	NC_011561	ATTT	2	8	32621	32628	25 %	75 %	0 %	0 %	212550286
74	NC_011561	TGGA	2	8	32768	32775	25 %	25 %	50 %	0 %	212550286
75	NC_011561	TTTC	2	8	32881	32888	0 %	75 %	0 %	25 %	212550286
76	NC_011561	CCTT	2	8	35582	35589	0 %	50 %	0 %	50 %	212550287
77	NC_011561	ATTC	2	8	35624	35631	25 %	50 %	0 %	25 %	212550287
78	NC_011561	TACC	2	8	36209	36216	25 %	25 %	0 %	50 %	212550287
79	NC_011561	TGAA	2	8	36508	36515	50 %	25 %	25 %	0 %	212550287

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.