MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550260
2	NC_011561	ATT	2	6	315	320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
3	NC_011561	TAT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
4	NC_011561	TTA	2	6	445	450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
5	NC_011561	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
6	NC_011561	AGA	2	6	545	550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
7	NC_011561	AGA	2	6	570	575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
8	NC_011561	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550260
9	NC_011561	GAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
10	NC_011561	GTT	2	6	826	831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550260
11	NC_011561	TTC	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550260
12	NC_011561	AAG	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
13	NC_011561	AGA	2	6	1056	1061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
14	NC_011561	CAG	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550260
15	NC_011561	ATC	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550260
16	NC_011561	ATT	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
17	NC_011561	ATT	2	6	1160	1165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
18	NC_011561	GAA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
19	NC_011561	TAA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550260
20	NC_011561	GCT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550260
21	NC_011561	TAG	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550260
22	NC_011561	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550261
23	NC_011561	CTA	2	6	1752	1757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550261
24	NC_011561	TGG	2	6	1869	1874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550261
25	NC_011561	GAA	3	9	1905	1913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550261
26	NC_011561	TGA	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550261
27	NC_011561	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550262
28	NC_011561	ATG	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550262
29	NC_011561	TGA	2	6	2284	2289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550262
30	NC_011561	AAG	2	6	2425	2430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550262
31	NC_011561	AGA	2	6	2479	2484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550262
32	NC_011561	CAA	2	6	2604	2609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550262
33	NC_011561	CCA	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550262
34	NC_011561	TAA	2	6	3448	3453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550263
35	NC_011561	TTC	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550263
36	NC_011561	TCT	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550263
37	NC_011561	AGA	2	6	3607	3612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550263
38	NC_011561	GAA	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550263
39	NC_011561	AAG	2	6	3881	3886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550263
40	NC_011561	TTC	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550264
41	NC_011561	TGG	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550264
42	NC_011561	GAA	2	6	4414	4419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550264
43	NC_011561	TCT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550264
44	NC_011561	AGA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550264
45	NC_011561	TCT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
46	NC_011561	GTA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550265
47	NC_011561	GAT	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550265
48	NC_011561	TTG	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550265
49	NC_011561	TGA	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550265
50	NC_011561	TCT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
51	NC_011561	CCT	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550265
52	NC_011561	TTC	2	6	5421	5426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
53	NC_011561	TCT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
54	NC_011561	ATC	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550265
55	NC_011561	TGT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550265
56	NC_011561	TTC	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
57	NC_011561	TAT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550266
58	NC_011561	TCT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
59	NC_011561	CCT	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550266
60	NC_011561	TCT	2	6	5803	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
61	NC_011561	CAT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550266
62	NC_011561	TAT	2	6	5912	5917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550266
63	NC_011561	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550266
64	NC_011561	TGC	2	6	5967	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550266
65	NC_011561	CTC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550266
66	NC_011561	TCT	2	6	6096	6101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
67	NC_011561	ATT	2	6	6196	6201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550266
68	NC_011561	TCT	2	6	6220	6225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
69	NC_011561	GGT	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550266
70	NC_011561	CTT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
71	NC_011561	AAT	2	6	6500	6505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550266
72	NC_011561	CTA	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550266
73	NC_011561	ACG	2	6	6590	6595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550266
74	NC_011561	TCT	2	6	6642	6647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
75	NC_011561	TTG	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550266
76	NC_011561	TAT	3	9	7136	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550266
77	NC_011561	GAA	2	6	7544	7549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550267
78	NC_011561	ATG	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550267
79	NC_011561	GAA	2	6	7748	7753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550267
80	NC_011561	TGA	3	9	7783	7791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550267
81	NC_011561	AGA	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550267
82	NC_011561	GAA	2	6	7933	7938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550267
83	NC_011561	GAG	2	6	8031	8036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550267
84	NC_011561	TTC	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550268
85	NC_011561	TTA	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550268
86	NC_011561	TTC	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550268
87	NC_011561	ACA	2	6	8324	8329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550268
88	NC_011561	TAA	2	6	8330	8335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550268
89	NC_011561	TCT	2	6	8636	8641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550268
90	NC_011561	TCA	2	6	8693	8698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550268
91	NC_011561	AGA	2	6	8704	8709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550268
92	NC_011561	AGA	2	6	8728	8733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550268
93	NC_011561	CAG	2	6	8781	8786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550268
94	NC_011561	ATT	2	6	8795	8800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550268
95	NC_011561	CTT	2	6	8808	8813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550268
96	NC_011561	ACC	2	6	8830	8835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550268
97	NC_011561	GAA	2	6	8962	8967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550268
98	NC_011561	TAG	2	6	9010	9015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550268
99	NC_011561	GAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550268
100	NC_011561	CTT	2	6	9274	9279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550268
101	NC_011561	TAT	2	6	9333	9338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550268
102	NC_011561	GAT	2	6	9384	9389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550268
103	NC_011561	TTA	2	6	9414	9419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550268
104	NC_011561	CTC	2	6	9424	9429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550268
105	NC_011561	GTT	2	6	9592	9597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550268
106	NC_011561	ATA	2	6	9600	9605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550268
107	NC_011561	GTT	2	6	9625	9630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550268
108	NC_011561	AAT	2	6	9639	9644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550268
109	NC_011561	TAT	2	6	9651	9656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550268
110	NC_011561	TGT	2	6	9721	9726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550268
111	NC_011561	AAT	2	6	9786	9791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550268
112	NC_011561	GTT	2	6	9951	9956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550268
113	NC_011561	AGA	2	6	10406	10411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550268
114	NC_011561	ATG	2	6	10441	10446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550268
115	NC_011561	TCT	2	6	10476	10481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550268
116	NC_011561	GCA	2	6	10487	10492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550268
117	NC_011561	AGG	2	6	10588	10593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550268
118	NC_011561	CAT	2	6	10641	10646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550268
119	NC_011561	ATT	2	6	10735	10740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550268
120	NC_011561	TAT	2	6	11130	11135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550269
121	NC_011561	CTG	2	6	11144	11149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550269
122	NC_011561	TCT	2	6	11153	11158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550269
123	NC_011561	AGT	2	6	11186	11191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550269
124	NC_011561	TCT	2	6	11198	11203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550269
125	NC_011561	GAA	2	6	11218	11223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550269
126	NC_011561	CAT	3	9	11229	11237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550269
127	NC_011561	AAT	2	6	11257	11262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550269
128	NC_011561	TAC	2	6	11277	11282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550269
129	NC_011561	TTG	2	6	11367	11372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550269
130	NC_011561	TGT	2	6	11497	11502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550269
131	NC_011561	ATA	2	6	11506	11511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550269
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.