MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 35017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011528	CGC	2	6	216217	216222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217909
4002	NC_011528	T	7	7	216283	216289	0 %	100 %	0 %	0 %	212217909
4003	NC_011528	CGG	2	6	216329	216334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217909
4004	NC_011528	T	6	6	216348	216353	0 %	100 %	0 %	0 %	212217909
4005	NC_011528	CAG	2	6	216359	216364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217909
4006	NC_011528	TTA	2	6	216396	216401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217909
4007	NC_011528	T	6	6	216518	216523	0 %	100 %	0 %	0 %	212217909
4008	NC_011528	GC	4	8	216543	216550	0 %	0 %	50 %	50 %	212217909
4009	NC_011528	GAT	2	6	216611	216616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217909
4010	NC_011528	GCCG	2	8	216638	216645	0 %	0 %	50 %	50 %	212217909
4011	NC_011528	GCAC	2	8	216654	216661	25 %	0 %	25 %	50 %	212217909
4012	NC_011528	CGG	2	6	216672	216677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217909
4013	NC_011528	GT	3	6	216682	216687	0 %	50 %	50 %	0 %	212217909
4014	NC_011528	TGA	3	9	216694	216702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217909
4015	NC_011528	GCG	2	6	216718	216723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217909
4016	NC_011528	T	7	7	216758	216764	0 %	100 %	0 %	0 %	212217909
4017	NC_011528	AGG	2	6	216770	216775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217909
4018	NC_011528	CTA	2	6	216778	216783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217909
4019	NC_011528	TTTA	2	8	216796	216803	25 %	75 %	0 %	0 %	212217909
4020	NC_011528	GAA	2	6	216844	216849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217909
4021	NC_011528	CCG	2	6	216891	216896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217909
4022	NC_011528	A	6	6	216947	216952	100 %	0 %	0 %	0 %	212217909
4023	NC_011528	ATT	2	6	216978	216983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217909
4024	NC_011528	GT	3	6	217003	217008	0 %	50 %	50 %	0 %	212217909
4025	NC_011528	TGG	2	6	217036	217041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217909
4026	NC_011528	GTCG	2	8	217074	217081	0 %	25 %	50 %	25 %	212217909
4027	NC_011528	CGC	2	6	217102	217107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217909
4028	NC_011528	A	6	6	217116	217121	100 %	0 %	0 %	0 %	212217909
4029	NC_011528	GTG	3	9	217173	217181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217909
4030	NC_011528	CAA	2	6	217224	217229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217909
4031	NC_011528	CAGC	2	8	217330	217337	25 %	0 %	25 %	50 %	212217909
4032	NC_011528	CATGA	2	10	217347	217356	40 %	20 %	20 %	20 %	212217909
4033	NC_011528	GAAA	2	8	217396	217403	75 %	0 %	25 %	0 %	212217909
4034	NC_011528	TATT	2	8	217423	217430	25 %	75 %	0 %	0 %	212217909
4035	NC_011528	GGC	2	6	217460	217465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217909
4036	NC_011528	TAT	2	6	217507	217512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217909
4037	NC_011528	GCTG	2	8	217535	217542	0 %	25 %	50 %	25 %	212217909
4038	NC_011528	GTT	2	6	217566	217571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217909
4039	NC_011528	CCTCT	2	10	217672	217681	0 %	40 %	0 %	60 %	212217909
4040	NC_011528	AAAG	2	8	217728	217735	75 %	0 %	25 %	0 %	212217909
4041	NC_011528	A	7	7	217766	217772	100 %	0 %	0 %	0 %	212217909
4042	NC_011528	TTA	2	6	217793	217798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217910
4043	NC_011528	GCAA	2	8	217863	217870	50 %	0 %	25 %	25 %	212217910
4044	NC_011528	GCT	2	6	217884	217889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217910
4045	NC_011528	CCG	2	6	217938	217943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217910
4046	NC_011528	GGTG	2	8	217995	218002	0 %	25 %	75 %	0 %	212217910
4047	NC_011528	A	7	7	218116	218122	100 %	0 %	0 %	0 %	212217911
4048	NC_011528	TG	3	6	218186	218191	0 %	50 %	50 %	0 %	212217911
4049	NC_011528	TGA	2	6	218196	218201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217911
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4051	NC_011528	GTG	2	6	218281	218286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217911
4052	NC_011528	GGA	2	6	218299	218304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217911
4053	NC_011528	GCA	2	6	218364	218369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217911
4054	NC_011528	AAC	2	6	218477	218482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217911
4055	NC_011528	GTT	2	6	218559	218564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217911
4056	NC_011528	GTG	2	6	218591	218596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217911
4057	NC_011528	AGCG	2	8	218631	218638	25 %	0 %	50 %	25 %	212217911
4058	NC_011528	TTGT	2	8	218679	218686	0 %	75 %	25 %	0 %	212217911
4059	NC_011528	TTG	2	6	218695	218700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217911
4060	NC_011528	GAG	2	6	218728	218733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217911
4061	NC_011528	GGGT	2	8	218792	218799	0 %	25 %	75 %	0 %	212217911
4062	NC_011528	TCA	2	6	218841	218846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217911
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4065	NC_011528	TGT	2	6	218921	218926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217911
4066	NC_011528	A	6	6	219003	219008	100 %	0 %	0 %	0 %	212217911
4067	NC_011528	GAAT	2	8	219059	219066	50 %	25 %	25 %	0 %	212217911
4068	NC_011528	TG	3	6	219073	219078	0 %	50 %	50 %	0 %	212217911
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4071	NC_011528	AC	3	6	219192	219197	50 %	0 %	0 %	50 %	212217912
4072	NC_011528	TGA	2	6	219223	219228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217912
4073	NC_011528	TCA	2	6	219317	219322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217912
4074	NC_011528	TGG	2	6	219332	219337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217912
4075	NC_011528	CTTT	2	8	219377	219384	0 %	75 %	0 %	25 %	212217912
4076	NC_011528	TCA	2	6	219385	219390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217912
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4079	NC_011528	GGGT	2	8	219411	219418	0 %	25 %	75 %	0 %	212217912
4080	NC_011528	AGCGA	2	10	219432	219441	40 %	0 %	40 %	20 %	212217912
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4082	NC_011528	TCA	2	6	219463	219468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217912
4083	NC_011528	TCGCT	2	10	219482	219491	0 %	40 %	20 %	40 %	212217912
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4089	NC_011528	T	7	7	219855	219861	0 %	100 %	0 %	0 %	212217914
4090	NC_011528	T	6	6	219897	219902	0 %	100 %	0 %	0 %	212217913
4091	NC_011528	CTCG	2	8	219931	219938	0 %	25 %	25 %	50 %	212217913
4092	NC_011528	T	6	6	219939	219944	0 %	100 %	0 %	0 %	212217913
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4094	NC_011528	TGA	2	6	220089	220094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217915
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4096	NC_011528	A	6	6	220172	220177	100 %	0 %	0 %	0 %	212217915
4097	NC_011528	AAAG	2	8	220322	220329	75 %	0 %	25 %	0 %	212217915
4098	NC_011528	ATC	2	6	220339	220344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217915
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4103	NC_011528	TTGGC	2	10	220544	220553	0 %	40 %	40 %	20 %	212217915
4104	NC_011528	TAAA	2	8	220575	220582	75 %	25 %	0 %	0 %	212217915
4105	NC_011528	GATC	2	8	220613	220620	25 %	25 %	25 %	25 %	212217915
4106	NC_011528	GC	3	6	220622	220627	0 %	0 %	50 %	50 %	212217915
4107	NC_011528	CAATC	2	10	220641	220650	40 %	20 %	0 %	40 %	212217915
4108	NC_011528	GAA	2	6	220677	220682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217915
4109	NC_011528	TGC	2	6	220685	220690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217915
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4111	NC_011528	AAT	2	6	220812	220817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217915
4112	NC_011528	CGC	2	6	220865	220870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217915
4113	NC_011528	T	7	7	220936	220942	0 %	100 %	0 %	0 %	212217915
4114	NC_011528	TCA	2	6	220976	220981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217915
4115	NC_011528	ATAA	2	8	220982	220989	75 %	25 %	0 %	0 %	212217915
4116	NC_011528	GCG	2	6	220990	220995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217915
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4118	NC_011528	AATG	2	8	221481	221488	50 %	25 %	25 %	0 %	212217916
4119	NC_011528	AATG	2	8	221642	221649	50 %	25 %	25 %	0 %	212217916
4120	NC_011528	GGC	2	6	221781	221786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217916
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4122	NC_011528	A	6	6	221836	221841	100 %	0 %	0 %	0 %	212217916
4123	NC_011528	A	6	6	221859	221864	100 %	0 %	0 %	0 %	212217916
4124	NC_011528	GCA	2	6	221881	221886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217916
4125	NC_011528	TCATT	2	10	221920	221929	20 %	60 %	0 %	20 %	212217916
4126	NC_011528	CAT	2	6	222052	222057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217916
4127	NC_011528	A	6	6	222130	222135	100 %	0 %	0 %	0 %	212217916
4128	NC_011528	TTGG	2	8	222184	222191	0 %	50 %	50 %	0 %	212217916
4129	NC_011528	GTC	2	6	222224	222229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217916
4130	NC_011528	TTA	2	6	222274	222279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217916
4131	NC_011528	AGTC	2	8	222310	222317	25 %	25 %	25 %	25 %	212217916
4132	NC_011528	TTGT	2	8	222321	222328	0 %	75 %	25 %	0 %	212217916
4133	NC_011528	TAA	2	6	222348	222353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217916
4134	NC_011528	T	8	8	222363	222370	0 %	100 %	0 %	0 %	212217916
4135	NC_011528	CAG	2	6	222411	222416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217916
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4137	NC_011528	AAG	2	6	222609	222614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217916
4138	NC_011528	GAAA	2	8	222649	222656	75 %	0 %	25 %	0 %	212217916
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4140	NC_011528	AAG	2	6	222853	222858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217916
4141	NC_011528	TGAAA	2	10	222866	222875	60 %	20 %	20 %	0 %	212217916
4142	NC_011528	A	6	6	222917	222922	100 %	0 %	0 %	0 %	212217917
4143	NC_011528	AAT	2	6	222937	222942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217917
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4145	NC_011528	AAT	2	6	222970	222975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217917
4146	NC_011528	TCT	2	6	222989	222994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217917
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4151	NC_011528	GAA	2	6	223312	223317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217917
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4153	NC_011528	GAA	2	6	223458	223463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217917
4154	NC_011528	TTCAT	2	10	223490	223499	20 %	60 %	0 %	20 %	212217917
4155	NC_011528	A	8	8	223550	223557	100 %	0 %	0 %	0 %	212217917
4156	NC_011528	A	6	6	223570	223575	100 %	0 %	0 %	0 %	212217917
4157	NC_011528	CAA	2	6	223615	223620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217917
4158	NC_011528	GAA	2	6	223738	223743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217917
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4162	NC_011528	CTT	2	6	223883	223888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217917
4163	NC_011528	ATT	2	6	223920	223925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217917
4164	NC_011528	AG	3	6	223971	223976	50 %	0 %	50 %	0 %	212217917
4165	NC_011528	A	6	6	224057	224062	100 %	0 %	0 %	0 %	212217917
4166	NC_011528	ACG	2	6	224066	224071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217917
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4186	NC_011528	A	6	6	224777	224782	100 %	0 %	0 %	0 %	212217917
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4189	NC_011528	ATT	3	9	225184	225192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217918
4190	NC_011528	CGCTT	2	10	225203	225212	0 %	40 %	20 %	40 %	212217918
4191	NC_011528	A	6	6	225231	225236	100 %	0 %	0 %	0 %	212217918
4192	NC_011528	TTG	2	6	227875	227880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217919
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4199	NC_011528	CAT	2	6	228217	228222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217919
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4204	NC_011528	AGCG	2	8	228316	228323	25 %	0 %	50 %	25 %	212217919
4205	NC_011528	AAAG	2	8	228376	228383	75 %	0 %	25 %	0 %	212217919
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4219	NC_011528	GGCG	2	8	229143	229150	0 %	0 %	75 %	25 %	212217920
4220	NC_011528	GGT	2	6	229154	229159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217920
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4231	NC_011528	AGGGA	2	10	229570	229579	40 %	0 %	60 %	0 %	212217921
4232	NC_011528	ACG	2	6	229601	229606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217921
4233	NC_011528	GAT	2	6	229615	229620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217921
4234	NC_011528	A	6	6	229757	229762	100 %	0 %	0 %	0 %	212217921
4235	NC_011528	TCG	2	6	229822	229827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217921
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4238	NC_011528	CTT	2	6	230011	230016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217922
4239	NC_011528	GCC	2	6	230017	230022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217922
4240	NC_011528	TGC	2	6	230025	230030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217922
4241	NC_011528	TCC	2	6	230097	230102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217922
4242	NC_011528	CAAT	2	8	230160	230167	50 %	25 %	0 %	25 %	212217922
4243	NC_011528	TTTC	2	8	230227	230234	0 %	75 %	0 %	25 %	212217922
4244	NC_011528	TGAT	2	8	230249	230256	25 %	50 %	25 %	0 %	212217922
4245	NC_011528	GACA	2	8	230364	230371	50 %	0 %	25 %	25 %	212217923
4246	NC_011528	CTT	2	6	230384	230389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
4247	NC_011528	A	6	6	230473	230478	100 %	0 %	0 %	0 %	212217923
4248	NC_011528	CCT	2	6	230489	230494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217923
4249	NC_011528	TTC	2	6	230501	230506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
4250	NC_011528	TCTT	2	8	230521	230528	0 %	75 %	0 %	25 %	212217923
4251	NC_011528	TTATCC	2	12	230584	230595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212217923
4252	NC_011528	CCT	2	6	230624	230629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217923
4253	NC_011528	G	7	7	230646	230652	0 %	0 %	100 %	0 %	212217923
4254	NC_011528	TCA	2	6	230659	230664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217923
4255	NC_011528	T	7	7	230740	230746	0 %	100 %	0 %	0 %	212217923
4256	NC_011528	GCC	2	6	230832	230837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217923
4257	NC_011528	TCTCAA	2	12	230849	230860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217923
4258	NC_011528	GTT	2	6	230871	230876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217923
4259	NC_011528	TCA	2	6	230980	230985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217923
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4262	NC_011528	T	6	6	231157	231162	0 %	100 %	0 %	0 %	212217923
4263	NC_011528	T	6	6	231192	231197	0 %	100 %	0 %	0 %	212217923
4264	NC_011528	TTG	2	6	231225	231230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217923
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4270	NC_011528	GGC	2	6	231441	231446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217923
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4272	NC_011528	CTT	2	6	231476	231481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
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4274	NC_011528	TGC	2	6	231515	231520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217923
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4278	NC_011528	CTT	2	6	231655	231660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217924
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4280	NC_011528	T	6	6	231682	231687	0 %	100 %	0 %	0 %	212217924
4281	NC_011528	GGA	2	6	231688	231693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217924
4282	NC_011528	TCTT	2	8	231716	231723	0 %	75 %	0 %	25 %	212217924
4283	NC_011528	GCT	2	6	231814	231819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217924
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4289	NC_011528	T	6	6	232091	232096	0 %	100 %	0 %	0 %	212217924
4290	NC_011528	TA	3	6	232156	232161	50 %	50 %	0 %	0 %	212217924
4291	NC_011528	TTA	2	6	232185	232190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217924
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4299	NC_011528	G	9	9	232654	232662	0 %	0 %	100 %	0 %	212217924
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4372	NC_011528	A	6	6	236410	236415	100 %	0 %	0 %	0 %	212217931
4373	NC_011528	TAC	2	6	236970	236975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217932
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4377	NC_011528	TCG	2	6	237131	237136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217932
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4481	NC_011528	TTTG	2	8	242562	242569	0 %	75 %	25 %	0 %	212217940
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4491	NC_011528	CGC	2	6	243146	243151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217941
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4495	NC_011528	AAT	2	6	243592	243597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217941
4496	NC_011528	ATCG	2	8	243769	243776	25 %	25 %	25 %	25 %	212217941
4497	NC_011528	ATG	2	6	243787	243792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217941
4498	NC_011528	CAAT	2	8	243795	243802	50 %	25 %	0 %	25 %	212217941
4499	NC_011528	CGA	2	6	243870	243875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217941
4500	NC_011528	CGT	2	6	243885	243890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217941

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