MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 35017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011528	AAAG	2	8	188585	188592	75 %	0 %	25 %	0 %	212217881
3502	NC_011528	TAT	2	6	188622	188627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217881
3503	NC_011528	GAA	3	9	188681	188689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217881
3504	NC_011528	GAA	2	6	188694	188699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217881
3505	NC_011528	TCA	2	6	188711	188716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217881
3506	NC_011528	CT	4	8	188743	188750	0 %	50 %	0 %	50 %	212217881
3507	NC_011528	AAC	2	6	188761	188766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217881
3508	NC_011528	TCA	2	6	188817	188822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217881
3509	NC_011528	AAG	2	6	188855	188860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217881
3510	NC_011528	ATA	2	6	188929	188934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217881
3511	NC_011528	TTTC	2	8	188991	188998	0 %	75 %	0 %	25 %	212217881
3512	NC_011528	A	6	6	189021	189026	100 %	0 %	0 %	0 %	212217881
3513	NC_011528	CA	3	6	189057	189062	50 %	0 %	0 %	50 %	212217881
3514	NC_011528	AG	3	6	189078	189083	50 %	0 %	50 %	0 %	212217881
3515	NC_011528	CCA	2	6	189140	189145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217881
3516	NC_011528	CAGAA	2	10	189160	189169	60 %	0 %	20 %	20 %	212217881
3517	NC_011528	TAAA	2	8	189235	189242	75 %	25 %	0 %	0 %	212217881
3518	NC_011528	CTT	2	6	189265	189270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217881
3519	NC_011528	TAA	2	6	189279	189284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217881
3520	NC_011528	AG	3	6	189541	189546	50 %	0 %	50 %	0 %	212217882
3521	NC_011528	AAT	2	6	189609	189614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217882
3522	NC_011528	CGA	2	6	189623	189628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217882
3523	NC_011528	AAG	2	6	189652	189657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217882
3524	NC_011528	ATT	2	6	189683	189688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217882
3525	NC_011528	TTCT	2	8	189724	189731	0 %	75 %	0 %	25 %	212217882
3526	NC_011528	A	6	6	189783	189788	100 %	0 %	0 %	0 %	212217882
3527	NC_011528	TCT	2	6	189791	189796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217882
3528	NC_011528	GAA	2	6	189831	189836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217882
3529	NC_011528	A	6	6	189872	189877	100 %	0 %	0 %	0 %	212217882
3530	NC_011528	A	7	7	190011	190017	100 %	0 %	0 %	0 %	212217882
3531	NC_011528	CGG	2	6	190074	190079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217882
3532	NC_011528	GAA	2	6	190090	190095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217882
3533	NC_011528	A	6	6	190162	190167	100 %	0 %	0 %	0 %	212217882
3534	NC_011528	CCAC	2	8	190178	190185	25 %	0 %	0 %	75 %	212217882
3535	NC_011528	AGG	2	6	190319	190324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217882
3536	NC_011528	ATG	2	6	190422	190427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217883
3537	NC_011528	TCG	2	6	190451	190456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217883
3538	NC_011528	TCG	2	6	190497	190502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217883
3539	NC_011528	GGC	2	6	190517	190522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217883
3540	NC_011528	GGTA	2	8	190540	190547	25 %	25 %	50 %	0 %	212217883
3541	NC_011528	GCG	2	6	190608	190613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217883
3542	NC_011528	T	7	7	190663	190669	0 %	100 %	0 %	0 %	212217883
3543	NC_011528	TCG	2	6	190683	190688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217883
3544	NC_011528	AAC	2	6	190721	190726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217883
3545	NC_011528	AGC	2	6	190730	190735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217883
3546	NC_011528	GTTT	2	8	190749	190756	0 %	75 %	25 %	0 %	212217883
3547	NC_011528	T	6	6	190760	190765	0 %	100 %	0 %	0 %	212217883
3548	NC_011528	TGG	2	6	190782	190787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217883
3549	NC_011528	TCT	2	6	191014	191019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217884
3550	NC_011528	TCT	2	6	191038	191043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217884
3551	NC_011528	GACGGT	2	12	191109	191120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212217884
3552	NC_011528	ATG	2	6	191554	191559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217886
3553	NC_011528	ATC	2	6	191593	191598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217886
3554	NC_011528	GCT	2	6	191604	191609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217886
3555	NC_011528	CAA	2	6	191778	191783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217886
3556	NC_011528	GAT	2	6	191890	191895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217886
3557	NC_011528	T	6	6	191895	191900	0 %	100 %	0 %	0 %	212217886
3558	NC_011528	CCG	2	6	191918	191923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217886
3559	NC_011528	TTA	2	6	191945	191950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217886
3560	NC_011528	TCA	2	6	191954	191959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217886
3561	NC_011528	TCCA	2	8	191962	191969	25 %	25 %	0 %	50 %	212217886
3562	NC_011528	AAT	2	6	192105	192110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217886
3563	NC_011528	GCT	2	6	192179	192184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217886
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3565	NC_011528	T	6	6	192197	192202	0 %	100 %	0 %	0 %	212217886
3566	NC_011528	ATG	3	9	192206	192214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217886
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3569	NC_011528	GTA	2	6	192448	192453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217887
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3571	NC_011528	TAA	2	6	192570	192575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217887
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3573	NC_011528	CCGC	2	8	192620	192627	0 %	0 %	25 %	75 %	212217887
3574	NC_011528	GCA	2	6	192636	192641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217887
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3582	NC_011528	ATA	2	6	192873	192878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217887
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3585	NC_011528	AT	3	6	192942	192947	50 %	50 %	0 %	0 %	212217887
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3593	NC_011528	ATG	3	9	193377	193385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217888
3594	NC_011528	GCC	2	6	193395	193400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217888
3595	NC_011528	TG	3	6	193417	193422	0 %	50 %	50 %	0 %	212217888
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3597	NC_011528	AAT	2	6	193442	193447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217888
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3599	NC_011528	A	8	8	193472	193479	100 %	0 %	0 %	0 %	212217888
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3602	NC_011528	CCGC	2	8	193568	193575	0 %	0 %	25 %	75 %	212217888
3603	NC_011528	T	6	6	193608	193613	0 %	100 %	0 %	0 %	212217888
3604	NC_011528	TGA	2	6	193618	193623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217888
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3606	NC_011528	T	7	7	193799	193805	0 %	100 %	0 %	0 %	212217888
3607	NC_011528	AC	3	6	193855	193860	50 %	0 %	0 %	50 %	212217888
3608	NC_011528	AAGAT	2	10	193890	193899	60 %	20 %	20 %	0 %	212217888
3609	NC_011528	CAT	2	6	193989	193994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217888
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3611	NC_011528	ATA	2	6	194122	194127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217888
3612	NC_011528	ATAA	2	8	194149	194156	75 %	25 %	0 %	0 %	212217888
3613	NC_011528	AAG	2	6	194177	194182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217888
3614	NC_011528	ACCG	3	12	194280	194291	25 %	0 %	25 %	50 %	212217888
3615	NC_011528	ACC	2	6	194304	194309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217888
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3624	NC_011528	GT	3	6	194683	194688	0 %	50 %	50 %	0 %	212217888
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3995	NC_011528	ATTT	2	8	215936	215943	25 %	75 %	0 %	0 %	212217909
3996	NC_011528	CTGC	2	8	215949	215956	0 %	25 %	25 %	50 %	212217909
3997	NC_011528	TGA	2	6	215992	215997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217909
3998	NC_011528	CGA	2	6	216002	216007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217909
3999	NC_011528	TTA	2	6	216039	216044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217909
4000	NC_011528	GAA	2	6	216135	216140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217909

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