MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 35017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_011528	GTT	3	9	1231104	1231112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218814
21002	NC_011528	TAT	2	6	1231145	1231150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218814
21003	NC_011528	CAT	2	6	1231178	1231183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218814
21004	NC_011528	CGA	2	6	1231196	1231201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218814
21005	NC_011528	TTA	2	6	1231215	1231220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218814
21006	NC_011528	AAGC	2	8	1231254	1231261	50 %	0 %	25 %	25 %	212218814
21007	NC_011528	CG	3	6	1231283	1231288	0 %	0 %	50 %	50 %	212218814
21008	NC_011528	GCA	2	6	1231438	1231443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218814
21009	NC_011528	TTG	2	6	1231462	1231467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218814
21010	NC_011528	AAT	2	6	1231539	1231544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218814
21011	NC_011528	ATG	2	6	1231564	1231569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218814
21012	NC_011528	GGC	2	6	1231587	1231592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212218814
21013	NC_011528	CAA	2	6	1231602	1231607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218814
21014	NC_011528	GCTA	2	8	1231670	1231677	25 %	25 %	25 %	25 %	212218814
21015	NC_011528	TGC	2	6	1231696	1231701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218814
21016	NC_011528	GAA	2	6	1231709	1231714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218814
21017	NC_011528	TGTT	2	8	1231976	1231983	0 %	75 %	25 %	0 %	212218815
21018	NC_011528	TTTA	2	8	1231995	1232002	25 %	75 %	0 %	0 %	212218815
21019	NC_011528	T	6	6	1232032	1232037	0 %	100 %	0 %	0 %	212218815
21020	NC_011528	AGAAAA	2	12	1232038	1232049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212218815
21021	NC_011528	TGG	2	6	1232083	1232088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212218815
21022	NC_011528	GTT	2	6	1232089	1232094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218815
21023	NC_011528	GCA	2	6	1232108	1232113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218815
21024	NC_011528	T	7	7	1232138	1232144	0 %	100 %	0 %	0 %	212218815
21025	NC_011528	AATT	2	8	1232157	1232164	50 %	50 %	0 %	0 %	212218815
21026	NC_011528	CTC	2	6	1232165	1232170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212218815
21027	NC_011528	CT	3	6	1232186	1232191	0 %	50 %	0 %	50 %	212218815
21028	NC_011528	TCT	2	6	1232244	1232249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218815
21029	NC_011528	TAA	2	6	1232268	1232273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218815
21030	NC_011528	TGGGT	2	10	1232315	1232324	0 %	40 %	60 %	0 %	212218815
21031	NC_011528	TAT	2	6	1232446	1232451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218815
21032	NC_011528	CAT	2	6	1232481	1232486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218815
21033	NC_011528	GCT	2	6	1232500	1232505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218815
21034	NC_011528	CAA	2	6	1232521	1232526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218815
21035	NC_011528	TTC	2	6	1232537	1232542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218815
21036	NC_011528	AAG	2	6	1232555	1232560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218815
21037	NC_011528	ACA	2	6	1232565	1232570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218815
21038	NC_011528	A	6	6	1232609	1232614	100 %	0 %	0 %	0 %	212218815
21039	NC_011528	CAAA	2	8	1232615	1232622	75 %	0 %	0 %	25 %	212218815
21040	NC_011528	TTTA	2	8	1232663	1232670	25 %	75 %	0 %	0 %	212218815
21041	NC_011528	CCT	2	6	1232724	1232729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212218815
21042	NC_011528	GTT	2	6	1232794	1232799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218815
21043	NC_011528	CTTAC	2	10	1232840	1232849	20 %	40 %	0 %	40 %	212218815
21044	NC_011528	TGA	2	6	1232898	1232903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218815
21045	NC_011528	CAA	2	6	1232935	1232940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218815
21046	NC_011528	ATT	2	6	1233125	1233130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218815
21047	NC_011528	GTA	2	6	1233136	1233141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218815
21048	NC_011528	AAT	2	6	1233144	1233149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218815
21049	NC_011528	TTA	2	6	1233163	1233168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218815
21050	NC_011528	CTTT	2	8	1233171	1233178	0 %	75 %	0 %	25 %	212218815
21051	NC_011528	CAA	2	6	1233210	1233215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218816
21052	NC_011528	A	6	6	1233214	1233219	100 %	0 %	0 %	0 %	212218816
21053	NC_011528	GAA	2	6	1233221	1233226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218816
21054	NC_011528	TCA	2	6	1233247	1233252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218816
21055	NC_011528	TGCC	2	8	1233273	1233280	0 %	25 %	25 %	50 %	212218816
21056	NC_011528	GTT	2	6	1233287	1233292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218816
21057	NC_011528	TTTC	2	8	1233433	1233440	0 %	75 %	0 %	25 %	212218817
21058	NC_011528	CGCATA	2	12	1233456	1233467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212218817
21059	NC_011528	AGA	2	6	1233771	1233776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218817
21060	NC_011528	ATCT	2	8	1233789	1233796	25 %	50 %	0 %	25 %	212218817
21061	NC_011528	TTA	2	6	1233797	1233802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218817
21062	NC_011528	CGA	2	6	1234061	1234066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218818
21063	NC_011528	AG	3	6	1234103	1234108	50 %	0 %	50 %	0 %	212218818
21064	NC_011528	AAG	2	6	1234109	1234114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218818
21065	NC_011528	TAC	2	6	1234132	1234137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218818
21066	NC_011528	A	6	6	1234153	1234158	100 %	0 %	0 %	0 %	212218818
21067	NC_011528	AAG	2	6	1234181	1234186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218818
21068	NC_011528	ATT	3	9	1234265	1234273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218818
21069	NC_011528	GAT	2	6	1234285	1234290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218818
21070	NC_011528	T	7	7	1234337	1234343	0 %	100 %	0 %	0 %	212218818
21071	NC_011528	TGA	2	6	1234377	1234382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218818
21072	NC_011528	TGTT	2	8	1234409	1234416	0 %	75 %	25 %	0 %	212218818
21073	NC_011528	CGA	2	6	1234417	1234422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218818
21074	NC_011528	TA	3	6	1234424	1234429	50 %	50 %	0 %	0 %	212218818
21075	NC_011528	GGT	2	6	1234432	1234437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212218818
21076	NC_011528	TTTA	2	8	1234470	1234477	25 %	75 %	0 %	0 %	212218818
21077	NC_011528	GAG	2	6	1234480	1234485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212218818
21078	NC_011528	ATT	2	6	1234623	1234628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218818
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21082	NC_011528	AGAT	2	8	1234679	1234686	50 %	25 %	25 %	0 %	212218818
21083	NC_011528	A	7	7	1234764	1234770	100 %	0 %	0 %	0 %	212218818
21084	NC_011528	T	7	7	1234775	1234781	0 %	100 %	0 %	0 %	212218818
21085	NC_011528	ACA	2	6	1234807	1234812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218818
21086	NC_011528	ATT	2	6	1234830	1234835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218818
21087	NC_011528	CTA	2	6	1234850	1234855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218818
21088	NC_011528	ATT	2	6	1234865	1234870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218818
21089	NC_011528	T	6	6	1234900	1234905	0 %	100 %	0 %	0 %	212218818
21090	NC_011528	ATT	2	6	1234938	1234943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218818
21091	NC_011528	A	6	6	1234951	1234956	100 %	0 %	0 %	0 %	212218818
21092	NC_011528	TTG	2	6	1234964	1234969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218818
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21096	NC_011528	AGGA	2	8	1235114	1235121	50 %	0 %	50 %	0 %	212218818
21097	NC_011528	ATT	2	6	1235128	1235133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218818
21098	NC_011528	A	7	7	1235176	1235182	100 %	0 %	0 %	0 %	212218818
21099	NC_011528	AAG	2	6	1235228	1235233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218818
21100	NC_011528	GAA	2	6	1235254	1235259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218818
21101	NC_011528	A	6	6	1235287	1235292	100 %	0 %	0 %	0 %	212218818
21102	NC_011528	TAC	2	6	1235306	1235311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218818
21103	NC_011528	A	6	6	1236460	1236465	100 %	0 %	0 %	0 %	212218819
21104	NC_011528	TTG	2	6	1236524	1236529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218819
21105	NC_011528	TAAA	2	8	1236538	1236545	75 %	25 %	0 %	0 %	212218819
21106	NC_011528	A	6	6	1236693	1236698	100 %	0 %	0 %	0 %	212218819
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21109	NC_011528	A	6	6	1236862	1236867	100 %	0 %	0 %	0 %	212218819
21110	NC_011528	TCA	2	6	1236900	1236905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218819
21111	NC_011528	AAT	2	6	1236909	1236914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218819
21112	NC_011528	ATA	2	6	1236956	1236961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218819
21113	NC_011528	CGA	2	6	1236962	1236967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218819
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21115	NC_011528	TAA	2	6	1237039	1237044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218819
21116	NC_011528	AAT	2	6	1237107	1237112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218819
21117	NC_011528	C	6	6	1237189	1237194	0 %	0 %	0 %	100 %	212218819
21118	NC_011528	GCA	2	6	1237195	1237200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218819
21119	NC_011528	TTCA	2	8	1237205	1237212	25 %	50 %	0 %	25 %	212218819
21120	NC_011528	AATCG	2	10	1237236	1237245	40 %	20 %	20 %	20 %	212218819
21121	NC_011528	TGATA	2	10	1237448	1237457	40 %	40 %	20 %	0 %	212218819
21122	NC_011528	ATGA	2	8	1237601	1237608	50 %	25 %	25 %	0 %	212218820
21123	NC_011528	ACCC	2	8	1237618	1237625	25 %	0 %	0 %	75 %	212218820
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21127	NC_011528	TGC	2	6	1237719	1237724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218820
21128	NC_011528	GCG	2	6	1237734	1237739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212218820
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21131	NC_011528	A	7	7	1237916	1237922	100 %	0 %	0 %	0 %	212218820
21132	NC_011528	AGC	2	6	1237938	1237943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218820
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21144	NC_011528	A	7	7	1238446	1238452	100 %	0 %	0 %	0 %	212218820
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21230	NC_011528	TCG	2	6	1242553	1242558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218824
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21232	NC_011528	CA	3	6	1243119	1243124	50 %	0 %	0 %	50 %	212218825
21233	NC_011528	ATTC	2	8	1243131	1243138	25 %	50 %	0 %	25 %	212218825
21234	NC_011528	T	6	6	1243189	1243194	0 %	100 %	0 %	0 %	212218825
21235	NC_011528	CAA	2	6	1243269	1243274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218825
21236	NC_011528	CCT	2	6	1243277	1243282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212218825
21237	NC_011528	TGT	2	6	1243297	1243302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218825
21238	NC_011528	TGA	2	6	1243351	1243356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218825
21239	NC_011528	ACCC	2	8	1243398	1243405	25 %	0 %	0 %	75 %	212218825
21240	NC_011528	TCC	2	6	1243462	1243467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212218825
21241	NC_011528	CAA	2	6	1243497	1243502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218825
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21247	NC_011528	TGC	2	6	1243828	1243833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218825
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21251	NC_011528	TCA	2	6	1243996	1244001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218825
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21253	NC_011528	T	7	7	1244075	1244081	0 %	100 %	0 %	0 %	212218825
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21257	NC_011528	CGA	2	6	1244431	1244436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218826
21258	NC_011528	CAT	2	6	1244526	1244531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218826
21259	NC_011528	CCGC	2	8	1244588	1244595	0 %	0 %	25 %	75 %	212218826
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21262	NC_011528	CG	3	6	1244685	1244690	0 %	0 %	50 %	50 %	212218827
21263	NC_011528	AGC	2	6	1244716	1244721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218827
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21265	NC_011528	AG	3	6	1244800	1244805	50 %	0 %	50 %	0 %	212218827
21266	NC_011528	GAA	2	6	1244834	1244839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218827
21267	NC_011528	CGG	2	6	1244911	1244916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212218827
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21269	NC_011528	TTG	2	6	1245009	1245014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218827
21270	NC_011528	CG	3	6	1245029	1245034	0 %	0 %	50 %	50 %	212218827
21271	NC_011528	TAA	2	6	1245042	1245047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218827
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21273	NC_011528	ATC	2	6	1245060	1245065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218827
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21341	NC_011528	ATTA	2	8	1248323	1248330	50 %	50 %	0 %	0 %	212218830
21342	NC_011528	GAA	2	6	1248398	1248403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218830
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21349	NC_011528	T	8	8	1248698	1248705	0 %	100 %	0 %	0 %	212218830
21350	NC_011528	GAA	2	6	1248713	1248718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212218830
21351	NC_011528	ACG	2	6	1248849	1248854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218830
21352	NC_011528	TGGC	2	8	1248895	1248902	0 %	25 %	50 %	25 %	212218830
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21354	NC_011528	A	6	6	1248938	1248943	100 %	0 %	0 %	0 %	212218830
21355	NC_011528	A	6	6	1249046	1249051	100 %	0 %	0 %	0 %	212218830
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21473	NC_011528	TAA	2	6	1258673	1258678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218836
21474	NC_011528	AT	3	6	1258741	1258746	50 %	50 %	0 %	0 %	212218836
21475	NC_011528	TTC	2	6	1258754	1258759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218836
21476	NC_011528	CTT	2	6	1258786	1258791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218836
21477	NC_011528	GA	3	6	1258812	1258817	50 %	0 %	50 %	0 %	212218836
21478	NC_011528	CTT	3	9	1258849	1258857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218836
21479	NC_011528	TTG	2	6	1258868	1258873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218836
21480	NC_011528	ACG	2	6	1258886	1258891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218836
21481	NC_011528	CGA	2	6	1258896	1258901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218836
21482	NC_011528	CTG	2	6	1258910	1258915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218836
21483	NC_011528	TTG	2	6	1258919	1258924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218836
21484	NC_011528	CTA	2	6	1258951	1258956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218836
21485	NC_011528	AAT	2	6	1258965	1258970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218836
21486	NC_011528	CCA	2	6	1259068	1259073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212218837
21487	NC_011528	CTT	2	6	1259083	1259088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218837
21488	NC_011528	AAT	2	6	1259146	1259151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218837
21489	NC_011528	CGAC	2	8	1259235	1259242	25 %	0 %	25 %	50 %	212218837
21490	NC_011528	ATC	2	6	1259249	1259254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218837
21491	NC_011528	G	6	6	1259257	1259262	0 %	0 %	100 %	0 %	212218837
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21493	NC_011528	CAACG	2	10	1259321	1259330	40 %	0 %	20 %	40 %	212218837
21494	NC_011528	GC	3	6	1259397	1259402	0 %	0 %	50 %	50 %	212218837
21495	NC_011528	GCCG	2	8	1259411	1259418	0 %	0 %	50 %	50 %	212218837
21496	NC_011528	GCC	2	6	1259456	1259461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212218837
21497	NC_011528	TTG	2	6	1259492	1259497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218837
21498	NC_011528	CGAT	2	8	1259541	1259548	25 %	25 %	25 %	25 %	212218837
21499	NC_011528	T	6	6	1259562	1259567	0 %	100 %	0 %	0 %	212218837
21500	NC_011528	TGT	2	6	1259598	1259603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218837

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