MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 35017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011528	GCT	2	6	51959	51964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217739
1002	NC_011528	ATT	2	6	52046	52051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217740
1003	NC_011528	G	6	6	52111	52116	0 %	0 %	100 %	0 %	212217740
1004	NC_011528	ATT	2	6	52153	52158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217740
1005	NC_011528	ATT	2	6	52221	52226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217740
1006	NC_011528	GCAA	2	8	52282	52289	50 %	0 %	25 %	25 %	212217740
1007	NC_011528	TTA	2	6	52370	52375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217740
1008	NC_011528	AC	3	6	52380	52385	50 %	0 %	0 %	50 %	212217740
1009	NC_011528	ATT	2	6	52445	52450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217740
1010	NC_011528	ACG	2	6	52547	52552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217740
1011	NC_011528	A	6	6	52564	52569	100 %	0 %	0 %	0 %	212217740
1012	NC_011528	ATA	3	9	52587	52595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217740
1013	NC_011528	TAC	2	6	52610	52615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217740
1014	NC_011528	GCG	2	6	52662	52667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217740
1015	NC_011528	GCC	2	6	52670	52675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217740
1016	NC_011528	GAA	2	6	52685	52690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217740
1017	NC_011528	A	6	6	52757	52762	100 %	0 %	0 %	0 %	212217740
1018	NC_011528	GCTG	2	8	52768	52775	0 %	25 %	50 %	25 %	212217740
1019	NC_011528	TAT	2	6	52783	52788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217740
1020	NC_011528	ATGTCA	2	12	52851	52862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212217740
1021	NC_011528	A	6	6	52921	52926	100 %	0 %	0 %	0 %	212217740
1022	NC_011528	CAC	2	6	52927	52932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217740
1023	NC_011528	AGA	2	6	53041	53046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217740
1024	NC_011528	A	7	7	53078	53084	100 %	0 %	0 %	0 %	212217740
1025	NC_011528	GCA	2	6	53100	53105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217740
1026	NC_011528	ATC	2	6	53138	53143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217740
1027	NC_011528	TAA	2	6	53197	53202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217740
1028	NC_011528	TAG	2	6	53253	53258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217740
1029	NC_011528	CCA	2	6	53283	53288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217740
1030	NC_011528	CAA	2	6	53382	53387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217740
1031	NC_011528	AGAA	2	8	53388	53395	75 %	0 %	25 %	0 %	212217740
1032	NC_011528	GTG	2	6	53707	53712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217741
1033	NC_011528	CGT	2	6	53734	53739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217741
1034	NC_011528	TAT	2	6	53762	53767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217741
1035	NC_011528	GGA	2	6	53799	53804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217741
1036	NC_011528	ACG	2	6	53930	53935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217742
1037	NC_011528	T	6	6	53940	53945	0 %	100 %	0 %	0 %	212217742
1038	NC_011528	ACT	2	6	53948	53953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217742
1039	NC_011528	ACG	2	6	54009	54014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217742
1040	NC_011528	T	7	7	54190	54196	0 %	100 %	0 %	0 %	212217743
1041	NC_011528	AG	3	6	54208	54213	50 %	0 %	50 %	0 %	212217743
1042	NC_011528	GATC	2	8	54286	54293	25 %	25 %	25 %	25 %	212217743
1043	NC_011528	CGA	2	6	54314	54319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217743
1044	NC_011528	GAA	2	6	54344	54349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217743
1045	NC_011528	ATT	2	6	54380	54385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217743
1046	NC_011528	CGT	2	6	54418	54423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217743
1047	NC_011528	GC	3	6	54520	54525	0 %	0 %	50 %	50 %	212217743
1048	NC_011528	GGC	2	6	54553	54558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217743
1049	NC_011528	TTA	2	6	54605	54610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217743
1050	NC_011528	CA	3	6	54619	54624	50 %	0 %	0 %	50 %	212217743
1051	NC_011528	AAG	2	6	54639	54644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217743
1052	NC_011528	AGA	2	6	54676	54681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217743
1053	NC_011528	ATT	2	6	54819	54824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217743
1054	NC_011528	AGA	2	6	54835	54840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217743
1055	NC_011528	TAT	2	6	54843	54848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217743
1056	NC_011528	TTACC	2	10	54855	54864	20 %	40 %	0 %	40 %	212217743
1057	NC_011528	TAT	2	6	54914	54919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217743
1058	NC_011528	TAT	2	6	55061	55066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217743
1059	NC_011528	ATTTT	2	10	55095	55104	20 %	80 %	0 %	0 %	212217743
1060	NC_011528	A	6	6	55138	55143	100 %	0 %	0 %	0 %	212217743
1061	NC_011528	ATC	2	6	55146	55151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217743
1062	NC_011528	TCT	2	6	55155	55160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217743
1063	NC_011528	CGC	2	6	55212	55217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217743
1064	NC_011528	AAAG	2	8	55235	55242	75 %	0 %	25 %	0 %	212217743
1065	NC_011528	A	8	8	55247	55254	100 %	0 %	0 %	0 %	212217743
1066	NC_011528	TTG	2	6	55286	55291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217743
1067	NC_011528	CTA	2	6	55423	55428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217744
1068	NC_011528	ATA	2	6	55488	55493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217744
1069	NC_011528	AGC	2	6	55526	55531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217744
1070	NC_011528	ACC	2	6	55597	55602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217744
1071	NC_011528	AATAG	2	10	55665	55674	60 %	20 %	20 %	0 %	212217744
1072	NC_011528	TGA	2	6	55699	55704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217744
1073	NC_011528	AACG	2	8	55724	55731	50 %	0 %	25 %	25 %	212217744
1074	NC_011528	CAT	2	6	55766	55771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217744
1075	NC_011528	CCA	2	6	55818	55823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217744
1076	NC_011528	TTG	2	6	55975	55980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217745
1077	NC_011528	TTATT	2	10	56023	56032	20 %	80 %	0 %	0 %	212217745
1078	NC_011528	ACC	2	6	56034	56039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217745
1079	NC_011528	A	6	6	56119	56124	100 %	0 %	0 %	0 %	212217746
1080	NC_011528	A	6	6	56160	56165	100 %	0 %	0 %	0 %	212217746
1081	NC_011528	GTA	2	6	56208	56213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217746
1082	NC_011528	GTTT	2	8	56232	56239	0 %	75 %	25 %	0 %	212217746
1083	NC_011528	CCG	2	6	56268	56273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217746
1084	NC_011528	AAG	2	6	56319	56324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217746
1085	NC_011528	CCAT	2	8	56346	56353	25 %	25 %	0 %	50 %	212217746
1086	NC_011528	AGA	2	6	56419	56424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217746
1087	NC_011528	GGC	2	6	56491	56496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217746
1088	NC_011528	GAA	2	6	56528	56533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217746
1089	NC_011528	GGC	2	6	56561	56566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217746
1090	NC_011528	TTG	2	6	56615	56620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217746
1091	NC_011528	CTT	2	6	56621	56626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217746
1092	NC_011528	TAT	2	6	56659	56664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217746
1093	NC_011528	TTA	2	6	56679	56684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217746
1094	NC_011528	ATA	2	6	56736	56741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217746
1095	NC_011528	AC	3	6	56747	56752	50 %	0 %	0 %	50 %	212217746
1096	NC_011528	ATT	2	6	56796	56801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217746
1097	NC_011528	CG	3	6	56819	56824	0 %	0 %	50 %	50 %	212217746
1098	NC_011528	A	6	6	56855	56860	100 %	0 %	0 %	0 %	212217746
1099	NC_011528	CAA	2	6	56861	56866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217746
1100	NC_011528	ATG	2	6	56882	56887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217746
1101	NC_011528	A	6	6	56958	56963	100 %	0 %	0 %	0 %	212217746
1102	NC_011528	AATTTA	2	12	57003	57014	50 %	50 %	0 %	0 %	212217746
1103	NC_011528	AGTT	2	8	57097	57104	25 %	50 %	25 %	0 %	212217746
1104	NC_011528	AGA	2	6	57277	57282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217746
1105	NC_011528	AGCG	2	8	57314	57321	25 %	0 %	50 %	25 %	212217746
1106	NC_011528	CGG	2	6	57415	57420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217746
1107	NC_011528	GC	3	6	57428	57433	0 %	0 %	50 %	50 %	212217746
1108	NC_011528	TAA	2	6	57447	57452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217746
1109	NC_011528	GAC	2	6	57459	57464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217746
1110	NC_011528	CGA	2	6	57489	57494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217746
1111	NC_011528	TGA	2	6	57585	57590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217746
1112	NC_011528	AGG	2	6	57622	57627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217746
1113	NC_011528	A	6	6	57711	57716	100 %	0 %	0 %	0 %	212217747
1114	NC_011528	CGTA	2	8	57755	57762	25 %	25 %	25 %	25 %	212217747
1115	NC_011528	TAT	2	6	57783	57788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217747
1116	NC_011528	CAG	2	6	57810	57815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217747
1117	NC_011528	ACC	2	6	57818	57823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217747
1118	NC_011528	CTT	2	6	57980	57985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217747
1119	NC_011528	ACC	2	6	58005	58010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217747
1120	NC_011528	TTC	2	6	58084	58089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217747
1121	NC_011528	GAA	2	6	58155	58160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217747
1122	NC_011528	T	7	7	58188	58194	0 %	100 %	0 %	0 %	212217747
1123	NC_011528	CCT	2	6	58479	58484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217749
1124	NC_011528	CGA	2	6	58545	58550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217749
1125	NC_011528	TCA	2	6	58563	58568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217749
1126	NC_011528	TCT	2	6	58631	58636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217749
1127	NC_011528	ATC	2	6	58751	58756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217749
1128	NC_011528	TG	3	6	58759	58764	0 %	50 %	50 %	0 %	212217749
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1130	NC_011528	CTT	2	6	58791	58796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217749
1131	NC_011528	GGTTTT	2	12	58892	58903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217749
1132	NC_011528	T	6	6	58911	58916	0 %	100 %	0 %	0 %	212217749
1133	NC_011528	GC	3	6	58964	58969	0 %	0 %	50 %	50 %	212217749
1134	NC_011528	TCT	2	6	59021	59026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217749
1135	NC_011528	ATCG	2	8	59031	59038	25 %	25 %	25 %	25 %	212217749
1136	NC_011528	TTG	2	6	59042	59047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217749
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1143	NC_011528	AAG	2	6	59468	59473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217748
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1154	NC_011528	GAA	2	6	60127	60132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217748
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1169	NC_011528	TAAA	2	8	60488	60495	75 %	25 %	0 %	0 %	212217748
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1238	NC_011528	GGC	2	6	66023	66028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217754
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1241	NC_011528	ACG	2	6	66169	66174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217754
1242	NC_011528	GGTT	2	8	66207	66214	0 %	50 %	50 %	0 %	212217754
1243	NC_011528	CGA	2	6	66218	66223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217754
1244	NC_011528	TGT	2	6	66348	66353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217754
1245	NC_011528	CAT	2	6	66359	66364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217754
1246	NC_011528	GAA	3	9	66423	66431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217754
1247	NC_011528	GAG	2	6	66486	66491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217754
1248	NC_011528	A	7	7	66526	66532	100 %	0 %	0 %	0 %	212217754
1249	NC_011528	TCG	2	6	66599	66604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217754
1250	NC_011528	AACA	2	8	66637	66644	75 %	0 %	0 %	25 %	212217754
1251	NC_011528	CTTT	2	8	66702	66709	0 %	75 %	0 %	25 %	212217754
1252	NC_011528	CGG	2	6	66752	66757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217754
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1254	NC_011528	GCGT	2	8	66850	66857	0 %	25 %	50 %	25 %	212217754
1255	NC_011528	AATG	2	8	66878	66885	50 %	25 %	25 %	0 %	212217754
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