MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011527	T	6	6	232746	232751	0 %	100 %	0 %	0 %	212211893
4002	NC_011527	AAT	2	6	232761	232766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211893
4003	NC_011527	GAC	2	6	232773	232778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211893
4004	NC_011527	GAC	2	6	232789	232794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211893
4005	NC_011527	CAC	2	6	232817	232822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211893
4006	NC_011527	TG	3	6	233089	233094	0 %	50 %	50 %	0 %	212211894
4007	NC_011527	TAA	2	6	233169	233174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211894
4008	NC_011527	ATC	2	6	233200	233205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211894
4009	NC_011527	A	6	6	233299	233304	100 %	0 %	0 %	0 %	212211894
4010	NC_011527	A	6	6	233341	233346	100 %	0 %	0 %	0 %	212211894
4011	NC_011527	CAA	2	6	233431	233436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211894
4012	NC_011527	CGA	2	6	233499	233504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211894
4013	NC_011527	AAT	2	6	233855	233860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211895
4014	NC_011527	ATT	2	6	233868	233873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211895
4015	NC_011527	CTG	2	6	233988	233993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211895
4016	NC_011527	A	8	8	233994	234001	100 %	0 %	0 %	0 %	212211895
4017	NC_011527	A	6	6	234082	234087	100 %	0 %	0 %	0 %	212211895
4018	NC_011527	CGG	2	6	234090	234095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211895
4019	NC_011527	GTT	2	6	234103	234108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211895
4020	NC_011527	ACC	2	6	234110	234115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211895
4021	NC_011527	AGA	2	6	234124	234129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211895
4022	NC_011527	GTG	2	6	234145	234150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211895
4023	NC_011527	G	7	7	234172	234178	0 %	0 %	100 %	0 %	212211895
4024	NC_011527	ATT	2	6	234229	234234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211895
4025	NC_011527	GAA	2	6	234275	234280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211895
4026	NC_011527	AT	3	6	234364	234369	50 %	50 %	0 %	0 %	212211895
4027	NC_011527	GCA	2	6	234370	234375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211895
4028	NC_011527	GCG	2	6	234411	234416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211895
4029	NC_011527	A	7	7	234439	234445	100 %	0 %	0 %	0 %	212211895
4030	NC_011527	TGA	2	6	234468	234473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211895
4031	NC_011527	TGC	2	6	234522	234527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211896
4032	NC_011527	AATG	2	8	234564	234571	50 %	25 %	25 %	0 %	212211896
4033	NC_011527	GAT	2	6	234656	234661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211896
4034	NC_011527	GATG	2	8	234727	234734	25 %	25 %	50 %	0 %	212211896
4035	NC_011527	ATT	2	6	234753	234758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211896
4036	NC_011527	T	6	6	234757	234762	0 %	100 %	0 %	0 %	212211896
4037	NC_011527	TGA	2	6	234804	234809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211896
4038	NC_011527	CAAA	2	8	234812	234819	75 %	0 %	0 %	25 %	212211896
4039	NC_011527	GCG	2	6	234930	234935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211896
4040	NC_011527	TTC	2	6	234989	234994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211896
4041	NC_011527	TTC	2	6	235071	235076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211897
4042	NC_011527	ATGA	2	8	235085	235092	50 %	25 %	25 %	0 %	212211897
4043	NC_011527	CAC	2	6	235107	235112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211897
4044	NC_011527	A	7	7	235113	235119	100 %	0 %	0 %	0 %	212211897
4045	NC_011527	CCCG	2	8	235126	235133	0 %	0 %	25 %	75 %	212211897
4046	NC_011527	ATT	2	6	235149	235154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211897
4047	NC_011527	T	7	7	235229	235235	0 %	100 %	0 %	0 %	212211897
4048	NC_011527	ATAAAG	2	12	235325	235336	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212211897
4049	NC_011527	AATTA	2	10	235434	235443	60 %	40 %	0 %	0 %	212211897
4050	NC_011527	ATTC	2	8	235472	235479	25 %	50 %	0 %	25 %	212211897
4051	NC_011527	GTG	2	6	235578	235583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211897
4052	NC_011527	CTT	2	6	235637	235642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211897
4053	NC_011527	T	7	7	235688	235694	0 %	100 %	0 %	0 %	212211897
4054	NC_011527	TCGC	2	8	235702	235709	0 %	25 %	25 %	50 %	212211897
4055	NC_011527	T	6	6	235766	235771	0 %	100 %	0 %	0 %	212211898
4056	NC_011527	T	6	6	235783	235788	0 %	100 %	0 %	0 %	212211898
4057	NC_011527	TCA	2	6	235801	235806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211898
4058	NC_011527	GTG	2	6	235844	235849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211898
4059	NC_011527	TCA	2	6	235855	235860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211898
4060	NC_011527	CGA	2	6	235863	235868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211898
4061	NC_011527	T	6	6	235874	235879	0 %	100 %	0 %	0 %	212211898
4062	NC_011527	CGC	2	6	235895	235900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211898
4063	NC_011527	GCT	2	6	235963	235968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211898
4064	NC_011527	GCT	2	6	236002	236007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211898
4065	NC_011527	ATTG	2	8	236011	236018	25 %	50 %	25 %	0 %	212211898
4066	NC_011527	CCG	2	6	236098	236103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211898
4067	NC_011527	TCA	2	6	236187	236192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211898
4068	NC_011527	TAAA	2	8	236221	236228	75 %	25 %	0 %	0 %	212211898
4069	NC_011527	ATC	2	6	236252	236257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211898
4070	NC_011527	TTG	2	6	236267	236272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211898
4071	NC_011527	CGA	2	6	236329	236334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211898
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4073	NC_011527	CG	3	6	236394	236399	0 %	0 %	50 %	50 %	212211898
4074	NC_011527	ACA	2	6	236445	236450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211898
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4076	NC_011527	AAT	2	6	236468	236473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211898
4077	NC_011527	CAT	2	6	236507	236512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211898
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4079	NC_011527	CCG	2	6	236707	236712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211899
4080	NC_011527	TAA	2	6	236793	236798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211899
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4091	NC_011527	A	6	6	237385	237390	100 %	0 %	0 %	0 %	212211899
4092	NC_011527	GAA	2	6	237409	237414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211899
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4103	NC_011527	TTA	2	6	238046	238051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211900
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4105	NC_011527	TTTA	2	8	238228	238235	25 %	75 %	0 %	0 %	212211900
4106	NC_011527	GTG	2	6	238275	238280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211900
4107	NC_011527	ATT	2	6	238316	238321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211900
4108	NC_011527	AGAA	2	8	238402	238409	75 %	0 %	25 %	0 %	212211900
4109	NC_011527	T	6	6	238450	238455	0 %	100 %	0 %	0 %	212211900
4110	NC_011527	ATT	2	6	238572	238577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211900
4111	NC_011527	GC	3	6	238650	238655	0 %	0 %	50 %	50 %	212211900
4112	NC_011527	A	6	6	238731	238736	100 %	0 %	0 %	0 %	212211900
4113	NC_011527	ATC	2	6	238761	238766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211900
4114	NC_011527	ATT	2	6	238771	238776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211900
4115	NC_011527	ATGA	2	8	239323	239330	50 %	25 %	25 %	0 %	212211901
4116	NC_011527	CGAC	2	8	239423	239430	25 %	0 %	25 %	50 %	212211901
4117	NC_011527	GGC	2	6	239551	239556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211901
4118	NC_011527	CATCCC	2	12	239599	239610	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	212211901
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4121	NC_011527	CG	3	6	239734	239739	0 %	0 %	50 %	50 %	212211901
4122	NC_011527	AATT	2	8	239774	239781	50 %	50 %	0 %	0 %	212211901
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4124	NC_011527	A	6	6	239863	239868	100 %	0 %	0 %	0 %	212211901
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4245	NC_011527	TTA	2	6	245159	245164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211909
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4248	NC_011527	GC	3	6	245293	245298	0 %	0 %	50 %	50 %	212211909
4249	NC_011527	CCTG	2	8	245309	245316	0 %	25 %	25 %	50 %	212211909
4250	NC_011527	T	7	7	245324	245330	0 %	100 %	0 %	0 %	212211909
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4256	NC_011527	ATG	2	6	245513	245518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211909
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4264	NC_011527	CG	3	6	246103	246108	0 %	0 %	50 %	50 %	212211911
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4279	NC_011527	TCAT	2	8	246856	246863	25 %	50 %	0 %	25 %	212211911
4280	NC_011527	CAT	2	6	246911	246916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211911
4281	NC_011527	GCTA	2	8	246924	246931	25 %	25 %	25 %	25 %	212211911
4282	NC_011527	GCG	2	6	246952	246957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211911
4283	NC_011527	AAAG	2	8	246962	246969	75 %	0 %	25 %	0 %	212211911
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4362	NC_011527	AAC	2	6	251721	251726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211916
4363	NC_011527	ACCCT	2	10	251729	251738	20 %	20 %	0 %	60 %	212211916
4364	NC_011527	TCT	2	6	251756	251761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211916
4365	NC_011527	GAC	2	6	251797	251802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
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4369	NC_011527	ACG	2	6	251979	251984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
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4371	NC_011527	CGA	2	6	252073	252078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
4372	NC_011527	CGG	2	6	252107	252112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211916
4373	NC_011527	ATC	2	6	252127	252132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211916
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4375	NC_011527	TCA	2	6	252161	252166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211916
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4377	NC_011527	AGC	2	6	252251	252256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
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4379	NC_011527	T	6	6	252276	252281	0 %	100 %	0 %	0 %	212211916
4380	NC_011527	TGC	2	6	252310	252315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211916
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4384	NC_011527	CGC	2	6	252515	252520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211916
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4403	NC_011527	A	6	6	253528	253533	100 %	0 %	0 %	0 %	212211919
4404	NC_011527	T	6	6	253567	253572	0 %	100 %	0 %	0 %	212211920
4405	NC_011527	AGCA	2	8	253615	253622	50 %	0 %	25 %	25 %	212211920
4406	NC_011527	AATA	2	8	253679	253686	75 %	25 %	0 %	0 %	212211920
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4463	NC_011527	CTTT	2	8	256306	256313	0 %	75 %	0 %	25 %	212211922
4464	NC_011527	TCA	2	6	256314	256319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211922
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4476	NC_011527	T	6	6	256693	256698	0 %	100 %	0 %	0 %	212211923
4477	NC_011527	CT	3	6	256728	256733	0 %	50 %	0 %	50 %	212211924
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4482	NC_011527	TTG	2	6	256941	256946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211924
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4486	NC_011527	TATC	2	8	257120	257127	25 %	50 %	0 %	25 %	212211925
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4493	NC_011527	TAT	2	6	257418	257423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211926
4494	NC_011527	CGC	2	6	257436	257441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211926
4495	NC_011527	CAT	2	6	257460	257465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211926
4496	NC_011527	TTTA	2	8	257585	257592	25 %	75 %	0 %	0 %	212211926
4497	NC_011527	TTA	2	6	257603	257608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211926
4498	NC_011527	AAG	2	6	257630	257635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211926
4499	NC_011527	TGC	3	9	257651	257659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211926
4500	NC_011527	ATT	2	6	257698	257703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211926

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