MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011527	GCTT	2	8	199351	199358	0 %	50 %	25 %	25 %	212211862
3502	NC_011527	GGA	2	6	199359	199364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211862
3503	NC_011527	TTA	2	6	199385	199390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211862
3504	NC_011527	ATT	2	6	199445	199450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211862
3505	NC_011527	TGA	2	6	199451	199456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211862
3506	NC_011527	GAA	2	6	199498	199503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211862
3507	NC_011527	ATA	2	6	199883	199888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211863
3508	NC_011527	CAT	2	6	199996	200001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211863
3509	NC_011527	CAA	2	6	200073	200078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211863
3510	NC_011527	CTT	2	6	200100	200105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211863
3511	NC_011527	CAC	2	6	200145	200150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211863
3512	NC_011527	ATC	2	6	200161	200166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211863
3513	NC_011527	AGT	2	6	200176	200181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211863
3514	NC_011527	TTA	2	6	200303	200308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211863
3515	NC_011527	TC	3	6	200462	200467	0 %	50 %	0 %	50 %	212211863
3516	NC_011527	T	7	7	200478	200484	0 %	100 %	0 %	0 %	212211863
3517	NC_011527	TTA	2	6	200489	200494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211863
3518	NC_011527	TAA	2	6	200502	200507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211863
3519	NC_011527	T	6	6	200510	200515	0 %	100 %	0 %	0 %	212211863
3520	NC_011527	CA	3	6	200566	200571	50 %	0 %	0 %	50 %	212211863
3521	NC_011527	AAT	2	6	200601	200606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211863
3522	NC_011527	TTTC	2	8	200613	200620	0 %	75 %	0 %	25 %	212211863
3523	NC_011527	CT	3	6	200630	200635	0 %	50 %	0 %	50 %	212211863
3524	NC_011527	T	6	6	200664	200669	0 %	100 %	0 %	0 %	212211863
3525	NC_011527	CTT	2	6	200677	200682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211863
3526	NC_011527	CGG	2	6	200694	200699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211863
3527	NC_011527	TAA	2	6	200721	200726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211863
3528	NC_011527	CTT	2	6	200826	200831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211863
3529	NC_011527	A	7	7	200911	200917	100 %	0 %	0 %	0 %	212211863
3530	NC_011527	CCGC	2	8	200966	200973	0 %	0 %	25 %	75 %	212211863
3531	NC_011527	TC	3	6	201045	201050	0 %	50 %	0 %	50 %	212211863
3532	NC_011527	GCCC	2	8	201120	201127	0 %	0 %	25 %	75 %	212211863
3533	NC_011527	GCG	2	6	201185	201190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211863
3534	NC_011527	CCT	3	9	201206	201214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211863
3535	NC_011527	ACT	2	6	201258	201263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211864
3536	NC_011527	TTG	2	6	201281	201286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211864
3537	NC_011527	AAT	2	6	201303	201308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211864
3538	NC_011527	TCT	2	6	201393	201398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211864
3539	NC_011527	AAT	2	6	201421	201426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211864
3540	NC_011527	TCC	2	6	201476	201481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211864
3541	NC_011527	GCATAG	2	12	201525	201536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212211864
3542	NC_011527	ACCG	2	8	201547	201554	25 %	0 %	25 %	50 %	212211864
3543	NC_011527	AGC	2	6	201587	201592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211864
3544	NC_011527	ATA	2	6	201650	201655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211864
3545	NC_011527	TAA	2	6	201678	201683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211864
3546	NC_011527	CT	3	6	201693	201698	0 %	50 %	0 %	50 %	212211864
3547	NC_011527	CCT	2	6	201735	201740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211864
3548	NC_011527	CAAA	2	8	201799	201806	75 %	0 %	0 %	25 %	212211864
3549	NC_011527	T	6	6	201956	201961	0 %	100 %	0 %	0 %	212211864
3550	NC_011527	CAG	2	6	201982	201987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211864
3551	NC_011527	CCTG	2	8	202020	202027	0 %	25 %	25 %	50 %	212211864
3552	NC_011527	TTC	2	6	202055	202060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211864
3553	NC_011527	TGT	2	6	202134	202139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211864
3554	NC_011527	CTA	2	6	202252	202257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211864
3555	NC_011527	TCG	2	6	202360	202365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211864
3556	NC_011527	TTC	2	6	202399	202404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211864
3557	NC_011527	TAACA	2	10	202499	202508	60 %	20 %	0 %	20 %	212211864
3558	NC_011527	T	6	6	202619	202624	0 %	100 %	0 %	0 %	212211865
3559	NC_011527	ATT	2	6	202632	202637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211865
3560	NC_011527	T	6	6	202636	202641	0 %	100 %	0 %	0 %	212211865
3561	NC_011527	CGC	2	6	202671	202676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211865
3562	NC_011527	CAAA	2	8	202718	202725	75 %	0 %	0 %	25 %	212211865
3563	NC_011527	ATA	2	6	202728	202733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211865
3564	NC_011527	GAT	2	6	202739	202744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211865
3565	NC_011527	T	6	6	202772	202777	0 %	100 %	0 %	0 %	212211865
3566	NC_011527	CAA	2	6	202793	202798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211865
3567	NC_011527	TTC	2	6	202842	202847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211865
3568	NC_011527	TAA	2	6	202859	202864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211865
3569	NC_011527	AGC	2	6	202897	202902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211865
3570	NC_011527	GTG	2	6	202918	202923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211865
3571	NC_011527	ATC	2	6	203085	203090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211865
3572	NC_011527	AT	3	6	203306	203311	50 %	50 %	0 %	0 %	212211865
3573	NC_011527	CAG	2	6	203333	203338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211865
3574	NC_011527	TTAA	2	8	203401	203408	50 %	50 %	0 %	0 %	212211865
3575	NC_011527	TTTA	2	8	203481	203488	25 %	75 %	0 %	0 %	212211865
3576	NC_011527	AT	3	6	203515	203520	50 %	50 %	0 %	0 %	212211865
3577	NC_011527	CGC	2	6	203606	203611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211866
3578	NC_011527	ATT	2	6	203633	203638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211866
3579	NC_011527	GTC	2	6	203669	203674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211866
3580	NC_011527	TC	3	6	203687	203692	0 %	50 %	0 %	50 %	212211866
3581	NC_011527	CTG	2	6	203710	203715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211866
3582	NC_011527	TA	3	6	203722	203727	50 %	50 %	0 %	0 %	212211866
3583	NC_011527	TCC	2	6	203742	203747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211866
3584	NC_011527	AGG	2	6	203774	203779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211866
3585	NC_011527	ATT	2	6	203795	203800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211866
3586	NC_011527	CGT	2	6	203850	203855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211866
3587	NC_011527	GTAAT	2	10	203930	203939	40 %	40 %	20 %	0 %	212211866
3588	NC_011527	TTC	2	6	203955	203960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211866
3589	NC_011527	A	6	6	204041	204046	100 %	0 %	0 %	0 %	212211866
3590	NC_011527	T	6	6	204103	204108	0 %	100 %	0 %	0 %	212211866
3591	NC_011527	TTTC	2	8	204231	204238	0 %	75 %	0 %	25 %	212211867
3592	NC_011527	CAT	2	6	204251	204256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211867
3593	NC_011527	T	6	6	204371	204376	0 %	100 %	0 %	0 %	212211867
3594	NC_011527	ATAA	2	8	204429	204436	75 %	25 %	0 %	0 %	212211867
3595	NC_011527	AAC	2	6	204486	204491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211867
3596	NC_011527	TC	3	6	204499	204504	0 %	50 %	0 %	50 %	212211867
3597	NC_011527	TAAA	2	8	204533	204540	75 %	25 %	0 %	0 %	212211867
3598	NC_011527	T	6	6	204647	204652	0 %	100 %	0 %	0 %	212211867
3599	NC_011527	AAT	2	6	204679	204684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
3600	NC_011527	GCG	2	6	204732	204737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211867
3601	NC_011527	TAA	2	6	204743	204748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
3602	NC_011527	GTT	2	6	204771	204776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211867
3603	NC_011527	ATTC	2	8	204791	204798	25 %	50 %	0 %	25 %	212211867
3604	NC_011527	AAATA	2	10	204818	204827	80 %	20 %	0 %	0 %	212211867
3605	NC_011527	CGG	2	6	205151	205156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211867
3606	NC_011527	ATA	2	6	205157	205162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
3607	NC_011527	ATA	2	6	205230	205235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
3608	NC_011527	GGC	2	6	205240	205245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211867
3609	NC_011527	TCC	3	9	205292	205300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211867
3610	NC_011527	AAT	2	6	205301	205306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
3611	NC_011527	TCA	2	6	205357	205362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211867
3612	NC_011527	GCT	2	6	205513	205518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211868
3613	NC_011527	GCGCG	2	10	205565	205574	0 %	0 %	60 %	40 %	212211868
3614	NC_011527	GCG	2	6	205581	205586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211868
3615	NC_011527	C	6	6	205631	205636	0 %	0 %	0 %	100 %	212211868
3616	NC_011527	GCT	2	6	205922	205927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211868
3617	NC_011527	TGCC	2	8	206012	206019	0 %	25 %	25 %	50 %	212211868
3618	NC_011527	CGG	2	6	206036	206041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211868
3619	NC_011527	GAA	2	6	206047	206052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211868
3620	NC_011527	GAAGCC	2	12	206107	206118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211868
3621	NC_011527	GCT	2	6	206143	206148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211868
3622	NC_011527	AGC	2	6	206154	206159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211868
3623	NC_011527	GAA	2	6	206161	206166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211868
3624	NC_011527	GCG	2	6	206204	206209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211868
3625	NC_011527	CTGATA	2	12	206222	206233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211868
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3663	NC_011527	GCAG	2	8	208358	208365	25 %	0 %	50 %	25 %	212211871
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3993	NC_011527	ATC	2	6	231974	231979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211891
3994	NC_011527	TTGCC	2	10	231993	232002	0 %	40 %	20 %	40 %	212211891
3995	NC_011527	AGT	2	6	232243	232248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211891
3996	NC_011527	GTG	2	6	232311	232316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211891
3997	NC_011527	AAT	2	6	232332	232337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211891
3998	NC_011527	GA	3	6	232430	232435	50 %	0 %	50 %	0 %	212211892
3999	NC_011527	CAT	2	6	232511	232516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211892
4000	NC_011527	TCC	2	6	232723	232728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211893

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