MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011527	T	8	8	172729	172736	0 %	100 %	0 %	0 %	212211834
3002	NC_011527	CTT	2	6	172752	172757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211834
3003	NC_011527	GTT	2	6	172760	172765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211834
3004	NC_011527	TCA	2	6	172814	172819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211835
3005	NC_011527	CGG	2	6	172844	172849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211835
3006	NC_011527	TAA	2	6	172902	172907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211835
3007	NC_011527	CAAAA	2	10	172953	172962	80 %	0 %	0 %	20 %	212211835
3008	NC_011527	GGC	2	6	173031	173036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211835
3009	NC_011527	AGC	2	6	173060	173065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211835
3010	NC_011527	ATA	2	6	173083	173088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211835
3011	NC_011527	GTTT	2	8	173176	173183	0 %	75 %	25 %	0 %	212211836
3012	NC_011527	TGG	2	6	173329	173334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211836
3013	NC_011527	TCT	2	6	173396	173401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211837
3014	NC_011527	CTTC	2	8	173406	173413	0 %	50 %	0 %	50 %	212211837
3015	NC_011527	CAG	2	6	173451	173456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211837
3016	NC_011527	TTTG	2	8	173474	173481	0 %	75 %	25 %	0 %	212211837
3017	NC_011527	ATGT	2	8	173482	173489	25 %	50 %	25 %	0 %	212211837
3018	NC_011527	CTT	2	6	173502	173507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211837
3019	NC_011527	AAGGA	2	10	173614	173623	60 %	0 %	40 %	0 %	212211837
3020	NC_011527	T	8	8	173677	173684	0 %	100 %	0 %	0 %	212211837
3021	NC_011527	CTG	3	9	173688	173696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211837
3022	NC_011527	TAG	2	6	173754	173759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211837
3023	NC_011527	TTC	2	6	173980	173985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211838
3024	NC_011527	CGA	2	6	174051	174056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211838
3025	NC_011527	AGG	2	6	174082	174087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211838
3026	NC_011527	CCG	2	6	174170	174175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211838
3027	NC_011527	AAT	2	6	174187	174192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211838
3028	NC_011527	CTA	2	6	174198	174203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211838
3029	NC_011527	CGA	2	6	174212	174217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211838
3030	NC_011527	GCG	2	6	174226	174231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211838
3031	NC_011527	ATA	2	6	174290	174295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211838
3032	NC_011527	TCA	2	6	174297	174302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211838
3033	NC_011527	ACC	2	6	174310	174315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211838
3034	NC_011527	AAC	2	6	174347	174352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211838
3035	NC_011527	TGT	2	6	174368	174373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211838
3036	NC_011527	T	6	6	174373	174378	0 %	100 %	0 %	0 %	212211838
3037	NC_011527	ATT	2	6	174508	174513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211838
3038	NC_011527	A	6	6	174536	174541	100 %	0 %	0 %	0 %	212211838
3039	NC_011527	ATA	2	6	174623	174628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211838
3040	NC_011527	CGAT	2	8	174645	174652	25 %	25 %	25 %	25 %	212211838
3041	NC_011527	A	6	6	174689	174694	100 %	0 %	0 %	0 %	212211838
3042	NC_011527	A	8	8	174723	174730	100 %	0 %	0 %	0 %	212211838
3043	NC_011527	GAAAC	2	10	174749	174758	60 %	0 %	20 %	20 %	212211838
3044	NC_011527	GTTT	2	8	174827	174834	0 %	75 %	25 %	0 %	212211838
3045	NC_011527	TTG	2	6	174889	174894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211838
3046	NC_011527	TTG	2	6	174934	174939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211838
3047	NC_011527	TGT	2	6	174953	174958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211838
3048	NC_011527	CATC	2	8	174978	174985	25 %	25 %	0 %	50 %	212211838
3049	NC_011527	TAA	2	6	174988	174993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211838
3050	NC_011527	ACA	2	6	175064	175069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211838
3051	NC_011527	AAG	2	6	175103	175108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211838
3052	NC_011527	AAATT	2	10	175125	175134	60 %	40 %	0 %	0 %	212211838
3053	NC_011527	GCT	2	6	175142	175147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211838
3054	NC_011527	CTAT	2	8	175177	175184	25 %	50 %	0 %	25 %	212211839
3055	NC_011527	GGC	2	6	175229	175234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211839
3056	NC_011527	ACC	2	6	175260	175265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211839
3057	NC_011527	CTC	2	6	175274	175279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211839
3058	NC_011527	CTT	2	6	175309	175314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211839
3059	NC_011527	ATA	2	6	175359	175364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211839
3060	NC_011527	GC	5	10	175381	175390	0 %	0 %	50 %	50 %	212211839
3061	NC_011527	CCA	2	6	175413	175418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211839
3062	NC_011527	ATG	2	6	175436	175441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211839
3063	NC_011527	GC	3	6	175480	175485	0 %	0 %	50 %	50 %	212211839
3064	NC_011527	TAA	2	6	175562	175567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211839
3065	NC_011527	AAT	2	6	175572	175577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211839
3066	NC_011527	CG	3	6	175613	175618	0 %	0 %	50 %	50 %	212211839
3067	NC_011527	TAA	2	6	175655	175660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211839
3068	NC_011527	TGG	2	6	175672	175677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211839
3069	NC_011527	GAT	2	6	175678	175683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211839
3070	NC_011527	TGG	2	6	175708	175713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211839
3071	NC_011527	A	6	6	175767	175772	100 %	0 %	0 %	0 %	212211839
3072	NC_011527	CAC	2	6	175851	175856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211840
3073	NC_011527	GAT	2	6	175884	175889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211840
3074	NC_011527	ACG	2	6	175918	175923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211840
3075	NC_011527	ATA	2	6	175957	175962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211840
3076	NC_011527	AAC	2	6	175965	175970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211840
3077	NC_011527	TAATA	2	10	176007	176016	60 %	40 %	0 %	0 %	212211840
3078	NC_011527	CGTTG	2	10	176072	176081	0 %	40 %	40 %	20 %	212211840
3079	NC_011527	TGAA	2	8	176241	176248	50 %	25 %	25 %	0 %	212211840
3080	NC_011527	ATTAAT	2	12	176253	176264	50 %	50 %	0 %	0 %	212211840
3081	NC_011527	ATC	2	6	176373	176378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211840
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3087	NC_011527	T	8	8	176928	176935	0 %	100 %	0 %	0 %	212211840
3088	NC_011527	A	6	6	176955	176960	100 %	0 %	0 %	0 %	212211840
3089	NC_011527	AAAC	2	8	176980	176987	75 %	0 %	0 %	25 %	212211840
3090	NC_011527	GTT	2	6	177168	177173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211841
3091	NC_011527	TTGA	2	8	177272	177279	25 %	50 %	25 %	0 %	212211841
3092	NC_011527	TAA	2	6	177298	177303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211841
3093	NC_011527	TCT	2	6	177306	177311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211841
3094	NC_011527	T	8	8	177311	177318	0 %	100 %	0 %	0 %	212211841
3095	NC_011527	CG	3	6	177354	177359	0 %	0 %	50 %	50 %	212211841
3096	NC_011527	AAT	2	6	177362	177367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211841
3097	NC_011527	CGT	2	6	177385	177390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211841
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3099	NC_011527	CGTTGC	4	24	177508	177531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211841
3100	NC_011527	TGC	2	6	177602	177607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211841
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3102	NC_011527	ATG	2	6	177717	177722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211841
3103	NC_011527	TGC	2	6	177792	177797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211841
3104	NC_011527	TTG	3	9	177830	177838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211841
3105	NC_011527	TAA	2	6	177839	177844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211841
3106	NC_011527	TTA	2	6	177939	177944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211841
3107	NC_011527	TAA	2	6	177994	177999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211841
3108	NC_011527	TCA	3	9	178032	178040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211841
3109	NC_011527	ATG	2	6	178059	178064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211841
3110	NC_011527	CGTTAT	2	12	178100	178111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212211841
3111	NC_011527	AAG	2	6	178138	178143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211841
3112	NC_011527	CCG	2	6	178237	178242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211841
3113	NC_011527	ACC	2	6	178305	178310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211841
3114	NC_011527	GCT	2	6	178322	178327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211841
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3116	NC_011527	GGGAA	2	10	178410	178419	40 %	0 %	60 %	0 %	212211841
3117	NC_011527	AAAAT	2	10	178519	178528	80 %	20 %	0 %	0 %	212211841
3118	NC_011527	A	8	8	178533	178540	100 %	0 %	0 %	0 %	212211841
3119	NC_011527	GCC	2	6	178554	178559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211841
3120	NC_011527	TGA	2	6	178675	178680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211842
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3122	NC_011527	TTG	2	6	178842	178847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211842
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3275	NC_011527	ATTT	2	8	186607	186614	25 %	75 %	0 %	0 %	212211849
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3494	NC_011527	GTC	2	6	199144	199149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211862
3495	NC_011527	CTT	2	6	199172	199177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211862
3496	NC_011527	CG	3	6	199178	199183	0 %	0 %	50 %	50 %	212211862
3497	NC_011527	TTTA	2	8	199214	199221	25 %	75 %	0 %	0 %	212211862
3498	NC_011527	GTT	2	6	199243	199248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211862
3499	NC_011527	TTGG	2	8	199266	199273	0 %	50 %	50 %	0 %	212211862
3500	NC_011527	ATT	2	6	199321	199326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211862

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