MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_011527	TTA	2	6	2004970	2004975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212213535
34002	NC_011527	GC	3	6	2005015	2005020	0 %	0 %	50 %	50 %	212213535
34003	NC_011527	CTT	2	6	2005043	2005048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212213535
34004	NC_011527	AAT	2	6	2005052	2005057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212213535
34005	NC_011527	CTG	2	6	2005079	2005084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212213535
34006	NC_011527	CTT	2	6	2005091	2005096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212213535
34007	NC_011527	TTATC	2	10	2005097	2005106	20 %	60 %	0 %	20 %	212213535
34008	NC_011527	GTA	2	6	2005189	2005194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212213535
34009	NC_011527	GCA	2	6	2005247	2005252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212213536
34010	NC_011527	TAA	2	6	2005351	2005356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212213536
34011	NC_011527	TCGTG	2	10	2005465	2005474	0 %	40 %	40 %	20 %	212213536
34012	NC_011527	CCT	2	6	2005493	2005498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212213536
34013	NC_011527	CCAG	2	8	2005519	2005526	25 %	0 %	25 %	50 %	212213536
34014	NC_011527	TAA	2	6	2005573	2005578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212213536
34015	NC_011527	A	6	6	2005606	2005611	100 %	0 %	0 %	0 %	212213536
34016	NC_011527	TGC	2	6	2005671	2005676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212213536
34017	NC_011527	A	6	6	2005700	2005705	100 %	0 %	0 %	0 %	212213536
34018	NC_011527	TAA	2	6	2005706	2005711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212213536
34019	NC_011527	GGC	2	6	2005742	2005747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212213536
34020	NC_011527	G	7	7	2005789	2005795	0 %	0 %	100 %	0 %	212213536
34021	NC_011527	TAT	2	6	2005803	2005808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212213536
34022	NC_011527	CG	3	6	2005833	2005838	0 %	0 %	50 %	50 %	212213536
34023	NC_011527	ATA	2	6	2005919	2005924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212213536
34024	NC_011527	ATC	2	6	2005949	2005954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212213536
34025	NC_011527	TCG	2	6	2006039	2006044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212213536
34026	NC_011527	GGT	2	6	2006080	2006085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212213536
34027	NC_011527	GCG	2	6	2006144	2006149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212213536
34028	NC_011527	GCG	2	6	2006172	2006177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212213536
34029	NC_011527	T	7	7	2006209	2006215	0 %	100 %	0 %	0 %	212213536
34030	NC_011527	CCA	2	6	2006238	2006243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212213536
34031	NC_011527	AC	3	6	2006247	2006252	50 %	0 %	0 %	50 %	212213536
34032	NC_011527	AAAT	2	8	2006401	2006408	75 %	25 %	0 %	0 %	212213536
34033	NC_011527	ACC	2	6	2006429	2006434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212213536
34034	NC_011527	ATC	2	6	2006455	2006460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212213536
34035	NC_011527	GCTC	2	8	2006516	2006523	0 %	25 %	25 %	50 %	212213536
34036	NC_011527	TGAT	2	8	2006558	2006565	25 %	50 %	25 %	0 %	212213536
34037	NC_011527	CGG	2	6	2006586	2006591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212213536
34038	NC_011527	AGT	2	6	2006647	2006652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212213536
34039	NC_011527	T	6	6	2006693	2006698	0 %	100 %	0 %	0 %	212213536
34040	NC_011527	GCA	2	6	2006750	2006755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212213536
34041	NC_011527	TCG	2	6	2006934	2006939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212213537
34042	NC_011527	TTTTAC	2	12	2006959	2006970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212213537
34043	NC_011527	AAT	2	6	2007019	2007024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212213537
34044	NC_011527	GAT	2	6	2007245	2007250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212213537
34045	NC_011527	T	6	6	2007250	2007255	0 %	100 %	0 %	0 %	212213537
34046	NC_011527	GTG	2	6	2007326	2007331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212213537
34047	NC_011527	AGC	2	6	2007385	2007390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212213537
34048	NC_011527	GATTT	2	10	2007466	2007475	20 %	60 %	20 %	0 %	212213538
34049	NC_011527	A	6	6	2007574	2007579	100 %	0 %	0 %	0 %	212213538
34050	NC_011527	GTT	2	6	2007618	2007623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212213538
34051	NC_011527	ATGG	2	8	2007639	2007646	25 %	25 %	50 %	0 %	212213538
34052	NC_011527	AACA	2	8	2007652	2007659	75 %	0 %	0 %	25 %	212213538
34053	NC_011527	GC	3	6	2007672	2007677	0 %	0 %	50 %	50 %	212213538
34054	NC_011527	CG	3	6	2007683	2007688	0 %	0 %	50 %	50 %	212213538
34055	NC_011527	TGA	2	6	2007728	2007733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212213538
34056	NC_011527	ATGA	2	8	2007856	2007863	50 %	25 %	25 %	0 %	212213538
34057	NC_011527	CTCA	2	8	2007891	2007898	25 %	25 %	0 %	50 %	212213539
34058	NC_011527	CG	3	6	2007899	2007904	0 %	0 %	50 %	50 %	212213539
34059	NC_011527	ATT	2	6	2007935	2007940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212213539
34060	NC_011527	T	6	6	2007939	2007944	0 %	100 %	0 %	0 %	212213539
34061	NC_011527	A	7	7	2007959	2007965	100 %	0 %	0 %	0 %	212213539
34062	NC_011527	T	6	6	2008009	2008014	0 %	100 %	0 %	0 %	212213539
34063	NC_011527	T	6	6	2008164	2008169	0 %	100 %	0 %	0 %	212213539
34064	NC_011527	CGT	2	6	2008230	2008235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212213539
34065	NC_011527	ATT	2	6	2008339	2008344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212213539
34066	NC_011527	ATT	2	6	2008437	2008442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212213539
34067	NC_011527	A	6	6	2008471	2008476	100 %	0 %	0 %	0 %	212213539
34068	NC_011527	AATT	2	8	2008668	2008675	50 %	50 %	0 %	0 %	212213539
34069	NC_011527	CAA	2	6	2008693	2008698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212213539
34070	NC_011527	CAA	2	6	2008711	2008716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212213539
34071	NC_011527	ATT	2	6	2008755	2008760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212213539
34072	NC_011527	TTG	2	6	2008762	2008767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212213539
34073	NC_011527	T	7	7	2008780	2008786	0 %	100 %	0 %	0 %	212213539

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.