MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011527	TTA	2	6	145124	145129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211815
2502	NC_011527	TCT	3	9	145202	145210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211815
2503	NC_011527	T	6	6	145335	145340	0 %	100 %	0 %	0 %	212211815
2504	NC_011527	CAT	2	6	145363	145368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211815
2505	NC_011527	CGG	2	6	145407	145412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211815
2506	NC_011527	TTC	2	6	145459	145464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211815
2507	NC_011527	GCG	2	6	145469	145474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211815
2508	NC_011527	CG	3	6	145514	145519	0 %	0 %	50 %	50 %	212211815
2509	NC_011527	GCT	2	6	145562	145567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211815
2510	NC_011527	TTA	2	6	145595	145600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211815
2511	NC_011527	ACCC	2	8	145773	145780	25 %	0 %	0 %	75 %	212211816
2512	NC_011527	ATA	2	6	145796	145801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211816
2513	NC_011527	A	7	7	145826	145832	100 %	0 %	0 %	0 %	212211816
2514	NC_011527	TG	3	6	145896	145901	0 %	50 %	50 %	0 %	212211816
2515	NC_011527	TGA	2	6	145906	145911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211816
2516	NC_011527	GTAT	2	8	145954	145961	25 %	50 %	25 %	0 %	212211816
2517	NC_011527	GTG	2	6	145991	145996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211816
2518	NC_011527	GGA	2	6	146009	146014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211816
2519	NC_011527	GCA	2	6	146074	146079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211816
2520	NC_011527	AAC	2	6	146187	146192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211816
2521	NC_011527	GTT	2	6	146269	146274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211816
2522	NC_011527	GTG	2	6	146301	146306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211816
2523	NC_011527	AGCG	2	8	146341	146348	25 %	0 %	50 %	25 %	212211816
2524	NC_011527	TTGT	2	8	146389	146396	0 %	75 %	25 %	0 %	212211816
2525	NC_011527	TTG	2	6	146405	146410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211816
2526	NC_011527	GAG	2	6	146438	146443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211816
2527	NC_011527	GGGT	2	8	146502	146509	0 %	25 %	75 %	0 %	212211816
2528	NC_011527	TCA	2	6	146551	146556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211816
2529	NC_011527	ACA	2	6	146605	146610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211816
2530	NC_011527	AGG	2	6	146625	146630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211816
2531	NC_011527	TGT	2	6	146631	146636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211816
2532	NC_011527	A	6	6	146713	146718	100 %	0 %	0 %	0 %	212211816
2533	NC_011527	GAAT	2	8	146769	146776	50 %	25 %	25 %	0 %	212211816
2534	NC_011527	TG	3	6	146783	146788	0 %	50 %	50 %	0 %	212211816
2535	NC_011527	CCG	2	6	146867	146872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211817
2536	NC_011527	A	8	8	146878	146885	100 %	0 %	0 %	0 %	212211817
2537	NC_011527	AC	3	6	146902	146907	50 %	0 %	0 %	50 %	212211817
2538	NC_011527	TGA	2	6	146933	146938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211817
2539	NC_011527	TCA	2	6	147027	147032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211817
2540	NC_011527	TGG	2	6	147042	147047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211817
2541	NC_011527	CTTT	2	8	147087	147094	0 %	75 %	0 %	25 %	212211817
2542	NC_011527	TCA	2	6	147095	147100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211817
2543	NC_011527	TTG	2	6	147108	147113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211817
2544	NC_011527	ACA	2	6	147114	147119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211817
2545	NC_011527	GGGT	2	8	147121	147128	0 %	25 %	75 %	0 %	212211817
2546	NC_011527	GAAGC	2	10	147141	147150	40 %	0 %	40 %	20 %	212211817
2547	NC_011527	ATT	2	6	147167	147172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211817
2548	NC_011527	CAC	2	6	148892	148897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211818
2549	NC_011527	CCAC	2	8	148923	148930	25 %	0 %	0 %	75 %	212211818
2550	NC_011527	TCG	2	6	149022	149027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211818
2551	NC_011527	CG	3	6	149026	149031	0 %	0 %	50 %	50 %	212211818
2552	NC_011527	ATCGA	2	10	149099	149108	40 %	20 %	20 %	20 %	212211818
2553	NC_011527	TGA	2	6	149182	149187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211818
2554	NC_011527	GAT	2	6	149203	149208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211818
2555	NC_011527	CATA	2	8	149215	149222	50 %	25 %	0 %	25 %	212211818
2556	NC_011527	TCA	2	6	149241	149246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211818
2557	NC_011527	AAC	2	6	149309	149314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211818
2558	NC_011527	CGGCTA	2	12	149332	149343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212211818
2559	NC_011527	ACA	2	6	149377	149382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211818
2560	NC_011527	TAT	2	6	149395	149400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211818
2561	NC_011527	CAT	2	6	149468	149473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211818
2562	NC_011527	AAT	2	6	149519	149524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211818
2563	NC_011527	CCA	2	6	149584	149589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211818
2564	NC_011527	TCGC	2	8	149598	149605	0 %	25 %	25 %	50 %	212211818
2565	NC_011527	AAT	2	6	149609	149614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211818
2566	NC_011527	CCTTT	2	10	149668	149677	0 %	60 %	0 %	40 %	212211818
2567	NC_011527	GAAAT	2	10	149728	149737	60 %	20 %	20 %	0 %	212211818
2568	NC_011527	CGC	2	6	149818	149823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211818
2569	NC_011527	CGC	2	6	149857	149862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211818
2570	NC_011527	CAA	2	6	149866	149871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211818
2571	NC_011527	AAT	2	6	149879	149884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211818
2572	NC_011527	TAAGG	2	10	149912	149921	40 %	20 %	40 %	0 %	212211818
2573	NC_011527	CAT	2	6	149926	149931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211818
2574	NC_011527	CAA	2	6	149933	149938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211818
2575	NC_011527	AATC	2	8	149980	149987	50 %	25 %	0 %	25 %	212211818
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2577	NC_011527	CGGG	2	8	150013	150020	0 %	0 %	75 %	25 %	212211818
2578	NC_011527	ATAA	2	8	150036	150043	75 %	25 %	0 %	0 %	212211818
2579	NC_011527	T	7	7	150050	150056	0 %	100 %	0 %	0 %	212211818
2580	NC_011527	AATT	2	8	150058	150065	50 %	50 %	0 %	0 %	212211818
2581	NC_011527	T	6	6	150140	150145	0 %	100 %	0 %	0 %	212211818
2582	NC_011527	CGC	2	6	150146	150151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211818
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2585	NC_011527	AAT	2	6	150236	150241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211818
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2587	NC_011527	AAT	2	6	150287	150292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211818
2588	NC_011527	GCG	2	6	150299	150304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211818
2589	NC_011527	ATT	3	9	150314	150322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211818
2590	NC_011527	GTA	2	6	150368	150373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211819
2591	NC_011527	TTCC	2	8	150377	150384	0 %	50 %	0 %	50 %	212211819
2592	NC_011527	AGC	2	6	150456	150461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211819
2593	NC_011527	C	6	6	150475	150480	0 %	0 %	0 %	100 %	212211819
2594	NC_011527	CG	3	6	150522	150527	0 %	0 %	50 %	50 %	212211819
2595	NC_011527	TCT	2	6	150697	150702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211819
2596	NC_011527	GA	3	6	150741	150746	50 %	0 %	50 %	0 %	212211819
2597	NC_011527	T	7	7	150751	150757	0 %	100 %	0 %	0 %	212211819
2598	NC_011527	CGG	2	6	150758	150763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211819
2599	NC_011527	CATT	2	8	150796	150803	25 %	50 %	0 %	25 %	212211819
2600	NC_011527	ACC	2	6	150861	150866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211819
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2603	NC_011527	GC	3	6	150979	150984	0 %	0 %	50 %	50 %	212211819
2604	NC_011527	TAT	2	6	151142	151147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211819
2605	NC_011527	TTA	2	6	151162	151167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211819
2606	NC_011527	T	6	6	151257	151262	0 %	100 %	0 %	0 %	212211819
2607	NC_011527	CTT	2	6	151313	151318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211819
2608	NC_011527	ATC	2	6	151342	151347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211819
2609	NC_011527	TCG	2	6	151379	151384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211819
2610	NC_011527	GC	3	6	151390	151395	0 %	0 %	50 %	50 %	212211819
2611	NC_011527	TCA	2	6	151405	151410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211819
2612	NC_011527	ATC	2	6	151456	151461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211819
2613	NC_011527	TGT	2	6	151469	151474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211819
2614	NC_011527	AGATTG	2	12	151477	151488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211819
2615	NC_011527	ATTTT	2	10	151516	151525	20 %	80 %	0 %	0 %	212211819
2616	NC_011527	CACT	2	8	151526	151533	25 %	25 %	0 %	50 %	212211819
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2619	NC_011527	ATCA	2	8	151694	151701	50 %	25 %	0 %	25 %	212211820
2620	NC_011527	T	6	6	151814	151819	0 %	100 %	0 %	0 %	212211820
2621	NC_011527	CAT	2	6	151820	151825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211820
2622	NC_011527	ACTA	2	8	151844	151851	50 %	25 %	0 %	25 %	212211820
2623	NC_011527	T	6	6	151853	151858	0 %	100 %	0 %	0 %	212211820
2624	NC_011527	TCCA	2	8	151928	151935	25 %	25 %	0 %	50 %	212211820
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2748	NC_011527	CAC	2	6	159111	159116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211824
2749	NC_011527	CCAC	2	8	159130	159137	25 %	0 %	0 %	75 %	212211824
2750	NC_011527	ATT	2	6	159180	159185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211824
2751	NC_011527	G	6	6	159493	159498	0 %	0 %	100 %	0 %	212211825
2752	NC_011527	TCG	2	6	159499	159504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211825
2753	NC_011527	TTG	2	6	159623	159628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211825
2754	NC_011527	A	6	6	159650	159655	100 %	0 %	0 %	0 %	212211825
2755	NC_011527	ATG	2	6	159678	159683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211825
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2760	NC_011527	AGCA	2	8	160079	160086	50 %	0 %	25 %	25 %	212211826
2761	NC_011527	TGA	2	6	160124	160129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211826
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2764	NC_011527	CGGT	2	8	160163	160170	0 %	25 %	50 %	25 %	212211826
2765	NC_011527	ATTG	2	8	160280	160287	25 %	50 %	25 %	0 %	212211827
2766	NC_011527	GGC	2	6	160308	160313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211827
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2772	NC_011527	CAT	2	6	160801	160806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211827
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2996	NC_011527	AGA	2	6	172404	172409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211834
2997	NC_011527	AGAT	2	8	172533	172540	50 %	25 %	25 %	0 %	212211834
2998	NC_011527	AAT	2	6	172545	172550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211834
2999	NC_011527	GTGA	2	8	172654	172661	25 %	25 %	50 %	0 %	212211834
3000	NC_011527	GGT	2	6	172663	172668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211834

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