MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011527	CTT	2	6	84953	84958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211763
1502	NC_011527	GC	3	6	84967	84972	0 %	0 %	50 %	50 %	212211763
1503	NC_011527	T	6	6	85002	85007	0 %	100 %	0 %	0 %	212211763
1504	NC_011527	TTTCA	2	10	85011	85020	20 %	60 %	0 %	20 %	212211763
1505	NC_011527	CAC	2	6	85055	85060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211763
1506	NC_011527	CGA	2	6	85107	85112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211763
1507	NC_011527	ATG	2	6	85183	85188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211763
1508	NC_011527	GTG	2	6	85189	85194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211763
1509	NC_011527	ACA	2	6	85207	85212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211763
1510	NC_011527	ATC	2	6	85233	85238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211763
1511	NC_011527	AAG	2	6	85241	85246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211763
1512	NC_011527	CTT	2	6	85268	85273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211763
1513	NC_011527	ACG	2	6	85326	85331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211763
1514	NC_011527	AAC	2	6	85368	85373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211763
1515	NC_011527	ATT	2	6	85383	85388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211763
1516	NC_011527	AAC	2	6	85471	85476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211763
1517	NC_011527	TCT	2	6	85502	85507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211763
1518	NC_011527	TTG	2	6	85561	85566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211763
1519	NC_011527	ACT	2	6	85612	85617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211763
1520	NC_011527	TCT	2	6	85645	85650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211763
1521	NC_011527	CTT	2	6	85664	85669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211763
1522	NC_011527	AAT	2	6	85695	85700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211763
1523	NC_011527	TTC	2	6	85783	85788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211763
1524	NC_011527	TGT	2	6	85908	85913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211763
1525	NC_011527	CTT	2	6	85952	85957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211763
1526	NC_011527	TGGT	2	8	86036	86043	0 %	50 %	50 %	0 %	212211763
1527	NC_011527	CCACG	2	10	86120	86129	20 %	0 %	20 %	60 %	212211763
1528	NC_011527	T	6	6	86180	86185	0 %	100 %	0 %	0 %	212211763
1529	NC_011527	TCT	2	6	86236	86241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211764
1530	NC_011527	AT	3	6	86251	86256	50 %	50 %	0 %	0 %	212211764
1531	NC_011527	TCG	2	6	86257	86262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211764
1532	NC_011527	CCAG	2	8	86263	86270	25 %	0 %	25 %	50 %	212211764
1533	NC_011527	GAAC	2	8	86332	86339	50 %	0 %	25 %	25 %	212211764
1534	NC_011527	GCC	2	6	86427	86432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211764
1535	NC_011527	TTC	3	9	86445	86453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211764
1536	NC_011527	ACC	2	6	86464	86469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211764
1537	NC_011527	ATTT	2	8	86513	86520	25 %	75 %	0 %	0 %	212211764
1538	NC_011527	TGA	2	6	86578	86583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211764
1539	NC_011527	TGG	2	6	86739	86744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211765
1540	NC_011527	CTACCA	2	12	86751	86762	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212211765
1541	NC_011527	GCG	2	6	86773	86778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211765
1542	NC_011527	ACTC	2	8	86816	86823	25 %	25 %	0 %	50 %	212211765
1543	NC_011527	CG	3	6	86946	86951	0 %	0 %	50 %	50 %	212211765
1544	NC_011527	CCG	2	6	86981	86986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211765
1545	NC_011527	GCGAT	2	10	87008	87017	20 %	20 %	40 %	20 %	212211765
1546	NC_011527	GC	3	6	87019	87024	0 %	0 %	50 %	50 %	212211765
1547	NC_011527	ATC	2	6	87073	87078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211765
1548	NC_011527	ACGA	2	8	87158	87165	50 %	0 %	25 %	25 %	212211765
1549	NC_011527	CTT	2	6	87171	87176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211765
1550	NC_011527	ACA	2	6	87186	87191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211765
1551	NC_011527	GCC	2	6	87216	87221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211765
1552	NC_011527	CCA	2	6	87237	87242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211765
1553	NC_011527	GCG	2	6	87266	87271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211765
1554	NC_011527	CAA	2	6	87283	87288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211765
1555	NC_011527	GGAC	2	8	87326	87333	25 %	0 %	50 %	25 %	212211765
1556	NC_011527	CGAAGC	2	12	87390	87401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211765
1557	NC_011527	TGC	2	6	87518	87523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211765
1558	NC_011527	CCGG	2	8	87686	87693	0 %	0 %	50 %	50 %	212211765
1559	NC_011527	ACG	2	6	87749	87754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211765
1560	NC_011527	CAT	2	6	87955	87960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211765
1561	NC_011527	CGC	2	6	87975	87980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211765
1562	NC_011527	CGC	2	6	88023	88028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211765
1563	NC_011527	A	6	6	88041	88046	100 %	0 %	0 %	0 %	212211765
1564	NC_011527	ATC	2	6	88086	88091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211765
1565	NC_011527	ATT	2	6	88121	88126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211765
1566	NC_011527	GTC	2	6	88266	88271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211765
1567	NC_011527	GTTA	2	8	88314	88321	25 %	50 %	25 %	0 %	212211765
1568	NC_011527	CAC	2	6	88340	88345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211765
1569	NC_011527	TGG	2	6	88349	88354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211765
1570	NC_011527	GAA	2	6	88540	88545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211765
1571	NC_011527	CTTT	2	8	88619	88626	0 %	75 %	0 %	25 %	212211765
1572	NC_011527	A	6	6	88656	88661	100 %	0 %	0 %	0 %	212211765
1573	NC_011527	TAT	2	6	88662	88667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211765
1574	NC_011527	ACGC	2	8	88670	88677	25 %	0 %	25 %	50 %	212211765
1575	NC_011527	ACG	2	6	88705	88710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211765
1576	NC_011527	CGC	2	6	88813	88818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211765
1577	NC_011527	ATTCGT	2	12	88858	88869	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212211765
1578	NC_011527	ACG	2	6	88940	88945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211765
1579	NC_011527	TGG	2	6	88979	88984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211765
1580	NC_011527	TTC	2	6	89013	89018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211765
1581	NC_011527	GCC	2	6	89029	89034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211765
1582	NC_011527	GTG	2	6	89065	89070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211765
1583	NC_011527	TGC	2	6	89120	89125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211765
1584	NC_011527	TTA	2	6	89231	89236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211765
1585	NC_011527	CATTG	2	10	89276	89285	20 %	40 %	20 %	20 %	212211765
1586	NC_011527	TTA	2	6	89313	89318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211765
1587	NC_011527	TGG	2	6	89325	89330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211765
1588	NC_011527	TCT	2	6	89365	89370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211765
1589	NC_011527	AAAATA	2	12	89387	89398	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212211766
1590	NC_011527	G	6	6	89409	89414	0 %	0 %	100 %	0 %	212211766
1591	NC_011527	CAT	2	6	89444	89449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211766
1592	NC_011527	TGG	2	6	89460	89465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211766
1593	NC_011527	GAA	2	6	89492	89497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211766
1594	NC_011527	T	6	6	89500	89505	0 %	100 %	0 %	0 %	212211766
1595	NC_011527	CTT	2	6	89557	89562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211766
1596	NC_011527	CCAA	2	8	89653	89660	50 %	0 %	0 %	50 %	212211766
1597	NC_011527	TCA	2	6	89698	89703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211766
1598	NC_011527	A	6	6	89737	89742	100 %	0 %	0 %	0 %	212211766
1599	NC_011527	TGT	2	6	89757	89762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211766
1600	NC_011527	TAA	2	6	89785	89790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211766
1601	NC_011527	TTA	2	6	89804	89809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211766
1602	NC_011527	GAAG	2	8	89834	89841	50 %	0 %	50 %	0 %	212211766
1603	NC_011527	G	6	6	89854	89859	0 %	0 %	100 %	0 %	212211766
1604	NC_011527	ACG	2	6	89866	89871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211766
1605	NC_011527	GAA	2	6	89876	89881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211766
1606	NC_011527	T	7	7	89926	89932	0 %	100 %	0 %	0 %	212211766
1607	NC_011527	AC	3	6	89940	89945	50 %	0 %	0 %	50 %	212211766
1608	NC_011527	A	7	7	90004	90010	100 %	0 %	0 %	0 %	212211766
1609	NC_011527	GGAA	2	8	90024	90031	50 %	0 %	50 %	0 %	212211766
1610	NC_011527	ATG	2	6	90057	90062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211766
1611	NC_011527	AAT	2	6	90090	90095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211766
1612	NC_011527	GTT	2	6	94602	94607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211767
1613	NC_011527	GAT	2	6	94640	94645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211767
1614	NC_011527	TCG	2	6	94646	94651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211767
1615	NC_011527	TAA	2	6	94654	94659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211767
1616	NC_011527	GTTTT	2	10	94668	94677	0 %	80 %	20 %	0 %	212211767
1617	NC_011527	TTC	2	6	94678	94683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211767
1618	NC_011527	TTTACC	2	12	94795	94806	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212211767
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1620	NC_011527	C	6	6	95022	95027	0 %	0 %	0 %	100 %	212211767
1621	NC_011527	CGAT	2	8	95089	95096	25 %	25 %	25 %	25 %	212211767
1622	NC_011527	AGC	2	6	95126	95131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211767
1623	NC_011527	C	6	6	95133	95138	0 %	0 %	0 %	100 %	212211767
1624	NC_011527	CAA	2	6	95145	95150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211767
1625	NC_011527	ATTT	2	8	95182	95189	25 %	75 %	0 %	0 %	212211767
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1627	NC_011527	T	7	7	95204	95210	0 %	100 %	0 %	0 %	212211767
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2000	NC_011527	A	7	7	120014	120020	100 %	0 %	0 %	0 %	212211789

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