MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011527	TTGT	2	8	285544	285551	0 %	75 %	25 %	0 %	212211955
5003	NC_011527	TTG	2	6	285560	285565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211955
5004	NC_011527	GAG	2	6	285593	285598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211955
5005	NC_011527	GGGT	2	8	285657	285664	0 %	25 %	75 %	0 %	212211955
5006	NC_011527	TCA	2	6	285706	285711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211955
5007	NC_011527	ACA	2	6	285760	285765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211955
5008	NC_011527	AGG	2	6	285780	285785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211955
5009	NC_011527	TGT	2	6	285786	285791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211955
5010	NC_011527	A	6	6	285868	285873	100 %	0 %	0 %	0 %	212211955
5011	NC_011527	GAAT	2	8	285924	285931	50 %	25 %	25 %	0 %	212211955
5012	NC_011527	TG	3	6	285938	285943	0 %	50 %	50 %	0 %	212211955
5013	NC_011527	CCG	2	6	286022	286027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211956
5014	NC_011527	A	8	8	286033	286040	100 %	0 %	0 %	0 %	212211956
5015	NC_011527	AC	3	6	286057	286062	50 %	0 %	0 %	50 %	212211956
5016	NC_011527	TGA	2	6	286088	286093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211956
5017	NC_011527	TCA	2	6	286182	286187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211956
5018	NC_011527	TGG	2	6	286197	286202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211956
5019	NC_011527	CTTT	2	8	286242	286249	0 %	75 %	0 %	25 %	212211956
5020	NC_011527	TCA	2	6	286250	286255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211956
5021	NC_011527	TTG	2	6	286263	286268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211956
5022	NC_011527	ACA	2	6	286269	286274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211956
5023	NC_011527	GGGT	2	8	286276	286283	0 %	25 %	75 %	0 %	212211956
5024	NC_011527	CGAAA	2	10	286300	286309	60 %	0 %	20 %	20 %	212211956
5025	NC_011527	ATT	2	6	286322	286327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211956
5026	NC_011527	GAG	2	6	286368	286373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211957
5027	NC_011527	TAT	2	6	286400	286405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211957
5028	NC_011527	ATT	2	6	286458	286463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211957
5029	NC_011527	TTTA	2	8	286504	286511	25 %	75 %	0 %	0 %	212211957
5030	NC_011527	TGG	2	6	286531	286536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211957
5031	NC_011527	A	8	8	286554	286561	100 %	0 %	0 %	0 %	212211957
5032	NC_011527	AAG	2	6	286587	286592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211957
5033	NC_011527	GTC	2	6	286606	286611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211957
5034	NC_011527	A	6	6	286650	286655	100 %	0 %	0 %	0 %	212211957
5035	NC_011527	TAA	2	6	286710	286715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211957
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5038	NC_011527	TAATAT	2	12	287762	287773	50 %	50 %	0 %	0 %	212211958
5039	NC_011527	AATT	2	8	287788	287795	50 %	50 %	0 %	0 %	212211958
5040	NC_011527	A	6	6	287847	287852	100 %	0 %	0 %	0 %	212211958
5041	NC_011527	TAA	2	6	287895	287900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211958
5042	NC_011527	CT	3	6	287954	287959	0 %	50 %	0 %	50 %	212211958
5043	NC_011527	TTGA	2	8	287961	287968	25 %	50 %	25 %	0 %	212211958
5044	NC_011527	GCG	2	6	288023	288028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211958
5045	NC_011527	TTC	2	6	288031	288036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211958
5046	NC_011527	CATC	2	8	288045	288052	25 %	25 %	0 %	50 %	212211958
5047	NC_011527	GCCT	2	8	288076	288083	0 %	25 %	25 %	50 %	212211958
5048	NC_011527	GGAT	2	8	288128	288135	25 %	25 %	50 %	0 %	212211958
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5053	NC_011527	CGT	2	6	288327	288332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211958
5054	NC_011527	GAG	2	6	288336	288341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211958
5055	NC_011527	TAAA	2	8	288342	288349	75 %	25 %	0 %	0 %	212211958
5056	NC_011527	GATT	2	8	288362	288369	25 %	50 %	25 %	0 %	212211958
5057	NC_011527	TAA	2	6	288385	288390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211958
5058	NC_011527	TAA	2	6	288394	288399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211958
5059	NC_011527	ATA	2	6	288419	288424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211958
5060	NC_011527	CAT	2	6	288433	288438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211958
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5062	NC_011527	A	6	6	288609	288614	100 %	0 %	0 %	0 %	212211958
5063	NC_011527	TAA	2	6	288625	288630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211958
5064	NC_011527	ATG	2	6	288659	288664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211958
5065	NC_011527	AAT	2	6	288697	288702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211958
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5069	NC_011527	CCAAG	2	10	288913	288922	40 %	0 %	20 %	40 %	212211958
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5072	NC_011527	TAAT	2	8	288984	288991	50 %	50 %	0 %	0 %	212211958
5073	NC_011527	TAAC	2	8	288999	289006	50 %	25 %	0 %	25 %	212211958
5074	NC_011527	CAA	2	6	289012	289017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211958
5075	NC_011527	T	8	8	289071	289078	0 %	100 %	0 %	0 %	212211958
5076	NC_011527	AATAAA	2	12	289085	289096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212211958
5077	NC_011527	ATGA	2	8	289120	289127	50 %	25 %	25 %	0 %	212211958
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5082	NC_011527	CAAT	2	8	289937	289944	50 %	25 %	0 %	25 %	212211961
5083	NC_011527	TTC	2	6	289955	289960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211961
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5087	NC_011527	TCAG	2	8	290093	290100	25 %	25 %	25 %	25 %	212211961
5088	NC_011527	GCT	2	6	290123	290128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211961
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5091	NC_011527	CAG	2	6	290208	290213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211961
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5096	NC_011527	CT	3	6	290293	290298	0 %	50 %	0 %	50 %	212211961
5097	NC_011527	C	6	6	290305	290310	0 %	0 %	0 %	100 %	212211961
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5103	NC_011527	T	7	7	290727	290733	0 %	100 %	0 %	0 %	212211961
5104	NC_011527	GGC	2	6	290750	290755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211961
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5106	NC_011527	TCT	2	6	290936	290941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211961
5107	NC_011527	CATTC	2	10	290943	290952	20 %	40 %	0 %	40 %	212211961
5108	NC_011527	TCGAGG	2	12	291026	291037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212211961
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5110	NC_011527	TTA	2	6	291162	291167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211960
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5112	NC_011527	TAC	2	6	291217	291222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211960
5113	NC_011527	CAA	2	6	291363	291368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211960
5114	NC_011527	TCGA	2	8	291371	291378	25 %	25 %	25 %	25 %	212211960
5115	NC_011527	AGA	2	6	291384	291389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211960
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5117	NC_011527	A	6	6	291494	291499	100 %	0 %	0 %	0 %	212211960
5118	NC_011527	AAAACC	2	12	291507	291518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211960
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5120	NC_011527	T	7	7	291627	291633	0 %	100 %	0 %	0 %	212211960
5121	NC_011527	CA	3	6	291646	291651	50 %	0 %	0 %	50 %	212211960
5122	NC_011527	TGA	2	6	291653	291658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211960
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5124	NC_011527	ATG	2	6	291841	291846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211960
5125	NC_011527	TCG	2	6	291860	291865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211960
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5240	NC_011527	GGGC	2	8	298187	298194	0 %	0 %	75 %	25 %	212211968
5241	NC_011527	ATGC	2	8	298210	298217	25 %	25 %	25 %	25 %	212211968
5242	NC_011527	ACG	2	6	298231	298236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211968
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5245	NC_011527	A	6	6	298311	298316	100 %	0 %	0 %	0 %	212211968
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5365	NC_011527	TCG	3	9	306661	306669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211977
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5496	NC_011527	AAAAC	2	10	314582	314591	80 %	0 %	0 %	20 %	212211983
5497	NC_011527	GCA	2	6	314596	314601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211983
5498	NC_011527	AAC	2	6	314661	314666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211983
5499	NC_011527	TTTA	2	8	314698	314705	25 %	75 %	0 %	0 %	212211983
5500	NC_011527	GAT	2	6	314843	314848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211983

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