MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 34073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011527	TTA	2	6	257707	257712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211926
4502	NC_011527	AAC	2	6	257736	257741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211926
4503	NC_011527	A	6	6	257839	257844	100 %	0 %	0 %	0 %	212211926
4504	NC_011527	ATT	2	6	259381	259386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211927
4505	NC_011527	TGC	2	6	259415	259420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211927
4506	NC_011527	A	7	7	259427	259433	100 %	0 %	0 %	0 %	212211927
4507	NC_011527	ACG	2	6	259438	259443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211927
4508	NC_011527	AGG	2	6	259445	259450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211927
4509	NC_011527	AGA	2	6	259481	259486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211927
4510	NC_011527	AAG	2	6	259516	259521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211927
4511	NC_011527	ATG	2	6	259588	259593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211927
4512	NC_011527	CG	3	6	259681	259686	0 %	0 %	50 %	50 %	212211927
4513	NC_011527	CTA	2	6	259701	259706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211927
4514	NC_011527	GCA	2	6	259710	259715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211927
4515	NC_011527	A	6	6	259720	259725	100 %	0 %	0 %	0 %	212211927
4516	NC_011527	GGC	2	6	259800	259805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211927
4517	NC_011527	ATT	2	6	259842	259847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211927
4518	NC_011527	CCA	2	6	259852	259857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211927
4519	NC_011527	TCC	2	6	259880	259885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211927
4520	NC_011527	GTT	2	6	259915	259920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211927
4521	NC_011527	TCTT	2	8	259928	259935	0 %	75 %	0 %	25 %	212211927
4522	NC_011527	CGC	2	6	260027	260032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211927
4523	NC_011527	T	6	6	260035	260040	0 %	100 %	0 %	0 %	212211927
4524	NC_011527	TGAA	2	8	260191	260198	50 %	25 %	25 %	0 %	212211928
4525	NC_011527	TTTTC	2	10	260206	260215	0 %	80 %	0 %	20 %	212211928
4526	NC_011527	T	7	7	260249	260255	0 %	100 %	0 %	0 %	212211928
4527	NC_011527	TTG	2	6	260260	260265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211928
4528	NC_011527	TTC	3	9	260266	260274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211928
4529	NC_011527	GAA	2	6	260275	260280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211928
4530	NC_011527	ATT	2	6	260288	260293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211928
4531	NC_011527	T	6	6	261519	261524	0 %	100 %	0 %	0 %	212211929
4532	NC_011527	A	7	7	261527	261533	100 %	0 %	0 %	0 %	212211929
4533	NC_011527	GAT	2	6	261546	261551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211929
4534	NC_011527	AATA	2	8	261552	261559	75 %	25 %	0 %	0 %	212211929
4535	NC_011527	CAG	2	6	261576	261581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211929
4536	NC_011527	ACGCCT	2	12	261653	261664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212211929
4537	NC_011527	CAG	3	9	261708	261716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211929
4538	NC_011527	ACC	2	6	261725	261730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211929
4539	NC_011527	GCA	2	6	261752	261757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211929
4540	NC_011527	TGG	2	6	261798	261803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211929
4541	NC_011527	GC	3	6	261849	261854	0 %	0 %	50 %	50 %	212211929
4542	NC_011527	TGCG	2	8	261879	261886	0 %	25 %	50 %	25 %	212211929
4543	NC_011527	CAC	2	6	261900	261905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211929
4544	NC_011527	ACCA	2	8	261919	261926	50 %	0 %	0 %	50 %	212211929
4545	NC_011527	GCC	2	6	261929	261934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211929
4546	NC_011527	CAT	2	6	261957	261962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211929
4547	NC_011527	CGT	2	6	262076	262081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211929
4548	NC_011527	AAT	2	6	262082	262087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211929
4549	NC_011527	ATA	2	6	262103	262108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211929
4550	NC_011527	A	6	6	262301	262306	100 %	0 %	0 %	0 %	212211929
4551	NC_011527	AAT	2	6	262324	262329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211929
4552	NC_011527	TGA	2	6	262335	262340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211929
4553	NC_011527	ATGG	2	8	262375	262382	25 %	25 %	50 %	0 %	212211929
4554	NC_011527	ACA	2	6	262394	262399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211929
4555	NC_011527	AAGCCA	2	12	262403	262414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212211929
4556	NC_011527	GTT	2	6	262439	262444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211929
4557	NC_011527	TAA	2	6	262495	262500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211929
4558	NC_011527	TAA	2	6	262522	262527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211929
4559	NC_011527	TAAA	2	8	262542	262549	75 %	25 %	0 %	0 %	212211929
4560	NC_011527	CCGA	2	8	262670	262677	25 %	0 %	25 %	50 %	212211929
4561	NC_011527	C	6	6	262713	262718	0 %	0 %	0 %	100 %	212211929
4562	NC_011527	A	6	6	262726	262731	100 %	0 %	0 %	0 %	212211929
4563	NC_011527	ATT	3	9	262981	262989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211930
4564	NC_011527	T	6	6	262994	262999	0 %	100 %	0 %	0 %	212211930
4565	NC_011527	T	6	6	263260	263265	0 %	100 %	0 %	0 %	212211930
4566	NC_011527	ATT	2	6	263323	263328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211930
4567	NC_011527	AAG	2	6	263349	263354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211930
4568	NC_011527	CAA	2	6	263378	263383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211930
4569	NC_011527	A	6	6	263451	263456	100 %	0 %	0 %	0 %	212211930
4570	NC_011527	TTA	2	6	263459	263464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211930
4571	NC_011527	T	7	7	263478	263484	0 %	100 %	0 %	0 %	212211930
4572	NC_011527	ATA	2	6	263492	263497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211930
4573	NC_011527	ATT	2	6	263551	263556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211930
4574	NC_011527	CTTC	2	8	263577	263584	0 %	50 %	0 %	50 %	212211931
4575	NC_011527	AGA	2	6	263684	263689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211931
4576	NC_011527	GC	4	8	263807	263814	0 %	0 %	50 %	50 %	212211931
4577	NC_011527	ATT	2	6	263815	263820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211931
4578	NC_011527	GAT	2	6	263852	263857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211931
4579	NC_011527	CCA	2	6	263896	263901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211931
4580	NC_011527	TAA	2	6	263950	263955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211931
4581	NC_011527	TAA	2	6	263978	263983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211931
4582	NC_011527	GAT	2	6	264006	264011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211931
4583	NC_011527	GGA	2	6	264035	264040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211931
4584	NC_011527	TA	3	6	264117	264122	50 %	50 %	0 %	0 %	212211931
4585	NC_011527	CAG	2	6	264151	264156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211931
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4587	NC_011527	TTCA	2	8	264369	264376	25 %	50 %	0 %	25 %	212211931
4588	NC_011527	TCA	2	6	264481	264486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211932
4589	NC_011527	CTT	2	6	264495	264500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211932
4590	NC_011527	TATC	2	8	264523	264530	25 %	50 %	0 %	25 %	212211932
4591	NC_011527	T	6	6	264553	264558	0 %	100 %	0 %	0 %	212211932
4592	NC_011527	ATCA	2	8	264612	264619	50 %	25 %	0 %	25 %	212211932
4593	NC_011527	TGA	2	6	264667	264672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211932
4594	NC_011527	AGG	2	6	264720	264725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211932
4595	NC_011527	ATTA	2	8	264802	264809	50 %	50 %	0 %	0 %	212211932
4596	NC_011527	ATT	2	6	264818	264823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211932
4597	NC_011527	TTA	2	6	264864	264869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211932
4598	NC_011527	ATA	2	6	264920	264925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211932
4599	NC_011527	AATT	2	8	265017	265024	50 %	50 %	0 %	0 %	212211932
4600	NC_011527	GCT	2	6	265040	265045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211932
4601	NC_011527	TGCGC	2	10	265766	265775	0 %	20 %	40 %	40 %	212211933
4602	NC_011527	GC	3	6	265783	265788	0 %	0 %	50 %	50 %	212211933
4603	NC_011527	GC	3	6	265901	265906	0 %	0 %	50 %	50 %	212211934
4604	NC_011527	CGT	2	6	265907	265912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211934
4605	NC_011527	ACG	2	6	265975	265980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211934
4606	NC_011527	AAT	2	6	266071	266076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211934
4607	NC_011527	CATACG	2	12	266100	266111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212211934
4608	NC_011527	TCT	3	9	266116	266124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211934
4609	NC_011527	GTC	2	6	266139	266144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211934
4610	NC_011527	TCT	2	6	266173	266178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211934
4611	NC_011527	TTCC	2	8	266202	266209	0 %	50 %	0 %	50 %	212211934
4612	NC_011527	AAT	2	6	266295	266300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211934
4613	NC_011527	CTT	2	6	266331	266336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211934
4614	NC_011527	CCT	2	6	266412	266417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211934
4615	NC_011527	CAT	2	6	266644	266649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211935
4616	NC_011527	A	8	8	266673	266680	100 %	0 %	0 %	0 %	212211935
4617	NC_011527	A	6	6	266791	266796	100 %	0 %	0 %	0 %	212211935
4618	NC_011527	AAAT	2	8	266798	266805	75 %	25 %	0 %	0 %	212211935
4619	NC_011527	A	7	7	266846	266852	100 %	0 %	0 %	0 %	212211935
4620	NC_011527	T	6	6	266894	266899	0 %	100 %	0 %	0 %	212211935
4621	NC_011527	AATC	2	8	266915	266922	50 %	25 %	0 %	25 %	212211935
4622	NC_011527	A	6	6	266949	266954	100 %	0 %	0 %	0 %	212211935
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4624	NC_011527	A	6	6	266976	266981	100 %	0 %	0 %	0 %	212211935
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4993	NC_011527	TGA	2	6	285061	285066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211955
4994	NC_011527	GTAT	2	8	285109	285116	25 %	50 %	25 %	0 %	212211955
4995	NC_011527	GTG	2	6	285146	285151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211955
4996	NC_011527	GGA	2	6	285164	285169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211955
4997	NC_011527	GCA	2	6	285229	285234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211955
4998	NC_011527	AAC	2	6	285342	285347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211955
4999	NC_011527	GTT	2	6	285424	285429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211955
5000	NC_011527	GTG	2	6	285456	285461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211955

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