MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 582

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011526	TTACG	2	10	35259	35268	20 %	40 %	20 %	20 %	212208444
502	NC_011526	AAC	2	6	35304	35309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208444
503	NC_011526	ATT	2	6	35352	35357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208444
504	NC_011526	TCC	2	6	35392	35397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212208444
505	NC_011526	ACA	2	6	35413	35418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208444
506	NC_011526	ATG	2	6	35482	35487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208444
507	NC_011526	ATTG	2	8	35496	35503	25 %	50 %	25 %	0 %	212208444
508	NC_011526	ATT	2	6	35538	35543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208444
509	NC_011526	ATT	2	6	35559	35564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208444
510	NC_011526	ATGA	2	8	35580	35587	50 %	25 %	25 %	0 %	212208444
511	NC_011526	TCA	2	6	35599	35604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208444
512	NC_011526	CAG	2	6	35690	35695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208444
513	NC_011526	ATG	2	6	35721	35726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208444
514	NC_011526	TTCT	2	8	35749	35756	0 %	75 %	0 %	25 %	212208444
515	NC_011526	TG	3	6	35764	35769	0 %	50 %	50 %	0 %	212208444
516	NC_011526	GGC	2	6	35789	35794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212208444
517	NC_011526	ATG	2	6	35815	35820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208444
518	NC_011526	TAAT	2	8	35893	35900	50 %	50 %	0 %	0 %	212208444
519	NC_011526	AAC	2	6	35939	35944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208444
520	NC_011526	A	7	7	36031	36037	100 %	0 %	0 %	0 %	212208445
521	NC_011526	CAG	2	6	36047	36052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208445
522	NC_011526	CGT	2	6	36069	36074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208445
523	NC_011526	TAAA	2	8	36077	36084	75 %	25 %	0 %	0 %	212208445
524	NC_011526	GCA	2	6	36085	36090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208445
525	NC_011526	CCT	2	6	36092	36097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212208445
526	NC_011526	CAGC	2	8	36253	36260	25 %	0 %	25 %	50 %	212208445
527	NC_011526	ATG	2	6	36287	36292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208445
528	NC_011526	ATT	2	6	36307	36312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208445
529	NC_011526	GTC	2	6	36317	36322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208445
530	NC_011526	GAC	2	6	36323	36328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208445
531	NC_011526	ACG	2	6	36434	36439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208445
532	NC_011526	ATT	2	6	36446	36451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208445
533	NC_011526	AGA	2	6	36480	36485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208445
534	NC_011526	A	7	7	36589	36595	100 %	0 %	0 %	0 %	212208445
535	NC_011526	A	6	6	36663	36668	100 %	0 %	0 %	0 %	212208445
536	NC_011526	TATTGC	2	12	36681	36692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212208445
537	NC_011526	GCA	2	6	36758	36763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208445
538	NC_011526	AAACA	2	10	36764	36773	80 %	0 %	0 %	20 %	212208445
539	NC_011526	ATC	2	6	36839	36844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208445
540	NC_011526	GC	3	6	36848	36853	0 %	0 %	50 %	50 %	212208445
541	NC_011526	TG	3	6	36905	36910	0 %	50 %	50 %	0 %	212208445
542	NC_011526	GAAT	2	8	37019	37026	50 %	25 %	25 %	0 %	212208446
543	NC_011526	AAAG	2	8	37109	37116	75 %	0 %	25 %	0 %	212208446
544	NC_011526	TTTA	2	8	37131	37138	25 %	75 %	0 %	0 %	212208446
545	NC_011526	A	7	7	37307	37313	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
546	NC_011526	GAA	2	6	37421	37426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208446
547	NC_011526	A	7	7	37591	37597	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
548	NC_011526	GA	3	6	37663	37668	50 %	0 %	50 %	0 %	212208446
549	NC_011526	AGATT	2	10	37688	37697	40 %	40 %	20 %	0 %	212208446
550	NC_011526	A	6	6	37708	37713	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
551	NC_011526	A	6	6	37730	37735	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
552	NC_011526	TAAT	2	8	37745	37752	50 %	50 %	0 %	0 %	212208446
553	NC_011526	AGA	2	6	37761	37766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208446
554	NC_011526	CAT	2	6	37857	37862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208446
555	NC_011526	AGT	2	6	37873	37878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208446
556	NC_011526	AAG	2	6	37883	37888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208446
557	NC_011526	TTA	2	6	37967	37972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208446
558	NC_011526	AGA	3	9	37998	38006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208446
559	NC_011526	GAAA	2	8	38013	38020	75 %	0 %	25 %	0 %	212208446
560	NC_011526	GAA	2	6	38023	38028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208446
561	NC_011526	GAA	2	6	38033	38038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208446
562	NC_011526	ATAAA	2	10	38063	38072	80 %	20 %	0 %	0 %	212208446
563	NC_011526	TTGAA	2	10	38132	38141	40 %	40 %	20 %	0 %	212208446
564	NC_011526	TAA	2	6	38154	38159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208446
565	NC_011526	GCTT	2	8	38212	38219	0 %	50 %	25 %	25 %	212208446
566	NC_011526	A	6	6	38242	38247	100 %	0 %	0 %	0 %	212208446
567	NC_011526	GGA	2	6	38257	38262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208446
568	NC_011526	GAG	2	6	38275	38280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208446
569	NC_011526	TGG	2	6	38291	38296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208446
570	NC_011526	TTCT	2	8	38425	38432	0 %	75 %	0 %	25 %	212208447
571	NC_011526	TTC	2	6	38449	38454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208447
572	NC_011526	CG	3	6	38497	38502	0 %	0 %	50 %	50 %	212208447
573	NC_011526	GAGCT	2	10	38524	38533	20 %	20 %	40 %	20 %	212208447
574	NC_011526	CGAA	2	8	38596	38603	50 %	0 %	25 %	25 %	212208447
575	NC_011526	A	6	6	38644	38649	100 %	0 %	0 %	0 %	212208447
576	NC_011526	A	6	6	38707	38712	100 %	0 %	0 %	0 %	212208447
577	NC_011526	TTC	2	6	38800	38805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208447
578	NC_011526	T	6	6	38836	38841	0 %	100 %	0 %	0 %	212208447
579	NC_011526	CG	3	6	38848	38853	0 %	0 %	50 %	50 %	212208447
580	NC_011526	TTG	2	6	38882	38887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208447
581	NC_011526	T	8	8	38905	38912	0 %	100 %	0 %	0 %	212208447
582	NC_011526	TTGAT	2	10	38940	38949	20 %	60 %	20 %	0 %	212208447

< Previous 12Next >