MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	ATTGC	2	10	3896	3905	20 %	40 %	20 %	20 %	206895113
2	NC_011295	GCTGG	2	10	4004	4013	0 %	20 %	60 %	20 %	206895113
3	NC_011295	GCTAA	2	10	4661	4670	40 %	20 %	20 %	20 %	206895739
4	NC_011295	CAACG	2	10	8645	8654	40 %	0 %	20 %	40 %	206896121
5	NC_011295	AGAAC	2	10	9286	9295	60 %	0 %	20 %	20 %	206895327
6	NC_011295	GCTCA	2	10	13873	13882	20 %	20 %	20 %	40 %	206895847
7	NC_011295	CACTT	2	10	14181	14190	20 %	40 %	0 %	40 %	206895847
8	NC_011295	CAGCT	2	10	14290	14299	20 %	20 %	20 %	40 %	206895847
9	NC_011295	AAAAG	2	10	18720	18729	80 %	0 %	20 %	0 %	206895542
10	NC_011295	CCTTG	2	10	18930	18939	0 %	40 %	20 %	40 %	206895542
11	NC_011295	TACGG	2	10	19855	19864	20 %	20 %	40 %	20 %	206895670
12	NC_011295	CCGTT	2	10	20192	20201	0 %	40 %	20 %	40 %	206895088
13	NC_011295	TCGTA	2	10	21437	21446	20 %	40 %	20 %	20 %	206895080
14	NC_011295	CCTTC	2	10	22264	22273	0 %	40 %	0 %	60 %	206895881
15	NC_011295	TTTGC	2	10	23192	23201	0 %	60 %	20 %	20 %	206895172
16	NC_011295	TGCCA	2	10	23856	23865	20 %	20 %	20 %	40 %	206895658
17	NC_011295	GTTGG	2	10	26871	26880	0 %	40 %	60 %	0 %	206895448
18	NC_011295	CTTAA	2	10	27879	27888	40 %	40 %	0 %	20 %	206895448
19	NC_011295	GAAAA	2	10	29525	29534	80 %	0 %	20 %	0 %	206895579
20	NC_011295	CCACT	2	10	30897	30906	20 %	20 %	0 %	60 %	206896272
21	NC_011295	AGATC	2	10	31834	31843	40 %	20 %	20 %	20 %	206896272
22	NC_011295	ACTCC	2	10	33149	33158	20 %	20 %	0 %	60 %	206895272
23	NC_011295	GCCAT	2	10	35199	35208	20 %	20 %	20 %	40 %	206895395
24	NC_011295	GAACT	2	10	36435	36444	40 %	20 %	20 %	20 %	206895489
25	NC_011295	ATATC	2	10	37144	37153	40 %	40 %	0 %	20 %	206896382
26	NC_011295	AGAAA	2	10	38656	38665	80 %	0 %	20 %	0 %	206895806
27	NC_011295	AGTTT	2	10	41203	41212	20 %	60 %	20 %	0 %	206895547
28	NC_011295	GGATG	2	10	41618	41627	20 %	20 %	60 %	0 %	206896367
29	NC_011295	GCCAG	2	10	42110	42119	20 %	0 %	40 %	40 %	206896367
30	NC_011295	GGGCC	2	10	45659	45668	0 %	0 %	60 %	40 %	206895207
31	NC_011295	TGCAG	2	10	45905	45914	20 %	20 %	40 %	20 %	206896042
32	NC_011295	CCCAT	2	10	50372	50381	20 %	20 %	0 %	60 %	206896426
33	NC_011295	CATAC	2	10	51500	51509	40 %	20 %	0 %	40 %	206896426
34	NC_011295	ATTTC	2	10	54429	54438	20 %	60 %	0 %	20 %	206895812
35	NC_011295	TGGGC	2	10	58367	58376	0 %	20 %	60 %	20 %	206895387
36	NC_011295	AGCAA	2	10	58922	58931	60 %	0 %	20 %	20 %	206895387
37	NC_011295	AAAGA	2	10	59231	59240	80 %	0 %	20 %	0 %	206895387
38	NC_011295	AAGCA	2	10	61757	61766	60 %	0 %	20 %	20 %	206896094
39	NC_011295	GCCAG	2	10	63147	63156	20 %	0 %	40 %	40 %	206895447
40	NC_011295	CGATC	2	10	64473	64482	20 %	20 %	20 %	40 %	206896229
41	NC_011295	GCTAC	2	10	66689	66698	20 %	20 %	20 %	40 %	206896408
42	NC_011295	ATACC	2	10	69245	69254	40 %	20 %	0 %	40 %	206895652
43	NC_011295	CACAA	2	10	70257	70266	60 %	0 %	0 %	40 %	206895652
44	NC_011295	TCAGT	2	10	72454	72463	20 %	40 %	20 %	20 %	206895112
45	NC_011295	ATGAC	2	10	73184	73193	40 %	20 %	20 %	20 %	206895112
46	NC_011295	AGTAC	2	10	74181	74190	40 %	20 %	20 %	20 %	206896449
47	NC_011295	TGGAA	2	10	77739	77748	40 %	20 %	40 %	0 %	206896461
48	NC_011295	TGAAG	2	10	79486	79495	40 %	20 %	40 %	0 %	206895251
49	NC_011295	GTGAA	2	10	81702	81711	40 %	20 %	40 %	0 %	206895251
50	NC_011295	TCAGA	2	10	82432	82441	40 %	20 %	20 %	20 %	206895251
51	NC_011295	TGCCA	2	10	92836	92845	20 %	20 %	20 %	40 %	206896030
52	NC_011295	AACAG	2	10	93665	93674	60 %	0 %	20 %	20 %	206896030
53	NC_011295	TCAGT	2	10	93907	93916	20 %	40 %	20 %	20 %	206896030
54	NC_011295	ACTGG	2	10	96425	96434	20 %	20 %	40 %	20 %	206895589
55	NC_011295	TGGGA	2	10	96905	96914	20 %	20 %	60 %	0 %	206896417
56	NC_011295	GGCTC	2	10	97095	97104	0 %	20 %	40 %	40 %	206896417
57	NC_011295	CTTTT	2	10	103804	103813	0 %	80 %	0 %	20 %	206895904
58	NC_011295	AGAAA	2	10	106714	106723	80 %	0 %	20 %	0 %	206896086
59	NC_011295	CAGAA	2	10	108815	108824	60 %	0 %	20 %	20 %	206895465
60	NC_011295	GCCAG	2	10	109538	109547	20 %	0 %	40 %	40 %	206895465
61	NC_011295	TTTCC	2	10	109858	109867	0 %	60 %	0 %	40 %	206895465
62	NC_011295	TTTGT	2	10	111640	111649	0 %	80 %	20 %	0 %	206896505
63	NC_011295	CTCAG	2	10	113424	113433	20 %	20 %	20 %	40 %	206895349
64	NC_011295	AAGGA	2	10	118594	118603	60 %	0 %	40 %	0 %	206896154
65	NC_011295	CAGCA	2	10	118748	118757	40 %	0 %	20 %	40 %	206896154
66	NC_011295	TGTTT	2	10	119106	119115	0 %	80 %	20 %	0 %	206896039
67	NC_011295	GCATG	2	10	122854	122863	20 %	20 %	40 %	20 %	206895209
68	NC_011295	TCCAA	2	10	123632	123641	40 %	20 %	0 %	40 %	206896525
69	NC_011295	TCCAA	2	10	126181	126190	40 %	20 %	0 %	40 %	206895698
70	NC_011295	AAGAG	2	10	126470	126479	60 %	0 %	40 %	0 %	206895698
71	NC_011295	CATAG	2	10	126840	126849	40 %	20 %	20 %	20 %	206895698
72	NC_011295	GACCA	2	10	132058	132067	40 %	0 %	20 %	40 %	206895761
73	NC_011295	AATGG	2	10	132278	132287	40 %	20 %	40 %	0 %	206895761
74	NC_011295	TAAAG	2	10	134910	134919	60 %	20 %	20 %	0 %	206895586
75	NC_011295	CTGAT	2	10	143202	143211	20 %	40 %	20 %	20 %	206895771
76	NC_011295	TTCTT	2	10	144250	144259	0 %	80 %	0 %	20 %	206896099
77	NC_011295	TGGGA	2	10	146459	146468	20 %	20 %	60 %	0 %	206895425
78	NC_011295	CCTTC	2	10	146578	146587	0 %	40 %	0 %	60 %	206895425
79	NC_011295	CTCTG	2	10	150609	150618	0 %	40 %	20 %	40 %	206895786
80	NC_011295	GTTAT	2	10	158079	158088	20 %	60 %	20 %	0 %	206896092
81	NC_011295	CATGC	2	10	159380	159389	20 %	20 %	20 %	40 %	206895660
82	NC_011295	GTTTT	2	10	159727	159736	0 %	80 %	20 %	0 %	206896299
83	NC_011295	TTTTC	2	10	159871	159880	0 %	80 %	0 %	20 %	206896299
84	NC_011295	ACGGC	2	10	163394	163403	20 %	0 %	40 %	40 %	206895266
85	NC_011295	TGCCA	2	10	164256	164265	20 %	20 %	20 %	40 %	206895266
86	NC_011295	GCTTT	2	10	164725	164734	0 %	60 %	20 %	20 %	206895803
87	NC_011295	TTTTC	2	10	164844	164853	0 %	80 %	0 %	20 %	206895803
88	NC_011295	TCCGA	2	10	168838	168847	20 %	20 %	20 %	40 %	206896380
89	NC_011295	TGGTG	2	10	168966	168975	0 %	40 %	60 %	0 %	206896380
90	NC_011295	GCCAC	2	10	170237	170246	20 %	0 %	20 %	60 %	206896288
91	NC_011295	TCCAT	2	10	171256	171265	20 %	40 %	0 %	40 %	206895631
92	NC_011295	CATCT	2	10	172936	172945	20 %	40 %	0 %	40 %	206895308
93	NC_011295	CTTTT	2	10	174781	174790	0 %	80 %	0 %	20 %	206895890
94	NC_011295	TGGTA	2	10	174884	174893	20 %	40 %	40 %	0 %	206895890
95	NC_011295	AAGGA	2	10	177210	177219	60 %	0 %	40 %	0 %	206895457
96	NC_011295	AAAGA	2	10	184106	184115	80 %	0 %	20 %	0 %	206896298
97	NC_011295	CCTTC	2	10	187982	187991	0 %	40 %	0 %	60 %	206895149
98	NC_011295	AAGGT	2	10	188770	188779	40 %	20 %	40 %	0 %	206896159
99	NC_011295	AGTGA	2	10	191603	191612	40 %	20 %	40 %	0 %	206895264
100	NC_011295	TCTTT	2	10	192008	192017	0 %	80 %	0 %	20 %	206895264
101	NC_011295	GCAAA	2	10	193021	193030	60 %	0 %	20 %	20 %	206896219
102	NC_011295	TGCAT	2	10	193776	193785	20 %	40 %	20 %	20 %	206895553
103	NC_011295	TTACA	2	10	193838	193847	40 %	40 %	0 %	20 %	206895553
104	NC_011295	AAGAT	2	10	195208	195217	60 %	20 %	20 %	0 %	206895314
105	NC_011295	TTTCC	2	10	197440	197449	0 %	60 %	0 %	40 %	206895200
106	NC_011295	TTTTG	2	10	198356	198365	0 %	80 %	20 %	0 %	206896143
107	NC_011295	AAGAA	2	10	199965	199974	80 %	0 %	20 %	0 %	206895913
108	NC_011295	AAAGC	2	10	201557	201566	60 %	0 %	20 %	20 %	206895285
109	NC_011295	TTGCT	2	10	204563	204572	0 %	60 %	20 %	20 %	206895725
110	NC_011295	AAAGC	2	10	205677	205686	60 %	0 %	20 %	20 %	206896303
111	NC_011295	TGTGC	2	10	209966	209975	0 %	40 %	40 %	20 %	206895352
112	NC_011295	CAAGC	2	10	210967	210976	40 %	0 %	20 %	40 %	206896393
113	NC_011295	AAAGC	2	10	211961	211970	60 %	0 %	20 %	20 %	206895255
114	NC_011295	CACAT	2	10	212149	212158	40 %	20 %	0 %	40 %	206895255
115	NC_011295	ACCAA	2	10	213560	213569	60 %	0 %	0 %	40 %	206896071
116	NC_011295	CCAAT	2	10	213891	213900	40 %	20 %	0 %	40 %	206896071
117	NC_011295	GGAAG	2	10	222176	222185	40 %	0 %	60 %	0 %	206896369
118	NC_011295	GCAAG	2	10	224810	224819	40 %	0 %	40 %	20 %	206895441
119	NC_011295	AACCA	2	10	226025	226034	60 %	0 %	0 %	40 %	206895899
120	NC_011295	AAAGG	2	10	226341	226350	60 %	0 %	40 %	0 %	206895899
121	NC_011295	GTCAT	2	10	226501	226510	20 %	40 %	20 %	20 %	206895899
122	NC_011295	ACTTC	2	10	229634	229643	20 %	40 %	0 %	40 %	206895976
123	NC_011295	GTTAG	2	10	230737	230746	20 %	40 %	40 %	0 %	206895697
124	NC_011295	TTTGG	2	10	232955	232964	0 %	60 %	40 %	0 %	206896132
125	NC_011295	ATATG	2	10	235909	235918	40 %	40 %	20 %	0 %	206896246
126	NC_011295	GCCAA	2	10	236077	236086	40 %	0 %	20 %	40 %	206895333
127	NC_011295	TTGTT	2	10	237088	237097	0 %	80 %	20 %	0 %	206895831
128	NC_011295	CACTG	2	10	237703	237712	20 %	20 %	20 %	40 %	206895831
129	NC_011295	CCCAG	2	10	238337	238346	20 %	0 %	20 %	60 %	206895831
130	NC_011295	ATTCC	2	10	242268	242277	20 %	40 %	0 %	40 %	206895808
131	NC_011295	TGCCA	2	10	243295	243304	20 %	20 %	20 %	40 %	206896462
132	NC_011295	GCCAT	2	10	249498	249507	20 %	20 %	20 %	40 %	206896549
133	NC_011295	GGTTT	2	10	250698	250707	0 %	60 %	40 %	0 %	206895691
134	NC_011295	CTAAA	2	10	251463	251472	60 %	20 %	0 %	20 %	206895691
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251	NC_011295	CTCCA	2	10	464680	464689	20 %	20 %	0 %	60 %	206895118
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256	NC_011295	GCTTG	2	10	472144	472153	0 %	40 %	40 %	20 %	206895293
257	NC_011295	GTCTT	2	10	474335	474344	0 %	60 %	20 %	20 %	206896207
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260	NC_011295	AAGCC	2	10	477293	477302	40 %	0 %	20 %	40 %	206895183
261	NC_011295	TGCTT	2	10	477480	477489	0 %	60 %	20 %	20 %	206895183
262	NC_011295	GTTAA	2	10	478279	478288	40 %	40 %	20 %	0 %	206895183
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