MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 24215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	TATG	2	8	6	13	25 %	50 %	25 %	0 %	206895191
2	NC_011295	TGA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895191
3	NC_011295	AAT	2	6	169	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895191
4	NC_011295	CT	3	6	233	238	0 %	50 %	0 %	50 %	206895191
5	NC_011295	CTG	2	6	332	337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895191
6	NC_011295	GGAG	2	8	382	389	25 %	0 %	75 %	0 %	206895191
7	NC_011295	CGG	2	6	662	667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895191
8	NC_011295	GGA	2	6	672	677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895191
9	NC_011295	TGG	2	6	687	692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895191
10	NC_011295	GTA	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895191
11	NC_011295	AAG	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895191
12	NC_011295	AGCT	2	8	1002	1009	25 %	25 %	25 %	25 %	206896538
13	NC_011295	CAGA	2	8	1031	1038	50 %	0 %	25 %	25 %	206896538
14	NC_011295	CTT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896538
15	NC_011295	GGCT	2	8	1189	1196	0 %	25 %	50 %	25 %	206896538
16	NC_011295	TGTA	2	8	1277	1284	25 %	50 %	25 %	0 %	206896538
17	NC_011295	T	6	6	1295	1300	0 %	100 %	0 %	0 %	206896538
18	NC_011295	GAG	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896538
19	NC_011295	GCT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896538
20	NC_011295	AAAG	2	8	1395	1402	75 %	0 %	25 %	0 %	206896538
21	NC_011295	TTC	2	6	1441	1446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896538
22	NC_011295	AT	3	6	1528	1533	50 %	50 %	0 %	0 %	206896538
23	NC_011295	TTA	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896538
24	NC_011295	CAT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896538
25	NC_011295	ATG	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896538
26	NC_011295	AGC	2	6	1653	1658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896538
27	NC_011295	AGTA	2	8	1659	1666	50 %	25 %	25 %	0 %	206896538
28	NC_011295	T	6	6	1687	1692	0 %	100 %	0 %	0 %	206896538
29	NC_011295	TGA	3	9	1736	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896538
30	NC_011295	AAG	2	6	1769	1774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896538
31	NC_011295	GAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895125
32	NC_011295	ACG	2	6	1913	1918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895125
33	NC_011295	TGA	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895125
34	NC_011295	AAG	2	6	1968	1973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895125
35	NC_011295	ATG	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895125
36	NC_011295	AGC	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895125
37	NC_011295	AGA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895125
38	NC_011295	TGC	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895125
39	NC_011295	AGCA	2	8	2372	2379	50 %	0 %	25 %	25 %	206895125
40	NC_011295	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895125
41	NC_011295	ATA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895125
42	NC_011295	CAG	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896061
43	NC_011295	AG	3	6	2820	2825	50 %	0 %	50 %	0 %	206896061
44	NC_011295	A	6	6	2871	2876	100 %	0 %	0 %	0 %	206896061
45	NC_011295	ACT	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896061
46	NC_011295	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	206896061
47	NC_011295	AGG	2	6	3098	3103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896061
48	NC_011295	GAA	2	6	3111	3116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896061
49	NC_011295	CA	3	6	3164	3169	50 %	0 %	0 %	50 %	206896061
50	NC_011295	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	206896061
51	NC_011295	CAT	2	6	3192	3197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896061
52	NC_011295	CTG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896061
53	NC_011295	GGA	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896061
54	NC_011295	AGT	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895113
55	NC_011295	AGCA	2	8	3509	3516	50 %	0 %	25 %	25 %	206895113
56	NC_011295	GAA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895113
57	NC_011295	GCA	2	6	3571	3576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895113
58	NC_011295	CAA	2	6	3716	3721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895113
59	NC_011295	CTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895113
60	NC_011295	GGT	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895113
61	NC_011295	CAC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895113
62	NC_011295	CAG	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895113
63	NC_011295	ATTGC	2	10	3896	3905	20 %	40 %	20 %	20 %	206895113
64	NC_011295	AGC	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895113
65	NC_011295	TGA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895113
66	NC_011295	GCTGG	2	10	4004	4013	0 %	20 %	60 %	20 %	206895113
67	NC_011295	GGC	2	6	4023	4028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895113
68	NC_011295	CTGC	2	8	4051	4058	0 %	25 %	25 %	50 %	206895113
69	NC_011295	TGC	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895113
70	NC_011295	AGC	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895739
71	NC_011295	AAG	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895739
72	NC_011295	A	7	7	4528	4534	100 %	0 %	0 %	0 %	206895739
73	NC_011295	CCT	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895739
74	NC_011295	TAT	2	6	4552	4557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895739
75	NC_011295	CAG	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895739
76	NC_011295	GGC	2	6	4604	4609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895739
77	NC_011295	ACT	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895739
78	NC_011295	GCTAA	2	10	4661	4670	40 %	20 %	20 %	20 %	206895739
79	NC_011295	CTT	2	6	4707	4712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895739
80	NC_011295	GGA	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895739
81	NC_011295	AAC	2	6	4745	4750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895739
82	NC_011295	GGT	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895739
83	NC_011295	GTA	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
84	NC_011295	GAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
85	NC_011295	TAG	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
86	NC_011295	AAG	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
87	NC_011295	GA	3	6	5256	5261	50 %	0 %	50 %	0 %	206896391
88	NC_011295	AAC	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896391
89	NC_011295	TCT	2	6	5377	5382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896391
90	NC_011295	TAAG	2	8	5387	5394	50 %	25 %	25 %	0 %	206896391
91	NC_011295	GTA	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
92	NC_011295	CTT	2	6	5607	5612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896391
93	NC_011295	AC	3	6	5615	5620	50 %	0 %	0 %	50 %	206896391
94	NC_011295	GCT	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896391
95	NC_011295	TTA	2	6	5681	5686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896391
96	NC_011295	CAAG	2	8	5715	5722	50 %	0 %	25 %	25 %	206896391
97	NC_011295	CAC	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896391
98	NC_011295	AAG	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
99	NC_011295	AAGG	2	8	5942	5949	50 %	0 %	50 %	0 %	206896391
100	NC_011295	ACA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896391
101	NC_011295	TCA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896391
102	NC_011295	TGC	2	6	6109	6114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896391
103	NC_011295	GAAA	2	8	6142	6149	75 %	0 %	25 %	0 %	206896391
104	NC_011295	GTT	2	6	6159	6164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896391
105	NC_011295	T	6	6	6250	6255	0 %	100 %	0 %	0 %	206896391
106	NC_011295	GAT	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
107	NC_011295	TCTA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	0 %	25 %	206896391
108	NC_011295	GAA	2	6	6399	6404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
109	NC_011295	CCA	2	6	6413	6418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896391
110	NC_011295	ATGA	2	8	6433	6440	50 %	25 %	25 %	0 %	206896391
111	NC_011295	GAA	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
112	NC_011295	AAG	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
113	NC_011295	AAC	2	6	6556	6561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896391
114	NC_011295	CAG	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896391
115	NC_011295	CTT	2	6	6593	6598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896391
116	NC_011295	AAG	2	6	6665	6670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
117	NC_011295	CAAA	2	8	6760	6767	75 %	0 %	0 %	25 %	206896391
118	NC_011295	TGG	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896391
119	NC_011295	TTGT	2	8	6793	6800	0 %	75 %	25 %	0 %	206896391
120	NC_011295	AAG	2	6	7024	7029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
121	NC_011295	ATT	2	6	7086	7091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895496
122	NC_011295	TGAT	2	8	7114	7121	25 %	50 %	25 %	0 %	206895496
123	NC_011295	CAG	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895496
124	NC_011295	GAA	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895496
125	NC_011295	TTC	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895496
126	NC_011295	GGC	2	6	7296	7301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895496
127	NC_011295	AAG	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895496
128	NC_011295	ACTT	2	8	7408	7415	25 %	50 %	0 %	25 %	206895496
129	NC_011295	A	6	6	7513	7518	100 %	0 %	0 %	0 %	206895496
130	NC_011295	TAA	2	6	7528	7533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895496
131	NC_011295	CAC	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895496
132	NC_011295	AGA	2	6	7592	7597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895496
133	NC_011295	CAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895496
134	NC_011295	ATTG	2	8	7975	7982	25 %	50 %	25 %	0 %	206896121
135	NC_011295	CTA	3	9	8100	8108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896121
136	NC_011295	ATG	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896121
137	NC_011295	ATT	2	6	8319	8324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896121
138	NC_011295	A	6	6	8394	8399	100 %	0 %	0 %	0 %	206896121
139	NC_011295	TGG	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896121
140	NC_011295	AAG	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896121
141	NC_011295	ATG	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896121
142	NC_011295	CACG	2	8	8542	8549	25 %	0 %	25 %	50 %	206896121
143	NC_011295	CAT	2	6	8587	8592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896121
144	NC_011295	GAG	2	6	8627	8632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896121
145	NC_011295	CAACG	2	10	8645	8654	40 %	0 %	20 %	40 %	206896121
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148	NC_011295	CCTT	2	8	8734	8741	0 %	50 %	0 %	50 %	206895327
149	NC_011295	T	7	7	8854	8860	0 %	100 %	0 %	0 %	206895327
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151	NC_011295	TGG	2	6	8947	8952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895327
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164	NC_011295	TTGG	2	8	9318	9325	0 %	50 %	50 %	0 %	206895327
165	NC_011295	ACC	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895327
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172	NC_011295	T	6	6	9750	9755	0 %	100 %	0 %	0 %	206895327
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179	NC_011295	AGTG	2	8	10286	10293	25 %	25 %	50 %	0 %	206895327
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249	NC_011295	CTG	2	6	14444	14449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895847
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251	NC_011295	AACATA	2	12	14584	14595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	206895847
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253	NC_011295	GCA	2	6	14773	14778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895847
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257	NC_011295	TGT	2	6	14984	14989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895373
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259	NC_011295	GTG	2	6	15060	15065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895373
260	NC_011295	A	6	6	15145	15150	100 %	0 %	0 %	0 %	206895204
261	NC_011295	GGT	2	6	15177	15182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895204
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266	NC_011295	TCT	2	6	15373	15378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895204
267	NC_011295	GCA	3	9	15411	15419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895204
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