MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 24215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011295	GCT	2	6	233673	233678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895082
4002	NC_011295	GGA	2	6	233789	233794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895082
4003	NC_011295	AAGA	2	8	233844	233851	75 %	0 %	25 %	0 %	206895082
4004	NC_011295	GA	3	6	233880	233885	50 %	0 %	50 %	0 %	206895082
4005	NC_011295	TGA	2	6	233939	233944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895082
4006	NC_011295	CCA	2	6	233947	233952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895082
4007	NC_011295	CCT	2	6	234168	234173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895082
4008	NC_011295	AAC	2	6	234194	234199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895082
4009	NC_011295	GAA	2	6	234228	234233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895082
4010	NC_011295	TTA	2	6	234242	234247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895082
4011	NC_011295	GGA	2	6	234260	234265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895082
4012	NC_011295	TTG	2	6	234314	234319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895476
4013	NC_011295	TGCT	2	8	234337	234344	0 %	50 %	25 %	25 %	206895476
4014	NC_011295	TAG	2	6	234345	234350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895476
4015	NC_011295	ATG	2	6	234376	234381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895476
4016	NC_011295	CCAA	2	8	234435	234442	50 %	0 %	0 %	50 %	206895927
4017	NC_011295	CTG	2	6	234542	234547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895927
4018	NC_011295	TTC	2	6	234616	234621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895927
4019	NC_011295	TTC	2	6	234764	234769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895927
4020	NC_011295	TCA	2	6	235014	235019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895927
4021	NC_011295	GCA	2	6	235077	235082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895927
4022	NC_011295	TGT	2	6	235203	235208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896246
4023	NC_011295	GTA	2	6	235295	235300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896246
4024	NC_011295	TGG	2	6	235362	235367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896246
4025	NC_011295	AGT	2	6	235474	235479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896246
4026	NC_011295	CCA	2	6	235481	235486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896246
4027	NC_011295	CTC	2	6	235489	235494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896246
4028	NC_011295	CTA	2	6	235536	235541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896246
4029	NC_011295	GT	3	6	235545	235550	0 %	50 %	50 %	0 %	206896246
4030	NC_011295	CCA	2	6	235562	235567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896246
4031	NC_011295	ATGCAC	2	12	235575	235586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206896246
4032	NC_011295	GACATG	2	12	235613	235624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206896246
4033	NC_011295	GCT	2	6	235666	235671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896246
4034	NC_011295	CA	3	6	235765	235770	50 %	0 %	0 %	50 %	206896246
4035	NC_011295	TCC	2	6	235781	235786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896246
4036	NC_011295	TA	3	6	235792	235797	50 %	50 %	0 %	0 %	206896246
4037	NC_011295	TTTC	2	8	235799	235806	0 %	75 %	0 %	25 %	206896246
4038	NC_011295	TCT	2	6	235811	235816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896246
4039	NC_011295	TCT	2	6	235874	235879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896246
4040	NC_011295	ATATG	2	10	235909	235918	40 %	40 %	20 %	0 %	206896246
4041	NC_011295	GC	3	6	235957	235962	0 %	0 %	50 %	50 %	206896246
4042	NC_011295	TTG	2	6	235981	235986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896246
4043	NC_011295	TGT	2	6	236015	236020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896246
4044	NC_011295	T	6	6	236020	236025	0 %	100 %	0 %	0 %	206896246
4045	NC_011295	TTC	2	6	236030	236035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896246
4046	NC_011295	TAT	2	6	236055	236060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896246
4047	NC_011295	ACCA	2	8	236069	236076	50 %	0 %	0 %	50 %	206896246
4048	NC_011295	GCCAA	2	10	236077	236086	40 %	0 %	20 %	40 %	206895333
4049	NC_011295	CAG	2	6	236185	236190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895333
4050	NC_011295	TACA	2	8	236201	236208	50 %	25 %	0 %	25 %	206895333
4051	NC_011295	GGC	2	6	236306	236311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895333
4052	NC_011295	CCAT	2	8	236334	236341	25 %	25 %	0 %	50 %	206895333
4053	NC_011295	GTA	2	6	236430	236435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895333
4054	NC_011295	CTG	2	6	236459	236464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895333
4055	NC_011295	TTG	2	6	236477	236482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895333
4056	NC_011295	ACC	2	6	236540	236545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895333
4057	NC_011295	GT	3	6	236710	236715	0 %	50 %	50 %	0 %	206895333
4058	NC_011295	TAG	2	6	236734	236739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895333
4059	NC_011295	AAG	2	6	236873	236878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896028
4060	NC_011295	A	6	6	236893	236898	100 %	0 %	0 %	0 %	206896028
4061	NC_011295	AGG	2	6	236936	236941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896028
4062	NC_011295	TAG	2	6	236966	236971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895831
4063	NC_011295	CTT	2	6	236972	236977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895831
4064	NC_011295	GAT	2	6	237057	237062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895831
4065	NC_011295	TAG	2	6	237072	237077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895831
4066	NC_011295	TTGTT	2	10	237088	237097	0 %	80 %	20 %	0 %	206895831
4067	NC_011295	CTG	2	6	237220	237225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895831
4068	NC_011295	GGA	2	6	237408	237413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895831
4069	NC_011295	GTT	2	6	237545	237550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895831
4070	NC_011295	CACTG	2	10	237703	237712	20 %	20 %	20 %	40 %	206895831
4071	NC_011295	AGT	2	6	237845	237850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895831
4072	NC_011295	TAG	2	6	237972	237977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895831
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4074	NC_011295	TCA	2	6	238162	238167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895831
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4078	NC_011295	CCCAG	2	10	238337	238346	20 %	0 %	20 %	60 %	206895831
4079	NC_011295	TTTC	2	8	238370	238377	0 %	75 %	0 %	25 %	206895831
4080	NC_011295	CGT	2	6	238379	238384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895831
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4082	NC_011295	CAG	2	6	238463	238468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895831
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4090	NC_011295	GTA	2	6	238955	238960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895330
4091	NC_011295	TTG	2	6	239108	239113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895330
4092	NC_011295	ATGG	2	8	239227	239234	25 %	25 %	50 %	0 %	206895330
4093	NC_011295	CAG	2	6	239328	239333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895330
4094	NC_011295	GCT	2	6	239335	239340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895330
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4100	NC_011295	AGC	2	6	239546	239551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895330
4101	NC_011295	AGA	2	6	239565	239570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895330
4102	NC_011295	TGCA	2	8	239582	239589	25 %	25 %	25 %	25 %	206895330
4103	NC_011295	TTA	2	6	239624	239629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895330
4104	NC_011295	GAA	2	6	239698	239703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895330
4105	NC_011295	AGG	2	6	239759	239764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895330
4106	NC_011295	TGG	2	6	239820	239825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895611
4107	NC_011295	GAAA	2	8	239923	239930	75 %	0 %	25 %	0 %	206895611
4108	NC_011295	GAAG	2	8	239978	239985	50 %	0 %	50 %	0 %	206895611
4109	NC_011295	TGC	2	6	240003	240008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895611
4110	NC_011295	CAG	2	6	240063	240068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895611
4111	NC_011295	TTGA	2	8	240191	240198	25 %	50 %	25 %	0 %	206895611
4112	NC_011295	GAA	2	6	240248	240253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895611
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4121	NC_011295	CCA	2	6	240894	240899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895611
4122	NC_011295	TGA	2	6	240901	240906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895611
4123	NC_011295	TGA	2	6	240922	240927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895611
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4125	NC_011295	TTAACG	2	12	241106	241117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	206895389
4126	NC_011295	CAT	2	6	241173	241178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895389
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4128	NC_011295	CAT	2	6	241326	241331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895389
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4132	NC_011295	TGC	2	6	241434	241439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895389
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4160	NC_011295	CAC	2	6	242725	242730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896462
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4227	NC_011295	GAAG	2	8	246078	246085	50 %	0 %	50 %	0 %	206896063
4228	NC_011295	GT	3	6	246152	246157	0 %	50 %	50 %	0 %	206896063
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4238	NC_011295	ATCC	2	8	246512	246519	25 %	25 %	0 %	50 %	206896063
4239	NC_011295	TTC	2	6	246555	246560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896063
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4242	NC_011295	CTT	2	6	246617	246622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896063
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4486	NC_011295	GGA	2	6	261226	261231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896398
4487	NC_011295	AGT	2	6	261297	261302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896398
4488	NC_011295	ACT	2	6	261310	261315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896398
4489	NC_011295	AG	4	8	261431	261438	50 %	0 %	50 %	0 %	206896398
4490	NC_011295	TGGA	2	8	261450	261457	25 %	25 %	50 %	0 %	206896398
4491	NC_011295	TGC	2	6	261586	261591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896004
4492	NC_011295	AGG	2	6	261614	261619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896004
4493	NC_011295	CAG	2	6	261626	261631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896004
4494	NC_011295	CAA	2	6	261695	261700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896004
4495	NC_011295	ATG	2	6	261784	261789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896004
4496	NC_011295	AAG	2	6	261828	261833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896004
4497	NC_011295	TAT	2	6	261935	261940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896004
4498	NC_011295	TTGGT	2	10	261961	261970	0 %	60 %	40 %	0 %	206896004
4499	NC_011295	CGG	2	6	261989	261994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206896004
4500	NC_011295	CAAA	2	8	262059	262066	75 %	0 %	0 %	25 %	206896004

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