MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 24215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011295	AAGGA	2	10	177210	177219	60 %	0 %	40 %	0 %	206895457
3002	NC_011295	TAGC	2	8	177224	177231	25 %	25 %	25 %	25 %	206895457
3003	NC_011295	TGA	2	6	177292	177297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896244
3004	NC_011295	TGG	2	6	177426	177431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896244
3005	NC_011295	CAT	2	6	177442	177447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896244
3006	NC_011295	GTGGAA	2	12	177461	177472	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	206896244
3007	NC_011295	GAA	2	6	177497	177502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896244
3008	NC_011295	CTG	2	6	177563	177568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896244
3009	NC_011295	CATA	2	8	177601	177608	50 %	25 %	0 %	25 %	206895820
3010	NC_011295	TGA	2	6	177631	177636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895820
3011	NC_011295	AAT	2	6	177647	177652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895820
3012	NC_011295	AAAG	2	8	177747	177754	75 %	0 %	25 %	0 %	206895820
3013	NC_011295	TAT	2	6	177807	177812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895820
3014	NC_011295	CCG	2	6	177886	177891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206895820
3015	NC_011295	CTT	3	9	177966	177974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895820
3016	NC_011295	AGA	2	6	177985	177990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895820
3017	NC_011295	GAG	2	6	178014	178019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895820
3018	NC_011295	ATGG	2	8	178088	178095	25 %	25 %	50 %	0 %	206895820
3019	NC_011295	CAG	2	6	178133	178138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895820
3020	NC_011295	GCA	2	6	178147	178152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895820
3021	NC_011295	CAT	2	6	178210	178215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895820
3022	NC_011295	AAC	2	6	178438	178443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896425
3023	NC_011295	GAA	2	6	178473	178478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896425
3024	NC_011295	GGA	2	6	178493	178498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896425
3025	NC_011295	GA	3	6	178768	178773	50 %	0 %	50 %	0 %	206896425
3026	NC_011295	ATG	2	6	178842	178847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896425
3027	NC_011295	CGA	2	6	178880	178885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896425
3028	NC_011295	TC	4	8	178922	178929	0 %	50 %	0 %	50 %	206896425
3029	NC_011295	CTG	2	6	179047	179052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895170
3030	NC_011295	TTA	2	6	179070	179075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895170
3031	NC_011295	TAG	2	6	179083	179088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895170
3032	NC_011295	CTT	2	6	179138	179143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895170
3033	NC_011295	AGGA	2	8	179151	179158	50 %	0 %	50 %	0 %	206895170
3034	NC_011295	T	6	6	179184	179189	0 %	100 %	0 %	0 %	206895170
3035	NC_011295	GAAGGG	2	12	179238	179249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895170
3036	NC_011295	TTC	2	6	179419	179424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895170
3037	NC_011295	TTC	2	6	179497	179502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895170
3038	NC_011295	AAGA	2	8	179520	179527	75 %	0 %	25 %	0 %	206895170
3039	NC_011295	A	6	6	179534	179539	100 %	0 %	0 %	0 %	206895170
3040	NC_011295	A	6	6	179576	179581	100 %	0 %	0 %	0 %	206896162
3041	NC_011295	AGA	2	6	179586	179591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896162
3042	NC_011295	TGC	2	6	179667	179672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896162
3043	NC_011295	TGA	2	6	179687	179692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896162
3044	NC_011295	GTAC	2	8	179793	179800	25 %	25 %	25 %	25 %	206896162
3045	NC_011295	TTAC	2	8	179816	179823	25 %	50 %	0 %	25 %	206896162
3046	NC_011295	AGT	2	6	179853	179858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896162
3047	NC_011295	GAA	3	9	179943	179951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3048	NC_011295	CTT	2	6	179997	180002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895390
3049	NC_011295	GCT	3	9	180020	180028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895390
3050	NC_011295	AAAG	2	8	180043	180050	75 %	0 %	25 %	0 %	206895390
3051	NC_011295	TAA	2	6	180075	180080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895390
3052	NC_011295	GTT	2	6	180087	180092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895390
3053	NC_011295	GT	3	6	180138	180143	0 %	50 %	50 %	0 %	206895390
3054	NC_011295	GAA	2	6	180185	180190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3055	NC_011295	GAA	2	6	180266	180271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3056	NC_011295	A	6	6	180284	180289	100 %	0 %	0 %	0 %	206895390
3057	NC_011295	CAT	2	6	180319	180324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895390
3058	NC_011295	AGA	2	6	180331	180336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3059	NC_011295	GAA	2	6	180341	180346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3060	NC_011295	GAA	2	6	180424	180429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3061	NC_011295	GGC	2	6	180449	180454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895390
3062	NC_011295	GTG	2	6	180518	180523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895390
3063	NC_011295	TTG	2	6	180722	180727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895390
3064	NC_011295	ACA	2	6	180732	180737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895390
3065	NC_011295	GAA	2	6	180803	180808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3066	NC_011295	GTG	2	6	180840	180845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895390
3067	NC_011295	CCT	2	6	180860	180865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895390
3068	NC_011295	CCA	2	6	180897	180902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895390
3069	NC_011295	TCA	2	6	180939	180944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895390
3070	NC_011295	CATC	2	8	180969	180976	25 %	25 %	0 %	50 %	206895390
3071	NC_011295	TGG	2	6	181090	181095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895390
3072	NC_011295	GGT	2	6	181136	181141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895390
3073	NC_011295	TGG	2	6	181147	181152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895390
3074	NC_011295	GAA	2	6	181163	181168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
3075	NC_011295	TTA	2	6	181200	181205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895390
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3078	NC_011295	CATG	2	8	181257	181264	25 %	25 %	25 %	25 %	206895390
3079	NC_011295	TTC	2	6	181280	181285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895390
3080	NC_011295	ATCG	2	8	181400	181407	25 %	25 %	25 %	25 %	206895390
3081	NC_011295	AGA	2	6	181530	181535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895390
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3087	NC_011295	TGT	2	6	182434	182439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895600
3088	NC_011295	GCA	2	6	182499	182504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895600
3089	NC_011295	CAT	2	6	182587	182592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895600
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3091	NC_011295	TGG	2	6	182629	182634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895600
3092	NC_011295	CAC	2	6	182730	182735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895600
3093	NC_011295	ATG	2	6	182738	182743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895600
3094	NC_011295	TAC	2	6	182765	182770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895600
3095	NC_011295	TTGAAA	2	12	182841	182852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	206895600
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3099	NC_011295	AAG	2	6	183194	183199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895600
3100	NC_011295	TGG	2	6	183262	183267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895600
3101	NC_011295	CTAT	2	8	183342	183349	25 %	50 %	0 %	25 %	206895600
3102	NC_011295	GAG	2	6	183413	183418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895600
3103	NC_011295	CAC	2	6	183449	183454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895600
3104	NC_011295	TTC	2	6	183472	183477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895600
3105	NC_011295	ATA	2	6	183502	183507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895600
3106	NC_011295	TAG	2	6	183590	183595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896298
3107	NC_011295	ATT	2	6	183645	183650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896298
3108	NC_011295	TGC	2	6	183740	183745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896298
3109	NC_011295	TGC	2	6	183749	183754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896298
3110	NC_011295	TAG	2	6	183775	183780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896298
3111	NC_011295	ATC	2	6	183813	183818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896298
3112	NC_011295	GAA	2	6	183863	183868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896298
3113	NC_011295	AG	3	6	183954	183959	50 %	0 %	50 %	0 %	206896298
3114	NC_011295	ATA	2	6	183984	183989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896298
3115	NC_011295	GAA	2	6	183996	184001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896298
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3117	NC_011295	TAA	2	6	184021	184026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896298
3118	NC_011295	AAAGA	2	10	184106	184115	80 %	0 %	20 %	0 %	206896298
3119	NC_011295	TAC	2	6	184124	184129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896298
3120	NC_011295	TAT	2	6	184178	184183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896298
3121	NC_011295	CTT	2	6	184273	184278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896298
3122	NC_011295	ATC	2	6	184401	184406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896298
3123	NC_011295	GGT	2	6	184458	184463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896298
3124	NC_011295	TGG	2	6	184528	184533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896298
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3134	NC_011295	GGAT	2	8	184854	184861	25 %	25 %	50 %	0 %	206896298
3135	NC_011295	GTT	2	6	184991	184996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895782
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3140	NC_011295	TTC	2	6	185331	185336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895782
3141	NC_011295	TCT	2	6	185341	185346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895782
3142	NC_011295	CTCTTT	2	12	185463	185474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895782
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3144	NC_011295	TTC	2	6	185533	185538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895782
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3147	NC_011295	TTAT	2	8	185635	185642	25 %	75 %	0 %	0 %	206895782
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3233	NC_011295	GAAA	2	8	191393	191400	75 %	0 %	25 %	0 %	206895939
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3238	NC_011295	AGTGA	2	10	191603	191612	40 %	20 %	40 %	0 %	206895264
3239	NC_011295	AT	3	6	191647	191652	50 %	50 %	0 %	0 %	206895264
3240	NC_011295	GCT	2	6	191655	191660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895264
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3242	NC_011295	CTA	2	6	191965	191970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895264
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3360	NC_011295	TTTCC	2	10	197440	197449	0 %	60 %	0 %	40 %	206895200
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3362	NC_011295	GGCA	2	8	197672	197679	25 %	0 %	50 %	25 %	206895200
3363	NC_011295	AAG	2	6	197688	197693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895200
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3366	NC_011295	TGA	2	6	197917	197922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895200
3367	NC_011295	GCT	2	6	197962	197967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895200
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3375	NC_011295	TTTTG	2	10	198356	198365	0 %	80 %	20 %	0 %	206896143
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3484	NC_011295	TGG	2	6	204286	204291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895725
3485	NC_011295	GAG	2	6	204294	204299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895725
3486	NC_011295	CCA	2	6	204324	204329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895725
3487	NC_011295	TG	3	6	204335	204340	0 %	50 %	50 %	0 %	206895725
3488	NC_011295	TCA	2	6	204385	204390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895725
3489	NC_011295	TGC	2	6	204451	204456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895725
3490	NC_011295	TGT	2	6	204463	204468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895725
3491	NC_011295	CTT	2	6	204517	204522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895725
3492	NC_011295	TTGCT	2	10	204563	204572	0 %	60 %	20 %	20 %	206895725
3493	NC_011295	TC	3	6	204699	204704	0 %	50 %	0 %	50 %	206896303
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3497	NC_011295	ATC	2	6	205069	205074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896303
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3499	NC_011295	AGTA	2	8	205123	205130	50 %	25 %	25 %	0 %	206896303
3500	NC_011295	CAG	2	6	205219	205224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896303

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