MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 24215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011295	GATT	2	8	88732	88739	25 %	50 %	25 %	0 %	206896051
1502	NC_011295	TCA	2	6	88842	88847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896051
1503	NC_011295	AC	3	6	89165	89170	50 %	0 %	0 %	50 %	206895208
1504	NC_011295	TGG	2	6	89176	89181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895208
1505	NC_011295	AGC	2	6	89205	89210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895208
1506	NC_011295	GTG	2	6	89214	89219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895208
1507	NC_011295	TGG	2	6	89245	89250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895208
1508	NC_011295	AGGC	2	8	89261	89268	25 %	0 %	50 %	25 %	206895208
1509	NC_011295	AGGC	2	8	89306	89313	25 %	0 %	50 %	25 %	206895208
1510	NC_011295	A	6	6	89333	89338	100 %	0 %	0 %	0 %	206895208
1511	NC_011295	AATA	2	8	89377	89384	75 %	25 %	0 %	0 %	206895208
1512	NC_011295	GCT	2	6	89663	89668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895836
1513	NC_011295	TCTG	2	8	89714	89721	0 %	50 %	25 %	25 %	206895836
1514	NC_011295	TGG	2	6	89728	89733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895836
1515	NC_011295	CTT	2	6	89748	89753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895836
1516	NC_011295	GAA	2	6	89760	89765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895836
1517	NC_011295	GTTT	2	8	89788	89795	0 %	75 %	25 %	0 %	206895836
1518	NC_011295	GAA	2	6	89853	89858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895836
1519	NC_011295	CT	4	8	89988	89995	0 %	50 %	0 %	50 %	206895836
1520	NC_011295	GGT	2	6	90074	90079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895836
1521	NC_011295	CTG	2	6	90084	90089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895836
1522	NC_011295	TGG	2	6	90094	90099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895836
1523	NC_011295	CCG	2	6	90122	90127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206895836
1524	NC_011295	GTG	2	6	90241	90246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895836
1525	NC_011295	CAGTAG	2	12	90328	90339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206895836
1526	NC_011295	CTG	2	6	90361	90366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895836
1527	NC_011295	GGT	2	6	90383	90388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895836
1528	NC_011295	GTG	2	6	90492	90497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895836
1529	NC_011295	AAG	2	6	90574	90579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895836
1530	NC_011295	AGA	2	6	90623	90628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895836
1531	NC_011295	ACA	2	6	90651	90656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895836
1532	NC_011295	CTT	2	6	90691	90696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895171
1533	NC_011295	TTTG	2	8	90778	90785	0 %	75 %	25 %	0 %	206895171
1534	NC_011295	AGT	2	6	90868	90873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895171
1535	NC_011295	TGGT	2	8	90923	90930	0 %	50 %	50 %	0 %	206895171
1536	NC_011295	CAT	2	6	90939	90944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895171
1537	NC_011295	AGG	2	6	90985	90990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895171
1538	NC_011295	GTG	2	6	91028	91033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895171
1539	NC_011295	CTC	2	6	91064	91069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895171
1540	NC_011295	TAC	2	6	91147	91152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895171
1541	NC_011295	TGG	2	6	91178	91183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895171
1542	NC_011295	TGGT	2	8	91209	91216	0 %	50 %	50 %	0 %	206895171
1543	NC_011295	TTTG	2	8	91225	91232	0 %	75 %	25 %	0 %	206895171
1544	NC_011295	GCT	2	6	91266	91271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895171
1545	NC_011295	TTG	2	6	91291	91296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895171
1546	NC_011295	GCG	2	6	91366	91371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895171
1547	NC_011295	GCT	2	6	91533	91538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895171
1548	NC_011295	TCAA	2	8	91576	91583	50 %	25 %	0 %	25 %	206895171
1549	NC_011295	CTA	2	6	91620	91625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895171
1550	NC_011295	GTG	2	6	91657	91662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895171
1551	NC_011295	GAA	2	6	91704	91709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895171
1552	NC_011295	GGA	2	6	91722	91727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895171
1553	NC_011295	ACT	2	6	91740	91745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895171
1554	NC_011295	AATC	2	8	92039	92046	50 %	25 %	0 %	25 %	206896030
1555	NC_011295	AGT	2	6	92065	92070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896030
1556	NC_011295	G	6	6	92107	92112	0 %	0 %	100 %	0 %	206896030
1557	NC_011295	GCG	2	6	92133	92138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206896030
1558	NC_011295	TTGG	2	8	92150	92157	0 %	50 %	50 %	0 %	206896030
1559	NC_011295	T	6	6	92206	92211	0 %	100 %	0 %	0 %	206896030
1560	NC_011295	GAA	2	6	92212	92217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896030
1561	NC_011295	TCA	2	6	92382	92387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896030
1562	NC_011295	CCT	2	6	92408	92413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896030
1563	NC_011295	TGG	2	6	92475	92480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896030
1564	NC_011295	GTG	2	6	92564	92569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896030
1565	NC_011295	GCC	2	6	92741	92746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206896030
1566	NC_011295	AAC	2	6	92805	92810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896030
1567	NC_011295	TGCCA	2	10	92836	92845	20 %	20 %	20 %	40 %	206896030
1568	NC_011295	GAG	2	6	92869	92874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896030
1569	NC_011295	TAC	2	6	92884	92889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896030
1570	NC_011295	TGG	2	6	92895	92900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896030
1571	NC_011295	CTA	2	6	92915	92920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896030
1572	NC_011295	AAC	2	6	93074	93079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896030
1573	NC_011295	GCT	2	6	93113	93118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1574	NC_011295	GCAG	2	8	93146	93153	25 %	0 %	50 %	25 %	206896030
1575	NC_011295	AGC	2	6	93157	93162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1576	NC_011295	TGC	2	6	93304	93309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1577	NC_011295	GTG	2	6	93395	93400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896030
1578	NC_011295	CAG	2	6	93463	93468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1579	NC_011295	AACC	2	8	93511	93518	50 %	0 %	0 %	50 %	206896030
1580	NC_011295	TGC	2	6	93532	93537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1581	NC_011295	GCT	2	6	93545	93550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1582	NC_011295	GTA	2	6	93581	93586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896030
1583	NC_011295	TGG	2	6	93652	93657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896030
1584	NC_011295	AACAG	2	10	93665	93674	60 %	0 %	20 %	20 %	206896030
1585	NC_011295	GAA	2	6	93694	93699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896030
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1588	NC_011295	TGC	2	6	93853	93858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1589	NC_011295	TCAGT	2	10	93907	93916	20 %	40 %	20 %	20 %	206896030
1590	NC_011295	AGC	2	6	93927	93932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896030
1591	NC_011295	TTC	2	6	93967	93972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896030
1592	NC_011295	AGA	2	6	94000	94005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896030
1593	NC_011295	TGG	2	6	94643	94648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895432
1594	NC_011295	TGA	2	6	94670	94675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895432
1595	NC_011295	AAAG	2	8	94710	94717	75 %	0 %	25 %	0 %	206895432
1596	NC_011295	AGA	3	9	94724	94732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895432
1597	NC_011295	CAA	2	6	94823	94828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895432
1598	NC_011295	CTA	2	6	94858	94863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895432
1599	NC_011295	TGGT	2	8	94867	94874	0 %	50 %	50 %	0 %	206895432
1600	NC_011295	AC	3	6	94906	94911	50 %	0 %	0 %	50 %	206895432
1601	NC_011295	A	6	6	95021	95026	100 %	0 %	0 %	0 %	206895432
1602	NC_011295	TAT	2	6	95054	95059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895432
1603	NC_011295	AGA	2	6	95087	95092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895432
1604	NC_011295	TTA	2	6	95122	95127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895432
1605	NC_011295	TGA	2	6	95156	95161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895432
1606	NC_011295	GAA	2	6	95275	95280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895589
1607	NC_011295	AGA	2	6	95282	95287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895589
1608	NC_011295	GTT	2	6	95309	95314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895589
1609	NC_011295	TCT	2	6	95341	95346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895589
1610	NC_011295	CGCT	2	8	95353	95360	0 %	25 %	25 %	50 %	206895589
1611	NC_011295	CGA	2	6	95386	95391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895589
1612	NC_011295	TGA	2	6	95442	95447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895589
1613	NC_011295	TGA	2	6	95466	95471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895589
1614	NC_011295	CTT	2	6	95481	95486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895589
1615	NC_011295	TAC	2	6	95516	95521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895589
1616	NC_011295	GAT	2	6	95531	95536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895589
1617	NC_011295	TGATGC	2	12	95596	95607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206895589
1618	NC_011295	CTA	2	6	95653	95658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895589
1619	NC_011295	GGC	2	6	95774	95779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895589
1620	NC_011295	A	6	6	95809	95814	100 %	0 %	0 %	0 %	206895589
1621	NC_011295	TGG	2	6	95894	95899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895589
1622	NC_011295	CTGA	2	8	95909	95916	25 %	25 %	25 %	25 %	206895589
1623	NC_011295	GAC	2	6	95954	95959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895589
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1625	NC_011295	TCC	2	6	96016	96021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895589
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1739	NC_011295	AGTA	2	8	102153	102160	50 %	25 %	25 %	0 %	206896108
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1742	NC_011295	ATG	2	6	102225	102230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896108
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1744	NC_011295	ATG	2	6	102310	102315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895256
1745	NC_011295	ATG	2	6	102325	102330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895256
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1988	NC_011295	CTG	2	6	117827	117832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895857
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1999	NC_011295	CATA	2	8	118578	118585	50 %	25 %	0 %	25 %	206896154
2000	NC_011295	AAGGA	2	10	118594	118603	60 %	0 %	40 %	0 %	206896154

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