MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 8264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	TAA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246404
2	NC_011047	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246404
3	NC_011047	TAA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246404
4	NC_011047	ATC	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246404
5	NC_011047	ACA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246404
6	NC_011047	CAA	3	9	1406	1414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246404
7	NC_011047	TAA	3	9	1423	1431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246404
8	NC_011047	ATT	2	6	1693	1698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246405
9	NC_011047	AAT	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
10	NC_011047	TAA	2	6	1751	1756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
11	NC_011047	TAG	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246405
12	NC_011047	AAC	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246405
13	NC_011047	ATA	2	6	1800	1805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
14	NC_011047	TAA	3	9	1913	1921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
15	NC_011047	ATT	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246405
16	NC_011047	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246405
17	NC_011047	AAT	2	6	2082	2087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
18	NC_011047	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
19	NC_011047	TAA	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
20	NC_011047	TTC	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246406
21	NC_011047	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246406
22	NC_011047	TAA	2	6	2628	2633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
23	NC_011047	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
24	NC_011047	GTT	2	6	2694	2699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246406
25	NC_011047	TAA	2	6	2718	2723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
26	NC_011047	TAA	2	6	2817	2822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
27	NC_011047	ATA	2	6	2828	2833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
28	NC_011047	GTT	2	6	2938	2943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246406
29	NC_011047	AGA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194246406
30	NC_011047	ATA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
31	NC_011047	ACT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246406
32	NC_011047	CTT	2	6	3158	3163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246406
33	NC_011047	ATA	3	9	3187	3195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
34	NC_011047	TAC	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246406
35	NC_011047	TAA	2	6	3317	3322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
36	NC_011047	CAA	2	6	3362	3367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246406
37	NC_011047	TAT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246406
38	NC_011047	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
39	NC_011047	ATA	2	6	3688	3693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
40	NC_011047	TCT	2	6	3695	3700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246407
41	NC_011047	TAA	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
42	NC_011047	GAG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194246407
43	NC_011047	AAT	2	6	3867	3872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
44	NC_011047	AAT	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
45	NC_011047	AAT	2	6	3990	3995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
46	NC_011047	TAC	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246407
47	NC_011047	ATT	2	6	4033	4038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
48	NC_011047	TAT	2	6	4053	4058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
49	NC_011047	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246407
50	NC_011047	TAA	3	9	4112	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
51	NC_011047	TAC	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246407
52	NC_011047	GTT	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246407
53	NC_011047	GCT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194246407
54	NC_011047	ATT	2	6	4333	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
55	NC_011047	ATC	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246407
56	NC_011047	CAG	2	6	4511	4516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194246407
57	NC_011047	AAG	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194246407
58	NC_011047	TAT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246408
59	NC_011047	TTC	2	6	4651	4656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246408
60	NC_011047	ATG	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246408
61	NC_011047	AAT	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246408
62	NC_011047	CTT	2	6	4866	4871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246408
63	NC_011047	ACC	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194246408
64	NC_011047	AGT	2	6	4945	4950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246408
65	NC_011047	ACC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194246408
66	NC_011047	ACA	2	6	5045	5050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246408
67	NC_011047	AAT	2	6	5144	5149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246408
68	NC_011047	ATA	2	6	5414	5419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246409
69	NC_011047	TAT	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246409
70	NC_011047	ATG	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246409
71	NC_011047	TAA	2	6	5610	5615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246409
72	NC_011047	CCA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194246409
73	NC_011047	CAT	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246409
74	NC_011047	AAT	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246409
75	NC_011047	TCT	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246409
76	NC_011047	ATA	2	6	5863	5868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246409
77	NC_011047	TAA	2	6	5922	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246409
78	NC_011047	TAT	2	6	6022	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246409
79	NC_011047	ATT	2	6	6034	6039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246409
80	NC_011047	CTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194246409
81	NC_011047	ATC	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246409
82	NC_011047	TAG	4	12	6315	6326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246409
83	NC_011047	AGA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194246409
84	NC_011047	ATC	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246409
85	NC_011047	TAA	3	9	6415	6423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246409
86	NC_011047	ATA	2	6	8163	8168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246410
87	NC_011047	AAT	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246410
88	NC_011047	TTA	2	6	8209	8214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246410
89	NC_011047	TAA	2	6	8244	8249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246410
90	NC_011047	AAT	2	6	8254	8259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246410
91	NC_011047	ATA	2	6	8301	8306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246410
92	NC_011047	TAT	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246410
93	NC_011047	ATA	2	6	8326	8331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246410
94	NC_011047	GAA	2	6	8399	8404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194246410
95	NC_011047	ATT	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246410
96	NC_011047	TTA	2	6	8602	8607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246410
97	NC_011047	TAT	2	6	8637	8642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246410
98	NC_011047	ATT	2	6	8710	8715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246410
99	NC_011047	ACA	2	6	8768	8773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246410
100	NC_011047	ATT	2	6	9089	9094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246411
101	NC_011047	ATT	2	6	9239	9244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246411
102	NC_011047	ACT	2	6	9261	9266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246411
103	NC_011047	CAG	2	6	9295	9300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194246411
104	NC_011047	TTA	2	6	9333	9338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246411
105	NC_011047	TAT	2	6	9446	9451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246411
106	NC_011047	ATG	2	6	9509	9514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246411
107	NC_011047	TCT	2	6	9531	9536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246411
108	NC_011047	ATT	2	6	10622	10627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246412
109	NC_011047	ATA	2	6	10650	10655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246412
110	NC_011047	AAT	2	6	10749	10754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246412
111	NC_011047	ATT	2	6	10885	10890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246412
112	NC_011047	ATA	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246412
113	NC_011047	TAA	2	6	10955	10960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246412
114	NC_011047	TAT	2	6	10961	10966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246412
115	NC_011047	AGA	2	6	11011	11016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194246412
116	NC_011047	TAA	2	6	11058	11063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246412
117	NC_011047	ATA	2	6	11200	11205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246412
118	NC_011047	ACC	2	6	11256	11261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194246412
119	NC_011047	GTT	2	6	11287	11292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246412
120	NC_011047	TAA	2	6	11304	11309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246412
121	NC_011047	ATT	2	6	11349	11354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246412
122	NC_011047	CAT	2	6	11399	11404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246412
123	NC_011047	ATA	2	6	11985	11990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246413
124	NC_011047	TAG	2	6	12073	12078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246413
125	NC_011047	GTT	2	6	12103	12108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246413
126	NC_011047	TGT	2	6	12126	12131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246413
127	NC_011047	ATT	2	6	12218	12223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246413
128	NC_011047	TAT	2	6	12254	12259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246413
129	NC_011047	ATT	2	6	12275	12280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246413
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131	NC_011047	ATA	2	6	12353	12358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246413
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258	NC_011047	TGA	2	6	21954	21959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246420
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262	NC_011047	TTG	2	6	22160	22165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246420
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