MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 31035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011027	CAG	2	6	182	187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211677
2	NC_011027	ACT	2	6	396	401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211677
3	NC_011027	CCA	2	6	511	516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211677
4	NC_011027	GCC	2	6	689	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211677
5	NC_011027	CGG	2	6	748	753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211677
6	NC_011027	ATG	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211677
7	NC_011027	CGA	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211677
8	NC_011027	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211677
9	NC_011027	AGG	2	6	975	980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211677
10	NC_011027	CAA	2	6	1015	1020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211677
11	NC_011027	ATC	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211677
12	NC_011027	CGG	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211677
13	NC_011027	CAA	2	6	1225	1230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211677
14	NC_011027	GCT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211677
15	NC_011027	CGC	2	6	1267	1272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211677
16	NC_011027	ATC	2	6	1331	1336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211677
17	NC_011027	ACA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211677
18	NC_011027	AGC	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211677
19	NC_011027	CTT	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211677
20	NC_011027	GAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211677
21	NC_011027	GGC	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211677
22	NC_011027	CGG	2	6	1522	1527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211677
23	NC_011027	CCT	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211677
24	NC_011027	GAA	2	6	1618	1623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211677
25	NC_011027	GCA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211678
26	NC_011027	ATC	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211678
27	NC_011027	ATG	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211678
28	NC_011027	TGG	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211678
29	NC_011027	GCC	2	6	2918	2923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211678
30	NC_011027	AGC	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211678
31	NC_011027	GTT	2	6	2983	2988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211678
32	NC_011027	GAG	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211678
33	NC_011027	CAA	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211678
34	NC_011027	CTT	2	6	3119	3124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211679
35	NC_011027	GAG	2	6	3266	3271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211679
36	NC_011027	CTC	2	6	3286	3291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211679
37	NC_011027	ATC	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211679
38	NC_011027	CGG	2	6	3462	3467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211679
39	NC_011027	CGT	2	6	3470	3475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211679
40	NC_011027	TTC	2	6	3571	3576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211679
41	NC_011027	CAG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211679
42	NC_011027	AGC	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211679
43	NC_011027	CTT	2	6	4016	4021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211679
44	NC_011027	TGA	2	6	4042	4047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211679
45	NC_011027	GGT	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211679
46	NC_011027	GTT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211679
47	NC_011027	TGA	2	6	4150	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211679
48	NC_011027	AGT	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211679
49	NC_011027	GAG	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211679
50	NC_011027	ACC	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211680
51	NC_011027	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211680
52	NC_011027	ATC	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211681
53	NC_011027	GAT	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211681
54	NC_011027	GCC	3	9	4805	4813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211681
55	NC_011027	TGA	2	6	4865	4870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211681
56	NC_011027	GAT	3	9	4900	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211681
57	NC_011027	TCT	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211681
58	NC_011027	TTC	2	6	5129	5134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211681
59	NC_011027	GTC	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211681
60	NC_011027	CGC	2	6	5277	5282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211681
61	NC_011027	TCA	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211681
62	NC_011027	CGA	2	6	5589	5594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211681
63	NC_011027	ACC	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211681
64	NC_011027	TGG	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211681
65	NC_011027	CAA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211681
66	NC_011027	TGA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211681
67	NC_011027	TCG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211681
68	NC_011027	GAA	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211681
69	NC_011027	TAT	2	6	5817	5822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193211681
70	NC_011027	ATG	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
71	NC_011027	CTG	2	6	6003	6008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
72	NC_011027	GAA	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211682
73	NC_011027	GGA	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211682
74	NC_011027	GTT	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211682
75	NC_011027	ATG	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
76	NC_011027	ATA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193211682
77	NC_011027	GAT	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
78	NC_011027	ATC	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211682
79	NC_011027	AGC	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211682
80	NC_011027	TTC	3	9	6518	6526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211682
81	NC_011027	TGG	2	6	6585	6590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211682
82	NC_011027	CTC	3	9	6616	6624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211682
83	NC_011027	TGA	3	9	6816	6824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
84	NC_011027	AGG	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211682
85	NC_011027	GCC	2	6	7072	7077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211682
86	NC_011027	CTG	3	9	7081	7089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
87	NC_011027	TGC	2	6	7159	7164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
88	NC_011027	TGC	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
89	NC_011027	AGC	2	6	7235	7240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211682
90	NC_011027	GCC	2	6	7241	7246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211682
91	NC_011027	TCG	2	6	7268	7273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
92	NC_011027	GTC	2	6	7303	7308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
93	NC_011027	GAA	2	6	7366	7371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211682
94	NC_011027	TCG	2	6	7512	7517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
95	NC_011027	GCG	2	6	7582	7587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211682
96	NC_011027	TGT	2	6	7617	7622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211682
97	NC_011027	GAT	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
98	NC_011027	GAT	3	9	7747	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
99	NC_011027	CTT	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211682
100	NC_011027	TAG	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
101	NC_011027	GTC	2	6	7837	7842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
102	NC_011027	AAC	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211682
103	NC_011027	CTG	2	6	7907	7912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
104	NC_011027	GCT	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211682
105	NC_011027	TTC	2	6	8012	8017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211682
106	NC_011027	TTG	2	6	8087	8092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211682
107	NC_011027	ACG	2	6	8165	8170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211682
108	NC_011027	GAT	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211682
109	NC_011027	CAA	2	6	8541	8546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211683
110	NC_011027	GCG	2	6	8645	8650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211683
111	NC_011027	AAG	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211683
112	NC_011027	TCG	2	6	8981	8986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211683
113	NC_011027	CGG	2	6	9084	9089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211683
114	NC_011027	TCT	2	6	9272	9277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211683
115	NC_011027	GCA	2	6	9502	9507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211683
116	NC_011027	TCG	2	6	9560	9565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211683
117	NC_011027	CTT	2	6	9602	9607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211683
118	NC_011027	GGT	2	6	9692	9697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211683
119	NC_011027	CCT	2	6	9713	9718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211683
120	NC_011027	GCC	2	6	9779	9784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211683
121	NC_011027	TGC	2	6	9969	9974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211683
122	NC_011027	TGA	2	6	10125	10130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211683
123	NC_011027	TTA	2	6	10580	10585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193211684
124	NC_011027	GGC	2	6	10646	10651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211684
125	NC_011027	ATC	2	6	10688	10693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211684
126	NC_011027	GAT	2	6	10775	10780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211684
127	NC_011027	TGA	2	6	10789	10794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211684
128	NC_011027	ATG	2	6	11025	11030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211684
129	NC_011027	GCG	2	6	11837	11842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211685
130	NC_011027	TTG	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211685
131	NC_011027	GTG	2	6	11916	11921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211685
132	NC_011027	CAT	2	6	11977	11982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211685
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134	NC_011027	GCT	2	6	12025	12030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211685
135	NC_011027	CGA	2	6	12091	12096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211685
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138	NC_011027	TGG	2	6	12279	12284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211686
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142	NC_011027	TTC	2	6	12672	12677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211686
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150	NC_011027	CGC	2	6	13300	13305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211686
151	NC_011027	CGA	2	6	13378	13383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211686
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249	NC_011027	GAT	2	6	20737	20742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211692
250	NC_011027	CCA	2	6	20751	20756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211692
251	NC_011027	CGG	2	6	20817	20822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211692
252	NC_011027	GTC	2	6	20836	20841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211692
253	NC_011027	GAA	2	6	21282	21287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211693
254	NC_011027	AGC	2	6	21299	21304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211693
255	NC_011027	TGA	2	6	21308	21313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211693
256	NC_011027	GAG	2	6	21349	21354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211693
257	NC_011027	GGC	2	6	21356	21361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211693
258	NC_011027	GGT	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211693
259	NC_011027	TTG	2	6	21461	21466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211693
260	NC_011027	TCC	2	6	21491	21496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211693
261	NC_011027	GAC	2	6	21550	21555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211693
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263	NC_011027	CAG	2	6	21655	21660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211693
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266	NC_011027	GAT	2	6	21723	21728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211693
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270	NC_011027	CGC	2	6	21880	21885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211693
271	NC_011027	GTC	2	6	21908	21913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211693
272	NC_011027	TGC	2	6	21935	21940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211693
273	NC_011027	CAT	2	6	21957	21962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211693
274	NC_011027	GCT	2	6	22017	22022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211693
275	NC_011027	GAG	2	6	22042	22047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211693
276	NC_011027	AGG	2	6	22085	22090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211693
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278	NC_011027	TGC	2	6	22109	22114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211693
279	NC_011027	ACT	2	6	22126	22131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211693
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283	NC_011027	CGC	2	6	22383	22388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211693
284	NC_011027	AGG	2	6	22400	22405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211693
285	NC_011027	CGG	2	6	22473	22478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211693
286	NC_011027	CAT	2	6	22479	22484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211693
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500	NC_011027	GTG	2	6	35018	35023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211704

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