MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 41667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_011027	GTAGCA	2	12	2253726	2253737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	193213686
41002	NC_011027	TGAGA	2	10	2253788	2253797	40 %	20 %	40 %	0 %	193213686
41003	NC_011027	T	7	7	2253916	2253922	0 %	100 %	0 %	0 %	193213686
41004	NC_011027	CCGGCA	2	12	2253927	2253938	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	193213686
41005	NC_011027	CAT	2	6	2253977	2253982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213686
41006	NC_011027	CAC	2	6	2253983	2253988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213686
41007	NC_011027	ATCAC	2	10	2254095	2254104	40 %	20 %	0 %	40 %	193213686
41008	NC_011027	CTG	2	6	2254162	2254167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213686
41009	NC_011027	T	8	8	2254362	2254369	0 %	100 %	0 %	0 %	193213687
41010	NC_011027	T	8	8	2254377	2254384	0 %	100 %	0 %	0 %	193213687
41011	NC_011027	TGA	2	6	2254429	2254434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213687
41012	NC_011027	TGA	2	6	2254477	2254482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213687
41013	NC_011027	ACC	2	6	2254500	2254505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213687
41014	NC_011027	CCG	2	6	2254524	2254529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213687
41015	NC_011027	C	6	6	2254678	2254683	0 %	0 %	0 %	100 %	193213687
41016	NC_011027	ATAA	2	8	2254701	2254708	75 %	25 %	0 %	0 %	193213687
41017	NC_011027	AAC	2	6	2254725	2254730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213687
41018	NC_011027	TGC	2	6	2254769	2254774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213688
41019	NC_011027	CAG	2	6	2254867	2254872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213688
41020	NC_011027	A	6	6	2254919	2254924	100 %	0 %	0 %	0 %	193213688
41021	NC_011027	T	6	6	2255012	2255017	0 %	100 %	0 %	0 %	193213688
41022	NC_011027	TCA	2	6	2255101	2255106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213689
41023	NC_011027	CGA	2	6	2255134	2255139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213689
41024	NC_011027	CCAGC	2	10	2255168	2255177	20 %	0 %	20 %	60 %	193213689
41025	NC_011027	CGG	2	6	2255213	2255218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213689
41026	NC_011027	CCA	2	6	2255236	2255241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213689
41027	NC_011027	ACT	2	6	2255336	2255341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213689
41028	NC_011027	GGA	2	6	2255350	2255355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213689
41029	NC_011027	ATC	2	6	2255441	2255446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213689
41030	NC_011027	GCA	2	6	2255500	2255505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213689
41031	NC_011027	CGT	2	6	2255548	2255553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213689
41032	NC_011027	GTA	2	6	2255651	2255656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213689
41033	NC_011027	GAT	2	6	2255674	2255679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213689
41034	NC_011027	GAAGA	2	10	2255727	2255736	60 %	0 %	40 %	0 %	193213689
41035	NC_011027	AGC	2	6	2255740	2255745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213689
41036	NC_011027	GCT	2	6	2255760	2255765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213689
41037	NC_011027	CGCC	2	8	2255833	2255840	0 %	0 %	25 %	75 %	193213689
41038	NC_011027	TGAC	2	8	2255887	2255894	25 %	25 %	25 %	25 %	193213689
41039	NC_011027	AAAC	2	8	2255926	2255933	75 %	0 %	0 %	25 %	193213689
41040	NC_011027	CCT	2	6	2255938	2255943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213689
41041	NC_011027	CCG	2	6	2256048	2256053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213689
41042	NC_011027	GAC	2	6	2256352	2256357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213690
41043	NC_011027	TGC	2	6	2256376	2256381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213690
41044	NC_011027	GT	3	6	2256430	2256435	0 %	50 %	50 %	0 %	193213690
41045	NC_011027	AGC	2	6	2256447	2256452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213690
41046	NC_011027	GAC	2	6	2256493	2256498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213690
41047	NC_011027	TCG	2	6	2256591	2256596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213690
41048	NC_011027	CCG	2	6	2256606	2256611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213690
41049	NC_011027	CCG	2	6	2256637	2256642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213690
41050	NC_011027	GCG	2	6	2256654	2256659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213690
41051	NC_011027	GGA	2	6	2256745	2256750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213690
41052	NC_011027	GCCATC	2	12	2256841	2256852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	193213690
41053	NC_011027	TC	3	6	2256877	2256882	0 %	50 %	0 %	50 %	193213690
41054	NC_011027	GGC	2	6	2256883	2256888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213690
41055	NC_011027	CCG	2	6	2256920	2256925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213690
41056	NC_011027	CCGA	2	8	2256966	2256973	25 %	0 %	25 %	50 %	193213690
41057	NC_011027	TTC	2	6	2256974	2256979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213690
41058	NC_011027	CCG	2	6	2256985	2256990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213690
41059	NC_011027	CCA	2	6	2257058	2257063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213691
41060	NC_011027	TTC	2	6	2257080	2257085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213691
41061	NC_011027	GCG	2	6	2257099	2257104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213691
41062	NC_011027	GTC	2	6	2257107	2257112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213691
41063	NC_011027	ATG	2	6	2257237	2257242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213691
41064	NC_011027	TCCG	2	8	2258686	2258693	0 %	25 %	25 %	50 %	193213692
41065	NC_011027	GGA	2	6	2258713	2258718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213692
41066	NC_011027	TGG	2	6	2258746	2258751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213692
41067	NC_011027	ACG	2	6	2258814	2258819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213692
41068	NC_011027	CGT	2	6	2258837	2258842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213692
41069	NC_011027	CAC	2	6	2258843	2258848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213692
41070	NC_011027	GGT	2	6	2258897	2258902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213692
41071	NC_011027	GCC	2	6	2258927	2258932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213692
41072	NC_011027	GCGCC	2	10	2258941	2258950	0 %	0 %	40 %	60 %	193213692
41073	NC_011027	CA	3	6	2259010	2259015	50 %	0 %	0 %	50 %	193213692
41074	NC_011027	TCGATC	2	12	2259030	2259041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193213692
41075	NC_011027	GTC	2	6	2259131	2259136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213692
41076	NC_011027	GAT	2	6	2259182	2259187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213692
41077	NC_011027	GGC	2	6	2259208	2259213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213692
41078	NC_011027	TGA	2	6	2259217	2259222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213692
41079	NC_011027	GCGTC	2	10	2259307	2259316	0 %	20 %	40 %	40 %	193213692
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41081	NC_011027	GCA	2	6	2259472	2259477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213692
41082	NC_011027	CGTG	2	8	2259487	2259494	0 %	25 %	50 %	25 %	193213692
41083	NC_011027	CGG	2	6	2259544	2259549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213692
41084	NC_011027	AC	3	6	2259568	2259573	50 %	0 %	0 %	50 %	193213692
41085	NC_011027	CGAG	2	8	2259574	2259581	25 %	0 %	50 %	25 %	193213692
41086	NC_011027	CGGG	2	8	2259598	2259605	0 %	0 %	75 %	25 %	193213692
41087	NC_011027	GAA	2	6	2259711	2259716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213692
41088	NC_011027	CGGCC	2	10	2259835	2259844	0 %	0 %	40 %	60 %	193213692
41089	NC_011027	GCG	2	6	2259868	2259873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213692
41090	NC_011027	ATGA	2	8	2259887	2259894	50 %	25 %	25 %	0 %	193213692
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41098	NC_011027	TCG	2	6	2260523	2260528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213693
41099	NC_011027	TGA	2	6	2260539	2260544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213693
41100	NC_011027	CTC	2	6	2260567	2260572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213693
41101	NC_011027	GCA	2	6	2260721	2260726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213693
41102	NC_011027	ATG	2	6	2260763	2260768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213693
41103	NC_011027	GTG	2	6	2260804	2260809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213693
41104	NC_011027	TGA	2	6	2260812	2260817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213693
41105	NC_011027	CGT	2	6	2260851	2260856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213693
41106	NC_011027	TGT	2	6	2260863	2260868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213693
41107	NC_011027	CGA	2	6	2260923	2260928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213693
41108	NC_011027	TGA	2	6	2260929	2260934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213693
41109	NC_011027	CGGG	2	8	2261011	2261018	0 %	0 %	75 %	25 %	193213693
41110	NC_011027	GCCGGT	2	12	2261080	2261091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	193213693
41111	NC_011027	CCGCG	2	10	2261127	2261136	0 %	0 %	40 %	60 %	193213693
41112	NC_011027	GTC	2	6	2261161	2261166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213693
41113	NC_011027	CAGC	2	8	2261172	2261179	25 %	0 %	25 %	50 %	193213693
41114	NC_011027	GTTG	2	8	2261215	2261222	0 %	50 %	50 %	0 %	193213693
41115	NC_011027	CTT	2	6	2261224	2261229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213693
41116	NC_011027	CGGT	2	8	2261276	2261283	0 %	25 %	50 %	25 %	193213693
41117	NC_011027	TGT	2	6	2261328	2261333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213693
41118	NC_011027	GCC	2	6	2261344	2261349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213693
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41224	NC_011027	CCCT	2	8	2266462	2266469	0 %	25 %	0 %	75 %	193213698
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41226	NC_011027	GCC	2	6	2266576	2266581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213698
41227	NC_011027	TGA	2	6	2266587	2266592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213698
41228	NC_011027	GTC	2	6	2266610	2266615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213698
41229	NC_011027	TGA	2	6	2266644	2266649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213698
41230	NC_011027	CGATGG	2	12	2266662	2266673	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	193213698
41231	NC_011027	GAT	3	9	2266723	2266731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213698
41232	NC_011027	CAC	2	6	2266765	2266770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213698
41233	NC_011027	GC	3	6	2266773	2266778	0 %	0 %	50 %	50 %	193213698
41234	NC_011027	CTC	2	6	2266792	2266797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213698
41235	NC_011027	GA	3	6	2266829	2266834	50 %	0 %	50 %	0 %	193213698
41236	NC_011027	GCT	2	6	2266851	2266856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213698
41237	NC_011027	CGAGGC	2	12	2266866	2266877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	193213698
41238	NC_011027	GCC	2	6	2266885	2266890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213698
41239	NC_011027	GCCT	2	8	2266910	2266917	0 %	25 %	25 %	50 %	193213698
41240	NC_011027	CCG	2	6	2266943	2266948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213698
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41242	NC_011027	CGC	3	9	2266996	2267004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213698
41243	NC_011027	GCGCC	2	10	2267016	2267025	0 %	0 %	40 %	60 %	193213698
41244	NC_011027	AGG	2	6	2267033	2267038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213698
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41246	NC_011027	GAG	2	6	2267096	2267101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213698
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41249	NC_011027	GCAA	2	8	2267207	2267214	50 %	0 %	25 %	25 %	193213698
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41251	NC_011027	CAG	2	6	2267329	2267334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213698
41252	NC_011027	AAC	2	6	2267360	2267365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213698
41253	NC_011027	CTT	2	6	2267485	2267490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213698
41254	NC_011027	CAGCC	2	10	2267493	2267502	20 %	0 %	20 %	60 %	193213698
41255	NC_011027	CGC	2	6	2267505	2267510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213698
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41258	NC_011027	AGC	3	9	2267561	2267569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213698
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41260	NC_011027	CCG	2	6	2267624	2267629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213698
41261	NC_011027	ATG	2	6	2267660	2267665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213698
41262	NC_011027	CTGC	2	8	2267691	2267698	0 %	25 %	25 %	50 %	193213699
41263	NC_011027	CAGG	2	8	2267737	2267744	25 %	0 %	50 %	25 %	193213699
41264	NC_011027	CCG	2	6	2267761	2267766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213699
41265	NC_011027	CG	3	6	2267861	2267866	0 %	0 %	50 %	50 %	193213699
41266	NC_011027	GATG	2	8	2267916	2267923	25 %	25 %	50 %	0 %	193213699
41267	NC_011027	CGCC	2	8	2267944	2267951	0 %	0 %	25 %	75 %	193213699
41268	NC_011027	TGG	2	6	2268011	2268016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213699
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41271	NC_011027	CGT	2	6	2268113	2268118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213699
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41287	NC_011027	TGC	2	6	2268649	2268654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213699
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41300	NC_011027	CACG	2	8	2269408	2269415	25 %	0 %	25 %	50 %	193213700
41301	NC_011027	GCC	2	6	2269501	2269506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213700
41302	NC_011027	CGC	2	6	2269555	2269560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213700
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41319	NC_011027	CGG	2	6	2270119	2270124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213700
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41321	NC_011027	TAG	2	6	2270156	2270161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213700
41322	NC_011027	GTCA	2	8	2270169	2270176	25 %	25 %	25 %	25 %	193213701
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41331	NC_011027	GCA	2	6	2270882	2270887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41332	NC_011027	GTC	2	6	2270896	2270901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41333	NC_011027	GCC	2	6	2270920	2270925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213701
41334	NC_011027	GGT	2	6	2271072	2271077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213701
41335	NC_011027	GTT	2	6	2271151	2271156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213701
41336	NC_011027	CCA	2	6	2271207	2271212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213701
41337	NC_011027	TGG	3	9	2271219	2271227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213701
41338	NC_011027	TGC	2	6	2271237	2271242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41339	NC_011027	GCCGAT	2	12	2271244	2271255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41340	NC_011027	GCT	2	6	2271294	2271299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41341	NC_011027	TCG	2	6	2271317	2271322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41342	NC_011027	GCG	2	6	2271334	2271339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213701
41343	NC_011027	GCTG	2	8	2271366	2271373	0 %	25 %	50 %	25 %	193213701
41344	NC_011027	ACC	2	6	2271389	2271394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213701
41345	NC_011027	ACG	2	6	2271399	2271404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41346	NC_011027	ACC	2	6	2271485	2271490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213701
41347	NC_011027	CAC	3	9	2271505	2271513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213701
41348	NC_011027	CGA	2	6	2271519	2271524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213701
41349	NC_011027	CCT	2	6	2271695	2271700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213702
41350	NC_011027	CCA	2	6	2271725	2271730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213702
41351	NC_011027	CCGC	2	8	2271761	2271768	0 %	0 %	25 %	75 %	193213702
41352	NC_011027	TCG	2	6	2271832	2271837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213702
41353	NC_011027	CTT	2	6	2271930	2271935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213702
41354	NC_011027	ACC	2	6	2271964	2271969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213702
41355	NC_011027	CGCA	2	8	2271996	2272003	25 %	0 %	25 %	50 %	193213702
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41362	NC_011027	GGC	2	6	2272436	2272441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213702
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41364	NC_011027	CTC	2	6	2272470	2272475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213702
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41369	NC_011027	CGG	2	6	2272715	2272720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213702
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41373	NC_011027	CGG	2	6	2272901	2272906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213702
41374	NC_011027	TGA	2	6	2272976	2272981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213702
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41380	NC_011027	GCA	2	6	2273326	2273331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213703
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41383	NC_011027	A	6	6	2273443	2273448	100 %	0 %	0 %	0 %	193213703
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41422	NC_011027	GCT	2	6	2275179	2275184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213704
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41450	NC_011027	CAG	2	6	2276797	2276802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213706
41451	NC_011027	CCG	2	6	2276862	2276867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213706
41452	NC_011027	CGAG	2	8	2276880	2276887	25 %	0 %	50 %	25 %	193213706
41453	NC_011027	TCA	2	6	2276891	2276896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213706
41454	NC_011027	CGCTT	2	10	2276924	2276933	0 %	40 %	20 %	40 %	193213706
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41456	NC_011027	CGA	2	6	2276972	2276977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213706
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41458	NC_011027	TGC	2	6	2277020	2277025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213706
41459	NC_011027	GCC	3	9	2277302	2277310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213707
41460	NC_011027	CGG	2	6	2277330	2277335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213707
41461	NC_011027	TCG	2	6	2277355	2277360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213707
41462	NC_011027	CG	3	6	2277359	2277364	0 %	0 %	50 %	50 %	193213707
41463	NC_011027	GCA	2	6	2277365	2277370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213707
41464	NC_011027	ATC	2	6	2277415	2277420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213707
41465	NC_011027	CGCT	2	8	2277430	2277437	0 %	25 %	25 %	50 %	193213707
41466	NC_011027	ATG	2	6	2277454	2277459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213707
41467	NC_011027	TGG	2	6	2277461	2277466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213707
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