MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 41667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011027	CGGTCG	2	12	196380	196391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	193211864
3502	NC_011027	TCA	2	6	196578	196583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211865
3503	NC_011027	A	6	6	196609	196614	100 %	0 %	0 %	0 %	193211865
3504	NC_011027	GAC	2	6	196618	196623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211865
3505	NC_011027	TC	3	6	196654	196659	0 %	50 %	0 %	50 %	193211865
3506	NC_011027	CTG	2	6	196664	196669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211865
3507	NC_011027	GACG	2	8	196760	196767	25 %	0 %	50 %	25 %	193211865
3508	NC_011027	CGGTCT	2	12	196849	196860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211865
3509	NC_011027	AGG	2	6	196899	196904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211865
3510	NC_011027	CGG	2	6	196921	196926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211865
3511	NC_011027	TATT	2	8	196942	196949	25 %	75 %	0 %	0 %	193211865
3512	NC_011027	GAT	2	6	197048	197053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211866
3513	NC_011027	TGA	2	6	197096	197101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211866
3514	NC_011027	TGA	2	6	197147	197152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211866
3515	NC_011027	CAA	2	6	197198	197203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211866
3516	NC_011027	ACCG	2	8	197363	197370	25 %	0 %	25 %	50 %	193211866
3517	NC_011027	CGC	2	6	197490	197495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211866
3518	NC_011027	AAGG	2	8	197496	197503	50 %	0 %	50 %	0 %	193211866
3519	NC_011027	GTAA	2	8	197515	197522	50 %	25 %	25 %	0 %	193211866
3520	NC_011027	GCAG	2	8	197607	197614	25 %	0 %	50 %	25 %	193211867
3521	NC_011027	AAG	2	6	197626	197631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211867
3522	NC_011027	GCAAC	2	10	197649	197658	40 %	0 %	20 %	40 %	193211867
3523	NC_011027	CGA	2	6	197713	197718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211867
3524	NC_011027	GAG	2	6	197794	197799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211867
3525	NC_011027	AGC	2	6	197814	197819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211867
3526	NC_011027	A	6	6	197969	197974	100 %	0 %	0 %	0 %	193211868
3527	NC_011027	GGT	2	6	198056	198061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211868
3528	NC_011027	TTGTCG	2	12	198084	198095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	193211868
3529	NC_011027	AAGG	2	8	198101	198108	50 %	0 %	50 %	0 %	193211868
3530	NC_011027	TCA	2	6	198189	198194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211868
3531	NC_011027	TCG	2	6	198231	198236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211868
3532	NC_011027	TGA	2	6	198261	198266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211868
3533	NC_011027	GGC	2	6	198299	198304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211868
3534	NC_011027	TC	3	6	198356	198361	0 %	50 %	0 %	50 %	193211868
3535	NC_011027	CTC	2	6	198364	198369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211868
3536	NC_011027	CGC	2	6	198443	198448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211868
3537	NC_011027	TGAG	2	8	198498	198505	25 %	25 %	50 %	0 %	193211869
3538	NC_011027	AAG	2	6	198551	198556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211869
3539	NC_011027	CGT	2	6	198646	198651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211869
3540	NC_011027	AAG	2	6	198681	198686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211869
3541	NC_011027	GAA	2	6	198760	198765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211870
3542	NC_011027	GTCG	2	8	198771	198778	0 %	25 %	50 %	25 %	193211870
3543	NC_011027	TAC	2	6	198800	198805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211870
3544	NC_011027	CAG	2	6	198828	198833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211870
3545	NC_011027	GAG	2	6	198836	198841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211870
3546	NC_011027	CGC	2	6	198913	198918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211870
3547	NC_011027	AAG	2	6	198924	198929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211870
3548	NC_011027	TTG	2	6	198982	198987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211870
3549	NC_011027	GAA	2	6	198990	198995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211870
3550	NC_011027	ACT	2	6	199042	199047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211870
3551	NC_011027	TTC	2	6	199101	199106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211870
3552	NC_011027	TGG	2	6	199139	199144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211870
3553	NC_011027	GAG	2	6	199173	199178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211870
3554	NC_011027	GAA	2	6	199241	199246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211870
3555	NC_011027	A	8	8	199245	199252	100 %	0 %	0 %	0 %	193211870
3556	NC_011027	CCT	2	6	199358	199363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211871
3557	NC_011027	CGC	2	6	199415	199420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211871
3558	NC_011027	ATC	2	6	199548	199553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211871
3559	NC_011027	CTT	2	6	199560	199565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211871
3560	NC_011027	GCA	2	6	199595	199600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3561	NC_011027	GAC	2	6	199615	199620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3562	NC_011027	ATCA	2	8	199626	199633	50 %	25 %	0 %	25 %	193211871
3563	NC_011027	TACGG	2	10	199644	199653	20 %	20 %	40 %	20 %	193211871
3564	NC_011027	GCGTCA	2	12	199681	199692	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3565	NC_011027	GGT	2	6	199721	199726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211871
3566	NC_011027	TCA	2	6	199792	199797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211871
3567	NC_011027	ATC	2	6	199851	199856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211871
3568	NC_011027	GCA	2	6	199921	199926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3569	NC_011027	GGC	2	6	199964	199969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211871
3570	NC_011027	GTG	2	6	199983	199988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211871
3571	NC_011027	CGA	2	6	200002	200007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3572	NC_011027	GAA	2	6	200008	200013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211871
3573	NC_011027	CGT	2	6	200036	200041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3574	NC_011027	GGC	2	6	200061	200066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211871
3575	NC_011027	ATC	2	6	200112	200117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211871
3576	NC_011027	TTC	2	6	200160	200165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211871
3577	NC_011027	AGA	2	6	200185	200190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211871
3578	NC_011027	GTG	2	6	200216	200221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211871
3579	NC_011027	TTC	2	6	200253	200258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211871
3580	NC_011027	CGT	2	6	200313	200318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3581	NC_011027	G	6	6	200321	200326	0 %	0 %	100 %	0 %	193211871
3582	NC_011027	ATTC	2	8	200327	200334	25 %	50 %	0 %	25 %	193211871
3583	NC_011027	ATT	2	6	200508	200513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193211871
3584	NC_011027	CAG	2	6	200538	200543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3585	NC_011027	TGA	2	6	200557	200562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211871
3586	NC_011027	ACG	2	6	200572	200577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211871
3587	NC_011027	GAT	2	6	200611	200616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211871
3588	NC_011027	AGCG	2	8	200627	200634	25 %	0 %	50 %	25 %	193211872
3589	NC_011027	TCG	2	6	200667	200672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211872
3590	NC_011027	GAC	2	6	200716	200721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211872
3591	NC_011027	CGA	2	6	200731	200736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211872
3592	NC_011027	ATC	2	6	200760	200765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211872
3593	NC_011027	GA	3	6	200976	200981	50 %	0 %	50 %	0 %	193211872
3594	NC_011027	CAG	2	6	200996	201001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211872
3595	NC_011027	CG	3	6	201015	201020	0 %	0 %	50 %	50 %	193211872
3596	NC_011027	CGG	2	6	201078	201083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211872
3597	NC_011027	GC	3	6	201098	201103	0 %	0 %	50 %	50 %	193211872
3598	NC_011027	GAT	2	6	201244	201249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211872
3599	NC_011027	CCATCG	2	12	201342	201353	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	193211872
3600	NC_011027	GAA	2	6	201445	201450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211873
3601	NC_011027	TACC	2	8	201636	201643	25 %	25 %	0 %	50 %	193211873
3602	NC_011027	TAAA	2	8	201648	201655	75 %	25 %	0 %	0 %	193211873
3603	NC_011027	A	6	6	201653	201658	100 %	0 %	0 %	0 %	193211873
3604	NC_011027	A	6	6	201786	201791	100 %	0 %	0 %	0 %	193211874
3605	NC_011027	AGC	2	6	201865	201870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211874
3606	NC_011027	AACA	2	8	201947	201954	75 %	0 %	0 %	25 %	193211875
3607	NC_011027	ATC	2	6	202088	202093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211875
3608	NC_011027	CAG	2	6	202133	202138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211875
3609	NC_011027	AAG	3	9	202271	202279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211875
3610	NC_011027	AAG	2	6	202286	202291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211875
3611	NC_011027	A	8	8	202360	202367	100 %	0 %	0 %	0 %	193211876
3612	NC_011027	CAA	2	6	202416	202421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211876
3613	NC_011027	CAT	2	6	202422	202427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211876
3614	NC_011027	GGC	2	6	202539	202544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211876
3615	NC_011027	TGC	2	6	202617	202622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211876
3616	NC_011027	CGC	2	6	202676	202681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211876
3617	NC_011027	AGA	2	6	202928	202933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211877
3618	NC_011027	TAC	2	6	202975	202980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211877
3619	NC_011027	AAG	2	6	202981	202986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211877
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3621	NC_011027	AAG	2	6	203134	203139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211877
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3742	NC_011027	AGC	2	6	209436	209441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211884
3743	NC_011027	AATG	2	8	209548	209555	50 %	25 %	25 %	0 %	193211885
3744	NC_011027	TCT	2	6	209569	209574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211885
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3746	NC_011027	TTG	2	6	209670	209675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211885
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3763	NC_011027	TCG	2	6	210524	210529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211886
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3864	NC_011027	TGC	2	6	215688	215693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211889
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3867	NC_011027	GTC	2	6	216341	216346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211890
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3977	NC_011027	GAG	4	12	221563	221574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211894
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3980	NC_011027	TTC	2	6	221725	221730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211894
3981	NC_011027	AAG	2	6	221737	221742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211894
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3983	NC_011027	CGG	2	6	221829	221834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211894
3984	NC_011027	CCA	2	6	222079	222084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211895
3985	NC_011027	GAG	2	6	222086	222091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211895
3986	NC_011027	TCG	2	6	222108	222113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211895
3987	NC_011027	GCG	2	6	222174	222179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211895
3988	NC_011027	CGT	2	6	222184	222189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211895
3989	NC_011027	ACG	2	6	222237	222242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211895
3990	NC_011027	GTG	2	6	222269	222274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211895
3991	NC_011027	GCG	2	6	222276	222281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211895
3992	NC_011027	TCA	2	6	222318	222323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211895
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3996	NC_011027	TC	3	6	222634	222639	0 %	50 %	0 %	50 %	193211895
3997	NC_011027	TCG	2	6	222696	222701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211895
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3999	NC_011027	GCTG	2	8	228848	228855	0 %	25 %	50 %	25 %	193211896
4000	NC_011027	GAA	2	6	228944	228949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211896

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