MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 2131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011026	GATTG	2	10	1350	1359	20 %	40 %	40 %	0 %	193213721
2	NC_011026	ACATT	2	10	1491	1500	40 %	40 %	0 %	20 %	193213721
3	NC_011026	TTCAC	2	10	6243	6252	20 %	40 %	0 %	40 %	193213726
4	NC_011026	CCGCA	2	10	6299	6308	20 %	0 %	20 %	60 %	193213726
5	NC_011026	AATCA	2	10	7032	7041	60 %	20 %	0 %	20 %	193213726
6	NC_011026	GGGCT	2	10	7396	7405	0 %	20 %	60 %	20 %	193213727
7	NC_011026	CGAGA	2	10	7716	7725	40 %	0 %	40 %	20 %	193213727
8	NC_011026	AAATC	2	10	7726	7735	60 %	20 %	0 %	20 %	193213727
9	NC_011026	GCGCG	2	10	9177	9186	0 %	0 %	60 %	40 %	193213727
10	NC_011026	GCGAT	2	10	9256	9265	20 %	20 %	40 %	20 %	193213727
11	NC_011026	CGGAG	2	10	9284	9293	20 %	0 %	60 %	20 %	193213727
12	NC_011026	CGCGC	2	10	9854	9863	0 %	0 %	40 %	60 %	193213727
13	NC_011026	CGAGC	2	10	11186	11195	20 %	0 %	40 %	40 %	193213728
14	NC_011026	ATTTT	2	10	13266	13275	20 %	80 %	0 %	0 %	193213728
15	NC_011026	GCCGC	2	10	13320	13329	0 %	0 %	40 %	60 %	193213728
16	NC_011026	CTTGG	2	10	15126	15135	0 %	40 %	40 %	20 %	193213730
17	NC_011026	TTGTC	2	10	15613	15622	0 %	60 %	20 %	20 %	193213730
18	NC_011026	TTTCA	2	10	16672	16681	20 %	60 %	0 %	20 %	193213732
19	NC_011026	TTATA	2	10	16909	16918	40 %	60 %	0 %	0 %	193213732
20	NC_011026	TTTGC	2	10	17293	17302	0 %	60 %	20 %	20 %	193213733
21	NC_011026	CACGC	2	10	19019	19028	20 %	0 %	20 %	60 %	193213735
22	NC_011026	ACAGA	2	10	19674	19683	60 %	0 %	20 %	20 %	193213735
23	NC_011026	TTCGC	2	10	20484	20493	0 %	40 %	20 %	40 %	193213736
24	NC_011026	AACGC	2	10	23378	23387	40 %	0 %	20 %	40 %	193213737
25	NC_011026	AAATC	2	10	26115	26124	60 %	20 %	0 %	20 %	193213739
26	NC_011026	AAAAC	2	10	26544	26553	80 %	0 %	0 %	20 %	193213739
27	NC_011026	TCAGT	2	10	30386	30395	20 %	40 %	20 %	20 %	193213741
28	NC_011026	CATCG	2	10	31181	31190	20 %	20 %	20 %	40 %	193213741
29	NC_011026	GGCTT	2	10	33050	33059	0 %	40 %	40 %	20 %	193213742
30	NC_011026	GCCAT	2	10	34171	34180	20 %	20 %	20 %	40 %	193213743
31	NC_011026	CAATT	2	10	34978	34987	40 %	40 %	0 %	20 %	193213744
32	NC_011026	TCAGC	2	10	36315	36324	20 %	20 %	20 %	40 %	193213745
33	NC_011026	CGTTT	2	10	41476	41485	0 %	60 %	20 %	20 %	193213750
34	NC_011026	GCCTT	2	10	41970	41979	0 %	40 %	20 %	40 %	193213750
35	NC_011026	ATTTC	2	10	42783	42792	20 %	60 %	0 %	20 %	193213751
36	NC_011026	AGGAA	2	10	45072	45081	60 %	0 %	40 %	0 %	193213752
37	NC_011026	ACGCC	2	10	46539	46548	20 %	0 %	20 %	60 %	193213754
38	NC_011026	GGCTG	2	10	48668	48677	0 %	20 %	60 %	20 %	193213758
39	NC_011026	ACTTC	2	10	48865	48874	20 %	40 %	0 %	40 %	193213758
40	NC_011026	AAACG	2	10	49257	49266	60 %	0 %	20 %	20 %	193213758
41	NC_011026	ATCGA	2	10	52957	52966	40 %	20 %	20 %	20 %	193213761
42	NC_011026	ATTGA	2	10	54543	54552	40 %	40 %	20 %	0 %	193213762
43	NC_011026	CAAGC	2	10	55778	55787	40 %	0 %	20 %	40 %	193213762
44	NC_011026	ATGGA	2	10	56861	56870	40 %	20 %	40 %	0 %	193213763
45	NC_011026	GCCAT	2	10	64651	64660	20 %	20 %	20 %	40 %	193213771
46	NC_011026	GAAAT	2	10	65132	65141	60 %	20 %	20 %	0 %	193213772
47	NC_011026	TCCGT	2	10	66345	66354	0 %	40 %	20 %	40 %	193213774
48	NC_011026	CGGCT	2	10	68039	68048	0 %	20 %	40 %	40 %	193213776
49	NC_011026	AACGG	2	10	68646	68655	40 %	0 %	40 %	20 %	193213776
50	NC_011026	GCCGA	2	10	68778	68787	20 %	0 %	40 %	40 %	193213776
51	NC_011026	GGCGC	2	10	70399	70408	0 %	0 %	60 %	40 %	193213779
52	NC_011026	GCTTG	2	10	70725	70734	0 %	40 %	40 %	20 %	193213779
53	NC_011026	AAACC	2	10	70898	70907	60 %	0 %	0 %	40 %	193213779
54	NC_011026	CGCTT	2	10	74394	74403	0 %	40 %	20 %	40 %	193213782
55	NC_011026	AATTC	2	10	74529	74538	40 %	40 %	0 %	20 %	193213782
56	NC_011026	CTCGG	2	10	76250	76259	0 %	20 %	40 %	40 %	193213782
57	NC_011026	CGCGG	2	10	76292	76301	0 %	0 %	60 %	40 %	193213782
58	NC_011026	TGATG	2	10	76906	76915	20 %	40 %	40 %	0 %	193213782
59	NC_011026	CGGCA	2	10	77745	77754	20 %	0 %	40 %	40 %	193213784
60	NC_011026	TCGGT	2	10	84383	84392	0 %	40 %	40 %	20 %	193213790
61	NC_011026	ATCGC	2	10	85105	85114	20 %	20 %	20 %	40 %	193213790
62	NC_011026	CGGCG	2	10	86584	86593	0 %	0 %	60 %	40 %	193213793
63	NC_011026	GTGGC	2	10	87962	87971	0 %	20 %	60 %	20 %	193213795
64	NC_011026	TTTCG	2	10	90454	90463	0 %	60 %	20 %	20 %	193213797
65	NC_011026	TGGCG	2	10	91108	91117	0 %	20 %	60 %	20 %	193213797
66	NC_011026	GATTT	2	10	96130	96139	20 %	60 %	20 %	0 %	193213802
67	NC_011026	CAAAT	2	10	97743	97752	60 %	20 %	0 %	20 %	193213803
68	NC_011026	CAAAA	2	10	101550	101559	80 %	0 %	0 %	20 %	193213806
69	NC_011026	ATAAA	2	10	104816	104825	80 %	20 %	0 %	0 %	193213809
70	NC_011026	TTTAC	2	10	107556	107565	20 %	60 %	0 %	20 %	193213810
71	NC_011026	GACGC	2	10	108184	108193	20 %	0 %	40 %	40 %	193213810
72	NC_011026	AAGAA	2	10	108300	108309	80 %	0 %	20 %	0 %	193213810
73	NC_011026	GCTGC	2	10	108767	108776	0 %	20 %	40 %	40 %	193213811
74	NC_011026	GATGC	2	10	109140	109149	20 %	20 %	40 %	20 %	193213812
75	NC_011026	TTATT	2	10	110276	110285	20 %	80 %	0 %	0 %	193213813
76	NC_011026	GCCGT	2	10	110752	110761	0 %	20 %	40 %	40 %	193213813
77	NC_011026	ATTTT	2	10	112790	112799	20 %	80 %	0 %	0 %	193213813
78	NC_011026	GATGT	2	10	113176	113185	20 %	40 %	40 %	0 %	193213814
79	NC_011026	CGGCA	2	10	113989	113998	20 %	0 %	40 %	40 %	193213816
80	NC_011026	CCTTG	2	10	117530	117539	0 %	40 %	20 %	40 %	193213819
81	NC_011026	AAAAC	2	10	118263	118272	80 %	0 %	0 %	20 %	193213819
82	NC_011026	CCATT	2	10	119476	119485	20 %	40 %	0 %	40 %	193213820
83	NC_011026	AAAAT	2	10	120510	120519	80 %	20 %	0 %	0 %	193213821
84	NC_011026	CGGCG	2	10	126258	126267	0 %	0 %	60 %	40 %	193213826
85	NC_011026	CATTG	2	10	126753	126762	20 %	40 %	20 %	20 %	193213827
86	NC_011026	GAAAA	2	10	128093	128102	80 %	0 %	20 %	0 %	193213829
87	NC_011026	GTTCA	2	10	128325	128334	20 %	40 %	20 %	20 %	193213829
88	NC_011026	ATGAA	2	10	133493	133502	60 %	20 %	20 %	0 %	193213833
89	NC_011026	GCTGA	2	10	134549	134558	20 %	20 %	40 %	20 %	193213834
90	NC_011026	TGATG	2	10	134803	134812	20 %	40 %	40 %	0 %	193213834
91	NC_011026	GTTTT	2	10	137330	137339	0 %	80 %	20 %	0 %	193213835
92	NC_011026	TGGTT	2	10	137592	137601	0 %	60 %	40 %	0 %	193213836
93	NC_011026	GATTT	2	10	137979	137988	20 %	60 %	20 %	0 %	193213836
94	NC_011026	TCCGA	2	10	138236	138245	20 %	20 %	20 %	40 %	193213836
95	NC_011026	ATTTT	2	10	138366	138375	20 %	80 %	0 %	0 %	193213836
96	NC_011026	TGGAT	2	10	139353	139362	20 %	40 %	40 %	0 %	193213837
97	NC_011026	TCGGG	2	10	141670	141679	0 %	20 %	60 %	20 %	193213840
98	NC_011026	CCGTG	2	10	143353	143362	0 %	20 %	40 %	40 %	193213840
99	NC_011026	TTTCG	2	10	152330	152339	0 %	60 %	20 %	20 %	193213848
100	NC_011026	CGGCG	2	10	153644	153653	0 %	0 %	60 %	40 %	193213849
101	NC_011026	GCCAA	2	10	154238	154247	40 %	0 %	20 %	40 %	193213849
102	NC_011026	CGGCG	2	10	155797	155806	0 %	0 %	60 %	40 %	193213850
103	NC_011026	AAATC	2	10	156764	156773	60 %	20 %	0 %	20 %	193213851
104	NC_011026	AAAGC	2	10	156959	156968	60 %	0 %	20 %	20 %	193213851
105	NC_011026	TCCTT	2	10	158876	158885	0 %	60 %	0 %	40 %	193213853
106	NC_011026	ACACG	2	10	159887	159896	40 %	0 %	20 %	40 %	193213854
107	NC_011026	TTTCC	2	10	165615	165624	0 %	60 %	0 %	40 %	193213861
108	NC_011026	ATCTA	2	10	168557	168566	40 %	40 %	0 %	20 %	193213864
109	NC_011026	CGCCA	2	10	168769	168778	20 %	0 %	20 %	60 %	193213864
110	NC_011026	AAGCG	2	10	169278	169287	40 %	0 %	40 %	20 %	193213864
111	NC_011026	GCAAG	2	10	169488	169497	40 %	0 %	40 %	20 %	193213864
112	NC_011026	ACAAG	2	10	169917	169926	60 %	0 %	20 %	20 %	193213864
113	NC_011026	AAGCG	2	10	170421	170430	40 %	0 %	40 %	20 %	193213864
114	NC_011026	ATTTT	2	10	171442	171451	20 %	80 %	0 %	0 %	193213864
115	NC_011026	AAAAG	2	10	171957	171966	80 %	0 %	20 %	0 %	193213864
116	NC_011026	AGCGC	2	10	173688	173697	20 %	0 %	40 %	40 %	193213866
117	NC_011026	CGAAT	2	10	177034	177043	40 %	20 %	20 %	20 %	193213868
118	NC_011026	TTCCA	2	10	180698	180707	20 %	40 %	0 %	40 %	193213872
119	NC_011026	TTCAA	2	10	181047	181056	40 %	40 %	0 %	20 %	193213872
120	NC_011026	GCGAC	2	10	181360	181369	20 %	0 %	40 %	40 %	193213872
121	NC_011026	TCAAA	2	10	181543	181552	60 %	20 %	0 %	20 %	193213872
122	NC_011026	AAAGT	2	10	183016	183025	60 %	20 %	20 %	0 %	193213872
123	NC_011026	TGCCG	2	10	186823	186832	0 %	20 %	40 %	40 %	193213877
124	NC_011026	GATCT	2	10	187040	187049	20 %	40 %	20 %	20 %	193213877
125	NC_011026	CGCAT	2	10	189598	189607	20 %	20 %	20 %	40 %	193213880
126	NC_011026	CGAAA	2	10	189793	189802	60 %	0 %	20 %	20 %	193213880
127	NC_011026	GGCAA	2	10	189806	189815	40 %	0 %	40 %	20 %	193213880
128	NC_011026	CAACC	2	10	192117	192126	40 %	0 %	0 %	60 %	193213882
129	NC_011026	TGGCT	2	10	195007	195016	0 %	40 %	40 %	20 %	193213884
130	NC_011026	TTGAG	2	10	195290	195299	20 %	40 %	40 %	0 %	193213884
131	NC_011026	CGATT	2	10	197452	197461	20 %	40 %	20 %	20 %	193213887
132	NC_011026	GAAAA	2	10	201720	201729	80 %	0 %	20 %	0 %	193213892
133	NC_011026	CATCG	2	10	203315	203324	20 %	20 %	20 %	40 %	193213892
134	NC_011026	CTTTC	2	10	205118	205127	0 %	60 %	0 %	40 %	193213893
135	NC_011026	CGTGT	2	10	208019	208028	0 %	40 %	40 %	20 %	193213896
136	NC_011026	CAAGC	2	10	211719	211728	40 %	0 %	20 %	40 %	193213899
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138	NC_011026	CTTGG	2	10	214914	214923	0 %	40 %	40 %	20 %	193213902
139	NC_011026	GATCG	2	10	220096	220105	20 %	20 %	40 %	20 %	193213908
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142	NC_011026	AAGCA	2	10	224626	224635	60 %	0 %	20 %	20 %	193213910
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156	NC_011026	CTTGC	2	10	238283	238292	0 %	40 %	20 %	40 %	193213923
157	NC_011026	CATTT	2	10	238684	238693	20 %	60 %	0 %	20 %	193213923
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248	NC_011026	GCTTT	2	10	373098	373107	0 %	60 %	20 %	20 %	193214042
249	NC_011026	AATTG	2	10	373111	373120	40 %	40 %	20 %	0 %	193214042
250	NC_011026	CTTGC	2	10	373207	373216	0 %	40 %	20 %	40 %	193214042
251	NC_011026	GGCGA	2	10	374772	374781	20 %	0 %	60 %	20 %	193214044
252	NC_011026	GCTTT	2	10	376449	376458	0 %	60 %	20 %	20 %	193214046
253	NC_011026	GCGCC	2	10	378208	378217	0 %	0 %	40 %	60 %	193214048
254	NC_011026	AAAAT	2	10	379168	379177	80 %	20 %	0 %	0 %	193214049
255	NC_011026	TTTAA	2	10	379463	379472	40 %	60 %	0 %	0 %	193214050
256	NC_011026	CAAAC	2	10	381945	381954	60 %	0 %	0 %	40 %	193214052
257	NC_011026	TGCCG	2	10	382254	382263	0 %	20 %	40 %	40 %	193214052
258	NC_011026	CATCA	2	10	383378	383387	40 %	20 %	0 %	40 %	193214054
259	NC_011026	CTGAT	2	10	383444	383453	20 %	40 %	20 %	20 %	193214054
260	NC_011026	CGAAT	2	10	383487	383496	40 %	20 %	20 %	20 %	193214054
261	NC_011026	TGGTT	2	10	384204	384213	0 %	60 %	40 %	0 %	193214055
262	NC_011026	AACGA	2	10	385464	385473	60 %	0 %	20 %	20 %	193214057
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