MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 35080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011026	ATT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213721
2	NC_011026	GGC	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
3	NC_011026	CGT	2	6	330	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213721
4	NC_011026	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
5	NC_011026	AAG	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
6	NC_011026	GCG	2	6	529	534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
7	NC_011026	CGG	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
8	NC_011026	AAC	2	6	724	729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213721
9	NC_011026	CCT	2	6	768	773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213721
10	NC_011026	CAT	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213721
11	NC_011026	CAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213721
12	NC_011026	GAA	2	6	1009	1014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
13	NC_011026	CCA	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213721
14	NC_011026	CGG	2	6	1365	1370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
15	NC_011026	GAA	2	6	1432	1437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
16	NC_011026	GAA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
17	NC_011026	ATA	2	6	1645	1650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213722
18	NC_011026	ATC	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213722
19	NC_011026	CTT	2	6	2132	2137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213723
20	NC_011026	TTC	2	6	2151	2156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213723
21	NC_011026	ACG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213723
22	NC_011026	GTG	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213723
23	NC_011026	GCG	2	6	2385	2390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213723
24	NC_011026	AAT	3	9	2477	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213723
25	NC_011026	GCG	2	6	2519	2524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213723
26	NC_011026	CAA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213723
27	NC_011026	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213723
28	NC_011026	AGG	2	6	2838	2843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213723
29	NC_011026	CGT	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213723
30	NC_011026	GCG	3	9	2887	2895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213723
31	NC_011026	CTC	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213723
32	NC_011026	CGA	2	6	3000	3005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213723
33	NC_011026	ATC	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213724
34	NC_011026	CAG	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213724
35	NC_011026	GCG	2	6	3251	3256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213724
36	NC_011026	AGC	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213724
37	NC_011026	ACC	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213724
38	NC_011026	ATA	2	6	3396	3401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213725
39	NC_011026	CCT	2	6	3457	3462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213725
40	NC_011026	GCC	3	9	3698	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213725
41	NC_011026	CAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213725
42	NC_011026	GCC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213725
43	NC_011026	ATA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213725
44	NC_011026	CCG	2	6	3894	3899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213725
45	NC_011026	AAT	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213725
46	NC_011026	CAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213725
47	NC_011026	ATT	2	6	4636	4641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
48	NC_011026	CGG	2	6	4704	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
49	NC_011026	ATC	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
50	NC_011026	CGG	2	6	4816	4821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
51	NC_011026	GCG	2	6	4920	4925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
52	NC_011026	ATG	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213726
53	NC_011026	CGA	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
54	NC_011026	CCA	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213726
55	NC_011026	AAT	2	6	5163	5168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213726
56	NC_011026	GAA	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213726
57	NC_011026	TGA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213726
58	NC_011026	ATT	2	6	5232	5237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
59	NC_011026	CAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
60	NC_011026	CAG	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
61	NC_011026	CGA	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
62	NC_011026	GTG	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213726
63	NC_011026	GGC	2	6	5583	5588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
64	NC_011026	ATC	2	6	5635	5640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
65	NC_011026	GCG	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
66	NC_011026	ATC	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
67	NC_011026	CGC	2	6	6015	6020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213726
68	NC_011026	GAA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213726
69	NC_011026	GAA	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213726
70	NC_011026	CAC	2	6	6439	6444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213726
71	NC_011026	CGC	2	6	6465	6470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213726
72	NC_011026	CAT	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
73	NC_011026	ACG	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
74	NC_011026	CCA	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213726
75	NC_011026	GCG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
76	NC_011026	ATT	2	6	6660	6665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
77	NC_011026	ACG	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
78	NC_011026	GCT	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213726
79	NC_011026	GCG	2	6	6766	6771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
80	NC_011026	ATG	2	6	6838	6843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213726
81	NC_011026	ATT	3	9	6852	6860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
82	NC_011026	AGA	2	6	6992	6997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213726
83	NC_011026	GGA	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213726
84	NC_011026	ACA	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213726
85	NC_011026	CGA	2	6	7208	7213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213727
86	NC_011026	CTT	3	9	7226	7234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213727
87	NC_011026	TTG	2	6	7279	7284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213727
88	NC_011026	GAT	2	6	7293	7298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213727
89	NC_011026	CGT	2	6	7355	7360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
90	NC_011026	GCG	2	6	7364	7369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213727
91	NC_011026	CGC	3	9	7454	7462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
92	NC_011026	CAG	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213727
93	NC_011026	ATG	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213727
94	NC_011026	CGG	2	6	7535	7540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213727
95	NC_011026	GTC	2	6	7542	7547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
96	NC_011026	TCG	2	6	7564	7569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
97	NC_011026	TTA	2	6	7654	7659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213727
98	NC_011026	GCT	2	6	7682	7687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
99	NC_011026	CTC	2	6	7755	7760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213727
100	NC_011026	CGC	3	9	7827	7835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
101	NC_011026	TAA	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213727
102	NC_011026	TGT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213727
103	NC_011026	ATC	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213727
104	NC_011026	CGG	2	6	8078	8083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213727
105	NC_011026	TCG	2	6	8176	8181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
106	NC_011026	TTG	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213727
107	NC_011026	GCG	2	6	8203	8208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213727
108	NC_011026	CCG	2	6	8330	8335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
109	NC_011026	TCC	2	6	8386	8391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213727
110	NC_011026	TTC	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213727
111	NC_011026	CGA	2	6	8566	8571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213727
112	NC_011026	CTT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213727
113	NC_011026	GCC	2	6	8632	8637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
114	NC_011026	CGG	2	6	8675	8680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213727
115	NC_011026	CCG	2	6	8740	8745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
116	NC_011026	CGT	2	6	8784	8789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
117	NC_011026	GCC	3	9	8809	8817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
118	NC_011026	TTG	2	6	8820	8825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213727
119	NC_011026	CGC	2	6	8826	8831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
120	NC_011026	AGC	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213727
121	NC_011026	CCG	2	6	8912	8917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
122	NC_011026	GCG	2	6	8951	8956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213727
123	NC_011026	CTG	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
124	NC_011026	CGC	2	6	8975	8980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
125	NC_011026	TCG	2	6	8981	8986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
126	NC_011026	CGA	2	6	9005	9010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213727
127	NC_011026	GGC	2	6	9051	9056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213727
128	NC_011026	GCA	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213727
129	NC_011026	TCG	2	6	9136	9141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
130	NC_011026	GCT	2	6	9355	9360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
131	NC_011026	CCG	2	6	9476	9481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213727
132	NC_011026	TCG	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
133	NC_011026	GCT	2	6	9827	9832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213727
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253	NC_011026	GGT	2	6	23493	23498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213737
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256	NC_011026	CGG	2	6	23709	23714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213737
257	NC_011026	GAT	2	6	23740	23745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213737
258	NC_011026	CAT	2	6	23886	23891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213737
259	NC_011026	CGA	2	6	24074	24079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213738
260	NC_011026	TTA	2	6	24205	24210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213738
261	NC_011026	ATT	2	6	24256	24261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213738
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375	NC_011026	TCT	2	6	35370	35375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213745
376	NC_011026	TCT	2	6	35381	35386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213745
377	NC_011026	CTT	2	6	35520	35525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213745
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497	NC_011026	CCA	3	9	46302	46310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213754
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