MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_011026	GAACTG	2	12	233951	233962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	193213919
4003	NC_011026	AAATAA	2	12	233989	234000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	193213919
4004	NC_011026	TTC	2	6	234094	234099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213919
4005	NC_011026	ATT	2	6	234190	234195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213919
4006	NC_011026	CGA	2	6	234526	234531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213920
4007	NC_011026	A	6	6	234629	234634	100 %	0 %	0 %	0 %	193213920
4008	NC_011026	AT	3	6	234651	234656	50 %	50 %	0 %	0 %	193213920
4009	NC_011026	ATA	2	6	234771	234776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213920
4010	NC_011026	AAATA	2	10	234804	234813	80 %	20 %	0 %	0 %	193213920
4011	NC_011026	AGA	2	6	234826	234831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213920
4012	NC_011026	TGA	4	12	234914	234925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213920
4013	NC_011026	AAG	2	6	234972	234977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213920
4014	NC_011026	CCA	2	6	234980	234985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213920
4015	NC_011026	GCC	2	6	235066	235071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213920
4016	NC_011026	ATC	2	6	235087	235092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213920
4017	NC_011026	A	6	6	235139	235144	100 %	0 %	0 %	0 %	193213920
4018	NC_011026	GCC	2	6	235198	235203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213920
4019	NC_011026	ATAA	2	8	235209	235216	75 %	25 %	0 %	0 %	193213920
4020	NC_011026	A	6	6	235215	235220	100 %	0 %	0 %	0 %	193213920
4021	NC_011026	AAT	2	6	235272	235277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213920
4022	NC_011026	CCA	2	6	235286	235291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213920
4023	NC_011026	AACCA	2	10	235302	235311	60 %	0 %	0 %	40 %	193213920
4024	NC_011026	CGC	2	6	235346	235351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213920
4025	NC_011026	TGAT	2	8	235381	235388	25 %	50 %	25 %	0 %	193213920
4026	NC_011026	CCG	3	9	235402	235410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213920
4027	NC_011026	CCA	2	6	235417	235422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213920
4028	NC_011026	A	6	6	235437	235442	100 %	0 %	0 %	0 %	193213920
4029	NC_011026	CTTA	2	8	235491	235498	25 %	50 %	0 %	25 %	193213920
4030	NC_011026	AAT	2	6	235499	235504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213920
4031	NC_011026	CAA	2	6	235571	235576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213920
4032	NC_011026	ATC	2	6	235609	235614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213920
4033	NC_011026	GCCC	2	8	235631	235638	0 %	0 %	25 %	75 %	193213920
4034	NC_011026	AAATC	2	10	235763	235772	60 %	20 %	0 %	20 %	193213920
4035	NC_011026	ACC	2	6	235825	235830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213920
4036	NC_011026	ACA	2	6	235855	235860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213920
4037	NC_011026	ATT	2	6	235875	235880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213920
4038	NC_011026	A	6	6	235895	235900	100 %	0 %	0 %	0 %	193213920
4039	NC_011026	CAA	2	6	235931	235936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213920
4040	NC_011026	TCG	2	6	235951	235956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213920
4041	NC_011026	CTGAC	2	10	236556	236565	20 %	20 %	20 %	40 %	193213921
4042	NC_011026	CTG	2	6	236594	236599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213921
4043	NC_011026	TAT	2	6	236642	236647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213921
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4050	NC_011026	CAA	2	6	237185	237190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213921
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4052	NC_011026	GCT	2	6	237235	237240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213921
4053	NC_011026	A	6	6	237382	237387	100 %	0 %	0 %	0 %	193213922
4054	NC_011026	TGC	2	6	237407	237412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213922
4055	NC_011026	ATG	2	6	237482	237487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213922
4056	NC_011026	GCG	2	6	237544	237549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213922
4057	NC_011026	A	6	6	237559	237564	100 %	0 %	0 %	0 %	193213922
4058	NC_011026	GCG	2	6	237613	237618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213922
4059	NC_011026	ACG	3	9	237638	237646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213922
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4062	NC_011026	CTTGG	2	10	237928	237937	0 %	40 %	40 %	20 %	193213922
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4064	NC_011026	AT	3	6	238175	238180	50 %	50 %	0 %	0 %	193213923
4065	NC_011026	CTTCA	2	10	238229	238238	20 %	40 %	0 %	40 %	193213923
4066	NC_011026	ATT	2	6	238274	238279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213923
4067	NC_011026	CTTGC	2	10	238283	238292	0 %	40 %	20 %	40 %	193213923
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4070	NC_011026	TGA	2	6	238510	238515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213923
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4074	NC_011026	GCA	2	6	238576	238581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213923
4075	NC_011026	CATTT	2	10	238684	238693	20 %	60 %	0 %	20 %	193213923
4076	NC_011026	ATGA	2	8	238694	238701	50 %	25 %	25 %	0 %	193213923
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4079	NC_011026	GCT	2	6	238818	238823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213923
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4093	NC_011026	AGTT	2	8	239584	239591	25 %	50 %	25 %	0 %	193213924
4094	NC_011026	A	6	6	239611	239616	100 %	0 %	0 %	0 %	193213924
4095	NC_011026	TGC	2	6	239680	239685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213924
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4104	NC_011026	A	6	6	240121	240126	100 %	0 %	0 %	0 %	193213924
4105	NC_011026	GACA	2	8	240152	240159	50 %	0 %	25 %	25 %	193213924
4106	NC_011026	TTA	2	6	240365	240370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213924
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4112	NC_011026	GCAA	2	8	240815	240822	50 %	0 %	25 %	25 %	193213925
4113	NC_011026	GC	3	6	240867	240872	0 %	0 %	50 %	50 %	193213925
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4121	NC_011026	GCG	2	6	241549	241554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213926
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4123	NC_011026	GC	3	6	241786	241791	0 %	0 %	50 %	50 %	193213926
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4237	NC_011026	CAT	2	6	248907	248912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213932
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4241	NC_011026	AC	3	6	249071	249076	50 %	0 %	0 %	50 %	193213932
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4245	NC_011026	CG	3	6	249301	249306	0 %	0 %	50 %	50 %	193213932
4246	NC_011026	CGAT	2	8	249322	249329	25 %	25 %	25 %	25 %	193213932
4247	NC_011026	A	6	6	249339	249344	100 %	0 %	0 %	0 %	193213932
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4249	NC_011026	GAT	2	6	249461	249466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213932
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4251	NC_011026	CGG	2	6	249478	249483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213932
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4253	NC_011026	GCG	3	9	249496	249504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213932
4254	NC_011026	ACC	2	6	249528	249533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213932
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4351	NC_011026	AAAC	2	8	255292	255299	75 %	0 %	0 %	25 %	193213936
4352	NC_011026	TTC	2	6	255322	255327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213936
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4355	NC_011026	A	8	8	255516	255523	100 %	0 %	0 %	0 %	193213936
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4359	NC_011026	GAT	2	6	255704	255709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213936
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4362	NC_011026	GC	3	6	255808	255813	0 %	0 %	50 %	50 %	193213936
4363	NC_011026	GGC	2	6	255909	255914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213936
4364	NC_011026	A	6	6	255975	255980	100 %	0 %	0 %	0 %	193213936
4365	NC_011026	CA	4	8	255992	255999	50 %	0 %	0 %	50 %	193213936
4366	NC_011026	GCA	2	6	256005	256010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213936
4367	NC_011026	TCG	2	6	256021	256026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213936
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4369	NC_011026	ATT	2	6	256053	256058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213936
4370	NC_011026	GTT	2	6	256100	256105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213936
4371	NC_011026	T	6	6	256294	256299	0 %	100 %	0 %	0 %	193213937
4372	NC_011026	CGC	2	6	256341	256346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213937
4373	NC_011026	ATGA	2	8	256368	256375	50 %	25 %	25 %	0 %	193213937
4374	NC_011026	A	6	6	256396	256401	100 %	0 %	0 %	0 %	193213937
4375	NC_011026	GCAC	2	8	256438	256445	25 %	0 %	25 %	50 %	193213937
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4377	NC_011026	TGGC	2	8	256778	256785	0 %	25 %	50 %	25 %	193213937
4378	NC_011026	CGC	2	6	256805	256810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213937
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4394	NC_011026	TGA	2	6	257957	257962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213938
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4467	NC_011026	TAT	2	6	262944	262949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213942
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4470	NC_011026	CTTA	2	8	263177	263184	25 %	50 %	0 %	25 %	193213942
4471	NC_011026	TAG	2	6	263193	263198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213942
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4473	NC_011026	T	6	6	263211	263216	0 %	100 %	0 %	0 %	193213942
4474	NC_011026	ATTT	2	8	263275	263282	25 %	75 %	0 %	0 %	193213942
4475	NC_011026	TCA	2	6	263348	263353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213942
4476	NC_011026	TGA	2	6	263364	263369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213942
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4478	NC_011026	GCTGG	2	10	263427	263436	0 %	20 %	60 %	20 %	193213942
4479	NC_011026	GGC	2	6	263472	263477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213942
4480	NC_011026	CAAC	2	8	263549	263556	50 %	0 %	0 %	50 %	193213942
4481	NC_011026	ATT	2	6	263572	263577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213942
4482	NC_011026	GCA	2	6	263610	263615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213942
4483	NC_011026	A	8	8	263624	263631	100 %	0 %	0 %	0 %	193213942
4484	NC_011026	GAT	2	6	263647	263652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213942
4485	NC_011026	CCG	2	6	263686	263691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213942
4486	NC_011026	ATT	2	6	263803	263808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213942
4487	NC_011026	TCA	2	6	263858	263863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213942
4488	NC_011026	AGC	2	6	263915	263920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213942
4489	NC_011026	AAC	3	9	263942	263950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213942
4490	NC_011026	GGC	2	6	264052	264057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213942
4491	NC_011026	T	6	6	264070	264075	0 %	100 %	0 %	0 %	193213942
4492	NC_011026	GAC	2	6	264082	264087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213942
4493	NC_011026	CAT	2	6	264177	264182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213942
4494	NC_011026	A	6	6	264229	264234	100 %	0 %	0 %	0 %	193213942
4495	NC_011026	A	6	6	264264	264269	100 %	0 %	0 %	0 %	193213942
4496	NC_011026	GCTT	2	8	264281	264288	0 %	50 %	25 %	25 %	193213942
4497	NC_011026	TGA	2	6	264359	264364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213942
4498	NC_011026	T	6	6	264482	264487	0 %	100 %	0 %	0 %	193213942
4499	NC_011026	GAC	2	6	264652	264657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213942
4500	NC_011026	A	6	6	264676	264681	100 %	0 %	0 %	0 %	193213942

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