MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011026	T	6	6	116366	116371	0 %	100 %	0 %	0 %	193213818
2003	NC_011026	CA	3	6	116378	116383	50 %	0 %	0 %	50 %	193213818
2004	NC_011026	A	6	6	116386	116391	100 %	0 %	0 %	0 %	193213818
2005	NC_011026	TGC	2	6	116420	116425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213818
2006	NC_011026	GAT	2	6	116454	116459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213818
2007	NC_011026	TGA	2	6	116522	116527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213818
2008	NC_011026	T	7	7	116631	116637	0 %	100 %	0 %	0 %	193213818
2009	NC_011026	AAGG	2	8	116678	116685	50 %	0 %	50 %	0 %	193213818
2010	NC_011026	AATG	2	8	116773	116780	50 %	25 %	25 %	0 %	193213818
2011	NC_011026	TCA	2	6	116795	116800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213818
2012	NC_011026	T	6	6	116804	116809	0 %	100 %	0 %	0 %	193213818
2013	NC_011026	CGTAGC	2	12	116943	116954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193213818
2014	NC_011026	T	6	6	116970	116975	0 %	100 %	0 %	0 %	193213818
2015	NC_011026	A	6	6	116982	116987	100 %	0 %	0 %	0 %	193213818
2016	NC_011026	CGA	2	6	116992	116997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213818
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2018	NC_011026	A	6	6	117142	117147	100 %	0 %	0 %	0 %	193213818
2019	NC_011026	GA	3	6	117199	117204	50 %	0 %	50 %	0 %	193213818
2020	NC_011026	CG	3	6	117278	117283	0 %	0 %	50 %	50 %	193213818
2021	NC_011026	A	6	6	117340	117345	100 %	0 %	0 %	0 %	193213818
2022	NC_011026	A	6	6	117389	117394	100 %	0 %	0 %	0 %	193213818
2023	NC_011026	ATG	2	6	117410	117415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213818
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2025	NC_011026	GAA	2	6	117578	117583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213819
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2033	NC_011026	GCA	2	6	118129	118134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213819
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2036	NC_011026	AAAAC	2	10	118263	118272	80 %	0 %	0 %	20 %	193213819
2037	NC_011026	T	7	7	118567	118573	0 %	100 %	0 %	0 %	193213820
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2043	NC_011026	GCTT	2	8	118774	118781	0 %	50 %	25 %	25 %	193213820
2044	NC_011026	GCTC	2	8	118804	118811	0 %	25 %	25 %	50 %	193213820
2045	NC_011026	ACC	2	6	118830	118835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213820
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2052	NC_011026	CCATT	2	10	119476	119485	20 %	40 %	0 %	40 %	193213820
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2054	NC_011026	A	8	8	119560	119567	100 %	0 %	0 %	0 %	193213820
2055	NC_011026	GGC	2	6	119646	119651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213820
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2058	NC_011026	TTC	2	6	119932	119937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213821
2059	NC_011026	TCTG	2	8	119994	120001	0 %	50 %	25 %	25 %	193213821
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2093	NC_011026	TG	3	6	122191	122196	0 %	50 %	50 %	0 %	193213822
2094	NC_011026	GAG	2	6	122210	122215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213822
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2099	NC_011026	GC	3	6	122642	122647	0 %	0 %	50 %	50 %	193213823
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2107	NC_011026	TGGC	2	8	123011	123018	0 %	25 %	50 %	25 %	193213824
2108	NC_011026	ATGG	2	8	123030	123037	25 %	25 %	50 %	0 %	193213824
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2111	NC_011026	CG	3	6	123247	123252	0 %	0 %	50 %	50 %	193213825
2112	NC_011026	TGC	2	6	123274	123279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213825
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2116	NC_011026	AC	3	6	123399	123404	50 %	0 %	0 %	50 %	193213825
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2119	NC_011026	CAAT	2	8	123466	123473	50 %	25 %	0 %	25 %	193213825
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2122	NC_011026	ACGG	2	8	123560	123567	25 %	0 %	50 %	25 %	193213825
2123	NC_011026	GCA	2	6	123598	123603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213825
2124	NC_011026	ACG	2	6	123613	123618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213825
2125	NC_011026	TCGC	2	8	123622	123629	0 %	25 %	25 %	50 %	193213825
2126	NC_011026	CGC	2	6	123747	123752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213825
2127	NC_011026	T	8	8	123774	123781	0 %	100 %	0 %	0 %	193213825
2128	NC_011026	ATG	2	6	123813	123818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213825
2129	NC_011026	ACG	2	6	123834	123839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213825
2130	NC_011026	GGCT	2	8	123911	123918	0 %	25 %	50 %	25 %	193213825
2131	NC_011026	GCC	2	6	123923	123928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213825
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2134	NC_011026	CG	3	6	124226	124231	0 %	0 %	50 %	50 %	193213825
2135	NC_011026	GGT	2	6	124303	124308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213825
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2137	NC_011026	CGT	2	6	124390	124395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213825
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2140	NC_011026	TAC	2	6	124484	124489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213825
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2142	NC_011026	T	6	6	124560	124565	0 %	100 %	0 %	0 %	193213825
2143	NC_011026	GC	3	6	124628	124633	0 %	0 %	50 %	50 %	193213825
2144	NC_011026	GTTG	2	8	124637	124644	0 %	50 %	50 %	0 %	193213825
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2147	NC_011026	ACAA	2	8	124739	124746	75 %	0 %	0 %	25 %	193213825
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2149	NC_011026	A	6	6	124795	124800	100 %	0 %	0 %	0 %	193213825
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2153	NC_011026	T	6	6	125068	125073	0 %	100 %	0 %	0 %	193213825
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2156	NC_011026	T	6	6	125324	125329	0 %	100 %	0 %	0 %	193213826
2157	NC_011026	GCA	2	6	125479	125484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213826
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2229	NC_011026	GCTG	2	8	129566	129573	0 %	25 %	50 %	25 %	193213830
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2236	NC_011026	T	7	7	130223	130229	0 %	100 %	0 %	0 %	193213831
2237	NC_011026	TCCA	2	8	130299	130306	25 %	25 %	0 %	50 %	193213831
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2240	NC_011026	ATG	2	6	130505	130510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213831
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2242	NC_011026	T	7	7	130622	130628	0 %	100 %	0 %	0 %	193213831
2243	NC_011026	A	6	6	130633	130638	100 %	0 %	0 %	0 %	193213831
2244	NC_011026	CG	4	8	130647	130654	0 %	0 %	50 %	50 %	193213831
2245	NC_011026	GCTG	2	8	130744	130751	0 %	25 %	50 %	25 %	193213831
2246	NC_011026	TTG	2	6	130769	130774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213831
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2248	NC_011026	TCA	2	6	130871	130876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213831
2249	NC_011026	TTG	2	6	130942	130947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213831
2250	NC_011026	AAT	2	6	131007	131012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213831
2251	NC_011026	GCC	2	6	131023	131028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213831
2252	NC_011026	TGC	2	6	131123	131128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213831
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2262	NC_011026	GCC	2	6	131479	131484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213831
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2357	NC_011026	AGC	2	6	137241	137246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213835
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2359	NC_011026	TGCT	2	8	137348	137355	0 %	50 %	25 %	25 %	193213835
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2364	NC_011026	TGGTT	2	10	137592	137601	0 %	60 %	40 %	0 %	193213836
2365	NC_011026	ATT	3	9	137624	137632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213836
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2367	NC_011026	TGC	2	6	137712	137717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213836
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2370	NC_011026	TTTC	2	8	137822	137829	0 %	75 %	0 %	25 %	193213836
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2492	NC_011026	CCG	2	6	145160	145165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213841
2493	NC_011026	CGG	2	6	145215	145220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213841
2494	NC_011026	CCG	2	6	145337	145342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213841
2495	NC_011026	CGTT	2	8	145407	145414	0 %	50 %	25 %	25 %	193213841
2496	NC_011026	TTC	2	6	145424	145429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213841
2497	NC_011026	GA	3	6	145481	145486	50 %	0 %	50 %	0 %	193213841
2498	NC_011026	A	6	6	145533	145538	100 %	0 %	0 %	0 %	193213841
2499	NC_011026	CGC	2	6	145629	145634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213841
2500	NC_011026	TATC	2	8	146034	146041	25 %	50 %	0 %	25 %	193213841

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