MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_011026	TGG	2	6	88694	88699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213796
1503	NC_011026	AAT	2	6	88718	88723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213796
1504	NC_011026	CAT	2	6	88737	88742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213796
1505	NC_011026	TGC	2	6	88804	88809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213796
1506	NC_011026	AGC	2	6	88891	88896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213796
1507	NC_011026	GCTCAA	2	12	88916	88927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193213796
1508	NC_011026	TCC	2	6	88969	88974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213796
1509	NC_011026	CTG	2	6	89054	89059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213796
1510	NC_011026	GCT	2	6	89076	89081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213796
1511	NC_011026	ACG	2	6	89120	89125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213796
1512	NC_011026	CAT	2	6	89156	89161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213796
1513	NC_011026	CAC	2	6	89313	89318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213796
1514	NC_011026	CAGC	2	8	89409	89416	25 %	0 %	25 %	50 %	193213796
1515	NC_011026	TAAA	2	8	89468	89475	75 %	25 %	0 %	0 %	193213796
1516	NC_011026	GCC	2	6	89547	89552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213796
1517	NC_011026	TGA	2	6	89606	89611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213796
1518	NC_011026	GC	3	6	89615	89620	0 %	0 %	50 %	50 %	193213796
1519	NC_011026	CAG	2	6	89630	89635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213796
1520	NC_011026	TCT	2	6	89677	89682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213796
1521	NC_011026	T	8	8	89682	89689	0 %	100 %	0 %	0 %	193213796
1522	NC_011026	CTG	2	6	89724	89729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213796
1523	NC_011026	TTG	2	6	89795	89800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213796
1524	NC_011026	GCC	2	6	89817	89822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213796
1525	NC_011026	T	6	6	89882	89887	0 %	100 %	0 %	0 %	193213796
1526	NC_011026	TGT	2	6	89908	89913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213796
1527	NC_011026	TCAT	2	8	89914	89921	25 %	50 %	0 %	25 %	193213796
1528	NC_011026	AGC	2	6	90200	90205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213797
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1530	NC_011026	TTC	2	6	90330	90335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213797
1531	NC_011026	TTTCG	2	10	90454	90463	0 %	60 %	20 %	20 %	193213797
1532	NC_011026	CGG	2	6	90468	90473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213797
1533	NC_011026	TGG	2	6	90993	90998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213797
1534	NC_011026	AGC	2	6	91034	91039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213797
1535	NC_011026	ATG	2	6	91063	91068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213797
1536	NC_011026	TGGCG	2	10	91108	91117	0 %	20 %	60 %	20 %	193213797
1537	NC_011026	TCG	2	6	91124	91129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213797
1538	NC_011026	GCT	2	6	91211	91216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213797
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1541	NC_011026	CG	3	6	91382	91387	0 %	0 %	50 %	50 %	193213797
1542	NC_011026	CGC	2	6	91392	91397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213797
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1545	NC_011026	GTT	2	6	91555	91560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213797
1546	NC_011026	CAT	2	6	91584	91589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213797
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1548	NC_011026	TGA	3	9	91698	91706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213797
1549	NC_011026	CAA	2	6	91768	91773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213797
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1555	NC_011026	CAC	2	6	92029	92034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213797
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1557	NC_011026	A	6	6	92106	92111	100 %	0 %	0 %	0 %	193213797
1558	NC_011026	GCC	2	6	92123	92128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213797
1559	NC_011026	GA	3	6	92159	92164	50 %	0 %	50 %	0 %	193213797
1560	NC_011026	CTG	2	6	92229	92234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213797
1561	NC_011026	TGA	2	6	92290	92295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213797
1562	NC_011026	CCA	2	6	92312	92317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213797
1563	NC_011026	CGC	3	9	92334	92342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213797
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1565	NC_011026	CGC	2	6	92448	92453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213797
1566	NC_011026	TCG	2	6	92480	92485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213797
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1569	NC_011026	A	6	6	92713	92718	100 %	0 %	0 %	0 %	193213797
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1572	NC_011026	GC	3	6	92883	92888	0 %	0 %	50 %	50 %	193213798
1573	NC_011026	CCTG	2	8	92961	92968	0 %	25 %	25 %	50 %	193213798
1574	NC_011026	GCC	2	6	92973	92978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213798
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1582	NC_011026	TCA	2	6	93328	93333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213798
1583	NC_011026	T	7	7	93372	93378	0 %	100 %	0 %	0 %	193213798
1584	NC_011026	T	6	6	93482	93487	0 %	100 %	0 %	0 %	193213798
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1588	NC_011026	A	8	8	93572	93579	100 %	0 %	0 %	0 %	193213798
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1594	NC_011026	CGG	2	6	94240	94245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213799
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1597	NC_011026	CAA	2	6	94297	94302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213799
1598	NC_011026	TCAG	2	8	94404	94411	25 %	25 %	25 %	25 %	193213800
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1600	NC_011026	A	6	6	94548	94553	100 %	0 %	0 %	0 %	193213800
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1603	NC_011026	GC	3	6	94736	94741	0 %	0 %	50 %	50 %	193213800
1604	NC_011026	GGCGTC	2	12	94745	94756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	193213800
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1606	NC_011026	A	7	7	94803	94809	100 %	0 %	0 %	0 %	193213800
1607	NC_011026	ATT	2	6	95050	95055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213801
1608	NC_011026	AG	3	6	95142	95147	50 %	0 %	50 %	0 %	193213801
1609	NC_011026	TGT	2	6	95242	95247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213801
1610	NC_011026	TTG	2	6	95320	95325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213801
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1612	NC_011026	AAT	2	6	95365	95370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213801
1613	NC_011026	CAA	2	6	95507	95512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213801
1614	NC_011026	GCC	2	6	95527	95532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213801
1615	NC_011026	ATTT	2	8	95554	95561	25 %	75 %	0 %	0 %	193213801
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1618	NC_011026	GCA	2	6	96062	96067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213802
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1620	NC_011026	T	6	6	96080	96085	0 %	100 %	0 %	0 %	193213802
1621	NC_011026	GATTT	2	10	96130	96139	20 %	60 %	20 %	0 %	193213802
1622	NC_011026	AC	3	6	96219	96224	50 %	0 %	0 %	50 %	193213802
1623	NC_011026	TGGCGC	2	12	96272	96283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	193213802
1624	NC_011026	A	6	6	96328	96333	100 %	0 %	0 %	0 %	193213802
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1626	NC_011026	A	7	7	96461	96467	100 %	0 %	0 %	0 %	193213802
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1752	NC_011026	TGTT	2	8	103495	103502	0 %	75 %	25 %	0 %	193213808
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1755	NC_011026	AGC	2	6	103567	103572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213808
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1869	NC_011026	TCA	2	6	109214	109219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213812
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1984	NC_011026	CAT	2	6	115545	115550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213818
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1986	NC_011026	GAAA	2	8	115652	115659	75 %	0 %	25 %	0 %	193213818
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1990	NC_011026	TCA	2	6	115956	115961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213818
1991	NC_011026	AT	3	6	115996	116001	50 %	50 %	0 %	0 %	193213818
1992	NC_011026	CAT	2	6	116074	116079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213818
1993	NC_011026	CCA	2	6	116082	116087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213818
1994	NC_011026	GAA	2	6	116109	116114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213818
1995	NC_011026	TCGA	2	8	116129	116136	25 %	25 %	25 %	25 %	193213818
1996	NC_011026	CGT	2	6	116169	116174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213818
1997	NC_011026	ATC	2	6	116176	116181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213818
1998	NC_011026	GCA	2	6	116211	116216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213818
1999	NC_011026	A	6	6	116224	116229	100 %	0 %	0 %	0 %	193213818
2000	NC_011026	GTA	2	6	116275	116280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213818

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