MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011026	CGA	4	12	58430	58441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213766
1002	NC_011026	ATT	2	6	58519	58524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213766
1003	NC_011026	AAAT	2	8	58570	58577	75 %	25 %	0 %	0 %	193213766
1004	NC_011026	GTC	2	6	58629	58634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213766
1005	NC_011026	CGT	2	6	58691	58696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213766
1006	NC_011026	CAAA	2	8	58724	58731	75 %	0 %	0 %	25 %	193213766
1007	NC_011026	AAC	2	6	58739	58744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213766
1008	NC_011026	CAA	2	6	58936	58941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213766
1009	NC_011026	AC	3	6	58947	58952	50 %	0 %	0 %	50 %	193213766
1010	NC_011026	CTTA	2	8	58954	58961	25 %	50 %	0 %	25 %	193213766
1011	NC_011026	TGG	2	6	59068	59073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213766
1012	NC_011026	CCGT	2	8	59118	59125	0 %	25 %	25 %	50 %	193213766
1013	NC_011026	ATG	2	6	59158	59163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213766
1014	NC_011026	ATT	2	6	59678	59683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213767
1015	NC_011026	CA	5	10	59696	59705	50 %	0 %	0 %	50 %	193213767
1016	NC_011026	GGC	2	6	59782	59787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213767
1017	NC_011026	GGC	2	6	60020	60025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213767
1018	NC_011026	TCA	2	6	60027	60032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213767
1019	NC_011026	TCGGAA	2	12	60230	60241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	193213767
1020	NC_011026	CGG	2	6	60334	60339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213767
1021	NC_011026	AAT	2	6	60491	60496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213767
1022	NC_011026	AAT	2	6	60524	60529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213767
1023	NC_011026	TGGA	2	8	60593	60600	25 %	25 %	50 %	0 %	193213767
1024	NC_011026	CGT	2	6	60639	60644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213767
1025	NC_011026	CG	3	6	60715	60720	0 %	0 %	50 %	50 %	193213767
1026	NC_011026	TCC	2	6	60872	60877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213767
1027	NC_011026	GAG	2	6	60893	60898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213767
1028	NC_011026	TAC	2	6	60995	61000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213767
1029	NC_011026	ATT	2	6	61058	61063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213767
1030	NC_011026	T	6	6	61136	61141	0 %	100 %	0 %	0 %	193213767
1031	NC_011026	CTT	2	6	61224	61229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213767
1032	NC_011026	CCG	2	6	61253	61258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213767
1033	NC_011026	TTGAAT	2	12	61304	61315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	193213767
1034	NC_011026	GGC	2	6	61324	61329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213767
1035	NC_011026	GACG	2	8	61363	61370	25 %	0 %	50 %	25 %	193213767
1036	NC_011026	GCAA	2	8	61416	61423	50 %	0 %	25 %	25 %	193213767
1037	NC_011026	CAT	2	6	61427	61432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213767
1038	NC_011026	ATA	2	6	61449	61454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213767
1039	NC_011026	ATC	2	6	61476	61481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213767
1040	NC_011026	TC	3	6	61480	61485	0 %	50 %	0 %	50 %	193213767
1041	NC_011026	CAT	2	6	61498	61503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213767
1042	NC_011026	T	7	7	61544	61550	0 %	100 %	0 %	0 %	193213767
1043	NC_011026	TTA	2	6	61824	61829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213768
1044	NC_011026	GGC	2	6	61832	61837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213768
1045	NC_011026	AAGC	2	8	61874	61881	50 %	0 %	25 %	25 %	193213768
1046	NC_011026	ATC	2	6	61952	61957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213768
1047	NC_011026	CTTG	2	8	62107	62114	0 %	50 %	25 %	25 %	193213768
1048	NC_011026	A	6	6	62137	62142	100 %	0 %	0 %	0 %	193213768
1049	NC_011026	GAT	2	6	62267	62272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213768
1050	NC_011026	CGG	2	6	62341	62346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213768
1051	NC_011026	CGC	2	6	62398	62403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213768
1052	NC_011026	CGC	2	6	62411	62416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213768
1053	NC_011026	TGG	2	6	62536	62541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213768
1054	NC_011026	TTC	2	6	62552	62557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213768
1055	NC_011026	CG	3	6	62605	62610	0 %	0 %	50 %	50 %	193213768
1056	NC_011026	CGC	2	6	62651	62656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213768
1057	NC_011026	A	6	6	62691	62696	100 %	0 %	0 %	0 %	193213768
1058	NC_011026	GCCA	2	8	62737	62744	25 %	0 %	25 %	50 %	193213768
1059	NC_011026	ATGGCA	2	12	62758	62769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	193213768
1060	NC_011026	GAA	2	6	62898	62903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213769
1061	NC_011026	ATG	2	6	62941	62946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213769
1062	NC_011026	TTC	2	6	63196	63201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213769
1063	NC_011026	GCT	2	6	63208	63213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213769
1064	NC_011026	ATT	2	6	63232	63237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213769
1065	NC_011026	GAA	2	6	63243	63248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213769
1066	NC_011026	GTTA	2	8	63369	63376	25 %	50 %	25 %	0 %	193213770
1067	NC_011026	TCA	2	6	63378	63383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213770
1068	NC_011026	T	6	6	63404	63409	0 %	100 %	0 %	0 %	193213770
1069	NC_011026	A	6	6	63442	63447	100 %	0 %	0 %	0 %	193213770
1070	NC_011026	GGC	2	6	63514	63519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213770
1071	NC_011026	CG	3	6	63532	63537	0 %	0 %	50 %	50 %	193213770
1072	NC_011026	CCA	2	6	63605	63610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213770
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1074	NC_011026	TAT	3	9	63814	63822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213770
1075	NC_011026	AAC	2	6	63954	63959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213770
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1077	NC_011026	CGC	2	6	63999	64004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213770
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1082	NC_011026	TGA	2	6	64513	64518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213771
1083	NC_011026	ACCA	2	8	64620	64627	50 %	0 %	0 %	50 %	193213771
1084	NC_011026	GCCAT	2	10	64651	64660	20 %	20 %	20 %	40 %	193213771
1085	NC_011026	AAG	2	6	64696	64701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213771
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1089	NC_011026	TACA	2	8	64800	64807	50 %	25 %	0 %	25 %	193213772
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1092	NC_011026	GC	3	6	64881	64886	0 %	0 %	50 %	50 %	193213772
1093	NC_011026	AGA	2	6	64924	64929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213772
1094	NC_011026	GACGCG	2	12	65036	65047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	193213772
1095	NC_011026	ACA	2	6	65068	65073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213772
1096	NC_011026	TGG	2	6	65090	65095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213772
1097	NC_011026	T	6	6	65124	65129	0 %	100 %	0 %	0 %	193213772
1098	NC_011026	GAAAT	2	10	65132	65141	60 %	20 %	20 %	0 %	193213772
1099	NC_011026	TAT	2	6	65182	65187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213772
1100	NC_011026	TGG	2	6	65508	65513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213773
1101	NC_011026	TGG	2	6	65623	65628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213773
1102	NC_011026	ATT	2	6	65718	65723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213773
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1104	NC_011026	GATCAT	2	12	65774	65785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193213773
1105	NC_011026	CAT	2	6	65789	65794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213773
1106	NC_011026	ACC	2	6	65810	65815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213773
1107	NC_011026	TCA	3	9	65887	65895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213773
1108	NC_011026	ATG	2	6	65910	65915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213773
1109	NC_011026	ATC	2	6	65916	65921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213773
1110	NC_011026	CCA	2	6	65950	65955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213773
1111	NC_011026	GAA	2	6	66030	66035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213774
1112	NC_011026	TCA	2	6	66036	66041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213774
1113	NC_011026	T	6	6	66194	66199	0 %	100 %	0 %	0 %	193213774
1114	NC_011026	ATCA	2	8	66224	66231	50 %	25 %	0 %	25 %	193213774
1115	NC_011026	ATAA	2	8	66260	66267	75 %	25 %	0 %	0 %	193213774
1116	NC_011026	CGG	2	6	66290	66295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213774
1117	NC_011026	TCCGT	2	10	66345	66354	0 %	40 %	20 %	40 %	193213774
1118	NC_011026	TGA	2	6	66475	66480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213774
1119	NC_011026	CGA	2	6	66622	66627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213774
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1121	NC_011026	GCA	2	6	66780	66785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213774
1122	NC_011026	CAA	2	6	66865	66870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213774
1123	NC_011026	ACC	2	6	66933	66938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213774
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1125	NC_011026	CAT	2	6	66955	66960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213774
1126	NC_011026	TGCTCT	2	12	67053	67064	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	193213774
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