MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011026	CTG	2	6	27745	27750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213739
502	NC_011026	TGA	2	6	27753	27758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213739
503	NC_011026	GTC	2	6	27787	27792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213739
504	NC_011026	TCT	2	6	27813	27818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213739
505	NC_011026	ATC	2	6	28195	28200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213740
506	NC_011026	GTT	2	6	28208	28213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213740
507	NC_011026	TCA	2	6	28244	28249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213740
508	NC_011026	CATT	2	8	28278	28285	25 %	50 %	0 %	25 %	193213740
509	NC_011026	AAT	2	6	28309	28314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213740
510	NC_011026	GAA	2	6	28341	28346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213740
511	NC_011026	CAA	2	6	28371	28376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213740
512	NC_011026	TCA	2	6	28425	28430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213740
513	NC_011026	T	7	7	28479	28485	0 %	100 %	0 %	0 %	193213740
514	NC_011026	AAT	2	6	28519	28524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213741
515	NC_011026	TGT	2	6	28545	28550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213741
516	NC_011026	CCG	2	6	28585	28590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213741
517	NC_011026	AAT	2	6	28599	28604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213741
518	NC_011026	T	7	7	28604	28610	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
519	NC_011026	TCG	2	6	28645	28650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
520	NC_011026	T	6	6	28682	28687	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
521	NC_011026	CAT	2	6	28833	28838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213741
522	NC_011026	CAA	2	6	28916	28921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213741
523	NC_011026	TCG	2	6	28924	28929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
524	NC_011026	CTT	2	6	28961	28966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
525	NC_011026	CTT	2	6	29060	29065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
526	NC_011026	GCG	2	6	29126	29131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213741
527	NC_011026	AGCA	2	8	29199	29206	50 %	0 %	25 %	25 %	193213741
528	NC_011026	GCT	2	6	29216	29221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
529	NC_011026	T	7	7	29247	29253	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
530	NC_011026	CCAA	2	8	29278	29285	50 %	0 %	0 %	50 %	193213741
531	NC_011026	AAT	2	6	29322	29327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213741
532	NC_011026	CCA	2	6	29411	29416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213741
533	NC_011026	T	6	6	29458	29463	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
534	NC_011026	CAA	2	6	29466	29471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213741
535	NC_011026	CG	3	6	29477	29482	0 %	0 %	50 %	50 %	193213741
536	NC_011026	TCGA	2	8	29500	29507	25 %	25 %	25 %	25 %	193213741
537	NC_011026	TTC	2	6	29589	29594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
538	NC_011026	T	7	7	29619	29625	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
539	NC_011026	T	8	8	29657	29664	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
540	NC_011026	T	7	7	29867	29873	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
541	NC_011026	TC	3	6	30089	30094	0 %	50 %	0 %	50 %	193213741
542	NC_011026	TCG	2	6	30152	30157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
543	NC_011026	ATG	2	6	30163	30168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213741
544	NC_011026	TTCG	2	8	30176	30183	0 %	50 %	25 %	25 %	193213741
545	NC_011026	CTTC	2	8	30236	30243	0 %	50 %	0 %	50 %	193213741
546	NC_011026	ATC	2	6	30280	30285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213741
547	NC_011026	GCT	2	6	30350	30355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
548	NC_011026	TTC	2	6	30360	30365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
549	NC_011026	TCAGT	2	10	30386	30395	20 %	40 %	20 %	20 %	193213741
550	NC_011026	A	7	7	30415	30421	100 %	0 %	0 %	0 %	193213741
551	NC_011026	T	7	7	30532	30538	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
552	NC_011026	AAT	2	6	30551	30556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213741
553	NC_011026	CTT	2	6	30565	30570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
554	NC_011026	CAACCA	2	12	30650	30661	50 %	0 %	0 %	50 %	193213741
555	NC_011026	CA	3	6	30756	30761	50 %	0 %	0 %	50 %	193213741
556	NC_011026	GAT	2	6	30762	30767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213741
557	NC_011026	TTC	2	6	30768	30773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
558	NC_011026	TGC	2	6	30807	30812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
559	NC_011026	TCG	2	6	30919	30924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
560	NC_011026	A	6	6	30970	30975	100 %	0 %	0 %	0 %	193213741
561	NC_011026	CAT	2	6	31143	31148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213741
562	NC_011026	AAT	2	6	31164	31169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213741
563	NC_011026	CATCG	2	10	31181	31190	20 %	20 %	20 %	40 %	193213741
564	NC_011026	A	6	6	31326	31331	100 %	0 %	0 %	0 %	193213741
565	NC_011026	TGA	2	6	31400	31405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213741
566	NC_011026	CCT	2	6	31442	31447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213741
567	NC_011026	ACC	2	6	31459	31464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213741
568	NC_011026	CTTT	2	8	31507	31514	0 %	75 %	0 %	25 %	193213741
569	NC_011026	CGC	2	6	31523	31528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213741
570	NC_011026	CTT	2	6	31559	31564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
571	NC_011026	ATC	2	6	31596	31601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213741
572	NC_011026	ATCG	2	8	31654	31661	25 %	25 %	25 %	25 %	193213741
573	NC_011026	AT	3	6	31877	31882	50 %	50 %	0 %	0 %	193213741
574	NC_011026	TGT	2	6	32023	32028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213741
575	NC_011026	TTC	2	6	32073	32078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
576	NC_011026	GAA	2	6	32108	32113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213741
577	NC_011026	A	6	6	32156	32161	100 %	0 %	0 %	0 %	193213741
578	NC_011026	TC	3	6	32177	32182	0 %	50 %	0 %	50 %	193213741
579	NC_011026	CAT	2	6	32222	32227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213741
580	NC_011026	CAAG	2	8	32234	32241	50 %	0 %	25 %	25 %	193213741
581	NC_011026	CTT	2	6	32255	32260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
582	NC_011026	AGCA	2	8	32262	32269	50 %	0 %	25 %	25 %	193213741
583	NC_011026	CTT	2	6	32273	32278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
584	NC_011026	CAG	2	6	32289	32294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213741
585	NC_011026	TGA	2	6	32357	32362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213741
586	NC_011026	TTC	2	6	32364	32369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
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588	NC_011026	ACTT	2	8	32761	32768	25 %	50 %	0 %	25 %	193213742
589	NC_011026	TGA	2	6	32810	32815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213742
590	NC_011026	CGA	2	6	32834	32839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213742
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592	NC_011026	CAA	2	6	32875	32880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213742
593	NC_011026	A	6	6	33030	33035	100 %	0 %	0 %	0 %	193213742
594	NC_011026	GGCTT	2	10	33050	33059	0 %	40 %	40 %	20 %	193213742
595	NC_011026	A	6	6	33061	33066	100 %	0 %	0 %	0 %	193213742
596	NC_011026	CGA	2	6	33074	33079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213742
597	NC_011026	ACA	2	6	33095	33100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213742
598	NC_011026	GCG	2	6	33111	33116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213742
599	NC_011026	TTC	2	6	33278	33283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213743
600	NC_011026	TCC	2	6	33339	33344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213743
601	NC_011026	TTGT	2	8	33376	33383	0 %	75 %	25 %	0 %	193213743
602	NC_011026	GAT	2	6	33598	33603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213743
603	NC_011026	ATG	2	6	33653	33658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213743
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606	NC_011026	ACG	3	9	33959	33967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213743
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608	NC_011026	ATC	2	6	34147	34152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213743
609	NC_011026	GCCAT	2	10	34171	34180	20 %	20 %	20 %	40 %	193213743
610	NC_011026	TCA	2	6	34304	34309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213743
611	NC_011026	T	7	7	34529	34535	0 %	100 %	0 %	0 %	193213744
612	NC_011026	CGA	2	6	34590	34595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213744
613	NC_011026	T	6	6	34628	34633	0 %	100 %	0 %	0 %	193213744
614	NC_011026	CG	3	6	34641	34646	0 %	0 %	50 %	50 %	193213744
615	NC_011026	GAA	2	6	34714	34719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213744
616	NC_011026	CG	3	6	34726	34731	0 %	0 %	50 %	50 %	193213744
617	NC_011026	AGC	2	6	34804	34809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213744
618	NC_011026	TGG	2	6	34836	34841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213744
619	NC_011026	TGA	2	6	34925	34930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213744
620	NC_011026	CAATT	2	10	34978	34987	40 %	40 %	0 %	20 %	193213744
621	NC_011026	CT	3	6	35050	35055	0 %	50 %	0 %	50 %	193213744
622	NC_011026	CCG	2	6	35093	35098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213744
623	NC_011026	TGC	2	6	35112	35117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213744
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625	NC_011026	CAA	2	6	35223	35228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213744
626	NC_011026	CGA	2	6	35247	35252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213744
627	NC_011026	GAA	2	6	35303	35308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213744
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629	NC_011026	TCT	2	6	35381	35386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213745
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