MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011026	TGA	2	6	294391	294396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213966
5003	NC_011026	AGA	2	6	294458	294463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213966
5004	NC_011026	CTT	2	6	294565	294570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213966
5005	NC_011026	CAT	2	6	294586	294591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213966
5006	NC_011026	TGA	2	6	294631	294636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213966
5007	NC_011026	AGA	2	6	294637	294642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213966
5008	NC_011026	A	8	8	294653	294660	100 %	0 %	0 %	0 %	193213966
5009	NC_011026	A	6	6	294668	294673	100 %	0 %	0 %	0 %	193213966
5010	NC_011026	GAAA	2	8	294675	294682	75 %	0 %	25 %	0 %	193213966
5011	NC_011026	A	6	6	294686	294691	100 %	0 %	0 %	0 %	193213966
5012	NC_011026	ACG	2	6	294696	294701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213966
5013	NC_011026	GAA	2	6	294761	294766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213966
5014	NC_011026	AGA	2	6	294772	294777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213966
5015	NC_011026	ACG	2	6	294783	294788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213966
5016	NC_011026	TCA	2	6	294984	294989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213967
5017	NC_011026	AACCGC	2	12	295006	295017	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	193213967
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5021	NC_011026	GCC	2	6	295263	295268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213967
5022	NC_011026	T	6	6	295269	295274	0 %	100 %	0 %	0 %	193213967
5023	NC_011026	ACC	2	6	295278	295283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213967
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5025	NC_011026	CTT	2	6	295386	295391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213967
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5038	NC_011026	T	8	8	296327	296334	0 %	100 %	0 %	0 %	193213969
5039	NC_011026	TTG	2	6	296373	296378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213969
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5045	NC_011026	AAAT	2	8	296597	296604	75 %	25 %	0 %	0 %	193213970
5046	NC_011026	CGTTT	2	10	296658	296667	0 %	60 %	20 %	20 %	193213970
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5050	NC_011026	CAAT	2	8	296945	296952	50 %	25 %	0 %	25 %	193213970
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5054	NC_011026	CAG	2	6	297167	297172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213970
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5057	NC_011026	ATC	2	6	297451	297456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213971
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5061	NC_011026	AAT	2	6	297888	297893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213971
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5112	NC_011026	GC	3	6	301338	301343	0 %	0 %	50 %	50 %	193213974
5113	NC_011026	CCG	2	6	301362	301367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213974
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5123	NC_011026	ATG	2	6	301794	301799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213974
5124	NC_011026	TTC	2	6	301899	301904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213974
5125	NC_011026	CGC	2	6	302053	302058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213975
5126	NC_011026	TTC	2	6	302064	302069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213975
5127	NC_011026	T	6	6	302153	302158	0 %	100 %	0 %	0 %	193213975
5128	NC_011026	CCG	2	6	302180	302185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213975
5129	NC_011026	GAAA	2	8	302217	302224	75 %	0 %	25 %	0 %	193213975
5130	NC_011026	GC	3	6	302284	302289	0 %	0 %	50 %	50 %	193213975
5131	NC_011026	CCT	2	6	302318	302323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213975
5132	NC_011026	CTTT	2	8	302362	302369	0 %	75 %	0 %	25 %	193213975
5133	NC_011026	CAT	2	6	302426	302431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213975
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5139	NC_011026	ATC	2	6	302572	302577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213975
5140	NC_011026	AT	3	6	302597	302602	50 %	50 %	0 %	0 %	193213975
5141	NC_011026	AAT	2	6	302647	302652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213975
5142	NC_011026	ATG	2	6	302656	302661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213975
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5150	NC_011026	ATTTT	2	10	303199	303208	20 %	80 %	0 %	0 %	193213976
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5157	NC_011026	TTGC	2	8	303783	303790	0 %	50 %	25 %	25 %	193213977
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5230	NC_011026	A	6	6	308548	308553	100 %	0 %	0 %	0 %	193213983
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5232	NC_011026	CAA	2	6	308582	308587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213983
5233	NC_011026	TGA	2	6	308602	308607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213983
5234	NC_011026	GTA	2	6	308687	308692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213983
5235	NC_011026	CAT	2	6	308696	308701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213983
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5237	NC_011026	CGT	2	6	308746	308751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213984
5238	NC_011026	GCT	2	6	308752	308757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213984
5239	NC_011026	T	6	6	308767	308772	0 %	100 %	0 %	0 %	193213984
5240	NC_011026	ACC	2	6	308804	308809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213984
5241	NC_011026	TGG	3	9	308889	308897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213984
5242	NC_011026	TGA	2	6	308907	308912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213984
5243	NC_011026	GCG	2	6	308955	308960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213984
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5245	NC_011026	CGAAG	2	10	309024	309033	40 %	0 %	40 %	20 %	193213984
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5367	NC_011026	GCC	2	6	316442	316447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213991
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5371	NC_011026	TTC	2	6	316581	316586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213992
5372	NC_011026	CAA	2	6	316605	316610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213992
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5488	NC_011026	CGC	2	6	323199	323204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214003
5489	NC_011026	CG	3	6	323207	323212	0 %	0 %	50 %	50 %	193214003
5490	NC_011026	CCTTG	2	10	323228	323237	0 %	40 %	20 %	40 %	193214003
5491	NC_011026	GATTT	2	10	323239	323248	20 %	60 %	20 %	0 %	193214003
5492	NC_011026	GCA	2	6	323252	323257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214003
5493	NC_011026	CGC	2	6	323288	323293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214003
5494	NC_011026	GCC	2	6	323343	323348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214003
5495	NC_011026	TCCA	2	8	323371	323378	25 %	25 %	0 %	50 %	193214003
5496	NC_011026	GAACGC	2	12	323444	323455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214003
5497	NC_011026	TA	3	6	323490	323495	50 %	50 %	0 %	0 %	193214003
5498	NC_011026	CCG	2	6	323504	323509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214003
5499	NC_011026	CGC	2	6	323542	323547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214003
5500	NC_011026	CCGC	3	12	323544	323555	0 %	0 %	25 %	75 %	193214003

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