MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011026	A	6	6	264913	264918	100 %	0 %	0 %	0 %	193213943
4502	NC_011026	GGC	3	9	265036	265044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213943
4503	NC_011026	ATA	2	6	265070	265075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213943
4504	NC_011026	TGA	3	9	265125	265133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213943
4505	NC_011026	GTTA	2	8	265171	265178	25 %	50 %	25 %	0 %	193213943
4506	NC_011026	ATGA	2	8	265222	265229	50 %	25 %	25 %	0 %	193213944
4507	NC_011026	GAAA	2	8	265233	265240	75 %	0 %	25 %	0 %	193213944
4508	NC_011026	A	6	6	265238	265243	100 %	0 %	0 %	0 %	193213944
4509	NC_011026	AAT	2	6	265341	265346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213944
4510	NC_011026	TGA	2	6	265356	265361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213944
4511	NC_011026	CGA	2	6	265434	265439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213944
4512	NC_011026	CGA	2	6	265461	265466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213944
4513	NC_011026	CGG	2	6	265539	265544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213944
4514	NC_011026	TGG	2	6	265571	265576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213944
4515	NC_011026	CTAACC	2	12	265615	265626	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	193213944
4516	NC_011026	AGC	2	6	265644	265649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213944
4517	NC_011026	AGA	2	6	265732	265737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213945
4518	NC_011026	TC	3	6	265829	265834	0 %	50 %	0 %	50 %	193213945
4519	NC_011026	ATC	2	6	265904	265909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213945
4520	NC_011026	ATCA	2	8	265926	265933	50 %	25 %	0 %	25 %	193213945
4521	NC_011026	GCC	2	6	265946	265951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213945
4522	NC_011026	CG	3	6	265953	265958	0 %	0 %	50 %	50 %	193213945
4523	NC_011026	CAA	2	6	266003	266008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213945
4524	NC_011026	AAAC	2	8	266047	266054	75 %	0 %	0 %	25 %	193213945
4525	NC_011026	GCCA	2	8	266091	266098	25 %	0 %	25 %	50 %	193213945
4526	NC_011026	TGC	2	6	266143	266148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213945
4527	NC_011026	GTT	2	6	266167	266172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213945
4528	NC_011026	A	6	6	266232	266237	100 %	0 %	0 %	0 %	193213945
4529	NC_011026	TTC	2	6	266238	266243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213945
4530	NC_011026	CAAA	2	8	266288	266295	75 %	0 %	0 %	25 %	193213945
4531	NC_011026	TGC	2	6	266331	266336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213945
4532	NC_011026	GTG	2	6	266357	266362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213945
4533	NC_011026	GAAAT	2	10	266370	266379	60 %	20 %	20 %	0 %	193213945
4534	NC_011026	ATT	2	6	266444	266449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213945
4535	NC_011026	T	6	6	266448	266453	0 %	100 %	0 %	0 %	193213945
4536	NC_011026	TCA	2	6	266456	266461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213945
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4538	NC_011026	CGC	2	6	266576	266581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213945
4539	NC_011026	AGA	2	6	266584	266589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213945
4540	NC_011026	GTTT	2	8	266664	266671	0 %	75 %	25 %	0 %	193213945
4541	NC_011026	GGC	2	6	266810	266815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213945
4542	NC_011026	TAC	2	6	266819	266824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213945
4543	NC_011026	CTT	2	6	266849	266854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213945
4544	NC_011026	T	7	7	266853	266859	0 %	100 %	0 %	0 %	193213945
4545	NC_011026	TCA	2	6	266925	266930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213945
4546	NC_011026	CAT	2	6	266998	267003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213945
4547	NC_011026	ACC	2	6	267014	267019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213945
4548	NC_011026	T	6	6	267037	267042	0 %	100 %	0 %	0 %	193213945
4549	NC_011026	CTG	2	6	267043	267048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213945
4550	NC_011026	GAA	2	6	267275	267280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213945
4551	NC_011026	CCG	2	6	267380	267385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213945
4552	NC_011026	CAC	2	6	267392	267397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213945
4553	NC_011026	CTTAA	2	10	267432	267441	40 %	40 %	0 %	20 %	193213945
4554	NC_011026	GCG	2	6	267628	267633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213946
4555	NC_011026	ACCG	2	8	267636	267643	25 %	0 %	25 %	50 %	193213946
4556	NC_011026	ATTTG	2	10	267740	267749	20 %	60 %	20 %	0 %	193213946
4557	NC_011026	CTGG	2	8	267795	267802	0 %	25 %	50 %	25 %	193213946
4558	NC_011026	TAT	2	6	267806	267811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213946
4559	NC_011026	GGC	2	6	267870	267875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213946
4560	NC_011026	CCG	2	6	267886	267891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213946
4561	NC_011026	GCT	2	6	267923	267928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213946
4562	NC_011026	ATC	2	6	267939	267944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213946
4563	NC_011026	A	6	6	267948	267953	100 %	0 %	0 %	0 %	193213946
4564	NC_011026	GAA	2	6	268005	268010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213946
4565	NC_011026	TCG	2	6	268080	268085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213947
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4567	NC_011026	GTC	2	6	268136	268141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213947
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4569	NC_011026	CGC	2	6	268822	268827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213948
4570	NC_011026	TGA	2	6	268828	268833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213948
4571	NC_011026	CGC	2	6	269096	269101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213948
4572	NC_011026	TTGT	2	8	269268	269275	0 %	75 %	25 %	0 %	193213948
4573	NC_011026	CGC	2	6	269291	269296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213948
4574	NC_011026	CCTCAA	2	12	269305	269316	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	193213948
4575	NC_011026	TGA	2	6	269326	269331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213948
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4577	NC_011026	TGG	2	6	269420	269425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213948
4578	NC_011026	CTG	2	6	269460	269465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213948
4579	NC_011026	TTC	2	6	269535	269540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213948
4580	NC_011026	GGC	2	6	269549	269554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213948
4581	NC_011026	TTGG	2	8	269634	269641	0 %	50 %	50 %	0 %	193213948
4582	NC_011026	TCA	2	6	269676	269681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213948
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4585	NC_011026	TTCGC	2	10	269848	269857	0 %	40 %	20 %	40 %	193213948
4586	NC_011026	TGG	2	6	269951	269956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213948
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4588	NC_011026	TGT	2	6	270055	270060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213948
4589	NC_011026	GCCAA	2	10	270081	270090	40 %	0 %	20 %	40 %	193213948
4590	NC_011026	TGG	2	6	270105	270110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213948
4591	NC_011026	CCAT	2	8	270125	270132	25 %	25 %	0 %	50 %	193213948
4592	NC_011026	TGA	2	6	270262	270267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213948
4593	NC_011026	GCT	2	6	270347	270352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213948
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4595	NC_011026	GTTG	2	8	270388	270395	0 %	50 %	50 %	0 %	193213948
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4597	NC_011026	CG	3	6	270452	270457	0 %	0 %	50 %	50 %	193213948
4598	NC_011026	GCTT	2	8	270552	270559	0 %	50 %	25 %	25 %	193213948
4599	NC_011026	AAG	2	6	270579	270584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213948
4600	NC_011026	TAC	2	6	270598	270603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213948
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4603	NC_011026	TTTA	2	8	270926	270933	25 %	75 %	0 %	0 %	193213949
4604	NC_011026	CCA	2	6	270942	270947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213949
4605	NC_011026	TCA	2	6	270988	270993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213949
4606	NC_011026	ATGG	2	8	271027	271034	25 %	25 %	50 %	0 %	193213949
4607	NC_011026	CCG	2	6	271064	271069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213949
4608	NC_011026	AAC	2	6	271096	271101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213949
4609	NC_011026	CAT	2	6	271125	271130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213949
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4611	NC_011026	TCT	2	6	271300	271305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213949
4612	NC_011026	ATA	2	6	271391	271396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213949
4613	NC_011026	GCC	2	6	271456	271461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213949
4614	NC_011026	GATGCC	2	12	271462	271473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193213949
4615	NC_011026	T	6	6	271490	271495	0 %	100 %	0 %	0 %	193213949
4616	NC_011026	CAA	2	6	271512	271517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213949
4617	NC_011026	AAC	2	6	271534	271539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213949
4618	NC_011026	AC	3	6	271560	271565	50 %	0 %	0 %	50 %	193213949
4619	NC_011026	ATG	2	6	271619	271624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213949
4620	NC_011026	CAG	2	6	271649	271654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213949
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4622	NC_011026	GCG	2	6	271877	271882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213949
4623	NC_011026	TTCT	2	8	271931	271938	0 %	75 %	0 %	25 %	193213949
4624	NC_011026	GCC	3	9	271939	271947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213949
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4730	NC_011026	AGCTG	2	10	278520	278529	20 %	20 %	40 %	20 %	193213952
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4738	NC_011026	CGC	2	6	279000	279005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213952
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4740	NC_011026	GGGC	2	8	279034	279041	0 %	0 %	75 %	25 %	193213952
4741	NC_011026	CAT	2	6	279052	279057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213952
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4743	NC_011026	TTTCAA	2	12	279239	279250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193213952
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4865	NC_011026	GATG	2	8	285778	285785	25 %	25 %	50 %	0 %	193213958
4866	NC_011026	ACA	2	6	285796	285801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213958
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4973	NC_011026	ACG	2	6	292099	292104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213964
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4982	NC_011026	TCA	2	6	292411	292416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213964
4983	NC_011026	TTCAC	2	10	292770	292779	20 %	40 %	0 %	40 %	193213964
4984	NC_011026	ACC	2	6	292841	292846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213964
4985	NC_011026	GATC	2	8	292852	292859	25 %	25 %	25 %	25 %	193213964
4986	NC_011026	GCT	2	6	292884	292889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213964
4987	NC_011026	TTA	2	6	292900	292905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213964
4988	NC_011026	GCT	2	6	292993	292998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213964
4989	NC_011026	CGA	2	6	293008	293013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213964
4990	NC_011026	ATC	2	6	293055	293060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213964
4991	NC_011026	AAAC	3	12	293158	293169	75 %	0 %	0 %	25 %	193213964
4992	NC_011026	T	6	6	293201	293206	0 %	100 %	0 %	0 %	193213964
4993	NC_011026	GTT	2	6	293341	293346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213965
4994	NC_011026	CTT	2	6	293352	293357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213965
4995	NC_011026	A	7	7	293383	293389	100 %	0 %	0 %	0 %	193213965
4996	NC_011026	ATAG	2	8	293460	293467	50 %	25 %	25 %	0 %	193213965
4997	NC_011026	TTG	2	6	293474	293479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213965
4998	NC_011026	CCG	2	6	294137	294142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213966
4999	NC_011026	AAG	2	6	294144	294149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213966
5000	NC_011026	CAA	2	6	294184	294189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213966

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