MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cellvibrio japonicus Ueda107 chromosome

Total Repeats: 53995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010995	GTT	2	6	4	9	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192359033
2	NC_010995	GCC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
3	NC_010995	GCA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192359033
4	NC_010995	TCC	2	6	179	184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192359033
5	NC_010995	CGC	2	6	272	277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
6	NC_010995	CCT	2	6	286	291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192359033
7	NC_010995	TGC	2	6	387	392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359033
8	NC_010995	GCC	2	6	427	432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
9	NC_010995	GCG	2	6	658	663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359033
10	NC_010995	CGG	2	6	684	689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359033
11	NC_010995	GGT	2	6	715	720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359033
12	NC_010995	GGT	2	6	792	797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359033
13	NC_010995	CTG	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359033
14	NC_010995	GCC	2	6	1086	1091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
15	NC_010995	AAG	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192359033
16	NC_010995	CTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192359033
17	NC_010995	ATA	2	6	1331	1336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192359033
18	NC_010995	GTG	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359033
19	NC_010995	TAC	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192359033
20	NC_010995	GGC	2	6	1489	1494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359033
21	NC_010995	TGC	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359033
22	NC_010995	ACA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192359033
23	NC_010995	CGT	2	6	1742	1747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362292
24	NC_010995	GAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
25	NC_010995	AGA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
26	NC_010995	TGT	2	6	2245	2250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362292
27	NC_010995	GAT	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362292
28	NC_010995	TGG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362292
29	NC_010995	AGT	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362292
30	NC_010995	TGT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362292
31	NC_010995	GAA	2	6	2576	2581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
32	NC_010995	GAA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
33	NC_010995	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
34	NC_010995	TGT	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362292
35	NC_010995	TCA	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192361120
36	NC_010995	TCG	2	6	2876	2881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
37	NC_010995	TTG	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192361120
38	NC_010995	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192361120
39	NC_010995	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192361120
40	NC_010995	GCG	2	6	3047	3052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192361120
41	NC_010995	CAG	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192361120
42	NC_010995	TCG	2	6	3208	3213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
43	NC_010995	AGC	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192361120
44	NC_010995	GTC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
45	NC_010995	TGC	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
46	NC_010995	GCT	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
47	NC_010995	TGG	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192361120
48	NC_010995	AAC	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192361120
49	NC_010995	TGG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192361120
50	NC_010995	TTG	2	6	3827	3832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192361120
51	NC_010995	AGA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
52	NC_010995	CAC	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
53	NC_010995	GGT	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
54	NC_010995	CGA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
55	NC_010995	GGT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
56	NC_010995	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
57	NC_010995	CGG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192360461
58	NC_010995	AGT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
59	NC_010995	CCG	2	6	4384	4389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192360461
60	NC_010995	ACC	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
61	NC_010995	TAA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192360461
62	NC_010995	TTG	2	6	4704	4709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192360461
63	NC_010995	CAA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192360461
64	NC_010995	CTG	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192360461
65	NC_010995	AAG	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
66	NC_010995	CCA	2	6	4908	4913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
67	NC_010995	ATT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192360461
68	NC_010995	CGG	2	6	5022	5027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192360461
69	NC_010995	TCC	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192360461
70	NC_010995	CTG	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192360461
71	NC_010995	ATG	2	6	5079	5084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
72	NC_010995	GAT	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
73	NC_010995	CCG	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192360461
74	NC_010995	TGG	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
75	NC_010995	GGT	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
76	NC_010995	AGA	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
77	NC_010995	CAT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192360461
78	NC_010995	CTT	3	9	5518	5526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192360461
79	NC_010995	GCC	2	6	5575	5580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192360461
80	NC_010995	CAG	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
81	NC_010995	GAT	2	6	5806	5811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
82	NC_010995	CAG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
83	NC_010995	CAT	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192360461
84	NC_010995	CTT	2	6	6025	6030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192360461
85	NC_010995	TTG	2	6	6054	6059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192360461
86	NC_010995	GAA	2	6	6089	6094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
87	NC_010995	GCG	2	6	6111	6116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192360461
88	NC_010995	ACA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192360461
89	NC_010995	ACC	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
90	NC_010995	TGC	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192360461
91	NC_010995	CAC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
92	NC_010995	TTG	2	6	6557	6562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192361286
93	NC_010995	GGA	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192361286
94	NC_010995	GAA	2	6	6584	6589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192361286
95	NC_010995	TGA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192361286
96	NC_010995	GTT	2	6	6953	6958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362495
97	NC_010995	GCT	3	9	7034	7042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
98	NC_010995	GGT	2	6	7208	7213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
99	NC_010995	GTT	2	6	7271	7276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362495
100	NC_010995	GCC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
101	NC_010995	GTA	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362495
102	NC_010995	GGC	2	6	7376	7381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192362495
103	NC_010995	GCC	2	6	7394	7399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
104	NC_010995	GAA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362495
105	NC_010995	CCG	2	6	7500	7505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
106	NC_010995	CCG	2	6	7509	7514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
107	NC_010995	CGC	3	9	7585	7593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
108	NC_010995	TGG	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
109	NC_010995	ACC	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192362495
110	NC_010995	GTT	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362495
111	NC_010995	TCT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192362495
112	NC_010995	GTG	2	6	7986	7991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
113	NC_010995	GAA	2	6	8003	8008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362495
114	NC_010995	ACC	2	6	8190	8195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192362495
115	NC_010995	GCC	2	6	8207	8212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
116	NC_010995	GTA	2	6	8222	8227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362495
117	NC_010995	CAC	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192362495
118	NC_010995	GGC	2	6	8327	8332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192362495
119	NC_010995	CGG	2	6	8441	8446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192362495
120	NC_010995	CGC	2	6	8515	8520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
121	NC_010995	GTA	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362495
122	NC_010995	GTT	3	9	8564	8572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362495
123	NC_010995	CGC	2	6	8632	8637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
124	NC_010995	TGG	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
125	NC_010995	CTG	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
126	NC_010995	GGA	2	6	8672	8677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192362495
127	NC_010995	AGA	2	6	8678	8683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362495
128	NC_010995	CTG	2	6	8861	8866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
129	NC_010995	GCT	2	6	8966	8971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
130	NC_010995	GCT	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
131	NC_010995	CTG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
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249	NC_010995	AGA	2	6	19058	19063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192361417
250	NC_010995	TGA	2	6	19073	19078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192361417
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253	NC_010995	AAT	2	6	19330	19335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192361417
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255	NC_010995	TAA	2	6	19560	19565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192359834
256	NC_010995	GTC	2	6	19571	19576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359834
257	NC_010995	ATT	2	6	19624	19629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192359834
258	NC_010995	ATT	2	6	19691	19696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192359834
259	NC_010995	CAA	2	6	19705	19710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192359834
260	NC_010995	TAA	2	6	19809	19814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192359834
261	NC_010995	TTG	2	6	19907	19912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192359834
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263	NC_010995	TGA	2	6	20106	20111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192359834
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272	NC_010995	TGG	2	6	20597	20602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359249
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284	NC_010995	CCA	2	6	21319	21324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192359249
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286	NC_010995	GCT	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359249
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