MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	CG	3	6	40	45	0 %	0 %	50 %	50 %	190571921
2	NC_010935	GC	3	6	1943	1948	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
3	NC_010935	GC	3	6	2047	2052	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
4	NC_010935	GC	3	6	2140	2145	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
5	NC_010935	GC	3	6	2510	2515	0 %	0 %	50 %	50 %	190571925
6	NC_010935	GC	3	6	3086	3091	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
7	NC_010935	GC	3	6	3327	3332	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
8	NC_010935	GC	3	6	3677	3682	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
9	NC_010935	CG	3	6	4538	4543	0 %	0 %	50 %	50 %	190571927
10	NC_010935	TG	3	6	4699	4704	0 %	50 %	50 %	0 %	190571927
11	NC_010935	GC	3	6	5292	5297	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
12	NC_010935	GC	3	6	5315	5320	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
13	NC_010935	CG	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
14	NC_010935	CG	3	6	5463	5468	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
15	NC_010935	GC	3	6	5704	5709	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
16	NC_010935	GC	3	6	5805	5810	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
17	NC_010935	CG	3	6	6104	6109	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
18	NC_010935	GC	3	6	6235	6240	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
19	NC_010935	GC	3	6	6548	6553	0 %	0 %	50 %	50 %	190571931
20	NC_010935	GC	3	6	6721	6726	0 %	0 %	50 %	50 %	190571931
21	NC_010935	CG	3	6	8757	8762	0 %	0 %	50 %	50 %	190571935
22	NC_010935	GC	3	6	8912	8917	0 %	0 %	50 %	50 %	190571935
23	NC_010935	GC	3	6	14306	14311	0 %	0 %	50 %	50 %	190571940
24	NC_010935	AC	3	6	16122	16127	50 %	0 %	0 %	50 %	190571943
25	NC_010935	CG	3	6	17678	17683	0 %	0 %	50 %	50 %	190571944
26	NC_010935	GC	3	6	18478	18483	0 %	0 %	50 %	50 %	190571944
27	NC_010935	GC	3	6	21172	21177	0 %	0 %	50 %	50 %	190571948
28	NC_010935	GC	3	6	21344	21349	0 %	0 %	50 %	50 %	190571949
29	NC_010935	GC	3	6	22862	22867	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
30	NC_010935	CG	3	6	23467	23472	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
31	NC_010935	CG	3	6	24974	24979	0 %	0 %	50 %	50 %	190571951
32	NC_010935	GC	3	6	25130	25135	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
33	NC_010935	GC	3	6	25228	25233	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
34	NC_010935	GT	3	6	25657	25662	0 %	50 %	50 %	0 %	190571952
35	NC_010935	CG	3	6	25833	25838	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
36	NC_010935	CG	3	6	26689	26694	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
37	NC_010935	GC	3	6	26862	26867	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
38	NC_010935	CG	3	6	26886	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
39	NC_010935	GC	3	6	27169	27174	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
40	NC_010935	CG	3	6	27348	27353	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
41	NC_010935	CG	3	6	28283	28288	0 %	0 %	50 %	50 %	190571955
42	NC_010935	CG	3	6	29503	29508	0 %	0 %	50 %	50 %	190571957
43	NC_010935	GC	3	6	30579	30584	0 %	0 %	50 %	50 %	190571958
44	NC_010935	GC	3	6	30663	30668	0 %	0 %	50 %	50 %	190571958
45	NC_010935	CG	3	6	30801	30806	0 %	0 %	50 %	50 %	190571958
46	NC_010935	GC	3	6	31993	31998	0 %	0 %	50 %	50 %	190571960
47	NC_010935	GC	3	6	33046	33051	0 %	0 %	50 %	50 %	190571962
48	NC_010935	CA	3	6	33933	33938	50 %	0 %	0 %	50 %	190571964
49	NC_010935	GC	3	6	35234	35239	0 %	0 %	50 %	50 %	190571964
50	NC_010935	GC	3	6	35358	35363	0 %	0 %	50 %	50 %	190571964
51	NC_010935	GC	3	6	35481	35486	0 %	0 %	50 %	50 %	190571964
52	NC_010935	CG	3	6	37388	37393	0 %	0 %	50 %	50 %	190571965
53	NC_010935	GC	4	8	37608	37615	0 %	0 %	50 %	50 %	190571965
54	NC_010935	GC	3	6	37791	37796	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
55	NC_010935	GC	3	6	37865	37870	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
56	NC_010935	GC	3	6	37935	37940	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
57	NC_010935	GC	3	6	38316	38321	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
58	NC_010935	CT	3	6	38459	38464	0 %	50 %	0 %	50 %	190572011
59	NC_010935	CG	3	6	38837	38842	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
60	NC_010935	GC	5	10	39014	39023	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
61	NC_010935	GC	3	6	39061	39066	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
62	NC_010935	GC	3	6	39075	39080	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
63	NC_010935	CG	4	8	40072	40079	0 %	0 %	50 %	50 %	190572010
64	NC_010935	GC	4	8	40583	40590	0 %	0 %	50 %	50 %	190572010
65	NC_010935	AG	3	6	40848	40853	50 %	0 %	50 %	0 %	190571969
66	NC_010935	CG	3	6	41015	41020	0 %	0 %	50 %	50 %	190571969
67	NC_010935	GC	3	6	41152	41157	0 %	0 %	50 %	50 %	190571969
68	NC_010935	CG	3	6	41195	41200	0 %	0 %	50 %	50 %	190571969
69	NC_010935	TG	3	6	41545	41550	0 %	50 %	50 %	0 %	190571969
70	NC_010935	CG	3	6	42060	42065	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
71	NC_010935	CG	3	6	42115	42120	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
72	NC_010935	CG	3	6	42172	42177	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
73	NC_010935	AC	3	6	42331	42336	50 %	0 %	0 %	50 %	190571970
74	NC_010935	CA	3	6	42343	42348	50 %	0 %	0 %	50 %	190571970
75	NC_010935	GC	3	6	42378	42383	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
76	NC_010935	CG	3	6	42895	42900	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
77	NC_010935	CG	3	6	43067	43072	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
78	NC_010935	CG	3	6	44647	44652	0 %	0 %	50 %	50 %	190571971
79	NC_010935	CA	3	6	44924	44929	50 %	0 %	0 %	50 %	190571971
80	NC_010935	GC	3	6	45114	45119	0 %	0 %	50 %	50 %	190571971
81	NC_010935	CG	3	6	45640	45645	0 %	0 %	50 %	50 %	190571972
82	NC_010935	GC	3	6	46035	46040	0 %	0 %	50 %	50 %	190571972
83	NC_010935	GA	3	6	46454	46459	50 %	0 %	50 %	0 %	190571973
84	NC_010935	GC	3	6	46481	46486	0 %	0 %	50 %	50 %	190571973
85	NC_010935	GC	3	6	47066	47071	0 %	0 %	50 %	50 %	190571974
86	NC_010935	CG	3	6	47123	47128	0 %	0 %	50 %	50 %	190571974
87	NC_010935	GC	5	10	47843	47852	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
88	NC_010935	AG	3	6	47877	47882	50 %	0 %	50 %	0 %	190571975
89	NC_010935	CG	3	6	47999	48004	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
90	NC_010935	GC	3	6	48207	48212	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
91	NC_010935	GC	3	6	48383	48388	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
92	NC_010935	CG	3	6	48486	48491	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
93	NC_010935	GA	3	6	48578	48583	50 %	0 %	50 %	0 %	190571975
94	NC_010935	GC	3	6	49378	49383	0 %	0 %	50 %	50 %	190571977
95	NC_010935	GA	3	6	49550	49555	50 %	0 %	50 %	0 %	190571977
96	NC_010935	CG	3	6	49787	49792	0 %	0 %	50 %	50 %	190571977
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101	NC_010935	CG	3	6	52056	52061	0 %	0 %	50 %	50 %	190571979
102	NC_010935	AC	3	6	53153	53158	50 %	0 %	0 %	50 %	190571980
103	NC_010935	GC	3	6	53377	53382	0 %	0 %	50 %	50 %	190571980
104	NC_010935	CG	3	6	53998	54003	0 %	0 %	50 %	50 %	190571981
105	NC_010935	GC	3	6	54569	54574	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
106	NC_010935	CG	3	6	54610	54615	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
107	NC_010935	GC	3	6	54630	54635	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
108	NC_010935	GC	3	6	54641	54646	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
109	NC_010935	CG	3	6	54786	54791	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
110	NC_010935	GC	3	6	56627	56632	0 %	0 %	50 %	50 %	190571984
111	NC_010935	GC	3	6	57429	57434	0 %	0 %	50 %	50 %	190571985
112	NC_010935	CG	3	6	57953	57958	0 %	0 %	50 %	50 %	190571986
113	NC_010935	GC	4	8	58317	58324	0 %	0 %	50 %	50 %	190571986
114	NC_010935	GC	3	6	58747	58752	0 %	0 %	50 %	50 %	190571987
115	NC_010935	GC	3	6	58755	58760	0 %	0 %	50 %	50 %	190571987
116	NC_010935	GC	3	6	58799	58804	0 %	0 %	50 %	50 %	190571987
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118	NC_010935	GC	3	6	59823	59828	0 %	0 %	50 %	50 %	190571988
119	NC_010935	GA	3	6	60321	60326	50 %	0 %	50 %	0 %	190571988
120	NC_010935	GC	3	6	62384	62389	0 %	0 %	50 %	50 %	190572008
121	NC_010935	GC	3	6	62649	62654	0 %	0 %	50 %	50 %	190572008
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123	NC_010935	GC	3	6	63466	63471	0 %	0 %	50 %	50 %	190572012
124	NC_010935	CG	3	6	64282	64287	0 %	0 %	50 %	50 %	190571989
125	NC_010935	GC	3	6	64812	64817	0 %	0 %	50 %	50 %	190572009
126	NC_010935	GC	3	6	65125	65130	0 %	0 %	50 %	50 %	190572009
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.