MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 1795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010935	ATGA	2	8	24694	24701	50 %	25 %	25 %	0 %	190571951
502	NC_010935	GAA	2	6	24817	24822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571951
503	NC_010935	CCGC	2	8	24824	24831	0 %	0 %	25 %	75 %	190571951
504	NC_010935	CGC	2	6	24905	24910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571951
505	NC_010935	AAC	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571951
506	NC_010935	ACT	2	6	24962	24967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571951
507	NC_010935	CG	3	6	24974	24979	0 %	0 %	50 %	50 %	190571951
508	NC_010935	GAA	2	6	25007	25012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571952
509	NC_010935	GCGCT	2	10	25036	25045	0 %	20 %	40 %	40 %	190571952
510	NC_010935	CCCTGG	2	12	25057	25068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571952
511	NC_010935	CCG	2	6	25069	25074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571952
512	NC_010935	GC	3	6	25130	25135	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
513	NC_010935	GC	3	6	25228	25233	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
514	NC_010935	AGC	2	6	25234	25239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
515	NC_010935	GCA	2	6	25376	25381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
516	NC_010935	TCA	3	9	25384	25392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571952
517	NC_010935	GATG	2	8	25397	25404	25 %	25 %	50 %	0 %	190571952
518	NC_010935	GAC	2	6	25430	25435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
519	NC_010935	CCG	2	6	25439	25444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571952
520	NC_010935	CCTGCG	2	12	25454	25465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571952
521	NC_010935	TCGCA	2	10	25467	25476	20 %	20 %	20 %	40 %	190571952
522	NC_010935	ACCG	2	8	25566	25573	25 %	0 %	25 %	50 %	190571952
523	NC_010935	GT	3	6	25657	25662	0 %	50 %	50 %	0 %	190571952
524	NC_010935	CAT	2	6	25682	25687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571952
525	NC_010935	GGC	2	6	25749	25754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571952
526	NC_010935	CGA	2	6	25763	25768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
527	NC_010935	CG	3	6	25833	25838	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
528	NC_010935	TGG	2	6	25856	25861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571952
529	NC_010935	GGA	2	6	25888	25893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190571952
530	NC_010935	ATC	2	6	25910	25915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571953
531	NC_010935	TGC	2	6	25918	25923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571953
532	NC_010935	GGC	2	6	25943	25948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571953
533	NC_010935	ACC	2	6	25955	25960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190571953
534	NC_010935	CCG	2	6	25982	25987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571953
535	NC_010935	CAG	3	9	26003	26011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571953
536	NC_010935	GCA	2	6	26029	26034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571953
537	NC_010935	GCTGT	2	10	26039	26048	0 %	40 %	40 %	20 %	190571953
538	NC_010935	CCG	2	6	26051	26056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571953
539	NC_010935	CGG	2	6	26184	26189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571953
540	NC_010935	CGG	2	6	26208	26213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571953
541	NC_010935	CCCG	2	8	26298	26305	0 %	0 %	25 %	75 %	190571953
542	NC_010935	GAA	2	6	26419	26424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571954
543	NC_010935	GCG	2	6	26434	26439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
544	NC_010935	CAA	2	6	26443	26448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571954
545	NC_010935	CTG	2	6	26489	26494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571954
546	NC_010935	TGA	2	6	26496	26501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571954
547	NC_010935	CGG	2	6	26511	26516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
548	NC_010935	TCG	2	6	26595	26600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571954
549	NC_010935	GGC	2	6	26612	26617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
550	NC_010935	CGC	2	6	26634	26639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571954
551	NC_010935	GCC	2	6	26644	26649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571954
552	NC_010935	CG	3	6	26689	26694	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
553	NC_010935	CGC	3	9	26709	26717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571954
554	NC_010935	CCGCAT	2	12	26767	26778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190571954
555	NC_010935	GCA	2	6	26844	26849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571954
556	NC_010935	GC	3	6	26862	26867	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
557	NC_010935	CGC	2	6	26877	26882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571954
558	NC_010935	CG	3	6	26886	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
559	NC_010935	GGC	2	6	26911	26916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
560	NC_010935	GCA	2	6	26923	26928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571954
561	NC_010935	CCG	2	6	26958	26963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571954
562	NC_010935	CGG	2	6	27004	27009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
563	NC_010935	CAG	2	6	27011	27016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571954
564	NC_010935	CGG	3	9	27019	27027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
565	NC_010935	GTGG	2	8	27029	27036	0 %	25 %	75 %	0 %	190571954
566	NC_010935	CCG	2	6	27060	27065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571954
567	NC_010935	GGC	2	6	27068	27073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
568	NC_010935	GGC	2	6	27123	27128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
569	NC_010935	GC	3	6	27169	27174	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
570	NC_010935	GTG	2	6	27182	27187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571954
571	NC_010935	CTG	2	6	27284	27289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571954
572	NC_010935	GGTCG	2	10	27310	27319	0 %	20 %	60 %	20 %	190571954
573	NC_010935	CG	3	6	27348	27353	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
574	NC_010935	TCGGC	2	10	27483	27492	0 %	20 %	40 %	40 %	190571954
575	NC_010935	CGC	2	6	27514	27519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571954
576	NC_010935	ACA	2	6	27537	27542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571954
577	NC_010935	CAG	2	6	27560	27565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571954
578	NC_010935	ACT	2	6	27738	27743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571954
579	NC_010935	CAC	2	6	27824	27829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190571955
580	NC_010935	CGG	2	6	27866	27871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571955
581	NC_010935	CAG	2	6	27954	27959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571955
582	NC_010935	CGG	2	6	27991	27996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571955
583	NC_010935	TGA	2	6	28036	28041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571955
584	NC_010935	ACT	2	6	28060	28065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571955
585	NC_010935	GCA	2	6	28081	28086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571955
586	NC_010935	CTA	2	6	28121	28126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571955
587	NC_010935	CGG	2	6	28154	28159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571955
588	NC_010935	CGCC	2	8	28165	28172	0 %	0 %	25 %	75 %	190571955
589	NC_010935	CCG	2	6	28196	28201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571955
590	NC_010935	GCGA	2	8	28206	28213	25 %	0 %	50 %	25 %	190571955
591	NC_010935	AGA	2	6	28219	28224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571955
592	NC_010935	CAG	2	6	28260	28265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571955
593	NC_010935	CG	3	6	28283	28288	0 %	0 %	50 %	50 %	190571955
594	NC_010935	CAG	2	6	28371	28376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571955
595	NC_010935	GCA	2	6	28415	28420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571955
596	NC_010935	GCA	3	9	28466	28474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571955
597	NC_010935	GCC	2	6	28476	28481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571955
598	NC_010935	GCC	2	6	28578	28583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571956
599	NC_010935	GGC	2	6	28589	28594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571956
600	NC_010935	CTG	2	6	28596	28601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571956
601	NC_010935	GCCA	2	8	28786	28793	25 %	0 %	25 %	50 %	190571957
602	NC_010935	GCT	2	6	28813	28818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571957
603	NC_010935	TGGC	2	8	28823	28830	0 %	25 %	50 %	25 %	190571957
604	NC_010935	CGC	3	9	28903	28911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571957
605	NC_010935	TCA	2	6	28929	28934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571957
606	NC_010935	CGC	2	6	28939	28944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571957
607	NC_010935	GTT	2	6	28951	28956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190571957
608	NC_010935	GCT	2	6	28960	28965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571957
609	NC_010935	ATG	2	6	28997	29002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571957
610	NC_010935	TTC	2	6	29030	29035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571957
611	NC_010935	CTT	2	6	29068	29073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571957
612	NC_010935	TGG	2	6	29075	29080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571957
613	NC_010935	TCT	2	6	29205	29210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571957
614	NC_010935	CTT	2	6	29318	29323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571957
615	NC_010935	GGC	2	6	29354	29359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571957
616	NC_010935	TTC	2	6	29363	29368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571957
617	NC_010935	ACT	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571957
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619	NC_010935	TCGGCA	2	12	29469	29480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190571957
620	NC_010935	ACT	2	6	29496	29501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571957
621	NC_010935	CG	3	6	29503	29508	0 %	0 %	50 %	50 %	190571957
622	NC_010935	CTG	2	6	29567	29572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571957
623	NC_010935	CAA	2	6	29581	29586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571957
624	NC_010935	TCA	2	6	29610	29615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571957
625	NC_010935	GGC	2	6	29686	29691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571957
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627	NC_010935	CGG	2	6	29707	29712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571957
628	NC_010935	GCT	2	6	29714	29719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571957
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752	NC_010935	GCA	2	6	34845	34850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571964
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