MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010830	TAATCT	2	12	2518	2529	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189501472
2	NC_010830	TTAGTT	2	12	2539	2550	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189501472
3	NC_010830	TAAAGA	2	12	3793	3804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189501474
4	NC_010830	CTAACA	2	12	3998	4009	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189501474
5	NC_010830	TAGCTG	2	12	9644	9655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189501477
6	NC_010830	AGCTTT	2	12	10458	10469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189501477
7	NC_010830	AAGGAA	2	12	17814	17825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501482
8	NC_010830	GGTTTA	2	12	25269	25280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189501488
9	NC_010830	TATACT	2	12	29201	29212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294661089
10	NC_010830	GTTAAA	2	12	33794	33805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189501494
11	NC_010830	TAAAAA	2	12	36431	36442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189501495
12	NC_010830	GCACAA	2	12	41101	41112	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189501498
13	NC_010830	AGCAGT	2	12	41430	41441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189501498
14	NC_010830	GAAAAA	2	12	44378	44389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294661090
15	NC_010830	TCTATA	2	12	49099	49110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189501504
16	NC_010830	ACCTGC	2	12	51857	51868	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189501505
17	NC_010830	TGATTA	2	12	55681	55692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189501507
18	NC_010830	CAAGTG	2	12	56646	56657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189501507
19	NC_010830	TACCAT	2	12	57362	57373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501507
20	NC_010830	CAAGAT	2	12	57804	57815	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189501507
21	NC_010830	CAAGAA	2	12	59303	59314	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189501509
22	NC_010830	GAACCA	2	12	60086	60097	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189501509
23	NC_010830	AGCCAT	2	12	71740	71751	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294661092
24	NC_010830	AGCTAC	2	12	72338	72349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189501521
25	NC_010830	AGTATT	2	12	72785	72796	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189501521
26	NC_010830	CTAAAA	2	12	73695	73706	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	189501522
27	NC_010830	AGGATT	2	12	75297	75308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294661093
28	NC_010830	TTGGTA	2	12	77787	77798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189501526
29	NC_010830	TCAAAA	2	12	78519	78530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	189501528
30	NC_010830	ATATTA	2	12	83217	83228	50 %	50 %	0 %	0 %	189501531
31	NC_010830	ACTCCC	2	12	86340	86351	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	189501532
32	NC_010830	TTATTG	2	12	99791	99802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189501545
33	NC_010830	AATATA	2	12	105132	105143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501551
34	NC_010830	CTATAT	2	12	105373	105384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189501551
35	NC_010830	ACTAAA	2	12	106957	106968	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	189501552
36	NC_010830	AATATA	2	12	109992	110003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294661102
37	NC_010830	AGCATA	2	12	110963	110974	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189501554
38	NC_010830	TTACAC	2	12	114505	114516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501558
39	NC_010830	TAGGTA	2	12	116101	116112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501559
40	NC_010830	TAAAGA	2	12	117224	117235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189501560
41	NC_010830	ATTAAA	2	12	118609	118620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501562
42	NC_010830	GATAAA	2	12	120604	120615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189501562
43	NC_010830	AGCTTG	2	12	121895	121906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189501565
44	NC_010830	AAGCGG	2	12	122646	122657	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294661103
45	NC_010830	AAAAGA	2	12	126319	126330	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189501567
46	NC_010830	ATATCA	2	12	135448	135459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189501575
47	NC_010830	TATTTC	2	12	140548	140559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189501579
48	NC_010830	CATCTG	2	12	142358	142369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294661106
49	NC_010830	CTGTAT	2	12	142520	142531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294661106
50	NC_010830	ATTTAC	2	12	143097	143108	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294661106
51	NC_010830	TTCTCT	2	12	143443	143454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294661106
52	NC_010830	TAATTT	2	12	143901	143912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294661106
53	NC_010830	TCTTTG	2	12	143957	143968	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294661106
54	NC_010830	ACTTCT	2	12	144235	144246	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294661106
55	NC_010830	ATTTTA	2	12	145262	145273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501583
56	NC_010830	GTAATT	2	12	147243	147254	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189501584
57	NC_010830	AGTTGT	2	12	150512	150523	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189501589
58	NC_010830	CCTGTG	2	12	153422	153433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501592
59	NC_010830	CTATTT	2	12	155403	155414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294661107
60	NC_010830	ACAGGA	2	12	160411	160422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189501597
61	NC_010830	TCTACA	2	12	169027	169038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501606
62	NC_010830	TCTAGC	2	12	174057	174068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189501610
63	NC_010830	AGAAAG	2	12	178560	178571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501614
64	NC_010830	TATATT	2	12	183705	183716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501617
65	NC_010830	ATGCTG	2	12	186192	186203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189501617
66	NC_010830	CAGCTG	2	12	186441	186452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294661110
67	NC_010830	CCTGTA	2	12	190798	190809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294661111
68	NC_010830	GCAAGA	2	12	191822	191833	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189501623
69	NC_010830	GGATCA	2	12	194403	194414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189501625
70	NC_010830	TTTTCC	2	12	195963	195974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501626
71	NC_010830	GATGCT	2	12	201452	201463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189501635
72	NC_010830	CAAGGT	2	12	203172	203183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189501639
73	NC_010830	TCTTAC	2	12	204146	204157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189501641
74	NC_010830	TTTCCC	2	12	206193	206204	0 %	50 %	0 %	50 %	189501647
75	NC_010830	TTATTT	2	12	207658	207669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189501650
76	NC_010830	TTAGCA	2	12	212150	212161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189501656
77	NC_010830	GGAATA	2	12	216353	216364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189501659
78	NC_010830	ACGCTG	2	12	216649	216660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189501659
79	NC_010830	TCCTAA	2	12	218346	218357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501661
80	NC_010830	TACCAT	2	12	227358	227369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661118
81	NC_010830	GGAATA	2	12	230863	230874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189501667
82	NC_010830	ACGCTG	2	12	231159	231170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189501667
83	NC_010830	TCCTAA	2	12	232856	232867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501669
84	NC_010830	TATTGA	2	12	239084	239095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189501673
85	NC_010830	TACCAT	2	12	241868	241879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661120
86	NC_010830	ATACCC	2	12	245878	245889	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	189501677
87	NC_010830	AATTAA	2	12	245897	245908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501677
88	NC_010830	CCAACA	2	12	246469	246480	50 %	0 %	0 %	50 %	189501678
89	NC_010830	GTAAAC	2	12	249420	249431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189501680
90	NC_010830	TATTGA	2	12	252730	252741	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189501682
91	NC_010830	GATGTA	2	12	253676	253687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501682
92	NC_010830	TGAATA	2	12	257604	257615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189501684
93	NC_010830	TAAAAT	2	12	258562	258573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501685
94	NC_010830	AATAGG	2	12	258851	258862	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189501685
95	NC_010830	GATTAT	2	12	260001	260012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189501686
96	NC_010830	TTTCTA	2	12	261008	261019	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189501688
97	NC_010830	CAAGAT	2	12	265584	265595	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189501691
98	NC_010830	TTATAC	2	12	267646	267657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189501692
99	NC_010830	CAAAAT	2	12	277477	277488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	189501701
100	NC_010830	TTGTAA	2	12	279769	279780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294661124
101	NC_010830	CCAATA	2	12	280965	280976	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189501704
102	NC_010830	TTGTTA	2	12	281124	281135	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189501704
103	NC_010830	CTACTT	2	12	282238	282249	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294661125
104	NC_010830	CTGTAT	2	12	282496	282507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294661125
105	NC_010830	AATATT	2	12	283378	283389	50 %	50 %	0 %	0 %	294661127
106	NC_010830	TTTAGC	2	12	286431	286442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189501709
107	NC_010830	TCATAA	2	12	286889	286900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294661128
108	NC_010830	GTATAG	2	12	287108	287119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294661128
109	NC_010830	CCTGTG	2	12	295785	295796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501714
110	NC_010830	GTTTCT	2	12	299918	299929	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189501716
111	NC_010830	TAAGAT	2	12	301943	301954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294661131
112	NC_010830	ATCATA	2	12	307768	307779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294661132
113	NC_010830	TATTCT	2	12	308210	308221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294661132
114	NC_010830	AATTAA	2	12	315819	315830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501725
115	NC_010830	AAAAAG	2	12	316038	316049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189501725
116	NC_010830	AAGCAG	2	12	319653	319664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189501728
117	NC_010830	TTGTTT	2	12	324267	324278	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189501731
118	NC_010830	ATGTAG	2	12	327789	327800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501734
119	NC_010830	TTATCT	2	12	328199	328210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189501735
120	NC_010830	CCTGTT	2	12	328496	328507	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189501735
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122	NC_010830	ATAGGT	2	12	336654	336665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501741
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228	NC_010830	AGATAG	2	12	671138	671149	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294661185
229	NC_010830	GAACAA	2	12	673494	673505	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189501942
230	NC_010830	TCTGAT	2	12	674955	674966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294661187
231	NC_010830	CTACAC	2	12	679806	679817	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	189501949
232	NC_010830	TATTGG	2	12	680704	680715	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189501949
233	NC_010830	CAAAGC	2	12	681317	681328	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189501949
234	NC_010830	CTATTA	2	12	692170	692181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294661193
235	NC_010830	TTTGCA	2	12	692611	692622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189501957
236	NC_010830	TACCCT	2	12	693101	693112	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189501957
237	NC_010830	TATTTG	2	12	693501	693512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189501957
238	NC_010830	TCTTCA	2	12	694225	694236	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189501957
239	NC_010830	TTCTTT	2	12	698204	698215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294661194
240	NC_010830	AGCATC	2	12	699872	699883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294661194
241	NC_010830	GAGCGT	2	12	701537	701548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294661194
242	NC_010830	AGAGCA	2	12	707482	707493	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189501961
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244	NC_010830	TAGAAA	2	12	709822	709833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189501964
245	NC_010830	CTATAT	2	12	711950	711961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189501967
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254	NC_010830	CTATTT	2	12	761972	761983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189502004
255	NC_010830	ACTTCT	2	12	762034	762045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189502004
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259	NC_010830	TAACTT	2	12	763721	763732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189502005
260	NC_010830	CTCTAT	2	12	764204	764215	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189502005
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262	NC_010830	TATCTA	2	12	765038	765049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189502005
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333	NC_010830	TACGGC	2	12	981783	981794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189502161
334	NC_010830	TTTTGC	2	12	986608	986619	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189502163
335	NC_010830	TGTCTG	2	12	990171	990182	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189502166
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339	NC_010830	TGTTTA	2	12	1007177	1007188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189502183
340	NC_010830	TATGGG	2	12	1011196	1011207	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189502185
341	NC_010830	TATCCA	2	12	1011656	1011667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661243
342	NC_010830	AATCCT	2	12	1011827	1011838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661243
343	NC_010830	TGCTTT	2	12	1013856	1013867	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189502188
344	NC_010830	CATAGC	2	12	1016489	1016500	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189502189
345	NC_010830	CTGTAT	2	12	1017156	1017167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294661244
346	NC_010830	TAAGAA	2	12	1018020	1018031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189502190
347	NC_010830	TTTAAA	2	12	1019314	1019325	50 %	50 %	0 %	0 %	189502192
348	NC_010830	ATATTG	2	12	1021637	1021648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189502194
349	NC_010830	AGATTT	2	12	1026112	1026123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189502196
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