MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 33858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010830	A	6	6	201366	201371	100 %	0 %	0 %	0 %	189501634
3502	NC_010830	AT	4	8	201403	201410	50 %	50 %	0 %	0 %	189501634
3503	NC_010830	CCCA	2	8	201427	201434	25 %	0 %	0 %	75 %	189501635
3504	NC_010830	GCT	2	6	201446	201451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501635
3505	NC_010830	GATGCT	2	12	201452	201463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189501635
3506	NC_010830	TAA	2	6	201573	201578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501635
3507	NC_010830	AGCT	2	8	201598	201605	25 %	25 %	25 %	25 %	189501635
3508	NC_010830	CATA	2	8	201663	201670	50 %	25 %	0 %	25 %	189501635
3509	NC_010830	CCT	2	6	201698	201703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189501635
3510	NC_010830	TAG	2	6	201759	201764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501635
3511	NC_010830	ACC	2	6	201769	201774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501635
3512	NC_010830	T	6	6	201824	201829	0 %	100 %	0 %	0 %	189501635
3513	NC_010830	GTA	2	6	201874	201879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501636
3514	NC_010830	CTT	2	6	202009	202014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501636
3515	NC_010830	AAT	2	6	202053	202058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501637
3516	NC_010830	TGC	2	6	202082	202087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501637
3517	NC_010830	TC	3	6	202101	202106	0 %	50 %	0 %	50 %	189501637
3518	NC_010830	TAT	2	6	202141	202146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501637
3519	NC_010830	AGA	2	6	202154	202159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501637
3520	NC_010830	ATT	2	6	202181	202186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501637
3521	NC_010830	ACA	2	6	202206	202211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501637
3522	NC_010830	AAT	2	6	202229	202234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501637
3523	NC_010830	GCT	2	6	202248	202253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501637
3524	NC_010830	CCA	2	6	202275	202280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501637
3525	NC_010830	GTACC	2	10	202303	202312	20 %	20 %	20 %	40 %	189501637
3526	NC_010830	TAA	2	6	202330	202335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501637
3527	NC_010830	CTT	2	6	202381	202386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501637
3528	NC_010830	CTA	2	6	202408	202413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501637
3529	NC_010830	ACT	2	6	202434	202439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501637
3530	NC_010830	CCTC	2	8	202464	202471	0 %	25 %	0 %	75 %	189501637
3531	NC_010830	AAC	2	6	202472	202477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501637
3532	NC_010830	CAA	2	6	202498	202503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501637
3533	NC_010830	ATT	2	6	202536	202541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501637
3534	NC_010830	CAT	2	6	202553	202558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501637
3535	NC_010830	AT	3	6	202557	202562	50 %	50 %	0 %	0 %	189501637
3536	NC_010830	AT	5	10	202621	202630	50 %	50 %	0 %	0 %	294661112
3537	NC_010830	CTT	2	6	202650	202655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294661112
3538	NC_010830	GCTT	2	8	202673	202680	0 %	50 %	25 %	25 %	294661112
3539	NC_010830	TCC	2	6	202688	202693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294661112
3540	NC_010830	GAA	2	6	202748	202753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294661112
3541	NC_010830	TTA	2	6	202808	202813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294661112
3542	NC_010830	TC	3	6	202837	202842	0 %	50 %	0 %	50 %	294661112
3543	NC_010830	TCT	2	6	202888	202893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294661112
3544	NC_010830	AGC	2	6	203044	203049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501639
3545	NC_010830	GTT	2	6	203064	203069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501639
3546	NC_010830	TTCC	2	8	203076	203083	0 %	50 %	0 %	50 %	189501639
3547	NC_010830	TGG	2	6	203137	203142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501639
3548	NC_010830	AAAT	2	8	203150	203157	75 %	25 %	0 %	0 %	189501639
3549	NC_010830	CAAGGT	2	12	203172	203183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189501639
3550	NC_010830	AAT	2	6	203263	203268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501639
3551	NC_010830	ATT	2	6	203272	203277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501639
3552	NC_010830	TA	3	6	203289	203294	50 %	50 %	0 %	0 %	189501639
3553	NC_010830	TTC	2	6	203328	203333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501639
3554	NC_010830	TA	3	6	203383	203388	50 %	50 %	0 %	0 %	189501639
3555	NC_010830	TAACG	2	10	203446	203455	40 %	20 %	20 %	20 %	189501639
3556	NC_010830	CTT	2	6	203562	203567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501640
3557	NC_010830	TTAC	2	8	203669	203676	25 %	50 %	0 %	25 %	189501640
3558	NC_010830	TTG	2	6	203687	203692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501640
3559	NC_010830	TTGT	2	8	203746	203753	0 %	75 %	25 %	0 %	189501640
3560	NC_010830	ATC	2	6	203761	203766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501640
3561	NC_010830	AT	3	6	203783	203788	50 %	50 %	0 %	0 %	189501640
3562	NC_010830	CTT	2	6	203818	203823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501640
3563	NC_010830	CTA	2	6	203844	203849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501640
3564	NC_010830	AGCT	2	8	204028	204035	25 %	25 %	25 %	25 %	189501641
3565	NC_010830	AT	3	6	204108	204113	50 %	50 %	0 %	0 %	189501641
3566	NC_010830	TCTTAC	2	12	204146	204157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189501641
3567	NC_010830	CTT	2	6	204205	204210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501641
3568	NC_010830	CCA	2	6	204241	204246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501641
3569	NC_010830	ATT	2	6	204291	204296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501641
3570	NC_010830	T	6	6	204302	204307	0 %	100 %	0 %	0 %	189501642
3571	NC_010830	TG	4	8	204342	204349	0 %	50 %	50 %	0 %	189501642
3572	NC_010830	CTT	2	6	204350	204355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501642
3573	NC_010830	CT	3	6	204361	204366	0 %	50 %	0 %	50 %	189501642
3574	NC_010830	AAT	2	6	204435	204440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501642
3575	NC_010830	GCAAT	2	10	204521	204530	40 %	20 %	20 %	20 %	189501642
3576	NC_010830	GTT	2	6	204670	204675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501642
3577	NC_010830	TCAA	2	8	204694	204701	50 %	25 %	0 %	25 %	189501642
3578	NC_010830	T	6	6	204702	204707	0 %	100 %	0 %	0 %	189501642
3579	NC_010830	CAG	2	6	204716	204721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501642
3580	NC_010830	T	6	6	204746	204751	0 %	100 %	0 %	0 %	189501642
3581	NC_010830	ACT	2	6	204808	204813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501642
3582	NC_010830	TGT	2	6	204829	204834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501642
3583	NC_010830	T	6	6	204851	204856	0 %	100 %	0 %	0 %	189501642
3584	NC_010830	T	7	7	204870	204876	0 %	100 %	0 %	0 %	189501643
3585	NC_010830	CTT	2	6	204897	204902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501643
3586	NC_010830	TTC	2	6	204912	204917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501643
3587	NC_010830	T	6	6	205024	205029	0 %	100 %	0 %	0 %	189501643
3588	NC_010830	TTC	2	6	205106	205111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501643
3589	NC_010830	T	6	6	205148	205153	0 %	100 %	0 %	0 %	189501643
3590	NC_010830	ATG	2	6	205174	205179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501643
3591	NC_010830	TAT	2	6	205182	205187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501643
3592	NC_010830	TAC	2	6	205219	205224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501644
3593	NC_010830	TCA	2	6	205289	205294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501644
3594	NC_010830	TAA	2	6	205303	205308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501644
3595	NC_010830	ATC	2	6	205321	205326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501644
3596	NC_010830	ACG	2	6	205351	205356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501644
3597	NC_010830	T	7	7	205363	205369	0 %	100 %	0 %	0 %	189501644
3598	NC_010830	T	7	7	205402	205408	0 %	100 %	0 %	0 %	189501644
3599	NC_010830	CAG	2	6	205416	205421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501644
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3602	NC_010830	TAT	2	6	205524	205529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501644
3603	NC_010830	TTG	2	6	205552	205557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501644
3604	NC_010830	CTT	3	9	205605	205613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501645
3605	NC_010830	CAT	2	6	205673	205678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501645
3606	NC_010830	T	6	6	205689	205694	0 %	100 %	0 %	0 %	189501645
3607	NC_010830	TCT	2	6	205698	205703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501645
3608	NC_010830	CTA	2	6	205742	205747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501645
3609	NC_010830	TTA	2	6	205771	205776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501645
3610	NC_010830	TTCT	2	8	205793	205800	0 %	75 %	0 %	25 %	189501645
3611	NC_010830	ATTTA	2	10	205831	205840	40 %	60 %	0 %	0 %	189501646
3612	NC_010830	TCTAG	2	10	205866	205875	20 %	40 %	20 %	20 %	189501646
3613	NC_010830	TAG	2	6	205903	205908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501646
3614	NC_010830	T	6	6	206026	206031	0 %	100 %	0 %	0 %	189501646
3615	NC_010830	ACA	2	6	206163	206168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501647
3616	NC_010830	TTTCCC	2	12	206193	206204	0 %	50 %	0 %	50 %	189501647
3617	NC_010830	CAG	2	6	206215	206220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501647
3618	NC_010830	GCCTT	2	10	206267	206276	0 %	40 %	20 %	40 %	189501647
3619	NC_010830	GCT	2	6	206304	206309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501647
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3621	NC_010830	TTA	2	6	206554	206559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501648
3622	NC_010830	AGT	2	6	206577	206582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501648
3623	NC_010830	AGA	2	6	206589	206594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501648
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3625	NC_010830	TTC	2	6	206717	206722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501648
3626	NC_010830	CTT	2	6	206723	206728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501648
3627	NC_010830	CTT	2	6	206740	206745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501648
3628	NC_010830	TGCT	2	8	206823	206830	0 %	50 %	25 %	25 %	189501648
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3640	NC_010830	TCT	2	6	207443	207448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294661113
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3733	NC_010830	A	8	8	212371	212378	100 %	0 %	0 %	0 %	189501656
3734	NC_010830	TAC	2	6	212383	212388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501656
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3737	NC_010830	AG	3	6	212668	212673	50 %	0 %	50 %	0 %	294661115
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3745	NC_010830	CAA	2	6	212952	212957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294661115
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3748	NC_010830	CTAT	2	8	213126	213133	25 %	50 %	0 %	25 %	294661115
3749	NC_010830	A	6	6	213145	213150	100 %	0 %	0 %	0 %	294661115
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3751	NC_010830	TAA	2	6	213297	213302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294661115
3752	NC_010830	TAT	2	6	213361	213366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294661115
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3852	NC_010830	TAAAA	2	10	218604	218613	80 %	20 %	0 %	0 %	189501661
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3856	NC_010830	TAC	2	6	218721	218726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501661
3857	NC_010830	TACT	2	8	218747	218754	25 %	50 %	0 %	25 %	189501661
3858	NC_010830	TGA	2	6	218789	218794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501661
3859	NC_010830	ACCAA	2	10	218829	218838	60 %	0 %	0 %	40 %	189501661
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3866	NC_010830	A	6	6	219209	219214	100 %	0 %	0 %	0 %	189501662
3867	NC_010830	CTA	2	6	219219	219224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501662
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3992	NC_010830	CTG	2	6	227218	227223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294661118
3993	NC_010830	AAC	2	6	227260	227265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294661118
3994	NC_010830	GTA	3	9	227278	227286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294661118
3995	NC_010830	AGAT	2	8	227309	227316	50 %	25 %	25 %	0 %	294661118
3996	NC_010830	AGC	2	6	227343	227348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294661118
3997	NC_010830	TACCAT	2	12	227358	227369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661118
3998	NC_010830	A	6	6	227389	227394	100 %	0 %	0 %	0 %	294661118
3999	NC_010830	TACT	2	8	227401	227408	25 %	50 %	0 %	25 %	294661118
4000	NC_010830	AGC	2	6	227411	227416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294661118

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