MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 45842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010803	CAT	2	6	225013	225018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345749
3502	NC_010803	TTCG	2	8	225060	225067	0 %	50 %	25 %	25 %	189345749
3503	NC_010803	TTCC	2	8	225116	225123	0 %	50 %	0 %	50 %	189345749
3504	NC_010803	TTC	2	6	225134	225139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345749
3505	NC_010803	TAG	2	6	225476	225481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345750
3506	NC_010803	CAGG	2	8	225496	225503	25 %	0 %	50 %	25 %	189345750
3507	NC_010803	TGT	2	6	225549	225554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345750
3508	NC_010803	TGGT	2	8	225590	225597	0 %	50 %	50 %	0 %	189345750
3509	NC_010803	GAA	2	6	225638	225643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345750
3510	NC_010803	ACCATT	2	12	225661	225672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345750
3511	NC_010803	AAAG	2	8	225678	225685	75 %	0 %	25 %	0 %	189345750
3512	NC_010803	GGCA	2	8	225828	225835	25 %	0 %	50 %	25 %	189345751
3513	NC_010803	GTCT	2	8	225898	225905	0 %	50 %	25 %	25 %	189345751
3514	NC_010803	AG	3	6	225919	225924	50 %	0 %	50 %	0 %	189345751
3515	NC_010803	CAG	2	6	225931	225936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345751
3516	NC_010803	TGC	2	6	225947	225952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345751
3517	NC_010803	GCT	2	6	225966	225971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345751
3518	NC_010803	GATC	2	8	225998	226005	25 %	25 %	25 %	25 %	189345751
3519	NC_010803	ATG	2	6	226084	226089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345751
3520	NC_010803	GAG	2	6	226168	226173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345751
3521	NC_010803	ATG	2	6	226201	226206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345751
3522	NC_010803	TGAT	2	8	226340	226347	25 %	50 %	25 %	0 %	189345751
3523	NC_010803	GAG	2	6	226378	226383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345751
3524	NC_010803	TG	3	6	226450	226455	0 %	50 %	50 %	0 %	189345751
3525	NC_010803	ATC	2	6	226456	226461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345751
3526	NC_010803	TATCGG	2	12	226485	226496	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189345751
3527	NC_010803	GGC	2	6	226599	226604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345751
3528	NC_010803	GAC	2	6	226627	226632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345751
3529	NC_010803	TAT	2	6	226647	226652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345751
3530	NC_010803	GAG	2	6	226735	226740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345751
3531	NC_010803	AGT	2	6	226823	226828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345751
3532	NC_010803	CGACT	2	10	226931	226940	20 %	20 %	20 %	40 %	189345752
3533	NC_010803	TGC	2	6	226960	226965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345752
3534	NC_010803	AAG	2	6	226970	226975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345752
3535	NC_010803	CTC	2	6	226976	226981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345752
3536	NC_010803	AG	3	6	227024	227029	50 %	0 %	50 %	0 %	189345752
3537	NC_010803	AGA	2	6	227062	227067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345752
3538	NC_010803	GGAA	2	8	227082	227089	50 %	0 %	50 %	0 %	189345752
3539	NC_010803	TGA	2	6	227140	227145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345752
3540	NC_010803	GGT	2	6	227291	227296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345752
3541	NC_010803	CGT	2	6	227338	227343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345752
3542	NC_010803	GCC	2	6	227397	227402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345752
3543	NC_010803	GAA	2	6	227453	227458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345752
3544	NC_010803	TCC	2	6	227462	227467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345752
3545	NC_010803	TCT	2	6	227624	227629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345752
3546	NC_010803	CGGG	2	8	227705	227712	0 %	0 %	75 %	25 %	189345752
3547	NC_010803	AGC	2	6	227800	227805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345752
3548	NC_010803	CTT	2	6	227827	227832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345752
3549	NC_010803	TGC	2	6	227871	227876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345752
3550	NC_010803	CGC	2	6	227890	227895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345752
3551	NC_010803	CAGT	2	8	227941	227948	25 %	25 %	25 %	25 %	189345752
3552	NC_010803	AGC	2	6	228090	228095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345753
3553	NC_010803	GTT	2	6	228104	228109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345753
3554	NC_010803	T	6	6	228125	228130	0 %	100 %	0 %	0 %	189345753
3555	NC_010803	CCT	2	6	228207	228212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345753
3556	NC_010803	T	7	7	228233	228239	0 %	100 %	0 %	0 %	189345753
3557	NC_010803	ATG	2	6	228318	228323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345753
3558	NC_010803	GC	3	6	228348	228353	0 %	0 %	50 %	50 %	189345753
3559	NC_010803	TCA	2	6	228361	228366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345753
3560	NC_010803	TGC	2	6	228408	228413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345753
3561	NC_010803	GCC	2	6	228422	228427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345753
3562	NC_010803	AAGG	2	8	228496	228503	50 %	0 %	50 %	0 %	189345753
3563	NC_010803	ATC	2	6	228512	228517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345753
3564	NC_010803	AAGC	2	8	228553	228560	50 %	0 %	25 %	25 %	189345753
3565	NC_010803	GGC	2	6	228668	228673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345753
3566	NC_010803	AAG	2	6	228749	228754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345753
3567	NC_010803	GCC	2	6	228794	228799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345753
3568	NC_010803	TGA	3	9	228811	228819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345753
3569	NC_010803	GACCGG	2	12	228874	228885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189345753
3570	NC_010803	GCA	2	6	228897	228902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345753
3571	NC_010803	GCC	2	6	228908	228913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345753
3572	NC_010803	TCT	2	6	228954	228959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345753
3573	NC_010803	T	6	6	228983	228988	0 %	100 %	0 %	0 %	189345753
3574	NC_010803	T	6	6	229064	229069	0 %	100 %	0 %	0 %	189345753
3575	NC_010803	CGC	2	6	229070	229075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345753
3576	NC_010803	GGC	2	6	229076	229081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345753
3577	NC_010803	CGG	2	6	229116	229121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345753
3578	NC_010803	CCGT	2	8	229160	229167	0 %	25 %	25 %	50 %	189345753
3579	NC_010803	GCCG	2	8	229205	229212	0 %	0 %	50 %	50 %	189345753
3580	NC_010803	ACA	2	6	229401	229406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345753
3581	NC_010803	TCT	2	6	229461	229466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345753
3582	NC_010803	TGA	3	9	229516	229524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345753
3583	NC_010803	GCC	2	6	229526	229531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345753
3584	NC_010803	GTG	2	6	229532	229537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345753
3585	NC_010803	GCT	2	6	229563	229568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345753
3586	NC_010803	AGG	2	6	229670	229675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345753
3587	NC_010803	T	6	6	229806	229811	0 %	100 %	0 %	0 %	189345753
3588	NC_010803	TCT	2	6	229824	229829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345753
3589	NC_010803	TTG	2	6	229840	229845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345753
3590	NC_010803	CATT	2	8	230117	230124	25 %	50 %	0 %	25 %	189345754
3591	NC_010803	TTC	2	6	230125	230130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345754
3592	NC_010803	TC	3	6	230129	230134	0 %	50 %	0 %	50 %	189345754
3593	NC_010803	TCCA	2	8	230192	230199	25 %	25 %	0 %	50 %	189345754
3594	NC_010803	TCT	2	6	230214	230219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345754
3595	NC_010803	ATC	2	6	230302	230307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345754
3596	NC_010803	T	7	7	230615	230621	0 %	100 %	0 %	0 %	189345755
3597	NC_010803	T	7	7	230840	230846	0 %	100 %	0 %	0 %	189345755
3598	NC_010803	A	6	6	230883	230888	100 %	0 %	0 %	0 %	189345755
3599	NC_010803	CCTGGG	2	12	230899	230910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189345755
3600	NC_010803	GAC	2	6	230973	230978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345755
3601	NC_010803	GGA	2	6	231116	231121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345755
3602	NC_010803	GACG	2	8	231210	231217	25 %	0 %	50 %	25 %	189345755
3603	NC_010803	CCA	2	6	231370	231375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345755
3604	NC_010803	CT	3	6	231441	231446	0 %	50 %	0 %	50 %	189345755
3605	NC_010803	CCA	2	6	231551	231556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345755
3606	NC_010803	AGC	2	6	231610	231615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345755
3607	NC_010803	TGC	2	6	231725	231730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345755
3608	NC_010803	GAT	2	6	231744	231749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345755
3609	NC_010803	GCT	2	6	231804	231809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345755
3610	NC_010803	TGCA	2	8	231849	231856	25 %	25 %	25 %	25 %	189345755
3611	NC_010803	CAGGA	2	10	231879	231888	40 %	0 %	40 %	20 %	189345755
3612	NC_010803	CGG	2	6	231914	231919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345755
3613	NC_010803	AG	3	6	231941	231946	50 %	0 %	50 %	0 %	189345755
3614	NC_010803	CTC	2	6	231986	231991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345755
3615	NC_010803	TGC	2	6	232009	232014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345755
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3617	NC_010803	GCG	2	6	232063	232068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345755
3618	NC_010803	GGAT	2	8	232086	232093	25 %	25 %	50 %	0 %	189345755
3619	NC_010803	GTC	2	6	232158	232163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345755
3620	NC_010803	CGG	2	6	232223	232228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345755
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3622	NC_010803	GCA	2	6	232343	232348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345755
3623	NC_010803	GTTC	2	8	232354	232361	0 %	50 %	25 %	25 %	189345755
3624	NC_010803	TAA	2	6	232474	232479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345755
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3654	NC_010803	A	6	6	233835	233840	100 %	0 %	0 %	0 %	189345756
3655	NC_010803	GTT	2	6	233858	233863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345756
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3732	NC_010803	ATC	2	6	238682	238687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345763
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3734	NC_010803	A	6	6	238797	238802	100 %	0 %	0 %	0 %	189345764
3735	NC_010803	CCGTCA	2	12	238833	238844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189345764
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3739	NC_010803	GA	3	6	239422	239427	50 %	0 %	50 %	0 %	189345765
3740	NC_010803	AGCCG	2	10	239441	239450	20 %	0 %	40 %	40 %	189345765
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3742	NC_010803	TCG	2	6	239524	239529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345765
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3988	NC_010803	ATG	2	6	253461	253466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345772
3989	NC_010803	GAA	2	6	253505	253510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345772
3990	NC_010803	TTTA	2	8	254457	254464	25 %	75 %	0 %	0 %	189345773
3991	NC_010803	CTTTTG	2	12	254553	254564	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189345773
3992	NC_010803	CAA	2	6	254589	254594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345773
3993	NC_010803	GTT	2	6	254648	254653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345773
3994	NC_010803	AT	4	8	254673	254680	50 %	50 %	0 %	0 %	189345773
3995	NC_010803	T	7	7	254729	254735	0 %	100 %	0 %	0 %	189345773
3996	NC_010803	TGT	3	9	254740	254748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345773
3997	NC_010803	T	6	6	254759	254764	0 %	100 %	0 %	0 %	189345773
3998	NC_010803	ATC	2	6	254776	254781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345773
3999	NC_010803	TTGA	2	8	254795	254802	25 %	50 %	25 %	0 %	189345773
4000	NC_010803	ATA	2	6	254832	254837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345773

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