MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 45842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010803	G	7	7	195490	195496	0 %	0 %	100 %	0 %	189345727
3002	NC_010803	GGCA	2	8	195603	195610	25 %	0 %	50 %	25 %	189345727
3003	NC_010803	TTCAG	2	10	195630	195639	20 %	40 %	20 %	20 %	189345727
3004	NC_010803	TGC	2	6	195692	195697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345727
3005	NC_010803	GCGG	2	8	195842	195849	0 %	0 %	75 %	25 %	189345728
3006	NC_010803	T	7	7	195882	195888	0 %	100 %	0 %	0 %	189345728
3007	NC_010803	GCC	2	6	195892	195897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345728
3008	NC_010803	AGT	2	6	195919	195924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345728
3009	NC_010803	TGC	2	6	196012	196017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345728
3010	NC_010803	TGT	2	6	196024	196029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345728
3011	NC_010803	AAT	2	6	196067	196072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345728
3012	NC_010803	AGC	2	6	196121	196126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345728
3013	NC_010803	AGC	2	6	196155	196160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345728
3014	NC_010803	TCA	2	6	196161	196166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345728
3015	NC_010803	AACCG	2	10	196199	196208	40 %	0 %	20 %	40 %	189345728
3016	NC_010803	GTTT	2	8	196212	196219	0 %	75 %	25 %	0 %	189345728
3017	NC_010803	TTCAG	2	10	196227	196236	20 %	40 %	20 %	20 %	189345728
3018	NC_010803	GCC	2	6	196265	196270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345728
3019	NC_010803	T	7	7	196367	196373	0 %	100 %	0 %	0 %	189345728
3020	NC_010803	CGG	2	6	196399	196404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345728
3021	NC_010803	GTT	2	6	196502	196507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345728
3022	NC_010803	CCAT	2	8	196534	196541	25 %	25 %	0 %	50 %	189345728
3023	NC_010803	GC	3	6	196626	196631	0 %	0 %	50 %	50 %	189345728
3024	NC_010803	TCG	2	6	196647	196652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345728
3025	NC_010803	C	6	6	196683	196688	0 %	0 %	0 %	100 %	189345728
3026	NC_010803	TCC	2	6	196691	196696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345728
3027	NC_010803	CGC	2	6	196789	196794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345728
3028	NC_010803	ATG	2	6	196941	196946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345728
3029	NC_010803	GTT	2	6	196963	196968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345728
3030	NC_010803	TTTC	2	8	197052	197059	0 %	75 %	0 %	25 %	189345728
3031	NC_010803	GAA	2	6	197243	197248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345729
3032	NC_010803	GTC	2	6	197282	197287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345729
3033	NC_010803	GAG	2	6	197290	197295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345729
3034	NC_010803	CGC	2	6	197299	197304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345729
3035	NC_010803	TGT	3	9	197305	197313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345729
3036	NC_010803	GCCA	2	8	197332	197339	25 %	0 %	25 %	50 %	189345729
3037	NC_010803	GCA	2	6	197384	197389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345729
3038	NC_010803	TTC	2	6	197425	197430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345729
3039	NC_010803	TC	3	6	197429	197434	0 %	50 %	0 %	50 %	189345729
3040	NC_010803	TTC	2	6	197438	197443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345729
3041	NC_010803	GCT	2	6	197459	197464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345729
3042	NC_010803	GTC	2	6	197552	197557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345729
3043	NC_010803	CAG	2	6	197564	197569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345729
3044	NC_010803	CTG	2	6	197584	197589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345729
3045	NC_010803	ATG	2	6	197702	197707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345729
3046	NC_010803	GGCG	2	8	197752	197759	0 %	0 %	75 %	25 %	189345729
3047	NC_010803	GGCATG	2	12	197843	197854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189345729
3048	NC_010803	TGC	2	6	197881	197886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345729
3049	NC_010803	T	6	6	197967	197972	0 %	100 %	0 %	0 %	189345729
3050	NC_010803	CGT	2	6	198258	198263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345730
3051	NC_010803	GAT	2	6	198289	198294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345730
3052	NC_010803	GCCGG	2	10	198299	198308	0 %	0 %	60 %	40 %	189345730
3053	NC_010803	CGC	2	6	198357	198362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345730
3054	NC_010803	ACTTTT	2	12	198368	198379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189345730
3055	NC_010803	GCC	2	6	198422	198427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345730
3056	NC_010803	AT	4	8	198617	198624	50 %	50 %	0 %	0 %	189345730
3057	NC_010803	GCG	2	6	198633	198638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345730
3058	NC_010803	ACGGCA	2	12	198674	198685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345730
3059	NC_010803	CCG	2	6	198839	198844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345730
3060	NC_010803	TAG	2	6	198881	198886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345730
3061	NC_010803	TTC	2	6	198951	198956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345730
3062	NC_010803	GAT	2	6	198999	199004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345730
3063	NC_010803	TGT	2	6	199008	199013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345730
3064	NC_010803	TCA	2	6	199579	199584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345731
3065	NC_010803	GAG	2	6	199607	199612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345731
3066	NC_010803	ACG	2	6	199641	199646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345731
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3068	NC_010803	CGG	2	6	199697	199702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345731
3069	NC_010803	CTA	2	6	199745	199750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345731
3070	NC_010803	G	6	6	199775	199780	0 %	0 %	100 %	0 %	189345731
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3072	NC_010803	CTT	2	6	199911	199916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345731
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3074	NC_010803	TCGT	2	8	200205	200212	0 %	50 %	25 %	25 %	189345731
3075	NC_010803	TGG	2	6	200247	200252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345731
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3079	NC_010803	CAG	2	6	200373	200378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345731
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3087	NC_010803	ATC	2	6	200598	200603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345731
3088	NC_010803	GCG	2	6	200605	200610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345731
3089	NC_010803	CAT	2	6	200840	200845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345731
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3091	NC_010803	TC	3	6	200986	200991	0 %	50 %	0 %	50 %	189345731
3092	NC_010803	GAT	2	6	201009	201014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345731
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3094	NC_010803	ATTC	2	8	201037	201044	25 %	50 %	0 %	25 %	189345731
3095	NC_010803	GGT	2	6	201066	201071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345731
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3101	NC_010803	ATT	2	6	201262	201267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345731
3102	NC_010803	TCT	2	6	201289	201294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345731
3103	NC_010803	TCA	2	6	201343	201348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345731
3104	NC_010803	AAG	2	6	201429	201434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345731
3105	NC_010803	ACGTT	2	10	201448	201457	20 %	40 %	20 %	20 %	189345731
3106	NC_010803	CGG	2	6	201515	201520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345731
3107	NC_010803	GCC	2	6	201581	201586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345731
3108	NC_010803	GCT	2	6	201600	201605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345731
3109	NC_010803	CAG	2	6	201615	201620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345731
3110	NC_010803	AT	3	6	201779	201784	50 %	50 %	0 %	0 %	189345732
3111	NC_010803	GCCT	2	8	201792	201799	0 %	25 %	25 %	50 %	189345732
3112	NC_010803	AGC	2	6	201804	201809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345732
3113	NC_010803	GCA	2	6	201856	201861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345732
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3115	NC_010803	AAAG	2	8	201984	201991	75 %	0 %	25 %	0 %	189345732
3116	NC_010803	CAG	2	6	202061	202066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345732
3117	NC_010803	A	6	6	202122	202127	100 %	0 %	0 %	0 %	189345732
3118	NC_010803	ATT	2	6	202130	202135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345732
3119	NC_010803	ATT	2	6	202138	202143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345732
3120	NC_010803	TCC	2	6	202185	202190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345732
3121	NC_010803	AGG	2	6	202232	202237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345732
3122	NC_010803	AG	3	6	202374	202379	50 %	0 %	50 %	0 %	189345732
3123	NC_010803	TTC	2	6	202400	202405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345732
3124	NC_010803	CCG	2	6	202555	202560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345733
3125	NC_010803	TACC	2	8	202598	202605	25 %	25 %	0 %	50 %	189345733
3126	NC_010803	T	6	6	202646	202651	0 %	100 %	0 %	0 %	189345733
3127	NC_010803	TGA	2	6	202686	202691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345733
3128	NC_010803	GACGG	2	10	202702	202711	20 %	0 %	60 %	20 %	189345733
3129	NC_010803	CCT	2	6	202736	202741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345733
3130	NC_010803	GCTGGG	2	12	202776	202787	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189345733
3131	NC_010803	TCA	2	6	202809	202814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345733
3132	NC_010803	ATC	2	6	202840	202845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345733
3133	NC_010803	GATG	2	8	202848	202855	25 %	25 %	50 %	0 %	189345733
3134	NC_010803	CTG	2	6	202910	202915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345733
3135	NC_010803	AT	3	6	202935	202940	50 %	50 %	0 %	0 %	189345733
3136	NC_010803	AAT	2	6	202942	202947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345733
3137	NC_010803	CGT	2	6	202956	202961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345733
3138	NC_010803	TC	3	6	203086	203091	0 %	50 %	0 %	50 %	189345733
3139	NC_010803	A	6	6	203155	203160	100 %	0 %	0 %	0 %	189345733
3140	NC_010803	CGGT	2	8	203204	203211	0 %	25 %	50 %	25 %	189345733
3141	NC_010803	AAGA	2	8	203226	203233	75 %	0 %	25 %	0 %	189345733
3142	NC_010803	GGC	2	6	203261	203266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345733
3143	NC_010803	AAATC	2	10	203270	203279	60 %	20 %	0 %	20 %	189345733
3144	NC_010803	TGT	2	6	203363	203368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345734
3145	NC_010803	CTG	2	6	203386	203391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345734
3146	NC_010803	GTG	2	6	203473	203478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345734
3147	NC_010803	TGA	2	6	203514	203519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345734
3148	NC_010803	AG	3	6	203621	203626	50 %	0 %	50 %	0 %	189345734
3149	NC_010803	GAG	2	6	203638	203643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345734
3150	NC_010803	GGCTT	2	10	203648	203657	0 %	40 %	40 %	20 %	189345734
3151	NC_010803	CAT	2	6	203736	203741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345734
3152	NC_010803	CTC	2	6	203847	203852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345734
3153	NC_010803	GGC	2	6	204048	204053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345734
3154	NC_010803	TGA	2	6	204090	204095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345734
3155	NC_010803	TCT	2	6	204140	204145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345734
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3159	NC_010803	T	7	7	204351	204357	0 %	100 %	0 %	0 %	189345734
3160	NC_010803	T	6	6	204387	204392	0 %	100 %	0 %	0 %	189345734
3161	NC_010803	TCGT	2	8	204544	204551	0 %	50 %	25 %	25 %	189345734
3162	NC_010803	TCA	2	6	204554	204559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345734
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3166	NC_010803	TCA	2	6	204759	204764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345734
3167	NC_010803	TCT	2	6	204812	204817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345734
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3172	NC_010803	TTC	2	6	204988	204993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345734
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3212	NC_010803	ATC	2	6	207755	207760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345737
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3214	NC_010803	CATT	2	8	207856	207863	25 %	50 %	0 %	25 %	189345737
3215	NC_010803	TGT	2	6	207994	207999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345737
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3220	NC_010803	TAT	2	6	208172	208177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345737
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3223	NC_010803	GGTGAT	2	12	208304	208315	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189345737
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3225	NC_010803	A	7	7	208438	208444	100 %	0 %	0 %	0 %	189345737
3226	NC_010803	TGT	2	6	208498	208503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345737
3227	NC_010803	GTC	2	6	208525	208530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345737
3228	NC_010803	CAG	2	6	208561	208566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345737
3229	NC_010803	TCG	2	6	208734	208739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345737
3230	NC_010803	GAA	2	6	208760	208765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345737
3231	NC_010803	CTG	2	6	208784	208789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345737
3232	NC_010803	CTTG	2	8	208843	208850	0 %	50 %	25 %	25 %	189345737
3233	NC_010803	CAAGG	2	10	208873	208882	40 %	0 %	40 %	20 %	189345737
3234	NC_010803	GGGA	2	8	208893	208900	25 %	0 %	75 %	0 %	189345737
3235	NC_010803	GTTTT	2	10	208963	208972	0 %	80 %	20 %	0 %	189345737
3236	NC_010803	TCA	2	6	208975	208980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345737
3237	NC_010803	GTC	2	6	209147	209152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345737
3238	NC_010803	CAGG	2	8	209207	209214	25 %	0 %	50 %	25 %	189345737
3239	NC_010803	TTC	2	6	209262	209267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345737
3240	NC_010803	GC	3	6	209312	209317	0 %	0 %	50 %	50 %	189345737
3241	NC_010803	GCC	2	6	209387	209392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345737
3242	NC_010803	GCCGAT	2	12	209477	209488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189345737
3243	NC_010803	GAT	2	6	209645	209650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345738
3244	NC_010803	TTA	2	6	209683	209688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345738
3245	NC_010803	TCGG	2	8	209707	209714	0 %	25 %	50 %	25 %	189345738
3246	NC_010803	AGACG	2	10	209771	209780	40 %	0 %	40 %	20 %	189345738
3247	NC_010803	CTG	2	6	209831	209836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345738
3248	NC_010803	TCG	2	6	209848	209853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345738
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3252	NC_010803	ATCGC	2	10	210075	210084	20 %	20 %	20 %	40 %	189345738
3253	NC_010803	T	6	6	210137	210142	0 %	100 %	0 %	0 %	189345738
3254	NC_010803	TGG	2	6	210292	210297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345738
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3282	NC_010803	TGT	2	6	211931	211936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345741
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3355	NC_010803	TCA	2	6	216383	216388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345745
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3360	NC_010803	ATTCAC	2	12	216616	216627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345745
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3488	NC_010803	T	7	7	224139	224145	0 %	100 %	0 %	0 %	189345747
3489	NC_010803	CAA	2	6	224226	224231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345748
3490	NC_010803	TCAT	2	8	224270	224277	25 %	50 %	0 %	25 %	189345748
3491	NC_010803	CGG	2	6	224412	224417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345748
3492	NC_010803	GAA	2	6	224459	224464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345748
3493	NC_010803	AGG	2	6	224479	224484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345748
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3496	NC_010803	CTC	2	6	224584	224589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345748
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3499	NC_010803	T	6	6	224698	224703	0 %	100 %	0 %	0 %	189345749
3500	NC_010803	GAT	2	6	224920	224925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345749

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