MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 45842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010803	AGTC	2	8	62196	62203	25 %	25 %	25 %	25 %	189345612
1002	NC_010803	TTG	2	6	62292	62297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345613
1003	NC_010803	TTG	2	6	62417	62422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345613
1004	NC_010803	AAT	2	6	62433	62438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345613
1005	NC_010803	CCCAT	2	10	62470	62479	20 %	20 %	0 %	60 %	189345613
1006	NC_010803	CTT	2	6	62532	62537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345613
1007	NC_010803	GTA	2	6	62542	62547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345613
1008	NC_010803	TGA	2	6	62548	62553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345613
1009	NC_010803	GACGA	2	10	62645	62654	40 %	0 %	40 %	20 %	189345613
1010	NC_010803	TCAG	2	8	62930	62937	25 %	25 %	25 %	25 %	189345613
1011	NC_010803	TATT	2	8	63018	63025	25 %	75 %	0 %	0 %	189345613
1012	NC_010803	ACC	3	9	63031	63039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345613
1013	NC_010803	TCT	2	6	63070	63075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345613
1014	NC_010803	T	6	6	63130	63135	0 %	100 %	0 %	0 %	189345613
1015	NC_010803	AG	3	6	63147	63152	50 %	0 %	50 %	0 %	189345613
1016	NC_010803	GGT	2	6	63212	63217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345613
1017	NC_010803	TCG	2	6	63221	63226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345613
1018	NC_010803	TGAA	2	8	63263	63270	50 %	25 %	25 %	0 %	189345613
1019	NC_010803	TGC	2	6	63317	63322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345613
1020	NC_010803	AGAA	2	8	63391	63398	75 %	0 %	25 %	0 %	189345613
1021	NC_010803	TGG	2	6	63435	63440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345613
1022	NC_010803	CTTG	2	8	63518	63525	0 %	50 %	25 %	25 %	189345613
1023	NC_010803	GCT	2	6	63543	63548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345613
1024	NC_010803	CAT	2	6	63579	63584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345613
1025	NC_010803	AGC	2	6	63628	63633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345613
1026	NC_010803	GAT	2	6	63637	63642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345613
1027	NC_010803	ACGGT	2	10	63655	63664	20 %	20 %	40 %	20 %	189345613
1028	NC_010803	TGC	3	9	63788	63796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345613
1029	NC_010803	TTG	2	6	63810	63815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345613
1030	NC_010803	GTA	2	6	63824	63829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345613
1031	NC_010803	CAA	2	6	63832	63837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345613
1032	NC_010803	TGGC	2	8	63857	63864	0 %	25 %	50 %	25 %	189345613
1033	NC_010803	TGA	2	6	64148	64153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345613
1034	NC_010803	CTC	2	6	64171	64176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345613
1035	NC_010803	TCC	2	6	64283	64288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345614
1036	NC_010803	TCGT	2	8	64302	64309	0 %	50 %	25 %	25 %	189345614
1037	NC_010803	ATC	2	6	64378	64383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345614
1038	NC_010803	AAAG	2	8	64410	64417	75 %	0 %	25 %	0 %	189345614
1039	NC_010803	CCG	2	6	64553	64558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345614
1040	NC_010803	T	6	6	64588	64593	0 %	100 %	0 %	0 %	189345614
1041	NC_010803	GCGGG	2	10	64778	64787	0 %	0 %	80 %	20 %	189345615
1042	NC_010803	TCC	2	6	64840	64845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345615
1043	NC_010803	TGA	2	6	64856	64861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345615
1044	NC_010803	GCG	2	6	64893	64898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345615
1045	NC_010803	GCCC	2	8	64989	64996	0 %	0 %	25 %	75 %	189345616
1046	NC_010803	AG	3	6	65000	65005	50 %	0 %	50 %	0 %	189345616
1047	NC_010803	GTTC	2	8	65025	65032	0 %	50 %	25 %	25 %	189345616
1048	NC_010803	GCG	2	6	65168	65173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345616
1049	NC_010803	TGA	2	6	65205	65210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345616
1050	NC_010803	T	8	8	65249	65256	0 %	100 %	0 %	0 %	189345616
1051	NC_010803	TCG	2	6	65318	65323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345616
1052	NC_010803	TCGATG	2	12	65348	65359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189345616
1053	NC_010803	GA	3	6	65411	65416	50 %	0 %	50 %	0 %	189345616
1054	NC_010803	CGA	2	6	65448	65453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345616
1055	NC_010803	GGC	2	6	65473	65478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345616
1056	NC_010803	GCTG	2	8	65566	65573	0 %	25 %	50 %	25 %	189345616
1057	NC_010803	T	6	6	65595	65600	0 %	100 %	0 %	0 %	189345616
1058	NC_010803	TATCG	2	10	65650	65659	20 %	40 %	20 %	20 %	189345616
1059	NC_010803	ATC	2	6	65693	65698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345616
1060	NC_010803	CAA	2	6	65737	65742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345616
1061	NC_010803	CGA	2	6	65815	65820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345616
1062	NC_010803	AGC	2	6	65821	65826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345616
1063	NC_010803	CTT	2	6	66461	66466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345617
1064	NC_010803	TCGGG	2	10	66481	66490	0 %	20 %	60 %	20 %	189345617
1065	NC_010803	CGAC	2	8	66492	66499	25 %	0 %	25 %	50 %	189345617
1066	NC_010803	AGC	2	6	66502	66507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345617
1067	NC_010803	CTT	2	6	66524	66529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345617
1068	NC_010803	TGC	2	6	66565	66570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345617
1069	NC_010803	CGA	2	6	66598	66603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345617
1070	NC_010803	CCG	2	6	66615	66620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345617
1071	NC_010803	GCG	2	6	66685	66690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345617
1072	NC_010803	CGAC	2	8	66732	66739	25 %	0 %	25 %	50 %	189345617
1073	NC_010803	TGA	2	6	66769	66774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345617
1074	NC_010803	GGT	2	6	66826	66831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345617
1075	NC_010803	CGTC	2	8	66852	66859	0 %	25 %	25 %	50 %	189345617
1076	NC_010803	CGA	2	6	66964	66969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345617
1077	NC_010803	TGT	2	6	67018	67023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345617
1078	NC_010803	CTG	2	6	67062	67067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345617
1079	NC_010803	GGT	2	6	67103	67108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345617
1080	NC_010803	TAGGCA	2	12	67167	67178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189345617
1081	NC_010803	GC	3	6	67224	67229	0 %	0 %	50 %	50 %	189345617
1082	NC_010803	CTG	2	6	67276	67281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345617
1083	NC_010803	AATG	2	8	67687	67694	50 %	25 %	25 %	0 %	189345618
1084	NC_010803	TGG	2	6	67861	67866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345618
1085	NC_010803	TGGG	2	8	67908	67915	0 %	25 %	75 %	0 %	189345618
1086	NC_010803	TC	3	6	67952	67957	0 %	50 %	0 %	50 %	189345618
1087	NC_010803	TCG	2	6	67975	67980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345618
1088	NC_010803	GC	3	6	68171	68176	0 %	0 %	50 %	50 %	189345618
1089	NC_010803	GCG	2	6	68278	68283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345618
1090	NC_010803	GCT	2	6	68327	68332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345618
1091	NC_010803	GCC	2	6	68378	68383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345618
1092	NC_010803	TCA	2	6	68431	68436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345618
1093	NC_010803	GGT	2	6	68459	68464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345618
1094	NC_010803	GGT	2	6	68501	68506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345618
1095	NC_010803	T	6	6	68551	68556	0 %	100 %	0 %	0 %	189345618
1096	NC_010803	GTC	2	6	68603	68608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345618
1097	NC_010803	CGG	2	6	68639	68644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345618
1098	NC_010803	GAC	2	6	68784	68789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345618
1099	NC_010803	TGA	2	6	68806	68811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345618
1100	NC_010803	TC	3	6	68870	68875	0 %	50 %	0 %	50 %	189345618
1101	NC_010803	GCA	2	6	68911	68916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345618
1102	NC_010803	GGAG	2	8	68977	68984	25 %	0 %	75 %	0 %	189345618
1103	NC_010803	AGG	3	9	68998	69006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345618
1104	NC_010803	T	6	6	69176	69181	0 %	100 %	0 %	0 %	189345619
1105	NC_010803	CGTTC	2	10	69198	69207	0 %	40 %	20 %	40 %	189345619
1106	NC_010803	AGACGC	2	12	69215	69226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345619
1107	NC_010803	CGA	2	6	69245	69250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345619
1108	NC_010803	TTC	2	6	69270	69275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345619
1109	NC_010803	CG	3	6	69308	69313	0 %	0 %	50 %	50 %	189345619
1110	NC_010803	CAT	2	6	69354	69359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345619
1111	NC_010803	TCGT	2	8	69426	69433	0 %	50 %	25 %	25 %	189345619
1112	NC_010803	CCTGC	2	10	69434	69443	0 %	20 %	20 %	60 %	189345619
1113	NC_010803	CAT	2	6	69494	69499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345619
1114	NC_010803	CGA	2	6	69608	69613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345619
1115	NC_010803	TGC	2	6	69615	69620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345619
1116	NC_010803	TTC	2	6	69653	69658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345619
1117	NC_010803	TTTA	2	8	69808	69815	25 %	75 %	0 %	0 %	189345620
1118	NC_010803	TTC	2	6	69850	69855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345620
1119	NC_010803	CGC	2	6	69913	69918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345620
1120	NC_010803	TTGAT	2	10	70090	70099	20 %	60 %	20 %	0 %	189345620
1121	NC_010803	ACTG	2	8	70163	70170	25 %	25 %	25 %	25 %	189345620
1122	NC_010803	TTTG	2	8	70206	70213	0 %	75 %	25 %	0 %	189345620
1123	NC_010803	T	6	6	70597	70602	0 %	100 %	0 %	0 %	189345621
1124	NC_010803	TAC	2	6	70696	70701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345621
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1126	NC_010803	GC	3	6	70780	70785	0 %	0 %	50 %	50 %	189345621
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1292	NC_010803	TCT	2	6	79263	79268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345629
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1353	NC_010803	TGCCC	2	10	82367	82376	0 %	20 %	20 %	60 %	189345632
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1367	NC_010803	ACG	2	6	82995	83000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345633
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1372	NC_010803	ATC	2	6	83340	83345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345633
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1375	NC_010803	GC	3	6	83417	83422	0 %	0 %	50 %	50 %	189345633
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1498	NC_010803	CGT	2	6	90794	90799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345640
1499	NC_010803	CGC	2	6	90868	90873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345640
1500	NC_010803	GGGTTC	2	12	90923	90934	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189345640

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