MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 45842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010803	GGC	2	6	29840	29845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345583
502	NC_010803	AGC	2	6	29847	29852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345583
503	NC_010803	AGC	2	6	29944	29949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345583
504	NC_010803	GAT	2	6	30050	30055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345583
505	NC_010803	GAAG	2	8	30095	30102	50 %	0 %	50 %	0 %	189345583
506	NC_010803	TCGTT	2	10	30106	30115	0 %	60 %	20 %	20 %	189345583
507	NC_010803	ATG	2	6	30121	30126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345583
508	NC_010803	AGC	2	6	30142	30147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345583
509	NC_010803	GAC	2	6	30211	30216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345583
510	NC_010803	TGA	2	6	30580	30585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345584
511	NC_010803	TTC	2	6	30614	30619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345584
512	NC_010803	T	6	6	30670	30675	0 %	100 %	0 %	0 %	189345584
513	NC_010803	TGG	2	6	30730	30735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345584
514	NC_010803	AG	3	6	30936	30941	50 %	0 %	50 %	0 %	189345585
515	NC_010803	T	6	6	30995	31000	0 %	100 %	0 %	0 %	189345585
516	NC_010803	CGC	2	6	31034	31039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345585
517	NC_010803	GCT	2	6	31062	31067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345585
518	NC_010803	AAG	2	6	31074	31079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345585
519	NC_010803	AAGA	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	189345585
520	NC_010803	TTC	2	6	31329	31334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345585
521	NC_010803	A	6	6	31406	31411	100 %	0 %	0 %	0 %	189345585
522	NC_010803	GA	3	6	31420	31425	50 %	0 %	50 %	0 %	189345585
523	NC_010803	T	7	7	31487	31493	0 %	100 %	0 %	0 %	189345585
524	NC_010803	CAG	2	6	31494	31499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345585
525	NC_010803	GGCTCC	2	12	31506	31517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189345585
526	NC_010803	GAT	2	6	31530	31535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345585
527	NC_010803	CAGC	2	8	31673	31680	25 %	0 %	25 %	50 %	189345585
528	NC_010803	A	6	6	31779	31784	100 %	0 %	0 %	0 %	189345585
529	NC_010803	TTG	2	6	31863	31868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345586
530	NC_010803	A	6	6	31880	31885	100 %	0 %	0 %	0 %	189345586
531	NC_010803	T	6	6	31905	31910	0 %	100 %	0 %	0 %	189345586
532	NC_010803	GAAAA	2	10	32037	32046	80 %	0 %	20 %	0 %	189345586
533	NC_010803	GCG	2	6	32053	32058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345586
534	NC_010803	TTA	2	6	32112	32117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345587
535	NC_010803	CGACA	2	10	32322	32331	40 %	0 %	20 %	40 %	189345587
536	NC_010803	TCG	2	6	32341	32346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345587
537	NC_010803	ATG	2	6	32374	32379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345587
538	NC_010803	GTC	2	6	32439	32444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345587
539	NC_010803	CGA	2	6	32447	32452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345587
540	NC_010803	CGT	2	6	32538	32543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345587
541	NC_010803	GCCGGA	2	12	32569	32580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189345587
542	NC_010803	TCCTG	2	10	32651	32660	0 %	40 %	20 %	40 %	189345587
543	NC_010803	AAG	2	6	32721	32726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345587
544	NC_010803	CCTG	2	8	32743	32750	0 %	25 %	25 %	50 %	189345587
545	NC_010803	TGT	2	6	32765	32770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345587
546	NC_010803	AAG	2	6	32778	32783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345587
547	NC_010803	CT	3	6	32843	32848	0 %	50 %	0 %	50 %	189345587
548	NC_010803	T	6	6	32894	32899	0 %	100 %	0 %	0 %	189345587
549	NC_010803	CAT	2	6	32916	32921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345587
550	NC_010803	CTG	2	6	32988	32993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345587
551	NC_010803	TGT	2	6	33002	33007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345587
552	NC_010803	CCG	2	6	33049	33054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345587
553	NC_010803	TTC	2	6	33184	33189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345587
554	NC_010803	TTC	2	6	33239	33244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345587
555	NC_010803	TGC	2	6	33364	33369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345587
556	NC_010803	CAA	2	6	33461	33466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345587
557	NC_010803	GAT	2	6	33474	33479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345587
558	NC_010803	CTT	2	6	33494	33499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345587
559	NC_010803	AGC	2	6	33927	33932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345588
560	NC_010803	TGC	2	6	33935	33940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345588
561	NC_010803	GGC	2	6	33966	33971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345588
562	NC_010803	TTC	2	6	34026	34031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345588
563	NC_010803	T	7	7	34065	34071	0 %	100 %	0 %	0 %	189345588
564	NC_010803	CCCT	2	8	34083	34090	0 %	25 %	0 %	75 %	189345588
565	NC_010803	TGG	2	6	34112	34117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345588
566	NC_010803	ACG	2	6	34178	34183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345588
567	NC_010803	G	6	6	34279	34284	0 %	0 %	100 %	0 %	189345588
568	NC_010803	CGAT	2	8	34288	34295	25 %	25 %	25 %	25 %	189345588
569	NC_010803	GTC	2	6	34309	34314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345588
570	NC_010803	TTA	2	6	34340	34345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345588
571	NC_010803	CAG	2	6	34709	34714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345589
572	NC_010803	GAA	2	6	34748	34753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345589
573	NC_010803	TCCGA	2	10	34781	34790	20 %	20 %	20 %	40 %	189345589
574	NC_010803	GGA	2	6	34807	34812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345589
575	NC_010803	GACC	2	8	34851	34858	25 %	0 %	25 %	50 %	189345589
576	NC_010803	TGCA	2	8	34916	34923	25 %	25 %	25 %	25 %	189345589
577	NC_010803	ATGT	2	8	34934	34941	25 %	50 %	25 %	0 %	189345589
578	NC_010803	GTA	2	6	35015	35020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345589
579	NC_010803	CAT	2	6	35032	35037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345589
580	NC_010803	GCA	2	6	35049	35054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345589
581	NC_010803	CGG	2	6	35077	35082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345589
582	NC_010803	GCA	2	6	35131	35136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345589
583	NC_010803	CGG	2	6	35221	35226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345589
584	NC_010803	CCT	2	6	35268	35273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345589
585	NC_010803	CGA	2	6	35449	35454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345589
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587	NC_010803	GACG	2	8	35480	35487	25 %	0 %	50 %	25 %	189345589
588	NC_010803	GCAA	2	8	35576	35583	50 %	0 %	25 %	25 %	189345589
589	NC_010803	TGG	2	6	35627	35632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345589
590	NC_010803	TCC	2	6	35653	35658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345589
591	NC_010803	CGTC	2	8	35705	35712	0 %	25 %	25 %	50 %	189345589
592	NC_010803	GC	3	6	35726	35731	0 %	0 %	50 %	50 %	189345589
593	NC_010803	TC	3	6	35759	35764	0 %	50 %	0 %	50 %	189345589
594	NC_010803	ATTT	2	8	35806	35813	25 %	75 %	0 %	0 %	189345589
595	NC_010803	GGT	2	6	35816	35821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345589
596	NC_010803	CGC	2	6	35822	35827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345589
597	NC_010803	CGC	2	6	35884	35889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345589
598	NC_010803	A	6	6	35904	35909	100 %	0 %	0 %	0 %	189345589
599	NC_010803	CGT	2	6	35942	35947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345589
600	NC_010803	ATT	2	6	35991	35996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345589
601	NC_010803	CTGGC	2	10	36091	36100	0 %	20 %	40 %	40 %	189345589
602	NC_010803	GATGA	2	10	36221	36230	40 %	20 %	40 %	0 %	189345589
603	NC_010803	A	6	6	36278	36283	100 %	0 %	0 %	0 %	189345589
604	NC_010803	GCT	2	6	36286	36291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345589
605	NC_010803	GAG	2	6	36299	36304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345589
606	NC_010803	AAT	2	6	36313	36318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345589
607	NC_010803	GCG	2	6	36844	36849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345590
608	NC_010803	CCA	2	6	36863	36868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345590
609	NC_010803	AAC	2	6	36958	36963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345590
610	NC_010803	GAGG	2	8	36981	36988	25 %	0 %	75 %	0 %	189345590
611	NC_010803	ATCGGT	2	12	37003	37014	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189345590
612	NC_010803	GAC	2	6	37059	37064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345590
613	NC_010803	CT	3	6	37102	37107	0 %	50 %	0 %	50 %	189345590
614	NC_010803	AGGG	2	8	37157	37164	25 %	0 %	75 %	0 %	189345590
615	NC_010803	GTGGGA	2	12	37267	37278	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	189345590
616	NC_010803	TATGGA	2	12	37368	37379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345590
617	NC_010803	GGC	2	6	37417	37422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345590
618	NC_010803	GGA	2	6	37600	37605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345590
619	NC_010803	AAT	2	6	37684	37689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345590
620	NC_010803	CGGT	2	8	37699	37706	0 %	25 %	50 %	25 %	189345590
621	NC_010803	GGCC	2	8	37739	37746	0 %	0 %	50 %	50 %	189345590
622	NC_010803	GAT	2	6	37788	37793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345590
623	NC_010803	CCG	2	6	37796	37801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345590
624	NC_010803	GTC	2	6	37821	37826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345590
625	NC_010803	CCG	2	6	37856	37861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345590
626	NC_010803	CT	3	6	37866	37871	0 %	50 %	0 %	50 %	189345590
627	NC_010803	TGC	2	6	37913	37918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345590
628	NC_010803	TCGG	2	8	37945	37952	0 %	25 %	50 %	25 %	189345590
629	NC_010803	TCT	2	6	38104	38109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345590
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