MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 45842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010803	CGA	2	6	286180	286185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4502	NC_010803	GCC	2	6	286285	286290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345800
4503	NC_010803	TCG	2	6	286307	286312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4504	NC_010803	A	6	6	286334	286339	100 %	0 %	0 %	0 %	189345800
4505	NC_010803	GTG	2	6	286353	286358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345800
4506	NC_010803	GGA	2	6	286417	286422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345800
4507	NC_010803	TGC	2	6	286624	286629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4508	NC_010803	GAA	2	6	286664	286669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345800
4509	NC_010803	CG	3	6	286704	286709	0 %	0 %	50 %	50 %	189345800
4510	NC_010803	GCGG	2	8	286751	286758	0 %	0 %	75 %	25 %	189345800
4511	NC_010803	AT	3	6	286785	286790	50 %	50 %	0 %	0 %	189345800
4512	NC_010803	ACT	2	6	286835	286840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345800
4513	NC_010803	CGA	2	6	286843	286848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4514	NC_010803	CGC	2	6	286886	286891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345800
4515	NC_010803	CAA	2	6	286945	286950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345800
4516	NC_010803	CAC	2	6	286973	286978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345800
4517	NC_010803	CCTG	2	8	287050	287057	0 %	25 %	25 %	50 %	189345800
4518	NC_010803	TCGA	2	8	287147	287154	25 %	25 %	25 %	25 %	189345800
4519	NC_010803	AGA	2	6	287169	287174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345800
4520	NC_010803	GGT	2	6	287179	287184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345800
4521	NC_010803	GAG	2	6	287201	287206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345800
4522	NC_010803	GGA	2	6	287272	287277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345800
4523	NC_010803	ATG	2	6	287336	287341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345800
4524	NC_010803	GGT	2	6	287353	287358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345800
4525	NC_010803	A	7	7	287444	287450	100 %	0 %	0 %	0 %	189345800
4526	NC_010803	GTC	2	6	287643	287648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4527	NC_010803	GGA	2	6	287687	287692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345800
4528	NC_010803	CGA	2	6	287740	287745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4529	NC_010803	CGA	2	6	287794	287799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4530	NC_010803	CAT	4	12	287848	287859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345800
4531	NC_010803	CCG	2	6	287924	287929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345800
4532	NC_010803	GAT	2	6	287930	287935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345800
4533	NC_010803	CCA	2	6	287964	287969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345800
4534	NC_010803	CGA	2	6	288019	288024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4535	NC_010803	AGC	2	6	288051	288056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4536	NC_010803	ATC	2	6	288068	288073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345800
4537	NC_010803	AG	3	6	288201	288206	50 %	0 %	50 %	0 %	189345800
4538	NC_010803	CGA	2	6	288292	288297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
4539	NC_010803	GAT	2	6	288472	288477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345801
4540	NC_010803	TCC	2	6	288510	288515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345801
4541	NC_010803	CGT	2	6	288553	288558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345801
4542	NC_010803	CTC	2	6	288620	288625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345801
4543	NC_010803	T	6	6	288632	288637	0 %	100 %	0 %	0 %	189345801
4544	NC_010803	GCA	2	6	288868	288873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345801
4545	NC_010803	CAC	2	6	289046	289051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345801
4546	NC_010803	GAT	2	6	289100	289105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345801
4547	NC_010803	GCA	2	6	289114	289119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345801
4548	NC_010803	ATC	2	6	289157	289162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345801
4549	NC_010803	CTG	2	6	289249	289254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345801
4550	NC_010803	TCA	2	6	289300	289305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345801
4551	NC_010803	GTA	2	6	289523	289528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345801
4552	NC_010803	ATC	2	6	289691	289696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345801
4553	NC_010803	GAAG	2	8	289743	289750	50 %	0 %	50 %	0 %	189345801
4554	NC_010803	TGT	2	6	289762	289767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345801
4555	NC_010803	TGT	2	6	289829	289834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345802
4556	NC_010803	A	7	7	289846	289852	100 %	0 %	0 %	0 %	189345802
4557	NC_010803	TG	3	6	289869	289874	0 %	50 %	50 %	0 %	189345802
4558	NC_010803	GGGA	2	8	290001	290008	25 %	0 %	75 %	0 %	189345802
4559	NC_010803	GAA	2	6	290098	290103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345802
4560	NC_010803	AGA	2	6	290165	290170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345802
4561	NC_010803	CGGA	2	8	290197	290204	25 %	0 %	50 %	25 %	189345802
4562	NC_010803	ACCG	2	8	290207	290214	25 %	0 %	25 %	50 %	189345802
4563	NC_010803	TTTC	2	8	290259	290266	0 %	75 %	0 %	25 %	189345802
4564	NC_010803	CAG	2	6	290684	290689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345803
4565	NC_010803	TC	3	6	290713	290718	0 %	50 %	0 %	50 %	189345803
4566	NC_010803	AT	3	6	290728	290733	50 %	50 %	0 %	0 %	189345803
4567	NC_010803	TC	3	6	290754	290759	0 %	50 %	0 %	50 %	189345803
4568	NC_010803	TCT	2	6	290793	290798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345803
4569	NC_010803	GATC	2	8	290953	290960	25 %	25 %	25 %	25 %	189345803
4570	NC_010803	GCA	2	6	291015	291020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345803
4571	NC_010803	GCA	2	6	291022	291027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345803
4572	NC_010803	ATG	2	6	291114	291119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345803
4573	NC_010803	T	7	7	291120	291126	0 %	100 %	0 %	0 %	189345803
4574	NC_010803	CCG	2	6	291159	291164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345803
4575	NC_010803	CAGAT	2	10	291180	291189	40 %	20 %	20 %	20 %	189345803
4576	NC_010803	GTC	2	6	291231	291236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345803
4577	NC_010803	TCC	2	6	291290	291295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345803
4578	NC_010803	AGG	2	6	291370	291375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345803
4579	NC_010803	TGC	2	6	291457	291462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345803
4580	NC_010803	CGGAG	2	10	291471	291480	20 %	0 %	60 %	20 %	189345803
4581	NC_010803	GGTC	2	8	291517	291524	0 %	25 %	50 %	25 %	189345803
4582	NC_010803	AGGG	2	8	291591	291598	25 %	0 %	75 %	0 %	189345803
4583	NC_010803	T	6	6	291984	291989	0 %	100 %	0 %	0 %	189345804
4584	NC_010803	TCA	2	6	292064	292069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345804
4585	NC_010803	CGA	2	6	292089	292094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
4586	NC_010803	GAA	2	6	292105	292110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345804
4587	NC_010803	ACC	2	6	292150	292155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345804
4588	NC_010803	TTG	2	6	292163	292168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345804
4589	NC_010803	A	7	7	292188	292194	100 %	0 %	0 %	0 %	189345804
4590	NC_010803	GAG	2	6	292213	292218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345804
4591	NC_010803	GGA	2	6	292236	292241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345804
4592	NC_010803	CTC	2	6	292255	292260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345804
4593	NC_010803	CA	3	6	292376	292381	50 %	0 %	0 %	50 %	189345804
4594	NC_010803	ATT	2	6	292408	292413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345804
4595	NC_010803	GGTCAG	2	12	292492	292503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189345804
4596	NC_010803	GGT	2	6	292521	292526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345804
4597	NC_010803	CGG	2	6	292583	292588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345804
4598	NC_010803	GGA	2	6	292617	292622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345804
4599	NC_010803	AAG	2	6	292651	292656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345804
4600	NC_010803	CAG	2	6	292720	292725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
4601	NC_010803	CT	3	6	292807	292812	0 %	50 %	0 %	50 %	189345804
4602	NC_010803	AT	3	6	292842	292847	50 %	50 %	0 %	0 %	189345804
4603	NC_010803	GA	3	6	292856	292861	50 %	0 %	50 %	0 %	189345804
4604	NC_010803	CGA	2	6	292866	292871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
4605	NC_010803	CAG	2	6	292921	292926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
4606	NC_010803	GAG	2	6	292968	292973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345805
4607	NC_010803	GCA	2	6	293006	293011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345805
4608	NC_010803	GTGC	2	8	293013	293020	0 %	25 %	50 %	25 %	189345805
4609	NC_010803	TGA	2	6	293123	293128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345805
4610	NC_010803	T	8	8	293190	293197	0 %	100 %	0 %	0 %	189345805
4611	NC_010803	T	6	6	293233	293238	0 %	100 %	0 %	0 %	189345805
4612	NC_010803	TG	3	6	293298	293303	0 %	50 %	50 %	0 %	189345805
4613	NC_010803	AGC	3	9	293386	293394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345805
4614	NC_010803	AGGT	2	8	293458	293465	25 %	25 %	50 %	0 %	189345805
4615	NC_010803	CTG	2	6	293499	293504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345805
4616	NC_010803	TAT	2	6	293636	293641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345806
4617	NC_010803	CAGA	2	8	293650	293657	50 %	0 %	25 %	25 %	189345806
4618	NC_010803	CGATG	2	10	293729	293738	20 %	20 %	40 %	20 %	189345806
4619	NC_010803	GCT	2	6	293864	293869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345806
4620	NC_010803	TCC	2	6	293882	293887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345806
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4622	NC_010803	GAG	3	9	294069	294077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345806
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4744	NC_010803	TC	3	6	300391	300396	0 %	50 %	0 %	50 %	189345810
4745	NC_010803	CTGA	2	8	300409	300416	25 %	25 %	25 %	25 %	189345810
4746	NC_010803	AAC	2	6	300435	300440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345810
4747	NC_010803	AAG	2	6	300506	300511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345811
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4751	NC_010803	T	7	7	300651	300657	0 %	100 %	0 %	0 %	189345811
4752	NC_010803	T	6	6	300665	300670	0 %	100 %	0 %	0 %	189345811
4753	NC_010803	T	6	6	300803	300808	0 %	100 %	0 %	0 %	189345811
4754	NC_010803	AGT	2	6	301045	301050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345811
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4756	NC_010803	CGG	2	6	301093	301098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345811
4757	NC_010803	GAC	2	6	301100	301105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345811
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4760	NC_010803	GCAG	2	8	301364	301371	25 %	0 %	50 %	25 %	189345811
4761	NC_010803	AG	3	6	301370	301375	50 %	0 %	50 %	0 %	189345811
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4764	NC_010803	TCC	2	6	301574	301579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345811
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4769	NC_010803	TGC	2	6	301881	301886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345812
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4771	NC_010803	CTG	2	6	302225	302230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345812
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4775	NC_010803	AGC	2	6	302408	302413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345812
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4843	NC_010803	AG	3	6	306250	306255	50 %	0 %	50 %	0 %	189345812
4844	NC_010803	TA	3	6	306295	306300	50 %	50 %	0 %	0 %	189345812
4845	NC_010803	GAA	2	6	306343	306348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345813
4846	NC_010803	AAT	2	6	306356	306361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345813
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4853	NC_010803	CGC	2	6	306583	306588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345813
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4856	NC_010803	A	6	6	306727	306732	100 %	0 %	0 %	0 %	189345813
4857	NC_010803	AGC	2	6	306792	306797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345813
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4861	NC_010803	GAT	2	6	307305	307310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345815
4862	NC_010803	GGCA	2	8	307328	307335	25 %	0 %	50 %	25 %	189345815
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4987	NC_010803	ATC	2	6	316023	316028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345822
4988	NC_010803	T	6	6	316034	316039	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
4989	NC_010803	T	6	6	316080	316085	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
4990	NC_010803	TCATG	2	10	316127	316136	20 %	40 %	20 %	20 %	189345822
4991	NC_010803	ATG	2	6	316151	316156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345822
4992	NC_010803	TGCG	2	8	316163	316170	0 %	25 %	50 %	25 %	189345822
4993	NC_010803	ATT	2	6	316186	316191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345822
4994	NC_010803	TA	3	6	316214	316219	50 %	50 %	0 %	0 %	189345822
4995	NC_010803	AAT	2	6	316256	316261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345822
4996	NC_010803	CCA	2	6	316272	316277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345822
4997	NC_010803	TAT	3	9	316301	316309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345822
4998	NC_010803	ATC	2	6	316321	316326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345822
4999	NC_010803	GTC	2	6	316344	316349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345822
5000	NC_010803	A	6	6	316353	316358	100 %	0 %	0 %	0 %	189345822

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